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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 2154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	GGCC	2	8	1652	1659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014323	CAGG	2	8	1882	1889	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014323	CCGT	2	8	6083	6090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014323	GTCT	2	8	13816	13823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014323	GTCA	2	8	16270	16277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014323	ATAG	2	8	19196	19203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014323	GCCT	2	8	20512	20519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014323	CTGC	2	8	29007	29014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014323	CGGA	2	8	29250	29257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014323	TGCG	2	8	34843	34850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014323	GCAG	2	8	37603	37610	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014323	GTTG	2	8	42697	42704	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014323	GACG	2	8	42786	42793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014323	GCCG	2	8	48204	48211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014323	CGCT	2	8	48910	48917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014323	GACC	2	8	50438	50445	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014323	TGCA	2	8	54014	54021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014323	TCCC	2	8	58859	58866	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014323	CAGG	2	8	59945	59952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014323	TGCA	2	8	63699	63706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014323	GCTG	2	8	66287	66294	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014323	GGCG	2	8	66317	66324	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014323	GCCG	2	8	71928	71935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014323	CAAG	2	8	75461	75468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014323	GCCA	2	8	76479	76486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014323	AGAA	2	8	76556	76563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014323	GGCG	2	8	81076	81083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014323	CGGA	2	8	81109	81116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014323	AAAC	2	8	81311	81318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014323	GTTT	2	8	81336	81343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014323	CCGG	2	8	82172	82179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014323	TTGC	2	8	86509	86516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014323	GCGG	2	8	86529	86536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014323	TTGA	2	8	87051	87058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014323	CAGC	2	8	91561	91568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014323	CAGC	2	8	91863	91870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014323	GCCT	2	8	98151	98158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014323	GGCC	2	8	101173	101180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014323	GTCC	2	8	104534	104541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014323	CAGG	2	8	104639	104646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014323	TGAG	2	8	106636	106643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014323	CAGT	2	8	109903	109910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014323	TCAA	2	8	112910	112917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014323	AAAT	2	8	114965	114972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014323	TCCT	2	8	115620	115627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014323	TCAC	2	8	115629	115636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014323	GTGA	2	8	124513	124520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014323	CCAA	2	8	124598	124605	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014323	GCTG	2	8	131693	131700	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014323	GTTC	2	8	133031	133038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014323	CTTT	2	8	138361	138368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014323	GAAA	2	8	138491	138498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014323	GAAA	2	8	144181	144188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014323	CTGG	2	8	147153	147160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014323	TTTG	2	8	150740	150747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014323	GCCC	2	8	153075	153082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_014323	ACGC	2	8	156134	156141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014323	CCTG	2	8	159136	159143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014323	GTTG	2	8	161110	161117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014323	CCCG	2	8	164517	164524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_014323	TACA	2	8	166120	166127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014323	GCCG	2	8	166323	166330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014323	GATG	2	8	166457	166464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014323	GCCG	2	8	170388	170395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014323	GGCA	2	8	173386	173393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014323	GCTG	2	8	175208	175215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014323	GCAG	2	8	175802	175809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014323	GGAG	2	8	177993	178000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014323	GGCT	2	8	181838	181845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014323	GCCA	2	8	192012	192019	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014323	CTTT	2	8	194374	194381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014323	TGTC	2	8	194395	194402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014323	TGTC	2	8	194530	194537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014323	GTTT	2	8	202777	202784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014323	CTTG	2	8	204047	204054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014323	AGCC	2	8	206692	206699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014323	CGGC	2	8	211168	211175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014323	TTAA	2	8	213181	213188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014323	TTCT	2	8	215387	215394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014323	GGAA	2	8	230703	230710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014323	CCAT	2	8	238288	238295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014323	GGCC	2	8	248205	248212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014323	TGCG	2	8	253408	253415	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014323	TTCC	2	8	261228	261235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014323	CCCG	2	8	261239	261246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_014323	GGGA	2	8	266415	266422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014323	CCGC	2	8	268611	268618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_014323	CTGT	2	8	268731	268738	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014323	CGCC	2	8	268949	268956	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_014323	TTCC	2	8	285972	285979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014323	TCTT	2	8	289352	289359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014323	AGTG	2	8	296057	296064	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014323	TGTT	2	8	305533	305540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014323	CAGA	2	8	305773	305780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014323	GTGC	2	8	305894	305901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014323	CGTG	2	8	306437	306444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014323	GGTG	2	8	314485	314492	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014323	GGCC	2	8	315283	315290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014323	CCTG	2	8	318476	318483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014323	GGTG	2	8	320760	320767	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014323	CCCG	2	8	320855	320862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_014323	GGGC	2	8	323424	323431	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014323	TTGC	2	8	323450	323457	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014323	AGTC	2	8	323518	323525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014323	GCTG	2	8	325373	325380	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014323	CTGT	2	8	325398	325405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014323	CCCT	2	8	328323	328330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_014323	AATC	2	8	336565	336572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014323	GCGA	2	8	340180	340187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014323	ACGG	2	8	341900	341907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014323	TGCA	2	