MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 3900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	CGCGC	2	10	363	372	0 %	0 %	40 %	60 %	300309347
2	NC_014323	ACCAC	2	10	1292	1301	40 %	0 %	0 %	60 %	300309347
3	NC_014323	TGCTC	2	10	6902	6911	0 %	40 %	20 %	40 %	300309350
4	NC_014323	CGATG	2	10	6962	6971	20 %	20 %	40 %	20 %	300309350
5	NC_014323	ACAAA	2	10	9260	9269	80 %	0 %	0 %	20 %	300309352
6	NC_014323	TCCTC	2	10	9284	9293	0 %	40 %	0 %	60 %	300309352
7	NC_014323	AGCGT	2	10	9822	9831	20 %	20 %	40 %	20 %	300309352
8	NC_014323	CTCTC	2	10	9869	9878	0 %	40 %	0 %	60 %	300309352
9	NC_014323	TGGAA	2	10	10887	10896	40 %	20 %	40 %	0 %	300309352
10	NC_014323	AGAAA	2	10	11576	11585	80 %	0 %	20 %	0 %	300309353
11	NC_014323	CTGGA	2	10	14211	14220	20 %	20 %	40 %	20 %	300309355
12	NC_014323	GCAGG	2	10	17861	17870	20 %	0 %	60 %	20 %	300309358
13	NC_014323	CGGCG	2	10	18664	18673	0 %	0 %	60 %	40 %	300309358
14	NC_014323	TTCCC	2	10	19845	19854	0 %	40 %	0 %	60 %	300309359
15	NC_014323	CACCG	2	10	20781	20790	20 %	0 %	20 %	60 %	300309360
16	NC_014323	GCGCG	2	10	21838	21847	0 %	0 %	60 %	40 %	300309360
17	NC_014323	GGCGC	2	10	22046	22055	0 %	0 %	60 %	40 %	300309360
18	NC_014323	GGCGC	2	10	24252	24261	0 %	0 %	60 %	40 %	300309362
19	NC_014323	CGACC	2	10	24348	24357	20 %	0 %	20 %	60 %	300309362
20	NC_014323	GCGCC	2	10	26800	26809	0 %	0 %	40 %	60 %	300309364
21	NC_014323	CCCTG	2	10	26854	26863	0 %	20 %	20 %	60 %	300309364
22	NC_014323	CCGTG	2	10	27800	27809	0 %	20 %	40 %	40 %	300309365
23	NC_014323	GGCGC	2	10	31859	31868	0 %	0 %	60 %	40 %	300309366
24	NC_014323	ACTGC	2	10	32956	32965	20 %	20 %	20 %	40 %	300309367
25	NC_014323	TCTCG	2	10	34958	34967	0 %	40 %	20 %	40 %	300309369
26	NC_014323	AAGCA	2	10	35337	35346	60 %	0 %	20 %	20 %	300309369
27	NC_014323	CCGCA	2	10	39005	39014	20 %	0 %	20 %	60 %	300309372
28	NC_014323	GCTCT	2	10	41290	41299	0 %	40 %	20 %	40 %	300309376
29	NC_014323	AGGTC	2	10	41976	41985	20 %	20 %	40 %	20 %	300309376
30	NC_014323	GACCG	2	10	44308	44317	20 %	0 %	40 %	40 %	300309379
31	NC_014323	AGGCC	2	10	47030	47039	20 %	0 %	40 %	40 %	300309380
32	NC_014323	GCGCG	2	10	48566	48575	0 %	0 %	60 %	40 %	300309382
33	NC_014323	CCAGG	2	10	48588	48597	20 %	0 %	40 %	40 %	300309382
34	NC_014323	TGTCT	2	10	48794	48803	0 %	60 %	20 %	20 %	300309382
35	NC_014323	GCGCG	2	10	49539	49548	0 %	0 %	60 %	40 %	300309383
36	NC_014323	CTGCG	2	10	53600	53609	0 %	20 %	40 %	40 %	300309386
37	NC_014323	GCTGG	2	10	56120	56129	0 %	20 %	60 %	20 %	300309387
38	NC_014323	CCGCC	2	10	56195	56204	0 %	0 %	20 %	80 %	300309387
39	NC_014323	CTTTC	2	10	57920	57929	0 %	60 %	0 %	40 %	300309389
40	NC_014323	GCGCC	2	10	64289	64298	0 %	0 %	40 %	60 %	300309396
41	NC_014323	GCGCG	2	10	65674	65683	0 %	0 %	60 %	40 %	300309397
42	NC_014323	CGCCC	2	10	67472	67481	0 %	0 %	20 %	80 %	300309398
43	NC_014323	AGGGC	2	10	69349	69358	20 %	0 %	60 %	20 %	300309401
44	NC_014323	CGCTG	2	10	70015	70024	0 %	20 %	40 %	40 %	300309402
45	NC_014323	TGCGC	2	10	70068	70077	0 %	20 %	40 %	40 %	300309402
46	NC_014323	GGCCA	2	10	70974	70983	20 %	0 %	40 %	40 %	300309403
