MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pCI-XO2

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014332	TTTCTT	2	12	117	128	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	301067931
2	NC_014332	GTTTTC	2	12	566	577	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	301067931
3	NC_014332	TGCTTC	2	12	1176	1187	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	301067931
4	NC_014332	ACTCTG	2	12	5760	5771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067939
5	NC_014332	TCATCT	2	12	8254	8265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067940
6	NC_014332	GTTACC	2	12	8708	8719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067942
7	NC_014332	AATTCA	2	12	16474	16485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	301067947
8	NC_014332	GAACAT	2	12	16885	16896	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301067948
9	NC_014332	TTTCTT	2	12	19437	19448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	301067952
10	NC_014332	CCTGTT	2	12	20172	20183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	301067953
11	NC_014332	TCTTTG	2	12	22218	22229	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	301067957
12	NC_014332	CATTTT	2	12	28083	28094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	301067962
13	NC_014332	TAAATT	2	12	29414	29425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014332	CATTCT	2	12	30603	30614	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067965
15	NC_014332	TTTGCA	2	12	31334	31345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301067965
16	NC_014332	TGTGTA	2	12	32021	32032	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	301067966
17	NC_014332	TTTTTC	2	12	35254	35265	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014332	CTTGAC	2	12	36509	36520	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067970
19	NC_014332	CAATAT	2	12	42175	42186	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	301067978
20	NC_014332	GAATTA	2	12	44089	44100	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	301067980
21	NC_014332	TATAAT	2	12	47100	47111	50 %	50 %	0 %	0 %	301067984
22	NC_014332	TACCAA	2	12	47905	47916	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	301067985
23	NC_014332	TAAAAT	2	12	48959	48970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014332	ACTTTC	2	12	49624	49635	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067987
25	NC_014332	TTGTTT	2	12	50547	50558	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	301067987
26	NC_014332	TCCCTT	2	12	50662	50673	0 %	50 %	0 %	50 %	301067987
27	NC_014332	TTTTAT	2	12	50674	50685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	301067987
28	NC_014332	GATTTG	2	12	50815	50826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	301067987
29	NC_014332	TATACA	2	12	50887	50898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014332	CATTCT	2	12	53342	53353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301067990
31	NC_014332	TCTTTA	2	12	54043	54054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	301067990
32	NC_014332	TTTTCT	2	12	54387	54398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	301067991
33	NC_014332	TCGTCA	2	12	55405	55416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067991
34	NC_014332	TGCTTC	2	12	56940	56951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	301067993
35	NC_014332	ATTCAT	2	12	60130	60141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014332	ACTTTG	2	12	62612	62623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301068000
37	NC_014332	TTATAA	2	12	64473	64484	50 %	50 %	0 %	0 %	301068004
38	NC_014332	CAAATA	2	12	65868	65879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	301068006
39	NC_014332	AATATG	2	12	66670	66681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014332	TATAAA	2	12	70630	70641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014332	TTTTAA	2	12	70771	70782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014332	ATTTTT	2	12	74193	74204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	301068016
43	NC_014332	ATTGTA	2	12	75671	75682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	301068018
44	NC_014332	TGTTTC	2	12	75776	75787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014332	TTAAAT	2	12	79707	79718	50 %	50 %	0 %	0 %	301068023
46	NC_014332	TCCAAA	2	12	85340	85351	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	301068028
47	NC_014332	TTCCTA	2	12	86335	86346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301068030
48	NC_014332	TACTTT	2	12	87207	87218	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	301068031
49	NC_014332	TCATAA	2	12	89817	89828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	301068033
50	NC_014332	TATTTA	3	18	90209	90226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301068034
51	NC_014332	CATATC	2	12	91220	91231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301068036
52	NC_014332	CATCTT	2	12	91934	91945	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	301068037
53	NC_014332	TCTCTT	2	12	92641	92652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301068037
54	NC_014332	TTTAAT	2	12	93051	93062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301068037

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.