MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 9936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	TGT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014328	ATT	2	6	72	77	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014328	GGA	2	6	89	94	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014328	CAA	2	6	1458	1463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014328	ATT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014328	TAA	2	6	1481	1486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014328	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014328	CTA	3	9	1630	1638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014328	TTA	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014328	AGG	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014328	ATA	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014328	AGG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014328	TAT	2	6	9062	9067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014328	GTC	2	6	9149	9154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014328	GAT	2	6	9251	9256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014328	AGC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014328	TAA	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014328	GGC	2	6	9454	9459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014328	GCG	2	6	9510	9515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014328	ATA	2	6	9588	9593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014328	CGA	2	6	9690	9695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014328	GCA	2	6	9764	9769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014328	GCA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014328	CGC	2	6	9811	9816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014328	AGG	2	6	9880	9885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014328	CAG	2	6	9907	9912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014328	GAG	2	6	10052	10057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014328	GAA	2	6	10099	10104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014328	AGG	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014328	AGC	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014328	GAA	2	6	10362	10367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014328	GGT	2	6	10435	10440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014328	GTC	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014328	TGT	2	6	10504	10509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014328	GGA	2	6	10561	10566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014328	ATC	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014328	AGG	2	6	10837	10842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014328	CCT	2	6	10919	10924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014328	TCT	2	6	11025	11030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014328	GAT	2	6	11168	11173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014328	GGA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014328	AAG	2	6	11259	11264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014328	GGA	2	6	11421	11426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014328	GCG	2	6	11455	11460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014328	CCG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014328	ACC	2	6	11657	11662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_014328	TAC	2	6	11676	11681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014328	ACG	2	6	11794	11799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014328	GCA	2	6	11838	11843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014328	TGT	2	6	11907	11912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014328	GGA	2	6	11970	11975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014328	ACA	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014328	ACC	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014328	AGC	2	6	12314	12319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014328	ACC	2	6	12393	12398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014328	AGG	2	6	12670	12675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014328	ATG	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014328	GAG	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014328	GAA	2	6	12882	12887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014328	TTG	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014328	CGG	2	6	13103	13108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014328	ACA	2	6	13199	13204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014328	AGT	2	6	13336	13341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014328	ACC	2	6	13374	13379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014328	CCT	2	6	13462	13467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014328	TTC	2	6	13514	13519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014328	GGT	2	6	13598	13603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014328	TCG	2	6	13713	13718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014328	CGT	2	6	13793	13798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014328	GAG	2	6	13842	13847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014328	GTT	2	6	13896	13901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014328	GAA	2	6	14017	14022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014328	GAG	2	6	14026	14031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014328	GAG	2	6	14221	14226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014328	GAT	2	6	14300	14305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014328	TGG	2	6	14310	14315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014328	TAA	2	6	14424	14429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014328	CCA	2	6	14501	14506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014328	TAT	2	6	14553	14558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014328	GGA	2	6	14585	14590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014328	GGT	2	6	15771	15776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014328	ATT	2	6	18538	18543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014328	TAT	2	6	20349	20354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014328	TAA	2	6	20372	20377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014328	TGA	2	6	20450	20455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014328	TAG	2	6	20462	20467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014328	ATA	2	6	20515	20520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014328	TAT	2	6	20663	20668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014328	GAT	2	6	20682	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014328	GGA	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014328	AGT	2	6	22141	22146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014328	TGT	2	6	22212	22217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014328	TAA	2	6	22220	22225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014328	ATA	2	6	22337	22342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014328	TAA	2	6	22465	22470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014328	CTT	2	6	22517	22522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014328	CTC	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014328	ATA	2	6	24167	24172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014328	ATC	2	6	24179	24184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014328	ATA	2	6	24223	24228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014328	ATT	2	6	24346	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014328	AAT	2	6	24408	24413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014328	TCC	2	6	24463	24468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014328	AGA	2	6	24602	24607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014328	CTT	2	6	25270	25275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014328	TAT	3	9	25278	25286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014328	AAT	2	6	25311	25316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014328	ACA	2	6	25364	25369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014328	CAA	2	6	26571	26576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014328	TGT	2	6	26698	26703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014328	AGG	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014328	CAA	2	6	27520	27525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014328	GGA	2	6	27641	27646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014328	AAT	2	6	27670	27675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014328	TAC	2	6	28105	28110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014328	AGC	2	6	28121	28126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014328	AGG	2	6	28142	28147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014328	AGG	2	6	28423	28428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014328	ATT	2	6	29219	29224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014328	ATG	2	6	29307	29312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014328	TAG	2	6	29453	29458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014328	ATA	2	6	29483	29488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014328	TAA	2	6	29540	29545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014328	ATT	2	6	29593	29598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014328	CTG	2	6	30495	30500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014328	ATC	2	6	30542	30547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014328	AGG	2	6	30633	30638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014328	TAT	2	6	31445	31450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014328	GAT	2	6	31512	31517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014328	AGG	2	6	31522	31527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014328	AAT	2	6	31825	31830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014328	ATT	2	6	33371	33376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014328	TAA	2	6	33401	33406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014328	TTA	2	6	33436	33441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014328	TAA	2	6	34079	34084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014328	AAT	2	6	34105	34110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014328	ATT	2	6	34241	34246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014328	AGA	2	6	34632	34637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014328	AGG	2	6	34697	34702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014328	TAT	2	6	34710	34715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014328	ATG	2	6	34721	34726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_014328	AAG	2	6	111863	111868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_014328	TAA	2	6	115891	115896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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457	NC_014328	ATA	2	6	117217	117222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_014328	TAT	2	6	121451	121456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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