MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 4669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	AAATT	2	10	1831	1840	60 %	40 %	0 %	0 %	300853234
2	NC_014328	AATTT	2	10	2455	2464	40 %	60 %	0 %	0 %	300853234
3	NC_014328	AATTT	2	10	4211	4220	40 %	60 %	0 %	0 %	300853236
4	NC_014328	ATAAA	2	10	4695	4704	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
5	NC_014328	AAAAC	2	10	5531	5540	80 %	0 %	0 %	20 %	300853238
6	NC_014328	AATAA	2	10	5990	5999	80 %	20 %	0 %	0 %	300853238
7	NC_014328	TGAAA	2	10	6489	6498	60 %	20 %	20 %	0 %	300853239
8	NC_014328	TTAAT	2	10	8195	8204	40 %	60 %	0 %	0 %	300853239
9	NC_014328	TCGTG	2	10	10458	10467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014328	TAAAG	2	10	11101	11110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014328	TATAA	2	10	11118	11127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014328	GGGAG	2	10	11733	11742	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014328	TAAGT	2	10	12258	12267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014328	AAGAT	2	10	13977	13986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014328	TTATA	2	10	15981	15990	40 %	60 %	0 %	0 %	300853242
16	NC_014328	ATATA	2	10	16736	16745	60 %	40 %	0 %	0 %	300853242
17	NC_014328	ATATA	2	10	16952	16961	60 %	40 %	0 %	0 %	300853242
18	NC_014328	TATAG	2	10	19188	19197	40 %	40 %	20 %	0 %	300853243
19	NC_014328	GAAAA	2	10	19330	19339	80 %	0 %	20 %	0 %	300853243
20	NC_014328	GAGAA	2	10	20818	20827	60 %	0 %	40 %	0 %	300853245
21	NC_014328	TTATC	2	10	22814	22823	20 %	60 %	0 %	20 %	300853246
22	NC_014328	CAATA	2	10	23489	23498	60 %	20 %	0 %	20 %	300853246
23	NC_014328	TTTTA	2	10	24128	24137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014328	TATCT	2	10	24307	24316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014328	AGTAC	2	10	24397	24406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014328	AATAT	2	10	24559	24568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014328	TAATA	2	10	25354	25363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	TATCA	2	10	29575	29584	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014328	GCTAT	2	10	30791	30800	20 %	40 %	20 %	20 %	300853256
30	NC_014328	AACTT	2	10	32184	32193	40 %	40 %	0 %	20 %	300853259
31	NC_014328	TATAA	2	10	34850	34859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014328	TTTGA	2	10	35240	35249	20 %	60 %	20 %	0 %	300853263
33	NC_014328	ATTTT	2	10	35543	35552	20 %	80 %	0 %	0 %	300853264
34	NC_014328	ACCAG	2	10	37836	37845	40 %	0 %	20 %	40 %	300853265
35	NC_014328	ATTAA	2	10	40733	40742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014328	TAATT	2	10	41018	41027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014328	AATTG	2	10	41188	41197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014328	TATGA	2	10	42214	42223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014328	TTTCA	2	10	42719	42728	20 %	60 %	0 %	20 %	300853268
40	NC_014328	TTAGT	2	10	42976	42985	20 %	60 %	20 %	0 %	300853268
41	NC_014328	TTACT	2	10	42994	43003	20 %	60 %	0 %	20 %	300853268
42	NC_014328	TCTGC	2	10	43513	43522	0 %	40 %	20 %	40 %	300853268
43	NC_014328	AATTA	2	10	43967	43976	60 %	40 %	0 %	0 %	300853268
44	NC_014328	AATTT	2	10	44371	44380	40 %	60 %	0 %	0 %	300853268
45	NC_014328	GAAAT	2	10	44976	44985	60 %	20 %	20 %	0 %	300853268
46	NC_014328	GCCAT	2	10	45138	45147	20 %	20 %	20 %	40 %	300853269
47	NC_014328	TGGAA	2	10	45721	45730	40 %	20 %	40 %	0 %	300853270
48	NC_014328	TTTCT	2	10	45735	45744	0 %	80 %	0 %	20 %	300853270
