MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 1302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014329	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	300857418
2	NC_014329	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	300857422
3	NC_014329	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014329	ACGTA	2	10	14248	14257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014329	CAGTA	2	10	14631	14640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014329	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	300857431
7	NC_014329	AAAAT	2	10	16762	16771	80 %	20 %	0 %	0 %	300857432
8	NC_014329	TAGCG	2	10	18330	18339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014329	CTTTT	2	10	19237	19246	0 %	80 %	0 %	20 %	300857436
10	NC_014329	GCTCT	2	10	19274	19283	0 %	40 %	20 %	40 %	300857436
11	NC_014329	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	300857445
12	NC_014329	TGCGT	2	10	24499	24508	0 %	40 %	40 %	20 %	300857446
13	NC_014329	CTGAT	2	10	28530	28539	20 %	40 %	20 %	20 %	300857450
14	NC_014329	GGAGC	2	10	29483	29492	20 %	0 %	60 %	20 %	300857451
15	NC_014329	TTGCT	2	10	30571	30580	0 %	60 %	20 %	20 %	300857452
16	NC_014329	TGAGG	2	10	37404	37413	20 %	20 %	60 %	0 %	300857456
17	NC_014329	CACAT	2	10	39588	39597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014329	TGCGG	2	10	40521	40530	0 %	20 %	60 %	20 %	300857460
19	NC_014329	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	300857466
20	NC_014329	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	300857466
21	NC_014329	CAGTG	2	10	49244	49253	20 %	20 %	40 %	20 %	300857468
22	NC_014329	TGAGA	2	10	49586	49595	40 %	20 %	40 %	0 %	300857468
23	NC_014329	AGTGA	2	10	49636	49645	40 %	20 %	40 %	0 %	300857468
24	NC_014329	TTGGA	2	10	52672	52681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014329	TTGAT	2	10	52707	52716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014329	TGCAC	2	10	52801	52810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014329	CTGGC	2	10	53060	53069	0 %	20 %	40 %	40 %	300857472
28	NC_014329	GCAGC	2	10	53559	53568	20 %	0 %	40 %	40 %	300857472
29	NC_014329	GACTG	2	10	53575	53584	20 %	20 %	40 %	20 %	300857472
30	NC_014329	AAGGC	2	10	55816	55825	40 %	0 %	40 %	20 %	300857474
31	NC_014329	ATGGC	2	10	58676	58685	20 %	20 %	40 %	20 %	300857478
32	NC_014329	ATGTG	2	10	62845	62854	20 %	40 %	40 %	0 %	300857482
33	NC_014329	TCTGT	2	10	64665	64674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014329	GCTGG	2	10	65006	65015	0 %	20 %	60 %	20 %	300857484
35	NC_014329	AGGGA	2	10	67614	67623	40 %	0 %	60 %	0 %	300857486
36	NC_014329	AAGAT	2	10	69421	69430	60 %	20 %	20 %	0 %	300857488
37	NC_014329	GGAGC	2	10	69528	69537	20 %	0 %	60 %	20 %	300857488
38	NC_014329	GGTCT	2	10	71242	71251	0 %	40 %	40 %	20 %	300857490
39	NC_014329	CATGT	2	10	71818	71827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014329	CAGCG	2	10	72698	72707	20 %	0 %	40 %	40 %	300857491
41	NC_014329	CAGGC	2	10	73104	73113	20 %	0 %	40 %	40 %	300857491
42	NC_014329	ATGGC	2	10	73949	73958	20 %	20 %	40 %	20 %	300857492
43	NC_014329	AGGCA	2	10	75269	75278	40 %	0 %	40 %	20 %	300857493
44	NC_014329	TAATT	2	10	76515	76524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014329	GCTTT	2	10	81110	81119	0 %	60 %	20 %	20 %	300857500
46	NC_014329	TGACC	2	10	81366	81375	20 %	20 %	20 %	40 %	300857500
47	NC_014329	CGTTA	2	10	82108	82117	20 %	40 %	20 %	20 %	300857501
48	NC_014329	TGCTG	2	10	82742	82751	0 %	40 %	40 %	20 %	300857501
49	NC_014329	TGGCC	2	10	84733	84742	0 %	20 %	40 %	40 %	300857502
50	NC_014329	GCGAC	2	10	85537	85546	20 %	0 %	40 %	40 %	300857502
