MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 2536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014334	CA	3	6	672	677	50 %	0 %	0 %	50 %	301065126
2	NC_014334	GC	3	6	1180	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	301065126
3	NC_014334	AT	4	8	1493	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014334	GC	4	8	5930	5937	0 %	0 %	50 %	50 %	301065130
5	NC_014334	GC	3	6	6104	6109	0 %	0 %	50 %	50 %	301065130
6	NC_014334	GC	3	6	7384	7389	0 %	0 %	50 %	50 %	301065132
7	NC_014334	AT	3	6	8395	8400	50 %	50 %	0 %	0 %	301065132
8	NC_014334	AT	3	6	9533	9538	50 %	50 %	0 %	0 %	301065133
9	NC_014334	GC	3	6	11495	11500	0 %	0 %	50 %	50 %	301065134
10	NC_014334	TG	3	6	12122	12127	0 %	50 %	50 %	0 %	301065134
11	NC_014334	GT	3	6	12625	12630	0 %	50 %	50 %	0 %	301065136
12	NC_014334	TG	3	6	13512	13517	0 %	50 %	50 %	0 %	301065138
13	NC_014334	AT	3	6	14113	14118	50 %	50 %	0 %	0 %	301065139
14	NC_014334	CG	3	6	14445	14450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014334	TA	3	6	14637	14642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014334	CA	3	6	15593	15598	50 %	0 %	0 %	50 %	301065140
17	NC_014334	TC	3	6	18272	18277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014334	TG	3	6	18376	18381	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014334	GT	3	6	18819	18824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014334	AT	3	6	18998	19003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014334	AC	3	6	19042	19047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014334	AC	3	6	20282	20287	50 %	0 %	0 %	50 %	301065145
23	NC_014334	TA	3	6	21145	21150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014334	GA	3	6	23549	23554	50 %	0 %	50 %	0 %	301065150
25	NC_014334	GC	3	6	24412	24417	0 %	0 %	50 %	50 %	301065150
26	NC_014334	GC	3	6	24462	24467	0 %	0 %	50 %	50 %	301065150
27	NC_014334	AT	3	6	26240	26245	50 %	50 %	0 %	0 %	301065151
28	NC_014334	TG	3	6	26280	26285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014334	TG	3	6	27441	27446	0 %	50 %	50 %	0 %	301065153
30	NC_014334	GT	3	6	28666	28671	0 %	50 %	50 %	0 %	301065155
31	NC_014334	TC	3	6	29175	29180	0 %	50 %	0 %	50 %	301065156
32	NC_014334	TA	3	6	29479	29484	50 %	50 %	0 %	0 %	301065156
33	NC_014334	AT	3	6	30500	30505	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
34	NC_014334	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
35	NC_014334	TG	3	6	31792	31797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014334	CG	3	6	33511	33516	0 %	0 %	50 %	50 %	301065159
37	NC_014334	TA	3	6	33860	33865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014334	TA	3	6	33939	33944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014334	TG	3	6	35547	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
40	NC_014334	GT	3	6	35682	35687	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
41	NC_014334	CT	3	6	35973	35978	0 %	50 %	0 %	50 %	301065162
42	NC_014334	CG	3	6	36085	36090	0 %	0 %	50 %	50 %	301065162
43	NC_014334	CA	3	6	37034	37039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014334	TC	3	6	37714	37719	0 %	50 %	0 %	50 %	301065164
45	NC_014334	TA	3	6	38551	38556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014334	AG	3	6	38998	39003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014334	CG	3	6	41054	41059	0 %	0 %	50 %	50 %	301065167
48	NC_014334	TG	3	6	41629	41634	0 %	50 %	50 %	0 %	301065168
49	NC_014334	TA	3	6	42407	42412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014334	CG	3	6	43250	43255	0 %	0 %	50 %	50 %	301065171
51	NC_014334	AT	3	6	43745	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	301065172
52	NC_014334	AT	3	6	44374	44379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014334	TC	3	6	46256	46261	0 %	50 %	0 %	50 %	301065175
54	NC_014334	GA	4	8	48776	48783	50 %	0 %	50 %	0 %	301065179
55	NC_014334	CA	3	6	49227	49232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014334	TA	3	6	51870	51875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014334	TC	3	6	51985	51990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014334	CA	3	6	54000	54005	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014334	CA	3	6	54086	54091	50 %	0 %	0 %	50 %	301065187
60	NC_014334	CT	3	6	54857	54862	0 %	50 %	0 %	50 %	301065187
61	NC_014334	GA	3	6	57042	57047	50 %	0 %	50 %	0 %	301065189
62	NC_014334	CA	3	6	58730	58735	50 %	0 %	0 %	50 %	301065190
63	NC_014334	AC	3	6	59083	59088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014334	AG	3	6	59881	59886	50 %	0 %	50 %	0 %	301065191
65	NC_014334	AG	3	6	60345	60350	50 %	0 %	50 %	0 %	301065191
66	NC_014334	GA	3	6	63959	63964	50 %	0 %	50 %	0 %	301065194
67	NC_014334	TG	3	6	64502	64507	0 %	50 %	50 %	0 %	301065194
68	NC_014334	CT	3	6	64676	64681	0 %	50 %	0 %	50 %	301065194
69	NC_014334	CT	3	6	65065	65070	0 %	50 %	0 %	50 %	301065195
70	NC_014334	AT	3	6	65446	65451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014334	TG	3	6	69339	69344	0 %	50 %	50 %	0 %	301065200
72	NC_014334	AG	3	6	69750	69755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014334	GT	3	6	70210	70215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014334	TG	3	6	70297	70302	0 %	50 %	50 %	0 %	301065201
