MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 2373

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AATAA	2	10	1802	1811	80 %	20 %	0 %	0 %	300869641
2	NC_014330	AAATT	2	10	2246	2255	60 %	40 %	0 %	0 %	300869641
3	NC_014330	AGACC	10	50	2432	2481	40 %	0 %	20 %	40 %	300869641
4	NC_014330	AAAAT	2	10	2729	2738	80 %	20 %	0 %	0 %	300869642
5	NC_014330	GTTTT	2	10	2932	2941	0 %	80 %	20 %	0 %	300869642
6	NC_014330	ATATA	2	10	3429	3438	60 %	40 %	0 %	0 %	300869642
7	NC_014330	TATTT	2	10	4558	4567	20 %	80 %	0 %	0 %	300869643
8	NC_014330	TTAAT	2	10	6291	6300	40 %	60 %	0 %	0 %	300869645
9	NC_014330	TATAT	2	10	8107	8116	40 %	60 %	0 %	0 %	300869646
10	NC_014330	TATTT	2	10	8258	8267	20 %	80 %	0 %	0 %	300869646
11	NC_014330	TAATT	2	10	8603	8612	40 %	60 %	0 %	0 %	300869646
12	NC_014330	AAAAT	2	10	8971	8980	80 %	20 %	0 %	0 %	300869646
13	NC_014330	TTAAT	2	10	10174	10183	40 %	60 %	0 %	0 %	300869647
14	NC_014330	TTGCA	2	10	11029	11038	20 %	40 %	20 %	20 %	300869649
15	NC_014330	ACTTA	2	10	12619	12628	40 %	40 %	0 %	20 %	300869651
16	NC_014330	GAAAA	2	10	13372	13381	80 %	0 %	20 %	0 %	300869651
17	NC_014330	ATATT	2	10	13814	13823	40 %	60 %	0 %	0 %	300869652
18	NC_014330	GGATT	2	10	14521	14530	20 %	40 %	40 %	0 %	300869653
19	NC_014330	TGTAT	2	10	14628	14637	20 %	60 %	20 %	0 %	300869653
20	NC_014330	AACTA	2	10	15519	15528	60 %	20 %	0 %	20 %	300869654
21	NC_014330	TTATT	2	10	16328	16337	20 %	80 %	0 %	0 %	300869654
22	NC_014330	AAATT	2	10	16501	16510	60 %	40 %	0 %	0 %	300869654
23	NC_014330	ATCTC	2	10	19407	19416	20 %	40 %	0 %	40 %	300869658
24	NC_014330	ATATT	2	10	19557	19566	40 %	60 %	0 %	0 %	300869658
25	NC_014330	GAAGA	2	10	20190	20199	60 %	0 %	40 %	0 %	300869659
26	NC_014330	AATAT	2	10	20332	20341	60 %	40 %	0 %	0 %	300869659
27	NC_014330	TTGTT	2	10	21644	21653	0 %	80 %	20 %	0 %	300869661
28	NC_014330	ATTTT	2	10	22396	22405	20 %	80 %	0 %	0 %	300869661
29	NC_014330	TGTAA	2	10	22541	22550	40 %	40 %	20 %	0 %	300869661
30	NC_014330	AAATA	2	10	23908	23917	80 %	20 %	0 %	0 %	300869662
31	NC_014330	TATGA	2	10	24785	24794	40 %	40 %	20 %	0 %	300869662
32	NC_014330	AAACT	2	10	27161	27170	60 %	20 %	0 %	20 %	300869665
33	NC_014330	TTTTA	2	10	28287	28296	20 %	80 %	0 %	0 %	300869666
34	NC_014330	ATTTT	2	10	29192	29201	20 %	80 %	0 %	0 %	300869667
35	NC_014330	GTTAT	2	10	29660	29669	20 %	60 %	20 %	0 %	300869667
36	NC_014330	TAGTT	2	10	30854	30863	20 %	60 %	20 %	0 %	300869669
37	NC_014330	TGCCT	2	10	31568	31577	0 %	40 %	20 %	40 %	300869669
38	NC_014330	TGATA	2	10	32027	32036	40 %	40 %	20 %	0 %	300869669
39	NC_014330	TTATA	2	10	32103	32112	40 %	60 %	0 %	0 %	300869669
40	NC_014330	ATAGA	2	10	32515	32524	60 %	20 %	20 %	0 %	300869669
41	NC_014330	TTCTT	2	10	33752	33761	0 %	80 %	0 %	20 %	300869671
42	NC_014330	GGATT	2	10	38130	38139	20 %	40 %	40 %	0 %	300869674
43	NC_014330	ATATT	2	10	38387	38396	40 %	60 %	0 %	0 %	300869674
44	NC_014330	ATTTT	2	10	39243	39252	20 %	80 %	0 %	0 %	300869675
45	NC_014330	TAATG	2	10	40570	40579	40 %	40 %	20 %	0 %	300869677
46	NC_014330	TTTTC	2	10	41563	41572	0 %	80 %	0 %	20 %	300869678