51	NC_014329	TGGGA	2	10	88952	88961	20 %	20 %	60 %	0 %	300857508
52	NC_014329	GATCG	2	10	90051	90060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014329	CAAAA	2	10	90783	90792	80 %	0 %	0 %	20 %	300857510
54	NC_014329	AACAA	2	10	93624	93633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014329	TGCAA	2	10	96631	96640	40 %	20 %	20 %	20 %	300857515
56	NC_014329	TGCAG	2	10	96851	96860	20 %	20 %	40 %	20 %	300857515
57	NC_014329	AGGTC	2	10	99287	99296	20 %	20 %	40 %	20 %	300857518
58	NC_014329	ACCAA	2	10	101146	101155	60 %	0 %	0 %	40 %	300857518
59	NC_014329	TCATC	2	10	102409	102418	20 %	40 %	0 %	40 %	300857519
60	NC_014329	TGCAC	2	10	104224	104233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014329	ACCTG	2	10	104439	104448	20 %	20 %	20 %	40 %	300857520
62	NC_014329	CGGTG	2	10	104648	104657	0 %	20 %	60 %	20 %	300857520
63	NC_014329	CGGCG	2	10	107267	107276	0 %	0 %	60 %	40 %	300857523
64	NC_014329	CGCGG	2	10	107327	107336	0 %	0 %	60 %	40 %	300857524
65	NC_014329	CAGCG	2	10	107863	107872	20 %	0 %	40 %	40 %	300857525
66	NC_014329	GGATC	2	10	118429	118438	20 %	20 %	40 %	20 %	300857537
67	NC_014329	TGTTT	2	10	120902	120911	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014329	CGGGA	2	10	125546	125555	20 %	0 %	60 %	20 %	300857542
69	NC_014329	GACTG	2	10	127807	127816	20 %	20 %	40 %	20 %	300857545
70	NC_014329	TTGGT	2	10	129116	129125	0 %	60 %	40 %	0 %	300857545
71	NC_014329	TTAAG	2	10	130900	130909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014329	GTGCG	2	10	131440	131449	0 %	20 %	60 %	20 %	300857547
73	NC_014329	GTGGC	2	10	133177	133186	0 %	20 %	60 %	20 %	300857549
74	NC_014329	CGCGT	2	10	133497	133506	0 %	20 %	40 %	40 %	300857550
75	NC_014329	GGGGC	2	10	133625	133634	0 %	0 %	80 %	20 %	300857550
76	NC_014329	AGACG	2	10	135430	135439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014329	GGGGC	2	10	135648	135657	0 %	0 %	80 %	20 %	300857552
78	NC_014329	ACGGT	2	10	136804	136813	20 %	20 %	40 %	20 %	300857553
79	NC_014329	CGATC	2	10	137077	137086	20 %	20 %	20 %	40 %	300857553
80	NC_014329	TGGCC	2	10	137284	137293	0 %	20 %	40 %	40 %	300857553
81	NC_014329	TGGTG	2	10	137662	137671	0 %	40 %	60 %	0 %	300857553
82	NC_014329	GGAGT	2	10	138134	138143	20 %	20 %	60 %	0 %	300857553
83	NC_014329	ATTGC	2	10	142068	142077	20 %	40 %	20 %	20 %	300857556
84	NC_014329	AAAAC	2	10	144894	144903	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014329	TCACT	2	10	145939	145948	20 %	40 %	0 %	40 %	300857560
86	NC_014329	ATTTC	2	10	146556	146565	20 %	60 %	0 %	20 %	300857560
87	NC_014329	AATGG	2	10	150256	150265	40 %	20 %	40 %	0 %	300857563
88	NC_014329	GTGAG	2	10	151239	151248	20 %	20 %	60 %	0 %	300857565
89	NC_014329	CTGAA	2	10	152037	152046	40 %	20 %	20 %	20 %	300857565
90	NC_014329	CCAGC	2	10	153329	153338	20 %	0 %	20 %	60 %	300857566
91	NC_014329	TTGCC	2	10	153839	153848	0 %	40 %	20 %	40 %	300857567
92	NC_014329	GTACC	2	10	155798	155807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014329	TACGC	2	10	156355	156364	20 %	20 %	20 %	40 %	300857570
94	NC_014329	GCGAC	2	10	159849	159858	20 %	0 %	40 %	40 %	300857574
95	NC_014329	GGTTG	2	10	161125	161134	0 %	40 %	60 %	0 %	300857576
96	NC_014329	CCTTG	2	10	161501	161510	0 %	40 %	20 %	40 %	300857577
97	NC_014329	GCATA	2	10	163225	163234	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014329	TGTGC	2	10	164448	164457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014329	CGGTG	2	10	165471	165480	0 %	20 %	60 %	20 %	300857580
100	NC_014329	CATGG	2	10	167604	167613	20 %	20 %	40 %	20 %	300857582