75	NC_014334	AG	3	6	70524	70529	50 %	0 %	50 %	0 %	301065201
76	NC_014334	AG	3	6	71109	71114	50 %	0 %	50 %	0 %	301065202
77	NC_014334	AT	3	6	71120	71125	50 %	50 %	0 %	0 %	301065202
78	NC_014334	CG	3	6	71870	71875	0 %	0 %	50 %	50 %	301065204
79	NC_014334	CA	3	6	75463	75468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014334	TA	3	6	80276	80281	50 %	50 %	0 %	0 %	301065214
81	NC_014334	GC	3	6	80437	80442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014334	GA	3	6	80590	80595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014334	TC	3	6	80602	80607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014334	CT	3	6	80716	80721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014334	GC	3	6	80724	80729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014334	TG	3	6	80942	80947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014334	TG	3	6	84183	84188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014334	CG	3	6	84677	84682	0 %	0 %	50 %	50 %	301065217
89	NC_014334	AC	3	6	84965	84970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014334	GT	3	6	85614	85619	0 %	50 %	50 %	0 %	301065219
91	NC_014334	CA	3	6	86463	86468	50 %	0 %	0 %	50 %	301065220
92	NC_014334	GC	3	6	88454	88459	0 %	0 %	50 %	50 %	301065222
93	NC_014334	GA	3	6	89331	89336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014334	AG	3	6	89370	89375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014334	CT	3	6	89801	89806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014334	TC	3	6	90339	90344	0 %	50 %	0 %	50 %	301065224
97	NC_014334	TA	3	6	90589	90594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014334	AT	3	6	91003	91008	50 %	50 %	0 %	0 %	301065226
99	NC_014334	TA	3	6	91249	91254	50 %	50 %	0 %	0 %	301065227
100	NC_014334	TG	3	6	92878	92883	0 %	50 %	50 %	0 %	301065228
101	NC_014334	CA	3	6	93003	93008	50 %	0 %	0 %	50 %	301065228
102	NC_014334	GA	3	6	93618	93623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014334	GC	3	6	95903	95908	0 %	0 %	50 %	50 %	301065231
104	NC_014334	GC	3	6	97049	97054	0 %	0 %	50 %	50 %	301065232
105	NC_014334	GC	3	6	98204	98209	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
106	NC_014334	GC	3	6	98444	98449	0 %	0 %	50 %	50 %	301065233
107	NC_014334	GC	3	6	98859	98864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014334	GA	3	6	99000	99005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014334	CG	3	6	99115	99120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014334	GC	3	6	99740	99745	0 %	0 %	50 %	50 %	301065234
111	NC_014334	TG	3	6	101002	101007	0 %	50 %	50 %	0 %	301065235
112	NC_014334	AT	3	6	103519	103524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014334	CT	3	6	103575	103580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014334	AT	3	6	104353	104358	50 %	50 %	0 %	0 %	301065240
115	NC_014334	TA	3	6	104643	104648	50 %	50 %	0 %	0 %	301065240
116	NC_014334	GA	3	6	106745	106750	50 %	0 %	50 %	0 %	301065241
117	NC_014334	AT	3	6	107111	107116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014334	CA	3	6	109545	109550	50 %	0 %	0 %	50 %	301065244
119	NC_014334	CG	3	6	112569	112574	0 %	0 %	50 %	50 %	301065246
120	NC_014334	GC	3	6	113590	113595	0 %	0 %	50 %	50 %	301065247
121	NC_014334	CG	3	6	114458	114463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014334	CA	3	6	114677	114682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014334	CG	3	6	118582	118587	0 %	0 %	50 %	50 %	301065250
124	NC_014334	TG	3	6	118664	118669	0 %	50 %	50 %	0 %	301065250
125	NC_014334	CG	3	6	120039	120044	0 %	0 %	50 %	50 %	301065252
126	NC_014334	GC	3	6	120088	120093	0 %	0 %	50 %	50 %	301065252
127	NC_014334	CA	4	8	124022	124029	50 %	0 %	0 %	50 %	301065254
128	NC_014334	GC	3	6	125947	125952	0 %	0 %	50 %	50 %	301065255
129	NC_014334	AT	3	6	126839	126844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014334	CG	3	6	126974	126979	0 %	0 %	50 %	50 %	301065256
131	NC_014334	GC	3	6	127173	127178	0 %	0 %	50 %	50 %	301065256
132	NC_014334	AC	3	6	128068	128073	50 %	0 %	0 %	50 %	301065256
133	NC_014334	AG	3	6	128739	128744	50 %	0 %	50 %	0 %	301065256
134	NC_014334	CA	3	6	129157	129162	50 %	0 %	0 %	50 %	301065257
135	NC_014334	CA	3	6	129214	129219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014334	CG	3	6	132100	132105	0 %	0 %	50 %	50 %	301065260
137	NC_014334	CG	3	6	132599	132604	0 %	0 %	50 %	50 %	301065260
138	NC_014334	TG	3	6	132902	132907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014334	TG	3	6	132980	132985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014334	GA	3	6	133080	133085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014334	GA	3	6	133503	133508	50 %	0 %	50 %	0 %	301065261
142	NC_014334	AT	3	6	133619	133624	50 %	50 %	0 %	0 %	301065261
143	NC_014334	AT	4	8	134105	134112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014334	TA	3	6	135387	135392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014334	GC	3	6	136144	136149	0 %	0 %	50 %	50 %	301065265
146	NC_014334	AC	3	6	137528	137533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014334	TA	3	6	137534	137539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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