MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 chromosome

Total Repeats: 4948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014329	TTCC	2	8	709	716	0 %	50 %	0 %	50 %	300857418
2	NC_014329	AGCC	2	8	856	863	25 %	0 %	25 %	50 %	300857418
3	NC_014329	ATGC	2	8	921	928	25 %	25 %	25 %	25 %	300857418
4	NC_014329	CAGG	2	8	1028	1035	25 %	0 %	50 %	25 %	300857418
5	NC_014329	TACG	2	8	1222	1229	25 %	25 %	25 %	25 %	300857418
6	NC_014329	GATG	2	8	1559	1566	25 %	25 %	50 %	0 %	300857418
7	NC_014329	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014329	GAAG	2	8	2428	2435	50 %	0 %	50 %	0 %	300857419
9	NC_014329	CCCA	2	8	2483	2490	25 %	0 %	0 %	75 %	300857419
10	NC_014329	CTGC	2	8	2768	2775	0 %	25 %	25 %	50 %	300857419
11	NC_014329	GAAA	2	8	3254	3261	75 %	0 %	25 %	0 %	300857419
12	NC_014329	TTAC	2	8	3397	3404	25 %	50 %	0 %	25 %	300857419
13	NC_014329	TCGT	2	8	3682	3689	0 %	50 %	25 %	25 %	300857420
14	NC_014329	AAGG	2	8	4838	4845	50 %	0 %	50 %	0 %	300857420
15	NC_014329	ATAC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	300857421
16	NC_014329	ATGC	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	300857422
17	NC_014329	TCGC	2	8	8249	8256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014329	GAAA	2	8	8469	8476	75 %	0 %	25 %	0 %	300857424
19	NC_014329	ACTC	2	8	9476	9483	25 %	25 %	0 %	50 %	300857426
20	NC_014329	CAAC	2	8	9634	9641	50 %	0 %	0 %	50 %	300857426
21	NC_014329	GCAT	2	8	9729	9736	25 %	25 %	25 %	25 %	300857426
22	NC_014329	CACG	2	8	10760	10767	25 %	0 %	25 %	50 %	300857426
23	NC_014329	TTAG	2	8	11986	11993	25 %	50 %	25 %	0 %	300857427
24	NC_014329	TCGC	2	8	12464	12471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014329	GGAT	2	8	12474	12481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014329	TTCC	2	8	12741	12748	0 %	50 %	0 %	50 %	300857428
27	NC_014329	GCTA	2	8	12809	12816	25 %	25 %	25 %	25 %	300857428
28	NC_014329	GCCT	2	8	12828	12835	0 %	25 %	25 %	50 %	300857428
29	NC_014329	TTGT	2	8	13535	13542	0 %	75 %	25 %	0 %	300857429
30	NC_014329	GCCC	2	8	13685	13692	0 %	0 %	25 %	75 %	300857429
31	NC_014329	AGTG	2	8	13934	13941	25 %	25 %	50 %	0 %	300857429
32	NC_014329	TGGG	2	8	14428	14435	0 %	25 %	75 %	0 %	300857430
33	NC_014329	AATC	2	8	14958	14965	50 %	25 %	0 %	25 %	300857431
34	NC_014329	AAAG	2	8	15050	15057	75 %	0 %	25 %	0 %	300857431
35	NC_014329	AGCT	2	8	15349	15356	25 %	25 %	25 %	25 %	300857431
36	NC_014329	AAGG	2	8	15669	15676	50 %	0 %	50 %	0 %	300857431
37	NC_014329	TTTA	2	8	16066	16073	25 %	75 %	0 %	0 %	300857432
38	NC_014329	GCCA	2	8	16975	16982	25 %	0 %	25 %	50 %	300857433
39	NC_014329	GCTT	2	8	17832	17839	0 %	50 %	25 %	25 %	300857434
40	NC_014329	ACCG	2	8	18834	18841	25 %	0 %	25 %	50 %	300857435
41	NC_014329	CAAT	2	8	19220	19227	50 %	25 %	0 %	25 %	300857436
42	NC_014329	GAAA	2	8	20226	20233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014329	CGTG	2	8	20897	20904	0 %	25 %	50 %	25 %	300857439
44	NC_014329	TCCC	2	8	21084	21091	0 %	25 %	0 %	75 %	300857440
45	NC_014329	TTCC	2	8	21949	21956	0 %	50 %	0 %	50 %	300857443
46	NC_014329	TACC	2	8	22256	22263	25 %	25 %	0 %	50 %	300857444
47	NC_014329	AGCG	2	8	23047	23054	25 %	0 %	50 %	25 %	300857445
