MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 2983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AAAAG	2	10	265	274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014330	AATAA	2	10	1802	1811	80 %	20 %	0 %	0 %	300869641
3	NC_014330	AAATT	2	10	2246	2255	60 %	40 %	0 %	0 %	300869641
4	NC_014330	AGACC	10	50	2432	2481	40 %	0 %	20 %	40 %	300869641
5	NC_014330	AAAAT	2	10	2729	2738	80 %	20 %	0 %	0 %	300869642
6	NC_014330	GTTTT	2	10	2932	2941	0 %	80 %	20 %	0 %	300869642
7	NC_014330	ATATA	2	10	3429	3438	60 %	40 %	0 %	0 %	300869642
8	NC_014330	TAATT	2	10	3869	3878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014330	TATTT	2	10	4558	4567	20 %	80 %	0 %	0 %	300869643
10	NC_014330	TATAA	2	10	5846	5855	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014330	TTAAT	2	10	6291	6300	40 %	60 %	0 %	0 %	300869645
12	NC_014330	TATAT	2	10	8107	8116	40 %	60 %	0 %	0 %	300869646
13	NC_014330	TATTT	2	10	8258	8267	20 %	80 %	0 %	0 %	300869646
14	NC_014330	TAATT	2	10	8603	8612	40 %	60 %	0 %	0 %	300869646
15	NC_014330	AAAAT	2	10	8971	8980	80 %	20 %	0 %	0 %	300869646
16	NC_014330	TTAAT	2	10	10174	10183	40 %	60 %	0 %	0 %	300869647
17	NC_014330	TTGCA	2	10	11029	11038	20 %	40 %	20 %	20 %	300869649
18	NC_014330	ACTTA	2	10	12619	12628	40 %	40 %	0 %	20 %	300869651
19	NC_014330	GAAAA	2	10	13372	13381	80 %	0 %	20 %	0 %	300869651
20	NC_014330	ATATT	2	10	13814	13823	40 %	60 %	0 %	0 %	300869652
21	NC_014330	GGATT	2	10	14521	14530	20 %	40 %	40 %	0 %	300869653
22	NC_014330	TGTAT	2	10	14628	14637	20 %	60 %	20 %	0 %	300869653
23	NC_014330	AACTA	2	10	15519	15528	60 %	20 %	0 %	20 %	300869654
24	NC_014330	TTATT	2	10	16328	16337	20 %	80 %	0 %	0 %	300869654
25	NC_014330	AAATT	2	10	16501	16510	60 %	40 %	0 %	0 %	300869654
26	NC_014330	ATTTT	2	10	18493	18502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014330	ATCTC	2	10	19407	19416	20 %	40 %	0 %	40 %	300869658
28	NC_014330	ATATT	2	10	19557	19566	40 %	60 %	0 %	0 %	300869658
29	NC_014330	GAAGA	2	10	20190	20199	60 %	0 %	40 %	0 %	300869659
30	NC_014330	AATAT	2	10	20332	20341	60 %	40 %	0 %	0 %	300869659
31	NC_014330	TTGTT	2	10	21644	21653	0 %	80 %	20 %	0 %	300869661
32	NC_014330	ATTTT	2	10	22396	22405	20 %	80 %	0 %	0 %	300869661
33	NC_014330	TGTAA	2	10	22541	22550	40 %	40 %	20 %	0 %	300869661
34	NC_014330	AAATA	2	10	23908	23917	80 %	20 %	0 %	0 %	300869662
35	NC_014330	TATGA	2	10	24785	24794	40 %	40 %	20 %	0 %	300869662
36	NC_014330	AAACT	2	10	27161	27170	60 %	20 %	0 %	20 %	300869665
37	NC_014330	TTATT	2	10	27818	27827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014330	TTTTA	2	10	28287	28296	20 %	80 %	0 %	0 %	300869666
39	NC_014330	ATTTT	2	10	29192	29201	20 %	80 %	0 %	0 %	300869667
40	NC_014330	GTTAT	2	10	29660	29669	20 %	60 %	20 %	0 %	300869667
41	NC_014330	TAGTT	2	10	30854	30863	20 %	60 %	20 %	0 %	300869669
42	NC_014330	TGCCT	2	10	31568	31577	0 %	40 %	20 %	40 %	300869669
43	NC_014330	TGATA	2	10	32027	32036	40 %	40 %	20 %	0 %	300869669
44	NC_014330	TTATA	2	10	32103	32112	40 %	60 %	0 %	0 %	300869669
45	NC_014330	ATAGA	2	10	32515	32524	60 %	20 %	20 %	0 %	300869669
46	NC_014330	TTCTT	2	10	33752	33761	0 %	80 %	0 %	20 %	300869671