47	NC_014323	GCCGC	2	10	71557	71566	0 %	0 %	40 %	60 %	300309403
48	NC_014323	AGGGC	2	10	71997	72006	20 %	0 %	60 %	20 %	300309404
49	NC_014323	GCGCT	2	10	75322	75331	0 %	20 %	40 %	40 %	300309407
50	NC_014323	GCGCC	2	10	80122	80131	0 %	0 %	40 %	60 %	300309413
51	NC_014323	CGGAG	2	10	80556	80565	20 %	0 %	60 %	20 %	300309413
52	NC_014323	CTGGC	2	10	85000	85009	0 %	20 %	40 %	40 %	300309417
53	NC_014323	GCCAG	2	10	85040	85049	20 %	0 %	40 %	40 %	300309417
54	NC_014323	TTTGA	2	10	87013	87022	20 %	60 %	20 %	0 %	300309419
55	NC_014323	CCACG	2	10	87346	87355	20 %	0 %	20 %	60 %	300309420
56	NC_014323	GCCGC	2	10	89377	89386	0 %	0 %	40 %	60 %	300309421
57	NC_014323	GAACT	2	10	89431	89440	40 %	20 %	20 %	20 %	300309421
58	NC_014323	GGCGC	2	10	89502	89511	0 %	0 %	60 %	40 %	300309421
59	NC_014323	GCGCC	2	10	90162	90171	0 %	0 %	40 %	60 %	300309422
60	NC_014323	CCACG	2	10	92633	92642	20 %	0 %	20 %	60 %	300309424
61	NC_014323	CCAGC	2	10	92663	92672	20 %	0 %	20 %	60 %	300309424
62	NC_014323	GCGCC	2	10	95099	95108	0 %	0 %	40 %	60 %	300309425
63	NC_014323	GGCGC	2	10	95378	95387	0 %	0 %	60 %	40 %	300309426
64	NC_014323	CAGCG	2	10	95496	95505	20 %	0 %	40 %	40 %	300309426
65	NC_014323	CCAGC	2	10	96110	96119	20 %	0 %	20 %	60 %	300309427
66	NC_014323	GCCGG	2	10	96617	96626	0 %	0 %	60 %	40 %	300309427
67	NC_014323	GGCGC	2	10	96872	96881	0 %	0 %	60 %	40 %	300309427
68	NC_014323	GCGCC	2	10	97313	97322	0 %	0 %	40 %	60 %	300309427
69	NC_014323	GGCCT	2	10	98923	98932	0 %	20 %	40 %	40 %	300309429
70	NC_014323	CGCGG	2	10	99190	99199	0 %	0 %	60 %	40 %	300309430
71	NC_014323	CTGGT	2	10	100496	100505	0 %	40 %	40 %	20 %	300309431
72	NC_014323	GCTGT	2	10	106121	106130	0 %	40 %	40 %	20 %	300309436
73	NC_014323	GGCGC	2	10	106429	106438	0 %	0 %	60 %	40 %	300309436
74	NC_014323	CTGCG	2	10	108342	108351	0 %	20 %	40 %	40 %	300309438
75	NC_014323	CGAAG	2	10	110551	110560	40 %	0 %	40 %	20 %	300309440
76	NC_014323	GCGCA	2	10	110709	110718	20 %	0 %	40 %	40 %	300309440
77	NC_014323	CGGCC	2	10	113001	113010	0 %	0 %	40 %	60 %	300309443
78	NC_014323	TACCG	2	10	113847	113856	20 %	20 %	20 %	40 %	300309444
79	NC_014323	CGTTC	2	10	115714	115723	0 %	40 %	20 %	40 %	300309447
80	NC_014323	CGTCG	2	10	116882	116891	0 %	20 %	40 %	40 %	300309447
81	NC_014323	TGCGT	2	10	117021	117030	0 %	40 %	40 %	20 %	300309447
82	NC_014323	GACCA	2	10	117209	117218	40 %	0 %	20 %	40 %	300309447
83	NC_014323	CTGGG	2	10	119051	119060	0 %	20 %	60 %	20 %	300309447
84	NC_014323	CCGTC	2	10	120405	120414	0 %	20 %	20 %	60 %	300309448
85	NC_014323	AAGGC	2	10	121372	121381	40 %	0 %	40 %	20 %	300309448
86	NC_014323	CTGGC	2	10	124129	124138	0 %	20 %	40 %	40 %	300309448
87	NC_014323	CCGGG	2	10	124958	124967	0 %	0 %	60 %	40 %	300309449
88	NC_014323	CAGGG	2	10	127286	127295	20 %	0 %	60 %	20 %	300309450
89	NC_014323	CGAAG	2	10	131889	131898	40 %	0 %	40 %	20 %	300309454
90	NC_014323	GCGCA	2	10	132047	132056	20 %	0 %	40 %	40 %	300309454
91	NC_014323	TCAAA	2	10	133641	133650	60 %	20 %	0 %	20 %	300309456
92	NC_014323	TCGCG	2	10	135935	135944	0 %	20 %	40 %	40 %	300309459
93	NC_014323	CTCCG	2	10	139910	139919	0 %	20 %	20 %	60 %	300309469