48	NC_014329	TTGA	2	8	23236	23243	25 %	50 %	25 %	0 %	300857445
49	NC_014329	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014329	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014329	CCTG	2	8	24581	24588	0 %	25 %	25 %	50 %	300857446
52	NC_014329	GGTG	2	8	24975	24982	0 %	25 %	75 %	0 %	300857446
53	NC_014329	TGAG	2	8	25492	25499	25 %	25 %	50 %	0 %	300857447
54	NC_014329	GGTG	2	8	25685	25692	0 %	25 %	75 %	0 %	300857447
55	NC_014329	AATT	2	8	27657	27664	50 %	50 %	0 %	0 %	300857449
56	NC_014329	TGGA	2	8	27814	27821	25 %	25 %	50 %	0 %	300857449
57	NC_014329	GAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	300857449
58	NC_014329	GAAA	2	8	28630	28637	75 %	0 %	25 %	0 %	300857450
59	NC_014329	CTTC	2	8	28639	28646	0 %	50 %	0 %	50 %	300857450
60	NC_014329	AGAA	2	8	28671	28678	75 %	0 %	25 %	0 %	300857450
61	NC_014329	GCTA	2	8	29130	29137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014329	TGAG	2	8	29778	29785	25 %	25 %	50 %	0 %	300857452
63	NC_014329	GTAC	2	8	29979	29986	25 %	25 %	25 %	25 %	300857452
64	NC_014329	GATC	2	8	30588	30595	25 %	25 %	25 %	25 %	300857452
65	NC_014329	GGAA	2	8	31726	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	300857453
66	NC_014329	TGGC	2	8	31988	31995	0 %	25 %	50 %	25 %	300857453
67	NC_014329	GGTT	2	8	32233	32240	0 %	50 %	50 %	0 %	300857453
68	NC_014329	CTGA	2	8	32265	32272	25 %	25 %	25 %	25 %	300857453
69	NC_014329	GGAC	2	8	33589	33596	25 %	0 %	50 %	25 %	300857454
70	NC_014329	GATA	2	8	34335	34342	50 %	25 %	25 %	0 %	300857454
71	NC_014329	TAAC	2	8	35724	35731	50 %	25 %	0 %	25 %	300857455
72	NC_014329	CAAG	2	8	35928	35935	50 %	0 %	25 %	25 %	300857455
73	NC_014329	CAGG	2	8	36343	36350	25 %	0 %	50 %	25 %	300857456
74	NC_014329	GCCC	2	8	36532	36539	0 %	0 %	25 %	75 %	300857456
75	NC_014329	TGGC	2	8	36652	36659	0 %	25 %	50 %	25 %	300857456
76	NC_014329	TGGT	2	8	37554	37561	0 %	50 %	50 %	0 %	300857457
77	NC_014329	GCTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	25 %	25 %	300857457
78	NC_014329	TACT	2	8	39037	39044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014329	AAGA	2	8	39119	39126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014329	TGCG	2	8	39569	39576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014329	AAAG	2	8	39902	39909	75 %	0 %	25 %	0 %	300857459
82	NC_014329	TAGA	2	8	40148	40155	50 %	25 %	25 %	0 %	300857459
83	NC_014329	TAAG	2	8	40288	40295	50 %	25 %	25 %	0 %	300857459
84	NC_014329	CAAG	2	8	40509	40516	50 %	0 %	25 %	25 %	300857460
85	NC_014329	GCTG	2	8	41457	41464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014329	GCTG	2	8	41557	41564	0 %	25 %	50 %	25 %	300857462
87	NC_014329	ATCA	2	8	41969	41976	50 %	25 %	0 %	25 %	300857462
88	NC_014329	ATGC	2	8	42353	42360	25 %	25 %	25 %	25 %	300857462
89	NC_014329	CCGG	2	8	43268	43275	0 %	0 %	50 %	50 %	300857463
90	NC_014329	CGCC	2	8	43866	43873	0 %	0 %	25 %	75 %	300857464
91	NC_014329	ATGC	2	8	43931	43938	25 %	25 %	25 %	25 %	300857464
92	NC_014329	AATG	2	8	44453	44460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014329	GGAA	3	12	44631	44642	50 %	0 %	50 %	0 %	300857465
94	NC_014329	AGCC	2	8	45560	45567	25 %	0 %	25 %	50 %	300857465
