MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014329	AGCTTC	2	12	21471	21482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014329	TTTTCT	2	12	22073	22084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014329	CAGAAG	2	12	74761	74772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014329	CTCACT	2	12	121052	121063	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014329	TGGGCG	2	12	135396	135407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014329	TGGGGC	2	12	182626	182637	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014329	GAAAAA	2	12	188052	188063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014329	TTTGCC	2	12	321027	321038	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014329	ACGGTA	2	12	322099	322110	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014329	TTCCTC	2	12	347101	347112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014329	GCTATA	2	12	378671	378682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014329	ACGTTG	2	12	379200	379211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014329	TGAGTA	2	12	390467	390478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014329	CTAAAA	2	12	397555	397566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014329	AAAAGC	2	12	408118	408129	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014329	AGGGCT	2	12	429768	429779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014329	GTGCCT	2	12	480590	480601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014329	CCCCCG	2	12	522928	522939	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
19	NC_014329	GCGCAA	2	12	524656	524667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014329	GGGTGT	2	12	618585	618596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014329	GTTTTT	2	12	620621	620632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014329	AGCGAA	2	12	621698	621709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014329	TGCGCG	2	12	645972	645983	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014329	GGCTGC	2	12	770337	770348	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014329	AATTTA	2	12	790927	790938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014329	AGGGGT	2	12	874445	874456	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014329	CCGTGC	2	12	939395	939406	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014329	GTGGTT	2	12	966325	966336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014329	GTCGAA	2	12	1022282	1022293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014329	GGGTGT	2	12	1029618	1029629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014329	GTTTTT	2	12	1031654	1031665	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014329	AGCGAA	2	12	1032731	1032742	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014329	TCAACT	2	12	1085357	1085368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014329	GCGTCC	2	12	1102465	1102476	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014329	TTTTAT	2	12	1137052	1137063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014329	AGAAAA	2	12	1150913	1150924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014329	TCTTTT	2	12	1150934	1150945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014329	CAGCCA	2	12	1178955	1178966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014329	AAGCTC	2	12	1207771	1207782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014329	CAAGAA	2	12	1289728	1289739	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014329	AATCTA	2	12	1417178	1417189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014329	TATTTC	2	12	1431325	1431336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014329	GACGGT	2	12	1450207	1450218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014329	GTCTGT	2	12	1477938	1477949	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014329	AATTTC	2	12	1511370	1511381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014329	CTGTGC	2	12	1551755	1551766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014329	TTGTGT	2	12	1640460	1640471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014329	ATTTTT	2	12	1754217	1754228	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014329	ACCCCT	2	12	1769252	1769263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014329	AAAAGA	2	12	1815164	1815175	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014329	AGCTTT	2	12	1816363	1816374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014329	ACCTTT	2	12	1835762	1835773	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014329	TTCGCT	2	12	1857869	1857880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014329	AAAAAC	2	12	1858946	1858957	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014329	CACCCA	2	12	1860983	1860994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014329	TAATTT	2	12	1935991	1936002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014329	AAACAA	2	12	1952358	1952369	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014329	CATTAT	2	12	1978733	1978744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014329	ACAGCC	2	12	1982207	1982218	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014329	TACCCC	2	12	2043990	2044001	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014329	CATATA	2	12	2058753	2058764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014329	TTCAAT	2	12	2071343	2071354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014329	GCACGC	2	12	2072565	2072576	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014329	TTTAGT	2	12	2097697	2097708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014329	CCCCCG	2	12	2124581	2124592	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_014329	CATAGA	2	12	2189443	2189454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014329	AGAAAA	2	12	2197784	2197795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014329	TTCGCT	2	12	2231071	2231082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014329	AAAAAC	2	12	2232148	2232159	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014329	CACCCA	2	12	2234185	2234196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014329	TTTTCT	2	12	2327567	2327578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.