49	NC_014328	TGATT	2	10	45830	45839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014328	GTAAA	2	10	45906	45915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014328	AAAAT	2	10	45971	45980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014328	CTAAT	2	10	46115	46124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014328	ATTTT	2	10	46533	46542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014328	AAAGT	2	10	47108	47117	60 %	20 %	20 %	0 %	300853273
55	NC_014328	TTTAA	2	10	47489	47498	40 %	60 %	0 %	0 %	300853273
56	NC_014328	GTATT	2	10	47682	47691	20 %	60 %	20 %	0 %	300853273
57	NC_014328	TATAT	2	10	49735	49744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014328	TAAAT	2	10	50809	50818	60 %	40 %	0 %	0 %	300853276
59	NC_014328	AAACA	2	10	52266	52275	80 %	0 %	0 %	20 %	300853278
60	NC_014328	ATACA	2	10	52442	52451	60 %	20 %	0 %	20 %	300853278
61	NC_014328	AATTT	2	10	52984	52993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014328	TGAAT	2	10	54145	54154	40 %	40 %	20 %	0 %	300853279
63	NC_014328	GCAAT	2	10	55141	55150	40 %	20 %	20 %	20 %	300853280
64	NC_014328	TGACA	2	10	58629	58638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014328	CTATG	2	10	59042	59051	20 %	40 %	20 %	20 %	300853285
66	NC_014328	CAATT	2	10	59750	59759	40 %	40 %	0 %	20 %	300853285
67	NC_014328	ATGGG	2	10	60020	60029	20 %	20 %	60 %	0 %	300853286
68	NC_014328	TATTT	2	10	63259	63268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014328	TCAAT	2	10	63622	63631	40 %	40 %	0 %	20 %	300853288
70	NC_014328	GAGAT	2	10	64246	64255	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014328	AATAT	2	10	65748	65757	60 %	40 %	0 %	0 %	300853290
72	NC_014328	ATATT	2	10	65844	65853	40 %	60 %	0 %	0 %	300853290
73	NC_014328	TACAT	2	10	66521	66530	40 %	40 %	0 %	20 %	300853291
74	NC_014328	ATCTG	2	10	68007	68016	20 %	40 %	20 %	20 %	300853292
75	NC_014328	TATAA	2	10	68022	68031	60 %	40 %	0 %	0 %	300853292
76	NC_014328	GTTTT	2	10	69576	69585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014328	TCACC	2	10	70425	70434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014328	TAATA	2	10	70484	70493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014328	AAATA	2	10	70558	70567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014328	AAATG	2	10	72165	72174	60 %	20 %	20 %	0 %	300853295
81	NC_014328	TTTAT	2	10	73889	73898	20 %	80 %	0 %	0 %	300853297
82	NC_014328	ATATT	2	10	74390	74399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014328	TTTAT	2	10	74409	74418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014328	CACCT	2	10	75914	75923	20 %	20 %	0 %	60 %	300853300
85	NC_014328	GTAGA	2	10	82998	83007	40 %	20 %	40 %	0 %	300853307
86	NC_014328	TATAA	2	10	83128	83137	60 %	40 %	0 %	0 %	300853308
87	NC_014328	AATAA	2	10	84173	84182	80 %	20 %	0 %	0 %	300853310
88	NC_014328	AAAAT	2	10	84865	84874	80 %	20 %	0 %	0 %	300853311
89	NC_014328	TGAAA	2	10	85154	85163	60 %	20 %	20 %	0 %	300853311
90	NC_014328	TTATA	2	10	87597	87606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014328	ATGGA	2	10	89147	89156	40 %	20 %	40 %	0 %	300853317
92	NC_014328	TGGAA	2	10	89991	90000	40 %	20 %	40 %	0 %	300853317
93	NC_014328	TTAGT	2	10	91657	91666	20 %	60 %	20 %	0 %	300853319
94	NC_014328	ATAGA	2	10	92419	92428	60 %	20 %	20 %	0 %	300853319
95	NC_014328	TCGTG	2	10	94057	94066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014328	TAAAG	2	10	94700	94709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014328	TATAA	2	10	94717	94726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014328	GGGAG	2	10	95332	95341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014328	TAAGT	2	10	95857	95866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014328	AAGAT	2	10	97576	97585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014328	GTAAC	2	10	98636	98645	40 %	20 %	20 %	20 %	300853320
