MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 1062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	TCGTG	2	10	10458	10467	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014328	TAAAG	2	10	11101	11110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014328	TATAA	2	10	11118	11127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014328	GGGAG	2	10	11733	11742	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014328	TAAGT	2	10	12258	12267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014328	AAGAT	2	10	13977	13986	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014328	TTTTA	2	10	24128	24137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014328	TATCT	2	10	24307	24316	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014328	AGTAC	2	10	24397	24406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014328	AATAT	2	10	24559	24568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014328	TAATA	2	10	25354	25363	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014328	TATCA	2	10	29575	29584	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014328	TATAA	2	10	34850	34859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014328	ATTAA	2	10	40733	40742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014328	TAATT	2	10	41018	41027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014328	AATTG	2	10	41188	41197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014328	TATGA	2	10	42214	42223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014328	TGATT	2	10	45830	45839	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014328	GTAAA	2	10	45906	45915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014328	AAAAT	2	10	45971	45980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014328	CTAAT	2	10	46115	46124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014328	ATTTT	2	10	46533	46542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014328	TATAT	2	10	49735	49744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014328	AATTT	2	10	52984	52993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014328	TGACA	2	10	58629	58638	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014328	TATTT	2	10	63259	63268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014328	GAGAT	2	10	64246	64255	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	GTTTT	2	10	69576	69585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014328	TCACC	2	10	70425	70434	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014328	TAATA	2	10	70484	70493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014328	AAATA	2	10	70558	70567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014328	ATATT	2	10	74390	74399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014328	TTTAT	2	10	74409	74418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014328	TTATA	2	10	87597	87606	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014328	TCGTG	2	10	94057	94066	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014328	TAAAG	2	10	94700	94709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014328	TATAA	2	10	94717	94726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014328	GGGAG	2	10	95332	95341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014328	TAAGT	2	10	95857	95866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014328	AAGAT	2	10	97576	97585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014328	AATTA	2	10	104115	104124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014328	TCGTG	2	10	110961	110970	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014328	TAAAG	2	10	111604	111613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014328	GGGAG	2	10	112337	112346	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014328	TAAGT	2	10	112862	112871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014328	AAGAT	2	10	114581	114590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014328	AAAAC	2	10	115915	115924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014328	TAATA	2	10	121404	121413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014328	TAATA	2	10	121438	121447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014328	AAAAT	2	10	122684	122693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014328	AATAA	2	10	125964	125973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014328	TCGTG	2	10	131527	131536	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014328	TAAAG	2	10	132204	132213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014328	TATAA	2	10	132221	132230	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014328	GGGAG	2	10	132936	132945	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014328	TAAGT	2	10	133461	133470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014328	AAGAT	2	10	135180	135189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014328	TAATT	2	10	135669	135678	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014328	AAAGA	2	10	136983	136992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014328	ATTTT	2	10	147255	147264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014328	TATTT	2	10	147308	147317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014328	TAACT	2	10	156257	156266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014328	AAATT	2	10	157247	157256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014328	TTTAA	2	10	158797	158806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014328	TACTA	2	10	161077	161086	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014328	AAATA	2	10	163130	163139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014328	AGCAA	2	10	163754	163763	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014328	GAGTA	2	10	168293	168302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014328	ATATT	2	10	169507	169516	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014328	TTACA	2	10	169664	169673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014328	GCAAA	2	10	171840	171849	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014328	TTAGG	2	10	172042	172051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014328	TTATT	2	10	173029	173038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014328	AATAT	2	10	175785	175794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014328	TAACA	2	10	184718	184727	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014328	ATATA	2	10	186672	186681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014328	GGAAA	2	10	191405	191414	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014328	TAATA	2	10	199974	199983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014328	TTATT	2	10	200042	200051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014328	TTTTA	2	10	203129	203138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014328	TTATA	2	10	204323	204332	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014328	TAAAT	2	10	209936	209945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014328	TGTAT	2	10	209977	209986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014328	TATAA	2	10	211073	211082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014328	TAATT	2	10	224878	224887	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014328	TTAAA	2	10	227938	227947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014328	ATGAA	2	10	239109	239118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014328	CTTTA	2	10	239811	239820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014328	AAAGA	2	10	252135	252144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014328	ATATG	2	10	254707	254716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014328	TTATA	2	10	257209	257218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014328	AGTTA	2	10	257323	257332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014328	ATTTT	2	10	282938	282947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014328	AATAT	2	10	286741	286750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014328	CTTTA	2	10	290179	290188	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014328	AAATT	2	10	296751	296760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014328	TTTAT	2	10	297038	297047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014328	TAATT	2	10	297059	297068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014328	AAATT	2	10	297811	297820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014328	ATAAG	2	10	299380	299389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014328	ATATT	2	10	302425	302434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014328	TATAA	2	10	302634	302643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014328	TAATA	2	10	305796	305805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014328	AATTA	2	10	308865	308874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014328	AAAAT	2	10	310174	310183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014328	GAAAA	2	10	331807	331816	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014328	ATCTT	2	10	332210	332219	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014328	TATAA	2	10	339408	339417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014328	GTTGA	2	10	341744	341753	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014328	ATTTA	2	10	382586	382595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014328	ATTTT	2	10	397185	397194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014328	CATTA	2	10	397208	397217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014328	TAAGA	2	10	404397	404406	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014328	GAATT	2	10	422340	422349	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014328	GTTAT	2	10	432022	432031	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014328	TTAAA	2	10	439747	439756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014328	ATTAA	2	10	443379	443388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014328	TTATA	2	10	446490	446499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014328	TATAT	2	10	450588	450597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014328	TAACT	2	10	452907	452916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014328	CTTAA	2	10	453597	453606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014328	TTAAA	2	10	453734	453743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014328	TCTCC	2	10	458474	458483	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_014328	TTTAA	2	10	462539	462548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014328	AAAAT	2	10	475566	475575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014328	AAACT	2	10	478659	478668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014328	CTCTC	2	10	482366	482375	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014328	TACAA	2	10	501284	501293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014328	ATATT	2	10	503184	503193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014328	AAATA	2	10	508483	508492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014328	TTATA	2	10	519650	519659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014328	AAAAG	2	10	519817	519826	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014328	ATATA	2	10	520037	520046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014328	CTATA	2	10	525139	525148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014328	TAAAT	2	10	531563	531572	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014328	AATAA	2	10	531709	531718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014328	GAAGC	2	10	531767	531776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014328	TTAAT	2	10	543328	543337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014328	TAATT	2	10	548025	548034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014328	ATATT	2	10	548398	548407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014328	AATAT	2	10	554543	554552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014328	AAAAG	2	10	564122	564131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014328	TGAAA	2	10	564171	564180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014328	TCAGA	2	10	564475	564484	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014328	TAATA	2	10	564578	564587	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014328	TATCA	2	10	568111	568120	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014328	ATTTT	2	10	568191	568200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014328	GTAAT	2	10	568380	568389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014328	TAAAA	2	10	571328	571337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_014328	AATTA	2	10	2174110	2174119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014328	CTTTA	2	10	2174568	2174577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
487	NC_014328	ATAGG	2	10	2176698	2176707	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
488	NC_014328	TGCAT	2	10	2179533	2179542	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
489	NC_014328	CTATA	2	10	2197979	2197988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
490	NC_014328	TAATA	2	10	2206152	2206161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_014328	ATAAA	2	10	2219355	2219364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014328	TGTAA	2	10	2221757	2221766	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014328	TGTAA	2	10	2223149	2223158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
494	NC_014328	TAATT	2	10	2225648	2225657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_014328	ATTTA	2	10	2245445	2245454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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