MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 66878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	TGT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014328	ATT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014328	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014328	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
5	NC_014328	ACA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853233
6	NC_014328	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
7	NC_014328	TAA	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
8	NC_014328	ATG	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
9	NC_014328	AAT	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
10	NC_014328	AGT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
11	NC_014328	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
12	NC_014328	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
13	NC_014328	TAA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
14	NC_014328	ACC	2	6	853	858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
15	NC_014328	AGA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
16	NC_014328	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
17	NC_014328	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
18	NC_014328	TAA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
19	NC_014328	TAT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853233
20	NC_014328	GAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
21	NC_014328	AAG	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
22	NC_014328	GAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
23	NC_014328	TAC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
24	NC_014328	CAA	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014328	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014328	TAA	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014328	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	CTA	3	9	1630	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014328	TTA	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014328	AGG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014328	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
32	NC_014328	TTA	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
33	NC_014328	AGA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
34	NC_014328	GTA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
35	NC_014328	CTA	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853234
36	NC_014328	AAT	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
37	NC_014328	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
38	NC_014328	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
39	NC_014328	ATT	2	6	2082	2087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
40	NC_014328	TGC	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853234
41	NC_014328	TAG	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
42	NC_014328	ATA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
43	NC_014328	AGA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
44	NC_014328	ATA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
45	NC_014328	AGA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
46	NC_014328	TAA	2	6	2545	2550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
47	NC_014328	AGA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
48	NC_014328	ACA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853234
49	NC_014328	ATA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
50	NC_014328	AGA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
51	NC_014328	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
52	NC_014328	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
53	NC_014328	GAA	3	9	2700	2708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
54	NC_014328	AGC	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853234
55	NC_014328	ATA	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014328	TAA	2	6	2869	2874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853235
57	NC_014328	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853235
58	NC_014328	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
59	NC_014328	TAA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
60	NC_014328	TCA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853236
61	NC_014328	AAG	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
62	NC_014328	GTA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
63	NC_014328	AGA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
64	NC_014328	ATA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
65	NC_014328	CTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853236
66	NC_014328	AGA	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
67	NC_014328	ATT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
68	NC_014328	TTA	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
69	NC_014328	ATT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
70	NC_014328	ATA	2	6	3817	3822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
71	NC_014328	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
72	NC_014328	ACA	2	6	3962	3967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853236
73	NC_014328	ATA	2	6	4008	4013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
74	NC_014328	TTA	2	6	4041	4046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
75	NC_014328	GAT	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
76	NC_014328	GTT	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853237
77	NC_014328	GAA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853237
78	NC_014328	AGG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014328	ATG	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
80	NC_014328	ATG	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
81	NC_014328	TCA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
82	NC_014328	ATA	2	6	4659	4664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
83	NC_014328	GAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
84	NC_014328	TAC	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
85	NC_014328	AGG	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
86	NC_014328	TGG	3	9	4837	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853238
87	NC_014328	CGG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300853238
88	NC_014328	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
89	NC_014328	GAG	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
90	NC_014328	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
91	NC_014328	AGA	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
92	NC_014328	AGA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
93	NC_014328	AAC	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853238
94	NC_014328	ACT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
95	NC_014328	ATG	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
96	NC_014328	TAA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
97	NC_014328	GAT	2	6	5629	5634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
98	NC_014328	GAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
99	NC_014328	TAA	3	9	5997	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
100	NC_014328	ATT	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853238
101	NC_014328	TTG	2	6	6081	6086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853238
102	NC_014328	ACC	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853238
103	NC_014328	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
104	NC_014328	TAC	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
105	NC_014328	GAT	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
106	NC_014328	TAC	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
107	NC_014328	GCT	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853238
108	NC_014328	TGA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
109	NC_014328	AGA	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
110	NC_014328	ATC	2	6	6674	6679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853239
111	NC_014328	CAG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853239
112	NC_014328	ATG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
113	NC_014328	GCA	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853239
114	NC_014328	GAA	2	6	6898	6903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
115	NC_014328	CTG	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
116	NC_014328	ACC	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853239
117	NC_014328	ATA	2	6	7033	7038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
118	NC_014328	AAT	3	9	7107	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
119	NC_014328	AAG	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
120	NC_014328	GAA	2	6	7189	7194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
121	NC_014328	AAT	3	9	7212	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
122	NC_014328	TAA	2	6	7242	7247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
123	NC_014328	AAT	2	6	7453	7458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
124	NC_014328	TAT	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853239
125	NC_014328	AAG	2	6	7511	7516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
126	NC_014328	AGA	2	6	7528	7533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
127	NC_014328	TAA	2	6	7625	7630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
128	NC_014328	ATC	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853239
129	NC_014328	TGC	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
130	NC_014328	TGA	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
131	NC_014328	ATG	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
132	NC_014328	AGT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
133	NC_014328	CTG	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
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152	NC_014328	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014328	GAT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014328	AGC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_014328	GCA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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163	NC_014328	AGG	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014328	CAG	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_014328	AGC	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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238	NC_014328	TAT	2	6	15779	15784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853242
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260	NC_014328	TTA	2	6	17352	17357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853242
261	NC_014328	GGA	2	6	17472	17477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853242
262	NC_014328	ATG	2	6	17542	17547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853242
263	NC_014328	TAA	2	6	17635	17640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
264	NC_014328	TGT	2	6	17870	17875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853242
265	NC_014328	TAA	2	6	17894	17899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
266	NC_014328	AGA	2	6	17900	17905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853242
267	NC_014328	TGC	2	6	17914	17919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853242
268	NC_014328	ACA	2	6	17944	17949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853242
269	NC_014328	GAT	2	6	17996	18001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853242
270	NC_014328	TCC	2	6	18014	18019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300853242
271	NC_014328	AGA	2	6	18022	18027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853242
272	NC_014328	AAT	2	6	18153	18158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
273	NC_014328	GTA	2	6	18231	18236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853242
274	NC_014328	ATA	2	6	18252	18257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
275	NC_014328	GAT	2	6	18273	18278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853242
276	NC_014328	GCA	2	6	18284	18289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853242
277	NC_014328	AAT	2	6	18309	18314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
278	NC_014328	CTA	2	6	18355	18360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853242
279	NC_014328	ACA	2	6	18383	18388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853242
280	NC_014328	ATA	2	6	18454	18459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853242
281	NC_014328	ATT	2	6	18538	18543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014328	ATG	2	6	18583	18588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853243
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285	NC_014328	ATG	2	6	18691	18696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853243
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287	NC_014328	ATG	2	6	18724	18729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853243
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289	NC_014328	TAA	2	6	18887	18892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853243
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292	NC_014328	TAA	2	6	19274	19279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853243
293	NC_014328	ATA	2	6	19306	19311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853243
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303	NC_014328	TAA	2	6	19883	19888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853243
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312	NC_014328	TAA	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_014328	TGA	2	6	20450	20455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
314	NC_014328	TAG	2	6	20462	20467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
315	NC_014328	ATA	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_014328	TAT	2	6	20663	20668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_014328	ATA	2	6	22337	22342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_014328	TAA	2	6	22465	22470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_014328	CTT	2	6	22517	22522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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354	NC_014328	ATC	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
355	NC_014328	ATA	2	6	24223	24228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_014328	GGA	2	6	27641	27646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
389	NC_014328	AAT	2	6	27670	27675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_014328	TCA	2	6	27711	27716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853252
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392	NC_014328	AGA	2	6	27764	27769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853252
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