101	NC_014329	CAGAT	2	10	167960	167969	40 %	20 %	20 %	20 %	300857582
102	NC_014329	GGATG	2	10	168858	168867	20 %	20 %	60 %	0 %	300857582
103	NC_014329	GGGAC	2	10	171484	171493	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014329	CACTT	2	10	171664	171673	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014329	AAACT	2	10	172542	172551	60 %	20 %	0 %	20 %	300857584
106	NC_014329	ACCGG	2	10	172937	172946	20 %	0 %	40 %	40 %	300857584
107	NC_014329	ATTGA	2	10	178747	178756	40 %	40 %	20 %	0 %	300857588
108	NC_014329	GTGGA	2	10	181156	181165	20 %	20 %	60 %	0 %	300857589
109	NC_014329	TTAAG	2	10	184488	184497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014329	TGACC	2	10	185406	185415	20 %	20 %	20 %	40 %	300857592
111	NC_014329	AGGTG	2	10	186359	186368	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014329	TTGCA	2	10	186692	186701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014329	GTTTG	2	10	188631	188640	0 %	60 %	40 %	0 %	300857594
114	NC_014329	CGGAT	2	10	189571	189580	20 %	20 %	40 %	20 %	300857595
115	NC_014329	AGCGC	2	10	190729	190738	20 %	0 %	40 %	40 %	300857596
116	NC_014329	GCAGT	2	10	192216	192225	20 %	20 %	40 %	20 %	300857597
117	NC_014329	CAATG	2	10	192487	192496	40 %	20 %	20 %	20 %	300857597
118	NC_014329	TAACG	2	10	193462	193471	40 %	20 %	20 %	20 %	300857598
119	NC_014329	AAGCC	2	10	194789	194798	40 %	0 %	20 %	40 %	300857599
120	NC_014329	GGCCC	2	10	196861	196870	0 %	0 %	40 %	60 %	300857602
121	NC_014329	GAATT	2	10	200426	200435	40 %	40 %	20 %	0 %	300857607
122	NC_014329	CAAGG	2	10	201315	201324	40 %	0 %	40 %	20 %	300857607
123	NC_014329	GATGG	2	10	203764	203773	20 %	20 %	60 %	0 %	300857608
124	NC_014329	TGGCG	2	10	204498	204507	0 %	20 %	60 %	20 %	300857609
125	NC_014329	TGCCA	2	10	206521	206530	20 %	20 %	20 %	40 %	300857610
126	NC_014329	AAATA	2	10	206623	206632	80 %	20 %	0 %	0 %	300857610
127	NC_014329	ATTCT	2	10	207219	207228	20 %	60 %	0 %	20 %	300857611
128	NC_014329	CAGGC	2	10	212036	212045	20 %	0 %	40 %	40 %	300857616
129	NC_014329	TTGTA	2	10	212446	212455	20 %	60 %	20 %	0 %	300857617
130	NC_014329	GCGAC	2	10	216962	216971	20 %	0 %	40 %	40 %	300857622
131	NC_014329	AGATC	2	10	216987	216996	40 %	20 %	20 %	20 %	300857622
132	NC_014329	CAAGG	2	10	217901	217910	40 %	0 %	40 %	20 %	300857623
133	NC_014329	AGAAA	2	10	218630	218639	80 %	0 %	20 %	0 %	300857624
134	NC_014329	CGGGG	2	10	224664	224673	0 %	0 %	80 %	20 %	300857631
135	NC_014329	GAAAA	2	10	224803	224812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014329	CGAGA	2	10	225443	225452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014329	TGCGC	2	10	227104	227113	0 %	20 %	40 %	40 %	300857634
138	NC_014329	CACTG	2	10	228264	228273	20 %	20 %	20 %	40 %	300857635
139	NC_014329	CATTG	2	10	228953	228962	20 %	40 %	20 %	20 %	300857636
140	NC_014329	CAAAA	2	10	229068	229077	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_014329	CGCAG	2	10	247959	247968	20 %	0 %	40 %	40 %	300857652
152	NC_014329	CATGC	2	10	249730	249739	20 %	20 %	20 %	40 %	300857653
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177	NC_014329	GCAGG	2	10	291220	291229	20 %	0 %	60 %	20 %	300857692
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188	NC_014329	TGCGA	2	10	310701	310710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
189	NC_014329	TGTTC	2	10	312333	312342	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_014329	GCTAC	2	10	428996	429005	20 %	20 %	20 %	40 %	300857831
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263	NC_014329	GATGT	2	10	447550	447559	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014329	GTCGC	2	10	448184	448193	0 %	20 %	40 %	40 %	300857853