47	NC_014330	ATTAT	2	10	35234	35243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014330	AATAG	2	10	37445	37454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014330	GGATT	2	10	38130	38139	20 %	40 %	40 %	0 %	300869674
50	NC_014330	ATATT	2	10	38387	38396	40 %	60 %	0 %	0 %	300869674
51	NC_014330	ATTTT	2	10	39243	39252	20 %	80 %	0 %	0 %	300869675
52	NC_014330	AATAA	2	10	39593	39602	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014330	TAATG	2	10	40570	40579	40 %	40 %	20 %	0 %	300869677
54	NC_014330	TTTTC	2	10	41563	41572	0 %	80 %	0 %	20 %	300869678
55	NC_014330	ACTAA	2	10	41587	41596	60 %	20 %	0 %	20 %	300869678
56	NC_014330	ATATT	2	10	42224	42233	40 %	60 %	0 %	0 %	300869678
57	NC_014330	TTTCT	2	10	43992	44001	0 %	80 %	0 %	20 %	300869680
58	NC_014330	TTTCA	2	10	46756	46765	20 %	60 %	0 %	20 %	300869682
59	NC_014330	AAGTA	2	10	46999	47008	60 %	20 %	20 %	0 %	300869682
60	NC_014330	CATTA	2	10	48467	48476	40 %	40 %	0 %	20 %	300869683
61	NC_014330	ATTTT	2	10	49716	49725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014330	GTATA	2	10	49813	49822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014330	ATATA	2	10	50122	50131	60 %	40 %	0 %	0 %	300869685
64	NC_014330	AGCAT	2	10	51718	51727	40 %	20 %	20 %	20 %	300869688
65	NC_014330	TACTA	2	10	52808	52817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014330	AATTA	2	10	55723	55732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014330	TTTTC	2	10	56000	56009	0 %	80 %	0 %	20 %	300869692
68	NC_014330	TTTGT	2	10	56438	56447	0 %	80 %	20 %	0 %	300869692
69	NC_014330	AATAA	2	10	58078	58087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014330	ATTTT	2	10	58419	58428	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014330	TATAA	2	10	59645	59654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014330	TAAAA	2	10	63194	63203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014330	TATTT	2	10	63270	63279	20 %	80 %	0 %	0 %	300869698
74	NC_014330	TTTAT	2	10	63357	63366	20 %	80 %	0 %	0 %	300869698
75	NC_014330	CTATA	2	10	65069	65078	40 %	40 %	0 %	20 %	300869699
76	NC_014330	AGCAG	2	10	65306	65315	40 %	0 %	40 %	20 %	300869699
77	NC_014330	TATTT	2	10	67523	67532	20 %	80 %	0 %	0 %	300869701
78	NC_014330	ATTTA	2	10	68896	68905	40 %	60 %	0 %	0 %	300869702
79	NC_014330	AATTT	2	10	70999	71008	40 %	60 %	0 %	0 %	300869704
80	NC_014330	TTATG	2	10	72633	72642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014330	TTTGT	2	10	72708	72717	0 %	80 %	20 %	0 %	300869706
82	NC_014330	ATTAT	2	10	73414	73423	40 %	60 %	0 %	0 %	300869706
83	NC_014330	AATTT	2	10	74053	74062	40 %	60 %	0 %	0 %	300869707
84	NC_014330	TATTT	2	10	75856	75865	20 %	80 %	0 %	0 %	300869707
85	NC_014330	AAATA	2	10	76975	76984	80 %	20 %	0 %	0 %	300869709
86	NC_014330	TAAAA	2	10	79402	79411	80 %	20 %	0 %	0 %	300869712
87	NC_014330	CTAAA	2	10	79888	79897	60 %	20 %	0 %	20 %	300869712
88	NC_014330	GAAAA	2	10	81262	81271	80 %	0 %	20 %	0 %	300869715
89	NC_014330	TAAAA	2	10	82324	82333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014330	TATAG	2	10	85212	85221	40 %	40 %	20 %	0 %	300869719
91	NC_014330	ATTTT	2	10	86790	86799	20 %	80 %	0 %	0 %	300869721
92	NC_014330	AAGCC	2	10	88524	88533	40 %	0 %	20 %	40 %	300869723
93	NC_014330	AGTAA	2	10	90753	90762	60 %	20 %	20 %	0 %	300869725
94	NC_014330	ATGGA	2	10	91228	91237	40 %	20 %	40 %	0 %	300869725