95	NC_014329	AAAT	2	8	46097	46104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014329	TTGC	2	8	47826	47833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014329	ATTA	2	8	47901	47908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014329	ATAC	2	8	48804	48811	50 %	25 %	0 %	25 %	300857468
99	NC_014329	TGCG	2	8	48916	48923	0 %	25 %	50 %	25 %	300857468
100	NC_014329	GTTT	2	8	50903	50910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014329	TCAT	2	8	51229	51236	25 %	50 %	0 %	25 %	300857469
102	NC_014329	ATCG	2	8	51465	51472	25 %	25 %	25 %	25 %	300857469
103	NC_014329	CGAT	2	8	51942	51949	25 %	25 %	25 %	25 %	300857470
104	NC_014329	ATGA	2	8	52076	52083	50 %	25 %	25 %	0 %	300857470
105	NC_014329	CTGG	2	8	52477	52484	0 %	25 %	50 %	25 %	300857471
106	NC_014329	ATGC	2	8	53798	53805	25 %	25 %	25 %	25 %	300857472
107	NC_014329	TGAT	2	8	54032	54039	25 %	50 %	25 %	0 %	300857472
108	NC_014329	CAAG	2	8	54117	54124	50 %	0 %	25 %	25 %	300857472
109	NC_014329	ACTT	2	8	54208	54215	25 %	50 %	0 %	25 %	300857472
110	NC_014329	CCGT	2	8	55312	55319	0 %	25 %	25 %	50 %	300857473
111	NC_014329	AGCA	2	8	55500	55507	50 %	0 %	25 %	25 %	300857474
112	NC_014329	GCGG	2	8	56579	56586	0 %	0 %	75 %	25 %	300857475
113	NC_014329	CGAC	2	8	56720	56727	25 %	0 %	25 %	50 %	300857476
114	NC_014329	CATC	2	8	57039	57046	25 %	25 %	0 %	50 %	300857476
115	NC_014329	GAGG	2	8	57252	57259	25 %	0 %	75 %	0 %	300857476
116	NC_014329	ATTG	2	8	57587	57594	25 %	50 %	25 %	0 %	300857476
117	NC_014329	TTGG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014329	AGGG	2	8	58576	58583	25 %	0 %	75 %	0 %	300857478
119	NC_014329	GCAC	2	8	59684	59691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014329	TGAC	2	8	59731	59738	25 %	25 %	25 %	25 %	300857479
121	NC_014329	CGTT	2	8	59978	59985	0 %	50 %	25 %	25 %	300857479
122	NC_014329	AAAC	2	8	60024	60031	75 %	0 %	0 %	25 %	300857479
123	NC_014329	TCAT	2	8	60272	60279	25 %	50 %	0 %	25 %	300857479
124	NC_014329	TGCT	2	8	60765	60772	0 %	50 %	25 %	25 %	300857480
125	NC_014329	GTGC	2	8	61176	61183	0 %	25 %	50 %	25 %	300857481
126	NC_014329	CGTA	2	8	61308	61315	25 %	25 %	25 %	25 %	300857481
127	NC_014329	CTTT	2	8	61446	61453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014329	ACCT	2	8	61937	61944	25 %	25 %	0 %	50 %	300857482
129	NC_014329	ATAC	2	8	62096	62103	50 %	25 %	0 %	25 %	300857482
130	NC_014329	CATG	2	8	62120	62127	25 %	25 %	25 %	25 %	300857482
131	NC_014329	GCGG	2	8	63097	63104	0 %	0 %	75 %	25 %	300857483
132	NC_014329	AACA	2	8	63128	63135	75 %	0 %	0 %	25 %	300857483
133	NC_014329	GATT	2	8	65399	65406	25 %	50 %	25 %	0 %	300857484
134	NC_014329	CCAG	2	8	66251	66258	25 %	0 %	25 %	50 %	300857485
135	NC_014329	GGTG	2	8	66467	66474	0 %	25 %	75 %	0 %	300857485
136	NC_014329	ATCC	2	8	66758	66765	25 %	25 %	0 %	50 %	300857485
137	NC_014329	GGCT	2	8	67995	68002	0 %	25 %	50 %	25 %	300857486
138	NC_014329	GCTG	2	8	68537	68544	0 %	25 %	50 %	25 %	300857487
139	NC_014329	CTTG	2	8	68862	68869	0 %	50 %	25 %	25 %	300857487
140	NC_014329	TCCA	2	8	69005	69012	25 %	25 %	0 %	50 %	300857487
141	NC_014329	AGTG	2	8	69224	69231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014329	GGTT	2	8	69742	69749	0 %	50 %	50 %	0 %	300857488
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