47	NC_014330	ACTAA	2	10	41587	41596	60 %	20 %	0 %	20 %	300869678
48	NC_014330	ATATT	2	10	42224	42233	40 %	60 %	0 %	0 %	300869678
49	NC_014330	TTTCT	2	10	43992	44001	0 %	80 %	0 %	20 %	300869680
50	NC_014330	TTTCA	2	10	46756	46765	20 %	60 %	0 %	20 %	300869682
51	NC_014330	AAGTA	2	10	46999	47008	60 %	20 %	20 %	0 %	300869682
52	NC_014330	CATTA	2	10	48467	48476	40 %	40 %	0 %	20 %	300869683
53	NC_014330	ATATA	2	10	50122	50131	60 %	40 %	0 %	0 %	300869685
54	NC_014330	AGCAT	2	10	51718	51727	40 %	20 %	20 %	20 %	300869688
55	NC_014330	TTTTC	2	10	56000	56009	0 %	80 %	0 %	20 %	300869692
56	NC_014330	TTTGT	2	10	56438	56447	0 %	80 %	20 %	0 %	300869692
57	NC_014330	TATTT	2	10	63270	63279	20 %	80 %	0 %	0 %	300869698
58	NC_014330	TTTAT	2	10	63357	63366	20 %	80 %	0 %	0 %	300869698
59	NC_014330	CTATA	2	10	65069	65078	40 %	40 %	0 %	20 %	300869699
60	NC_014330	AGCAG	2	10	65306	65315	40 %	0 %	40 %	20 %	300869699
61	NC_014330	TATTT	2	10	67523	67532	20 %	80 %	0 %	0 %	300869701
62	NC_014330	ATTTA	2	10	68896	68905	40 %	60 %	0 %	0 %	300869702
63	NC_014330	AATTT	2	10	70999	71008	40 %	60 %	0 %	0 %	300869704
64	NC_014330	TTTGT	2	10	72708	72717	0 %	80 %	20 %	0 %	300869706
65	NC_014330	ATTAT	2	10	73414	73423	40 %	60 %	0 %	0 %	300869706
66	NC_014330	AATTT	2	10	74053	74062	40 %	60 %	0 %	0 %	300869707
67	NC_014330	TATTT	2	10	75856	75865	20 %	80 %	0 %	0 %	300869707
68	NC_014330	AAATA	2	10	76975	76984	80 %	20 %	0 %	0 %	300869709
69	NC_014330	TAAAA	2	10	79402	79411	80 %	20 %	0 %	0 %	300869712
70	NC_014330	CTAAA	2	10	79888	79897	60 %	20 %	0 %	20 %	300869712
71	NC_014330	GAAAA	2	10	81262	81271	80 %	0 %	20 %	0 %	300869715
72	NC_014330	TATAG	2	10	85212	85221	40 %	40 %	20 %	0 %	300869719
73	NC_014330	ATTTT	2	10	86790	86799	20 %	80 %	0 %	0 %	300869721
74	NC_014330	AAGCC	2	10	88524	88533	40 %	0 %	20 %	40 %	300869723
75	NC_014330	AGTAA	2	10	90753	90762	60 %	20 %	20 %	0 %	300869725
76	NC_014330	ATGGA	2	10	91228	91237	40 %	20 %	40 %	0 %	300869725
77	NC_014330	TTTAC	2	10	91694	91703	20 %	60 %	0 %	20 %	300869725
78	NC_014330	GATAC	2	10	92392	92401	40 %	20 %	20 %	20 %	300869725
79	NC_014330	TAAGC	2	10	94110	94119	40 %	20 %	20 %	20 %	300869727
80	NC_014330	ATTTT	2	10	94366	94375	20 %	80 %	0 %	0 %	300869727
81	NC_014330	ATACT	2	10	99781	99790	40 %	40 %	0 %	20 %	300869730
82	NC_014330	ATCTT	2	10	100532	100541	20 %	60 %	0 %	20 %	300869731
83	NC_014330	ACTTG	2	10	101187	101196	20 %	40 %	20 %	20 %	300869732
84	NC_014330	TATTT	2	10	101851	101860	20 %	80 %	0 %	0 %	300869733
85	NC_014330	TACAA	2	10	102600	102609	60 %	20 %	0 %	20 %	300869734
86	NC_014330	AGCAC	2	10	102706	102715	40 %	0 %	20 %	40 %	300869734
87	NC_014330	TAATT	2	10	105328	105337	40 %	60 %	0 %	0 %	300869736
88	NC_014330	TTTTA	2	10	107388	107397	20 %	80 %	0 %	0 %	300869736
89	NC_014330	AATAC	2	10	107557	107566	60 %	20 %	0 %	20 %	300869736
90	NC_014330	ATTTA	2	10	108951	108960	40 %	60 %	0 %	0 %	300869737
91	NC_014330	TTAAG	2	10	109517	109526	40 %	40 %	20 %	0 %	300869737
92	NC_014330	CTGTA	2	10	110400	110409	20 %	40 %	20 %	20 %	300869738
