MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus biovar anthracis str. CI plasmid pCI-XO2

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014332	ACTCA	2	10	498	507	40 %	20 %	0 %	40 %	301067931
2	NC_014332	TTTCT	2	10	2891	2900	0 %	80 %	0 %	20 %	301067935
3	NC_014332	CTTTT	2	10	3440	3449	0 %	80 %	0 %	20 %	301067935
4	NC_014332	TCATT	2	10	3497	3506	20 %	60 %	0 %	20 %	301067935
5	NC_014332	ACTTT	2	10	4307	4316	20 %	60 %	0 %	20 %	301067937
6	NC_014332	GAATC	2	10	6523	6532	40 %	20 %	20 %	20 %	301067939
7	NC_014332	ATCTT	2	10	9112	9121	20 %	60 %	0 %	20 %	301067944
8	NC_014332	GCTTC	2	10	9338	9347	0 %	40 %	20 %	40 %	301067944
9	NC_014332	CGCTT	2	10	9580	9589	0 %	40 %	20 %	40 %	301067944
10	NC_014332	TTCAC	2	10	9701	9710	20 %	40 %	0 %	40 %	301067944
11	NC_014332	TTTGT	2	10	10138	10147	0 %	80 %	20 %	0 %	301067944
12	NC_014332	TTTTC	2	10	10427	10436	0 %	80 %	0 %	20 %	301067944
13	NC_014332	TTCAT	2	10	12145	12154	20 %	60 %	0 %	20 %	301067945
14	NC_014332	TTTCT	2	10	12274	12283	0 %	80 %	0 %	20 %	301067945
15	NC_014332	TTCTT	2	10	14646	14655	0 %	80 %	0 %	20 %	301067946
16	NC_014332	ATTCA	2	10	16170	16179	40 %	40 %	0 %	20 %	301067947
17	NC_014332	TCCAA	2	10	16954	16963	40 %	20 %	0 %	40 %	301067948
18	NC_014332	TTTCA	2	10	18894	18903	20 %	60 %	0 %	20 %	301067952
19	NC_014332	AGAAA	2	10	19318	19327	80 %	0 %	20 %	0 %	301067952
20	NC_014332	TCTTG	2	10	20691	20700	0 %	60 %	20 %	20 %	301067953
21	NC_014332	CAAAT	2	10	23673	23682	60 %	20 %	0 %	20 %	301067957
22	NC_014332	AATTT	2	10	27288	27297	40 %	60 %	0 %	0 %	301067960
23	NC_014332	GATGT	2	10	27413	27422	20 %	40 %	40 %	0 %	301067960
24	NC_014332	TGCTT	2	10	29104	29113	0 %	60 %	20 %	20 %	301067963
25	NC_014332	CTTCT	2	10	29228	29237	0 %	60 %	0 %	40 %	301067963
26	NC_014332	TTTTC	2	10	30758	30767	0 %	80 %	0 %	20 %	301067965
27	NC_014332	TAACT	2	10	31447	31456	40 %	40 %	0 %	20 %	301067965
28	NC_014332	CAACA	2	10	32320	32329	60 %	0 %	0 %	40 %	301067967
29	NC_014332	ACTTT	2	10	34539	34548	20 %	60 %	0 %	20 %	301067968
30	NC_014332	CTTAT	2	10	35640	35649	20 %	60 %	0 %	20 %	301067969
31	NC_014332	GGGAT	2	10	36443	36452	20 %	20 %	60 %	0 %	301067970
32	NC_014332	AAACA	2	10	36624	36633	80 %	0 %	0 %	20 %	301067970
33	NC_014332	AAATC	2	10	39246	39255	60 %	20 %	0 %	20 %	301067972
34	NC_014332	TTTCC	2	10	39922	39931	0 %	60 %	0 %	40 %	301067973
35	NC_014332	TTTTG	2	10	42021	42030	0 %	80 %	20 %	0 %	301067978
36	NC_014332	ATAAG	2	10	42366	42375	60 %	20 %	20 %	0 %	301067979
37	NC_014332	GCAAA	2	10	43853	43862	60 %	0 %	20 %	20 %	301067980
38	NC_014332	GATAA	2	10	44513	44522	60 %	20 %	20 %	0 %	301067981
39	NC_014332	TTCTT	2	10	44971	44980	0 %	80 %	0 %	20 %	301067981
40	NC_014332	CTTCT	2	10	45823	45832	0 %	60 %	0 %	40 %	301067982
41	NC_014332	GAAAA	2	10	46726	46735	80 %	0 %	20 %	0 %	301067983
42	NC_014332	ATCTT	2	10	50087	50096	20 %	60 %	0 %	20 %	301067987
43	NC_014332	ATTTC	2	10	50621	50630	20 %	60 %	0 %	20 %	301067987
44	NC_014332	TAAAA	2	10	52247	52256	80 %	20 %	0 %	0 %	301067988
45	NC_014332	TTTTA	2	10	54264	54273	20 %	80 %	0 %	0 %	301067990
46	NC_014332	ATTTT	2	10	56881	56890	20 %	80 %	0 %	0 %	301067993
47	NC_014332	CCTTT	2	10	57929	57938	0 %	60 %	0 %	40 %	301067994
48	NC_014332	TAAAT	2	10	58710	58719	60 %	40 %	0 %	0 %	301067995
49	NC_014332	GTTTT	2	10	59421	59430	0 %	80 %	20 %	0 %	301067998
50	NC_014332	TAAAA	2	10	64887	64896	80 %	20 %	0 %	0 %	301068004
51	NC_014332	TATTT	2	10	65832	65841	20 %	80 %	0 %	0 %	301068006
52	NC_014332	TAAAG	2	10	69539	69548	60 %	20 %	20 %	0 %	301068011
53	NC_014332	GAAAT	2	10	69999	70008	60 %	20 %	20 %	0 %	301068011
54	NC_014332	AAATC	2	10	72852	72861	60 %	20 %	0 %	20 %	301068015
55	NC_014332	CTTCA	2	10	73494	73503	20 %	40 %	0 %	40 %	301068016
56	NC_014332	AACAA	2	10	78343	78352	80 %	0 %	0 %	20 %	301068021
57	NC_014332	TAATA	2	10	78563	78572	60 %	40 %	0 %	0 %	301068021
58	NC_014332	ACAAT	2	10	80004	80013	60 %	20 %	0 %	20 %	301068023
59	NC_014332	CAAAA	2	10	83267	83276	80 %	0 %	0 %	20 %	301068026
60	NC_014332	CATTT	2	10	85605	85614	20 %	60 %	0 %	20 %	301068029
61	NC_014332	TAATG	2	10	87253	87262	40 %	40 %	20 %	0 %	301068031
62	NC_014332	ATGCA	2	10	89720	89729	40 %	20 %	20 %	20 %	301068033
63	NC_014332	CATTC	2	10	90501	90510	20 %	40 %	0 %	40 %	301068035
64	NC_014332	AAATA	2	10	90540	90549	80 %	20 %	0 %	0 %	301068035
65	NC_014332	TTCCG	2	10	91593	91602	0 %	40 %	20 %	40 %	301068036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.