265	NC_014329	GGTGG	2	10	451436	451445	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
266	NC_014329	GCATC	2	10	452719	452728	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
267	NC_014329	CGCAA	2	10	452899	452908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_014329	GCTGT	2	10	453666	453675	0 %	40 %	40 %	20 %	300857858
269	NC_014329	CGATC	2	10	453794	453803	20 %	20 %	20 %	40 %	300857859
270	NC_014329	TGCGC	2	10	453937	453946	0 %	20 %	40 %	40 %	300857859
271	NC_014329	GACCT	2	10	455894	455903	20 %	20 %	20 %	40 %	300857861
272	NC_014329	GGGTT	2	10	456021	456030	0 %	40 %	60 %	0 %	300857861
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275	NC_014329	CGAGA	2	10	459237	459246	40 %	0 %	40 %	20 %	300857866
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277	NC_014329	TGATG	2	10	460293	460302	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014329	AGGTG	2	10	462216	462225	20 %	20 %	60 %	0 %	300857868
279	NC_014329	TTCTG	2	10	463204	463213	0 %	60 %	20 %	20 %	300857870
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281	NC_014329	ATCTG	2	10	464969	464978	20 %	40 %	20 %	20 %	300857871
282	NC_014329	CCATT	2	10	466060	466069	20 %	40 %	0 %	40 %	300857872
283	NC_014329	TTTCT	2	10	467176	467185	0 %	80 %	0 %	20 %	300857873
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285	NC_014329	CCGTG	2	10	467935	467944	0 %	20 %	40 %	40 %	300857874
286	NC_014329	TGCCT	2	10	468643	468652	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
287	NC_014329	CTTTG	2	10	475160	475169	0 %	60 %	20 %	20 %	300857880
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289	NC_014329	GTCTT	2	10	476703	476712	0 %	60 %	20 %	20 %	300857882
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303	NC_014329	AGGGG	2	10	500870	500879	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014329	TCCCA	2	10	510473	510482	20 %	20 %	0 %	60 %	300857910
305	NC_014329	CTTCT	2	10	511933	511942	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
306	NC_014329	GCGTC	2	10	512176	512185	0 %	20 %	40 %	40 %	300857913
307	NC_014329	TAGCT	2	10	514179	514188	20 %	40 %	20 %	20 %	300857915
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342	NC_014329	CTTGG	2	10	575711	575720	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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351	NC_014329	GACTG	2	10	584303	584312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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373	NC_014329	TCGTG	2	10	620136	620145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
374	NC_014329	CGTCA	2	10	620472	620481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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378	NC_014329	TGACA	2	10	624143	624152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
379	NC_014329	TGTGT	2	10	624158	624167	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
380	NC_014329	CAAAT	2	10	625618	625627	60 %	20 %	0 %	20 %	300858009
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400	NC_014329	CGTAG	2	10	663573	663582	20 %	20 %	40 %	20 %	300858045
401	NC_014329	TTTCA	2	10	666170	666179	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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497	NC_014329	TAATG	2	10	847874	847883	40 %	40 %	20 %	0 %	300858217
498	NC_014329	CCTTG	2	10	850674	850683	0 %	40 %	20 %	40 %	300858220
499	NC_014329	GCCTA	2	10	851289	851298	20 %	20 %	20 %	40 %	300858220
500	NC_014329	GTTAA	2	10	853734	853743	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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