95	NC_014330	TTTAC	2	10	91694	91703	20 %	60 %	0 %	20 %	300869725
96	NC_014330	GATAC	2	10	92392	92401	40 %	20 %	20 %	20 %	300869725
97	NC_014330	TATAA	2	10	93737	93746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014330	TAAGC	2	10	94110	94119	40 %	20 %	20 %	20 %	300869727
99	NC_014330	ATTTT	2	10	94366	94375	20 %	80 %	0 %	0 %	300869727
100	NC_014330	TTAAA	2	10	96283	96292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014330	ATACT	2	10	99781	99790	40 %	40 %	0 %	20 %	300869730
102	NC_014330	ATCTT	2	10	100532	100541	20 %	60 %	0 %	20 %	300869731
103	NC_014330	ACTTG	2	10	101187	101196	20 %	40 %	20 %	20 %	300869732
104	NC_014330	TATTT	2	10	101851	101860	20 %	80 %	0 %	0 %	300869733
105	NC_014330	TACAA	2	10	102600	102609	60 %	20 %	0 %	20 %	300869734
106	NC_014330	AGCAC	2	10	102706	102715	40 %	0 %	20 %	40 %	300869734
107	NC_014330	TAATT	2	10	105328	105337	40 %	60 %	0 %	0 %	300869736
108	NC_014330	TTTTA	2	10	107388	107397	20 %	80 %	0 %	0 %	300869736
109	NC_014330	AATAC	2	10	107557	107566	60 %	20 %	0 %	20 %	300869736
110	NC_014330	ATTTA	2	10	108951	108960	40 %	60 %	0 %	0 %	300869737
111	NC_014330	TTAAG	2	10	109517	109526	40 %	40 %	20 %	0 %	300869737
112	NC_014330	CTGTA	2	10	110400	110409	20 %	40 %	20 %	20 %	300869738
113	NC_014330	TTTAA	2	10	110835	110844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014330	ATATT	2	10	111145	111154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014330	AAACT	2	10	112489	112498	60 %	20 %	0 %	20 %	300869740
116	NC_014330	TATCA	2	10	113355	113364	40 %	40 %	0 %	20 %	300869742
117	NC_014330	TTATT	2	10	114602	114611	20 %	80 %	0 %	0 %	300869743
118	NC_014330	TAAAT	2	10	115132	115141	60 %	40 %	0 %	0 %	300869744
119	NC_014330	ACTAA	2	10	115982	115991	60 %	20 %	0 %	20 %	300869745
120	NC_014330	CATTC	2	10	117177	117186	20 %	40 %	0 %	40 %	300869746
121	NC_014330	GTAAA	2	10	117580	117589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014330	ACCAA	2	10	118070	118079	60 %	0 %	0 %	40 %	300869747
123	NC_014330	TTATT	2	10	118501	118510	20 %	80 %	0 %	0 %	300869748
124	NC_014330	TAATA	2	10	119828	119837	60 %	40 %	0 %	0 %	300869750
125	NC_014330	ATATA	2	10	121471	121480	60 %	40 %	0 %	0 %	300869751
126	NC_014330	TTATT	2	10	121639	121648	20 %	80 %	0 %	0 %	300869752
127	NC_014330	GATTA	2	10	121858	121867	40 %	40 %	20 %	0 %	300869752
128	NC_014330	AAAAT	2	10	122415	122424	80 %	20 %	0 %	0 %	300869752
129	NC_014330	CTATG	2	10	123966	123975	20 %	40 %	20 %	20 %	300869754
130	NC_014330	CTATT	2	10	124073	124082	20 %	60 %	0 %	20 %	300869754
131	NC_014330	ATTAT	2	10	125468	125477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014330	AAATT	2	10	125887	125896	60 %	40 %	0 %	0 %	300869756
133	NC_014330	CTACC	2	10	126323	126332	20 %	20 %	0 %	60 %	300869756
134	NC_014330	AAGAC	2	10	127602	127611	60 %	0 %	20 %	20 %	300869756
135	NC_014330	CCCTA	2	10	128442	128451	20 %	20 %	0 %	60 %	300869757
136	NC_014330	TTAAA	2	10	128573	128582	60 %	40 %	0 %	0 %	300869757
137	NC_014330	TCTTT	2	10	129771	129780	0 %	80 %	0 %	20 %	300869758
138	NC_014330	AATTA	2	10	129942	129951	60 %	40 %	0 %	0 %	300869758
139	NC_014330	ATTAT	2	10	130934	130943	40 %	60 %	0 %	0 %	300869759
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