8	341935	341942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014323	TCTA	2	8	342456	342463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014323	CTTG	2	8	342465	342472	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014323	TGGA	2	8	342475	342482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014323	TTGA	2	8	359272	359279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014323	GCAG	2	8	367594	367601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014323	GCAA	2	8	376739	376746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014323	GCCC	2	8	378153	378160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_014323	CCTC	2	8	379884	379891	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_014323	GCAA	3	12	379894	379905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014323	CCGG	2	8	380584	380591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014323	ATGC	2	8	390077	390084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014323	GCAG	2	8	394071	394078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014323	AAAG	2	8	395909	395916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014323	AGGC	2	8	397819	397826	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014323	TGGA	2	8	397892	397899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014323	TGGC	2	8	397922	397929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014323	ATTC	3	12	398056	398067	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014323	GGGT	2	8	398825	398832	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014323	CCGC	2	8	400091	400098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014323	CAGG	2	8	402539	402546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014323	AAAG	2	8	402648	402655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014323	CAGC	2	8	402663	402670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014323	ACCG	2	8	402719	402726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014323	GGCG	2	8	404481	404488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014323	TTTG	2	8	404510	404517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014323	TACT	2	8	404530	404537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014323	TTTG	2	8	405277	405284	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014323	AGGA	2	8	406124	406131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014323	GGCA	2	8	410564	410571	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014323	GTAA	2	8	415778	415785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014323	AATC	2	8	417280	417287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014323	TGCG	2	8	418600	418607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014323	GGCT	2	8	421014	421021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014323	GCCT	2	8	423271	423278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014323	GCGG	2	8	424743	424750	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014323	CGGC	2	8	425313	425320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014323	CTTT	2	8	425898	425905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014323	CTTC	2	8	428274	428281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014323	CCGC	2	8	437061	437068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014323	TCCC	2	8	437920	437927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_014323	CCAG	2	8	437992	437999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014323	GCGG	2	8	439055	439062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014323	CGAT	2	8	439632	439639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014323	GGCA	2	8	440782	440789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_014323	CTGC	2	8	445012	445019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014323	AATA	2	8	447492	447499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014323	CCTT	2	8	449107	449114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_014323	GCCT	2	8	453901	453908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
160	NC_014323	CCGC	2	8	464884	464891	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
161	NC_014323	GATA	2	8	468100	468107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014323	CAGT	2	8	468129	468136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_014323	TGCC	2	8	474715	474722	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_014323	TGCT	2	8	474734	474741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_014323	TCAA	2	8	477845	477852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_014323	GCGA	2	8	488565	488572	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_014323	CAGG	2	8	488903	488910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_014323	CCTG	2	8	490822	490829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_014323	GCTG	2	8	491466	491473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014323	GCCC	2	8	495944	495951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_014323	TCCG	2	8	496282	496289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
174	NC_014323	TCGG	2	8	498082	498089	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
175	NC_014323	GGCC	2	8	498149	498156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
176	NC_014323	AGAA	2	8	499235	499242	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_014323	TTTC	2	8	499462	499469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
179	NC_014323	TTCT	2	8	499475	499482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_014323	TTCT	2	8	499487	499494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_014323	GCCG	2	8	502799	502806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_014323	CCGC	2	8	507183	507190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
183	NC_014323	CTTG	2	8	511469	511476	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_014323	CTGG	2	8	513136	513143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
185	NC_014323	GCCC	2	8	513200	513207	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
186	NC_014323	GGGC	2	8	515832	515839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
187	NC_014323	GGAT	2	8	519110	519117	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014323	GTGA	2	8	520044	520051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014323	TACC	2	8	520621	520628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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192	NC_014323	ATCA	2	8	521622	521629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_014323	TTGA	2	8	523589	523596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_014323	TTTG	2	8	525146	525153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_014323	CCGG	2	8	536976	536983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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225	NC_014323	CCTG	2	8	568074	568081	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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231	NC_014323	TCGG	2	8	595758	595765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_014323	GGTC	2	8	597706	597713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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241	NC_014323	CGTT	2	8	612540	612547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
242	NC_014323	CGCC	2	8	613357	613364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
243	NC_014323	CCGC	2	8	614193	614200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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273	NC_014323	TGCT	2	8	698568	698575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_014323	CTGT	2	8	712738	712745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_014323	TTCC	2	8	719762	719769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_014323	TCAT	2	8	721045	721052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
284	NC_014323	GGCG	2	8	721139	721146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
285	NC_014323	TTGT	2	8	721174	721181	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014323	GCAG	2	8	721194	721201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
287	NC_014323	GCAT	2	8	722201	722208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_014323	TCAT	2	8	722361	722368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_014323	CAAG	2	8	731923	731930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
292	NC_014323	GCAG	2	8	734397	734404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_014323	ACCG	2	8	737153	737160	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_014323	CAGG	2	8	746847	746854	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
295	NC_014323	GCAA	2	8	747620	747627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
296	NC_014323	GGCT	2	8	749580	749587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_014323	TTGA	2	8	1242170	1242177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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486	NC_014323	TGGG	2	8	1244590	1244597	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
487	NC_014323	ATGG	2	8	1244999	1245006	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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