93	NC_014330	AAACT	2	10	112489	112498	60 %	20 %	0 %	20 %	300869740
94	NC_014330	TATCA	2	10	113355	113364	40 %	40 %	0 %	20 %	300869742
95	NC_014330	TTATT	2	10	114602	114611	20 %	80 %	0 %	0 %	300869743
96	NC_014330	TAAAT	2	10	115132	115141	60 %	40 %	0 %	0 %	300869744
97	NC_014330	ACTAA	2	10	115982	115991	60 %	20 %	0 %	20 %	300869745
98	NC_014330	CATTC	2	10	117177	117186	20 %	40 %	0 %	40 %	300869746
99	NC_014330	ACCAA	2	10	118070	118079	60 %	0 %	0 %	40 %	300869747
100	NC_014330	TTATT	2	10	118501	118510	20 %	80 %	0 %	0 %	300869748
101	NC_014330	TAATA	2	10	119828	119837	60 %	40 %	0 %	0 %	300869750
102	NC_014330	ATATA	2	10	121471	121480	60 %	40 %	0 %	0 %	300869751
103	NC_014330	TTATT	2	10	121639	121648	20 %	80 %	0 %	0 %	300869752
104	NC_014330	GATTA	2	10	121858	121867	40 %	40 %	20 %	0 %	300869752
105	NC_014330	AAAAT	2	10	122415	122424	80 %	20 %	0 %	0 %	300869752
106	NC_014330	CTATG	2	10	123966	123975	20 %	40 %	20 %	20 %	300869754
107	NC_014330	CTATT	2	10	124073	124082	20 %	60 %	0 %	20 %	300869754
108	NC_014330	AAATT	2	10	125887	125896	60 %	40 %	0 %	0 %	300869756
109	NC_014330	CTACC	2	10	126323	126332	20 %	20 %	0 %	60 %	300869756
110	NC_014330	AAGAC	2	10	127602	127611	60 %	0 %	20 %	20 %	300869756
111	NC_014330	CCCTA	2	10	128442	128451	20 %	20 %	0 %	60 %	300869757
112	NC_014330	TTAAA	2	10	128573	128582	60 %	40 %	0 %	0 %	300869757
113	NC_014330	TCTTT	2	10	129771	129780	0 %	80 %	0 %	20 %	300869758
114	NC_014330	AATTA	2	10	129942	129951	60 %	40 %	0 %	0 %	300869758
115	NC_014330	ATTAT	2	10	130934	130943	40 %	60 %	0 %	0 %	300869759
116	NC_014330	TCTTT	2	10	131069	131078	0 %	80 %	0 %	20 %	300869760
117	NC_014330	TGTTA	2	10	132992	133001	20 %	60 %	20 %	0 %	300869761
118	NC_014330	AAAAT	2	10	133553	133562	80 %	20 %	0 %	0 %	300869762
119	NC_014330	ATTTT	2	10	134158	134167	20 %	80 %	0 %	0 %	300869763
120	NC_014330	TTTGT	2	10	134248	134257	0 %	80 %	20 %	0 %	300869763
121	NC_014330	TATTT	2	10	134720	134729	20 %	80 %	0 %	0 %	300869763
122	NC_014330	TCTAT	2	10	134844	134853	20 %	60 %	0 %	20 %	300869763
123	NC_014330	TATTT	2	10	136525	136534	20 %	80 %	0 %	0 %	300869765
124	NC_014330	AATTA	2	10	136840	136849	60 %	40 %	0 %	0 %	300869765
125	NC_014330	ATATT	2	10	137417	137426	40 %	60 %	0 %	0 %	300869765
126	NC_014330	TAATA	2	10	138261	138270	60 %	40 %	0 %	0 %	300869766
127	NC_014330	AAATC	2	10	138775	138784	60 %	20 %	0 %	20 %	300869766
128	NC_014330	TATAA	2	10	138804	138813	60 %	40 %	0 %	0 %	300869766
129	NC_014330	ATTAT	2	10	138898	138907	40 %	60 %	0 %	0 %	300869766
130	NC_014330	TTAAA	2	10	139052	139061	60 %	40 %	0 %	0 %	300869766
131	NC_014330	CTTTT	2	10	139376	139385	0 %	80 %	0 %	20 %	300869767
132	NC_014330	TTTTC	2	10	140926	140935	0 %	80 %	0 %	20 %	300869768
133	NC_014330	ATACT	2	10	143419	143428	40 %	40 %	0 %	20 %	300869769
134	NC_014330	TCCAG	2	10	145690	145699	20 %	20 %	20 %	40 %	300869771
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136	NC_014330	TTTGT	2	10	146969	146978	0 %	80 %	20 %	0 %	300869772
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