MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium ljungdahlii DSM 13528 chromosome

Total Repeats: 56942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014328	ATA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
2	NC_014328	ACA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853233
3	NC_014328	AGA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
4	NC_014328	TAA	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
5	NC_014328	ATG	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
6	NC_014328	AAT	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
7	NC_014328	AGT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
8	NC_014328	GAT	2	6	689	694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
9	NC_014328	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
10	NC_014328	TAA	2	6	823	828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
11	NC_014328	ACC	2	6	853	858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
12	NC_014328	AGA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
13	NC_014328	ACC	2	6	928	933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853233
14	NC_014328	CTA	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
15	NC_014328	TAA	2	6	1062	1067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853233
16	NC_014328	TAT	2	6	1202	1207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853233
17	NC_014328	GAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853233
18	NC_014328	AAG	2	6	1237	1242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
19	NC_014328	GAA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853233
20	NC_014328	TAC	2	6	1348	1353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853233
21	NC_014328	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
22	NC_014328	TTA	2	6	1810	1815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
23	NC_014328	AGA	2	6	1895	1900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
24	NC_014328	GTA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
25	NC_014328	CTA	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853234
26	NC_014328	AAT	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
27	NC_014328	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
28	NC_014328	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
29	NC_014328	ATT	2	6	2082	2087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
30	NC_014328	TGC	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853234
31	NC_014328	TAG	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853234
32	NC_014328	ATA	2	6	2271	2276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
33	NC_014328	AGA	2	6	2324	2329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
34	NC_014328	ATA	2	6	2386	2391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
35	NC_014328	AGA	2	6	2483	2488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
36	NC_014328	TAA	2	6	2545	2550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
37	NC_014328	AGA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
38	NC_014328	ACA	2	6	2569	2574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853234
39	NC_014328	ATA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
40	NC_014328	AGA	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
41	NC_014328	ATT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853234
42	NC_014328	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853234
43	NC_014328	GAA	3	9	2700	2708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853234
44	NC_014328	AGC	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853234
45	NC_014328	TAA	2	6	2869	2874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853235
46	NC_014328	GAA	2	6	2986	2991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853235
47	NC_014328	TTA	2	6	3139	3144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
48	NC_014328	TAA	2	6	3295	3300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
49	NC_014328	TCA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853236
50	NC_014328	AAG	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
51	NC_014328	GTA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
52	NC_014328	AGA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
53	NC_014328	ATA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
54	NC_014328	CTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853236
55	NC_014328	AGA	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853236
56	NC_014328	ATT	2	6	3565	3570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
57	NC_014328	TTA	2	6	3612	3617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
58	NC_014328	ATT	2	6	3744	3749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
59	NC_014328	ATA	2	6	3817	3822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
60	NC_014328	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
61	NC_014328	ACA	2	6	3962	3967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853236
62	NC_014328	ATA	2	6	4008	4013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853236
63	NC_014328	TTA	2	6	4041	4046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853236
64	NC_014328	GAT	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853236
65	NC_014328	GTT	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853237
66	NC_014328	GAA	2	6	4350	4355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853237
67	NC_014328	ATG	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
68	NC_014328	ATG	2	6	4542	4547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
69	NC_014328	TCA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
70	NC_014328	ATA	2	6	4659	4664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
71	NC_014328	GAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
72	NC_014328	TAC	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
73	NC_014328	AGG	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
74	NC_014328	TGG	3	9	4837	4845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300853238
75	NC_014328	CGG	2	6	4861	4866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300853238
76	NC_014328	ATA	2	6	4991	4996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
77	NC_014328	GAG	2	6	5006	5011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300853238
78	NC_014328	TGA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
79	NC_014328	AGA	2	6	5137	5142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
80	NC_014328	AGA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
81	NC_014328	AAC	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300853238
82	NC_014328	ACT	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
83	NC_014328	ATG	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
84	NC_014328	TAA	2	6	5332	5337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
85	NC_014328	GAT	2	6	5629	5634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
86	NC_014328	GAA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
87	NC_014328	TAA	3	9	5997	6005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853238
88	NC_014328	ATT	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853238
89	NC_014328	TTG	2	6	6081	6086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853238
90	NC_014328	ACC	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853238
91	NC_014328	GAA	2	6	6139	6144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853238
92	NC_014328	TAC	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
93	NC_014328	GAT	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853238
94	NC_014328	TAC	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853238
95	NC_014328	GCT	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853238
96	NC_014328	TGA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
97	NC_014328	AGA	2	6	6580	6585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
98	NC_014328	ATC	2	6	6674	6679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853239
99	NC_014328	CAG	2	6	6692	6697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853239
100	NC_014328	ATG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
101	NC_014328	GCA	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300853239
102	NC_014328	GAA	2	6	6898	6903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
103	NC_014328	CTG	2	6	6956	6961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
104	NC_014328	ACC	2	6	6990	6995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300853239
105	NC_014328	ATA	2	6	7033	7038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
106	NC_014328	AAT	3	9	7107	7115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
107	NC_014328	AAG	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
108	NC_014328	GAA	2	6	7189	7194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
109	NC_014328	AAT	3	9	7212	7220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
110	NC_014328	TAA	2	6	7242	7247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
111	NC_014328	AAT	2	6	7453	7458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
112	NC_014328	TAT	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853239
113	NC_014328	AAG	2	6	7511	7516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
114	NC_014328	AGA	2	6	7528	7533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
115	NC_014328	TAA	2	6	7625	7630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
116	NC_014328	ATC	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853239
117	NC_014328	TGC	2	6	7826	7831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
118	NC_014328	TGA	2	6	7878	7883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
119	NC_014328	ATG	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
120	NC_014328	AGT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
121	NC_014328	CTG	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300853239
122	NC_014328	TTC	2	6	8007	8012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853239
123	NC_014328	AGA	2	6	8017	8022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
124	NC_014328	ATA	3	9	8096	8104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
125	NC_014328	ATT	2	6	8267	8272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853239
126	NC_014328	CTA	2	6	8282	8287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300853239
127	NC_014328	AGA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
128	NC_014328	GAT	2	6	8461	8466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
129	NC_014328	GAA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
130	NC_014328	AGA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
131	NC_014328	ATG	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
132	NC_014328	GAA	2	6	8821	8826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853239
133	NC_014328	GTT	2	6	8833	8838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300853239
134	NC_014328	TGA	2	6	8862	8867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
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136	NC_014328	GAT	2	6	8896	8901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853239
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138	NC_014328	ATA	2	6	8916	8921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853239
139	NC_014328	TAG	2	6	14661	14666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853240
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152	NC_014328	ATA	2	6	15372	15377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300853241
153	NC_014328	TAG	2	6	15517	15522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853241
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249	NC_014328	TAT	3	9	22988	22996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300853246
250	NC_014328	TCT	2	6	23105	23110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300853246
251	NC_014328	AGA	2	6	23353	23358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300853246
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256	NC_014328	AGT	2	6	24807	24812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300853247
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