94	NC_014323	GCGTC	2	10	142178	142187	0 %	20 %	40 %	40 %	300309475
95	NC_014323	TCGTG	2	10	142445	142454	0 %	40 %	40 %	20 %	300309475
96	NC_014323	TTAAC	2	10	144309	144318	40 %	40 %	0 %	20 %	300309478
97	NC_014323	CCCGG	2	10	145028	145037	0 %	0 %	40 %	60 %	300309480
98	NC_014323	TGGTG	2	10	146222	146231	0 %	40 %	60 %	0 %	300309482
99	NC_014323	ATCCT	2	10	146785	146794	20 %	40 %	0 %	40 %	300309482
100	NC_014323	CAGCG	2	10	146883	146892	20 %	0 %	40 %	40 %	300309482
101	NC_014323	GCGTC	2	10	147342	147351	0 %	20 %	40 %	40 %	300309483
102	NC_014323	TGCCC	2	10	148023	148032	0 %	20 %	20 %	60 %	300309484
103	NC_014323	GAGCT	2	10	148323	148332	20 %	20 %	40 %	20 %	300309485
104	NC_014323	GCTTG	2	10	149486	149495	0 %	40 %	40 %	20 %	300309485
105	NC_014323	GCGTC	2	10	149877	149886	0 %	20 %	40 %	40 %	300309485
106	NC_014323	GCGCC	2	10	150648	150657	0 %	0 %	40 %	60 %	300309486
107	NC_014323	GGGCT	2	10	152679	152688	0 %	20 %	60 %	20 %	300309488
108	NC_014323	AATCA	2	10	156274	156283	60 %	20 %	0 %	20 %	300309491
109	NC_014323	GCGCG	2	10	156469	156478	0 %	0 %	60 %	40 %	300309491
110	NC_014323	GCTGT	2	10	157469	157478	0 %	40 %	40 %	20 %	300309492
111	NC_014323	GCGCA	2	10	166812	166821	20 %	0 %	40 %	40 %	300309500
112	NC_014323	ACCGC	2	10	167100	167109	20 %	0 %	20 %	60 %	300309500
113	NC_014323	CCAGA	2	10	167357	167366	40 %	0 %	20 %	40 %	300309500
114	NC_014323	GGTCA	2	10	173924	173933	20 %	20 %	40 %	20 %	300309508
115	NC_014323	AGTGC	2	10	174007	174016	20 %	20 %	40 %	20 %	300309508
116	NC_014323	GCGTC	2	10	176236	176245	0 %	20 %	40 %	40 %	300309512
117	NC_014323	GAGCA	2	10	177010	177019	40 %	0 %	40 %	20 %	300309512
118	NC_014323	GGCCC	2	10	179309	179318	0 %	0 %	40 %	60 %	300309514
119	NC_014323	ACCGC	2	10	181094	181103	20 %	0 %	20 %	60 %	300309516
120	NC_014323	CGGCC	2	10	181569	181578	0 %	0 %	40 %	60 %	300309516
121	NC_014323	GCCGC	2	10	182720	182729	0 %	0 %	40 %	60 %	300309517
122	NC_014323	GGGCC	2	10	185760	185769	0 %	0 %	60 %	40 %	300309520
123	NC_014323	GGGCG	2	10	187487	187496	0 %	0 %	80 %	20 %	300309522
124	NC_014323	ACCTG	2	10	189398	189407	20 %	20 %	20 %	40 %	300309523
125	NC_014323	GCCGC	2	10	189910	189919	0 %	0 %	40 %	60 %	300309523
126	NC_014323	GCGCA	2	10	194636	194645	20 %	0 %	40 %	40 %	300309527
127	NC_014323	CGGTG	2	10	196941	196950	0 %	20 %	60 %	20 %	300309528
128	NC_014323	CATCG	2	10	197994	198003	20 %	20 %	20 %	40 %	300309529
129	NC_014323	CTGGC	2	10	198814	198823	0 %	20 %	40 %	40 %	300309529
130	NC_014323	AGCGC	2	10	199262	199271	20 %	0 %	40 %	40 %	300309529
131	NC_014323	CGGCG	2	10	199394	199403	0 %	0 %	60 %	40 %	300309529
132	NC_014323	GGGCG	2	10	201602	201611	0 %	0 %	80 %	20 %	300309533
133	NC_014323	CATGC	2	10	203083	203092	20 %	20 %	20 %	40 %	300309534
134	NC_014323	TCGGA	2	10	204357	204366	20 %	20 %	40 %	20 %	300309535
135	NC_014323	GCCGC	2	10	204534	204543	0 %	0 %	40 %	60 %	300309535
136	NC_014323	CTGGG	2	10	204581	204590	0 %	20 %	60 %	20 %	300309535
137	NC_014323	GCGCG	2	10	206217	206226	0 %	0 %	60 %	40 %	300309536
138	NC_014323	AAGCC	2	10	206342	206351	40 %	0 %	20 %	40 %	300309536