102	NC_014328	GATTT	2	10	98958	98967	20 %	60 %	20 %	0 %	300853321
103	NC_014328	GTTTT	2	10	101065	101074	0 %	80 %	20 %	0 %	300853323
104	NC_014328	ATTTT	2	10	101961	101970	20 %	80 %	0 %	0 %	300853324
105	NC_014328	TGTAC	2	10	102755	102764	20 %	40 %	20 %	20 %	300853324
106	NC_014328	ATAAA	2	10	103110	103119	80 %	20 %	0 %	0 %	300853324
107	NC_014328	AATTA	2	10	104115	104124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014328	GAAAA	2	10	104448	104457	80 %	0 %	20 %	0 %	300853325
109	NC_014328	AAGGC	2	10	105668	105677	40 %	0 %	40 %	20 %	300853326
110	NC_014328	GTAAT	2	10	106338	106347	40 %	40 %	20 %	0 %	300853327
111	NC_014328	TCGTG	2	10	110961	110970	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014328	TAAAG	2	10	111604	111613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014328	GGGAG	2	10	112337	112346	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014328	TAAGT	2	10	112862	112871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014328	AAGAT	2	10	114581	114590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014328	ATGGA	2	10	115149	115158	40 %	20 %	40 %	0 %	300853330
117	NC_014328	TTTAG	2	10	115652	115661	20 %	60 %	20 %	0 %	300853330
118	NC_014328	AAAAC	2	10	115915	115924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014328	TAATA	2	10	121404	121413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014328	TAATA	2	10	121438	121447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014328	AAAAT	2	10	122684	122693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014328	TATAA	2	10	123428	123437	60 %	40 %	0 %	0 %	300853336
123	NC_014328	GAAAT	2	10	123453	123462	60 %	20 %	20 %	0 %	300853336
124	NC_014328	GAATG	2	10	123815	123824	40 %	20 %	40 %	0 %	300853336
125	NC_014328	ATTAT	2	10	125789	125798	40 %	60 %	0 %	0 %	300853337
126	NC_014328	AATAA	2	10	125964	125973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014328	AGCAA	2	10	126539	126548	60 %	0 %	20 %	20 %	300853338
128	NC_014328	AATTT	2	10	127685	127694	40 %	60 %	0 %	0 %	300853339
129	NC_014328	GAATG	2	10	129779	129788	40 %	20 %	40 %	0 %	300853340
130	NC_014328	TCGTG	2	10	131527	131536	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014328	TAAAG	2	10	132204	132213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014328	TATAA	2	10	132221	132230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014328	GGGAG	2	10	132936	132945	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014328	TAAGT	2	10	133461	133470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014328	AAGAT	2	10	135180	135189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014328	TAATT	2	10	135669	135678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014328	AAAGA	2	10	136983	136992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014328	TATTT	2	10	138250	138259	20 %	80 %	0 %	0 %	300853343
139	NC_014328	ATATT	2	10	139002	139011	40 %	60 %	0 %	0 %	300853344
140	NC_014328	TCATT	2	10	139233	139242	20 %	60 %	0 %	20 %	300853344
141	NC_014328	AGATA	2	10	141183	141192	60 %	20 %	20 %	0 %	300853346
142	NC_014328	ATTTT	2	10	147255	147264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014328	TATTT	2	10	147308	147317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_014328	TTATT	2	10	156852	156861	20 %	80 %	0 %	0 %	300853364
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253	NC_014328	AGTAA	2	10	239139	239148	60 %	20 %	20 %	0 %	300853440
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274	NC_014328	AGATA	2	10	254892	254901	60 %	20 %	20 %	0 %	300853458
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