MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 5014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AGA	2	6	3	8	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014330	AAT	2	6	9	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014330	GTG	2	6	27	32	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014330	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014330	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014330	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014330	ATA	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014330	GAA	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014330	TGT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014330	TAA	2	6	344	349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014330	ATA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014330	GAG	2	6	394	399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014330	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014330	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014330	GAT	3	9	652	660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014330	ATT	2	6	695	700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014330	ATT	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014330	TGG	2	6	747	752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014330	AAT	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014330	GAT	3	9	829	837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014330	TTA	2	6	859	864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014330	AAT	2	6	895	900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014330	ATA	2	6	904	909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014330	ATG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014330	ATT	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014330	TAT	2	6	994	999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014330	TAA	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014330	ATT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014330	TAA	2	6	2516	2521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014330	TAA	2	6	3880	3885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014330	ATA	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014330	TTA	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014330	TAG	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014330	TGT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014330	TAA	2	6	5172	5177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014330	AGT	2	6	5197	5202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014330	ATA	2	6	5270	5275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014330	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014330	TAA	2	6	7280	7285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014330	TTA	2	6	7289	7294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014330	TAA	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014330	TAA	3	9	10215	10223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014330	TAT	2	6	10226	10231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014330	AAG	2	6	10240	10245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014330	TAT	2	6	10583	10588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014330	TAA	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014330	CGT	2	6	10736	10741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014330	CAA	2	6	10773	10778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014330	AGA	3	9	10805	10813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014330	TAA	2	6	11518	11523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014330	AGG	2	6	13400	13405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014330	TAA	2	6	14146	14151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014330	ATT	2	6	14167	14172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014330	TAT	2	6	14194	14199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014330	TTA	2	6	14202	14207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014330	TAT	2	6	16655	16660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014330	TAT	2	6	16712	16717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014330	TAT	2	6	16726	16731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014330	ATT	2	6	18345	18350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014330	TTA	2	6	18356	18361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014330	TTA	2	6	18409	18414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014330	GTA	2	6	18445	18450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014330	TGA	2	6	20106	20111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014330	TTA	2	6	22710	22715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014330	ATT	3	9	22725	22733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014330	ATA	2	6	26643	26648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014330	ATT	2	6	27455	27460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014330	AAT	2	6	27482	27487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014330	TCA	2	6	27518	27523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014330	ATT	2	6	27571	27576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014330	ATA	2	6	27595	27600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014330	AAT	2	6	27621	27626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014330	TTA	2	6	27648	27653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014330	ATC	2	6	27655	27660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014330	AGG	2	6	27667	27672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014330	ATT	2	6	27684	27689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014330	GTA	2	6	27738	27743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014330	ATA	2	6	27759	27764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014330	AAT	2	6	27765	27770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014330	AGG	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014330	ATA	2	6	29168	29173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014330	TAT	2	6	35225	35230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014330	ATA	2	6	35244	35249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014330	TAT	2	6	35250	35255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014330	ATT	3	9	36655	36663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014330	ATT	2	6	37411	37416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014330	ATT	2	6	39775	39780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014330	TAT	2	6	41360	41365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014330	ATT	2	6	41368	41373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014330	ATT	2	6	43667	43672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014330	TAT	2	6	43681	43686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014330	TAT	2	6	43738	43743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014330	TAC	2	6	46186	46191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014330	TAA	2	6	46198	46203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014330	TCC	2	6	49708	49713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014330	AAT	2	6	51385	51390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014330	TAT	2	6	52749	52754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014330	TTA	2	6	52826	52831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014330	AAT	2	6	52832	52837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014330	TAA	2	6	52840	52845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014330	AGA	2	6	52882	52887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014330	TGG	2	6	52912	52917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014330	CTT	2	6	52960	52965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014330	AAG	2	6	53002	53007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014330	TAA	2	6	53023	53028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014330	AAC	2	6	53196	53201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014330	ATT	2	6	54459	54464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014330	TAT	2	6	54740	54745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014330	ACC	2	6	55648	55653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014330	TTC	2	6	55755	55760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014330	AGT	2	6	55829	55834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014330	TTA	2	6	56500	56505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014330	AAT	2	6	56585	56590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014330	ATA	2	6	56603	56608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014330	CTA	2	6	56611	56616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014330	AAG	2	6	58015	58020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014330	CTT	2	6	58036	58041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014330	TGA	2	6	58042	58047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014330	TGG	2	6	58126	58131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014330	CTT	2	6	58174	58179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014330	AAG	2	6	58215	58220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014330	TAA	2	6	58248	58253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014330	TAT	2	6	58279	58284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014330	TAG	2	6	58286	58291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014330	GCG	2	6	58324	58329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014330	TTA	2	6	58368	58373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014330	TAA	2	6	59627	59632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014330	ATA	2	6	59658	59663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014330	ATT	2	6	59700	59705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014330	ATA	2	6	59714	59719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014330	AGA	2	6	59763	59768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014330	GAA	2	6	59820	59825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014330	ATT	2	6	59828	59833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014330	AAG	2	6	59845	59850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014330	ATT	2	6	59901	59906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014330	ATA	2	6	59943	59948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014330	TAT	2	6	59956	59961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014330	TAT	2	6	59976	59981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014330	TAT	3	9	60669	60677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014330	ATA	2	6	62822	62827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014330	AAT	2	6	62865	62870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014330	TTA	2	6	63043	63048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014330	TAT	2	6	66191	66196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014330	TAT	2	6	68242	68247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_014330	TAA	2	6	241284	241289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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