139	NC_014323	GGCCA	2	10	209292	209301	20 %	0 %	40 %	40 %	300309538
140	NC_014323	CACCG	2	10	209595	209604	20 %	0 %	20 %	60 %	300309538
141	NC_014323	GCCGC	2	10	209947	209956	0 %	0 %	40 %	60 %	300309538
142	NC_014323	GGCCT	2	10	212314	212323	0 %	20 %	40 %	40 %	300309541
143	NC_014323	CGTGA	2	10	212932	212941	20 %	20 %	40 %	20 %	300309541
144	NC_014323	GTGCG	2	10	213386	213395	0 %	20 %	60 %	20 %	300309542
145	NC_014323	TCATG	2	10	215007	215016	20 %	40 %	20 %	20 %	300309543
146	NC_014323	GATGC	2	10	216040	216049	20 %	20 %	40 %	20 %	300309545
147	NC_014323	GATGC	2	10	223825	223834	20 %	20 %	40 %	20 %	300309556
148	NC_014323	CTGGT	2	10	223940	223949	0 %	40 %	40 %	20 %	300309556
149	NC_014323	TGCCG	2	10	224241	224250	0 %	20 %	40 %	40 %	300309556
150	NC_014323	GGGCC	2	10	224772	224781	0 %	0 %	60 %	40 %	300309556
151	NC_014323	GCCAG	2	10	224981	224990	20 %	0 %	40 %	40 %	300309557
152	NC_014323	GGTGC	2	10	225257	225266	0 %	20 %	60 %	20 %	300309558
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157	NC_014323	GCCAG	2	10	232136	232145	20 %	0 %	40 %	40 %	300309566
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159	NC_014323	GCGCA	2	10	233115	233124	20 %	0 %	40 %	40 %	300309567
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161	NC_014323	GGCCA	2	10	234804	234813	20 %	0 %	40 %	40 %	300309568
162	NC_014323	GGCCA	2	10	234885	234894	20 %	0 %	40 %	40 %	300309568
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165	NC_014323	CTGGC	2	10	241776	241785	0 %	20 %	40 %	40 %	300309577
166	NC_014323	GCCAG	2	10	241834	241843	20 %	0 %	40 %	40 %	300309577
167	NC_014323	CAAGC	2	10	242015	242024	40 %	0 %	20 %	40 %	300309578
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169	NC_014323	GGTCG	2	10	244287	244296	0 %	20 %	60 %	20 %	300309580
170	NC_014323	CGCAG	2	10	248077	248086	20 %	0 %	40 %	40 %	300309584
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193	NC_014323	GCCAG	2	10	285723	285732	20 %	0 %	40 %	40 %	300309611
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199	NC_014323	CATTG	2	10	295553	295562	20 %	40 %	20 %	20 %	300309620
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243	NC_014323	GACGC	2	10	358141	358150	20 %	0 %	40 %	40 %	300309667
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253	NC_014323	TGCGC	2	10	373341	373350	0 %	20 %	40 %	40 %	300309679
254	NC_014323	CGGTG	2	10	375822	375831	0 %	20 %	60 %	20 %	300309682
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382	NC_014323	ACACC	2	10	544212	544221	40 %	0 %	0 %	60 %	300309836
383	NC_014323	CGCAG	2	10	544832	544841	20 %	0 %	40 %	40 %	300309836
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387	NC_014323	ATGAC	2	10	546613	546622	40 %	20 %	20 %	20 %	300309838
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391	NC_014323	GTCGG	2	10	554782	554791	0 %	20 %	60 %	20 %	300309843
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499	NC_014323	CGGCG	2	10	706680	706689	0 %	0 %	60 %	40 %	300309977
500	NC_014323	GCTGG	2	10	706925	706934	0 %	20 %	60 %	20 %	300309977

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