MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 8769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	GCC	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014323	CGG	2	6	1453	1458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014323	CGC	2	6	1519	1524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014323	ATC	2	6	1546	1551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014323	CAA	2	6	1564	1569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014323	ACT	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014323	TGA	2	6	1606	1611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014323	AGT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014323	GAG	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014323	ATG	2	6	1953	1958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014323	ATT	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014323	TGC	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014323	CGC	2	6	5915	5920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014323	AGC	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014323	TAG	2	6	8169	8174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014323	AAT	2	6	11247	11252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014323	AGC	4	12	11299	11310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014323	CAA	2	6	12352	12357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014323	GAT	2	6	13778	13783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014323	ACC	2	6	13826	13831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014323	GAC	2	6	13832	13837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014323	AGA	2	6	13852	13857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014323	ATT	2	6	15018	15023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014323	CCT	2	6	16140	16145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014323	AAG	2	6	16176	16181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014323	GGC	2	6	16216	16221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014323	TCG	2	6	16257	16262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014323	CTG	2	6	19239	19244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014323	AAT	2	6	19264	19269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014323	TTG	2	6	19352	19357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014323	CAC	2	6	19407	19412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014323	CAA	2	6	20579	20584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014323	GTG	2	6	22892	22897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014323	GGC	2	6	22918	22923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014323	GGC	2	6	22951	22956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014323	TGC	2	6	22989	22994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014323	CGG	2	6	23025	23030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014323	GCG	2	6	23051	23056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014323	GCG	2	6	23211	23216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014323	GAT	2	6	25485	25490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014323	GGC	2	6	25781	25786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014323	ACG	2	6	25792	25797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014323	CTA	2	6	25825	25830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014323	CTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014323	GCC	2	6	29052	29057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014323	CGA	2	6	29129	29134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014323	CCT	2	6	29219	29224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014323	ACC	2	6	37572	37577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014323	GTC	2	6	39664	39669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014323	CAG	2	6	42706	42711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014323	TGG	2	6	42718	42723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014323	AAC	2	6	42736	42741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014323	GGA	2	6	42794	42799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014323	TCC	2	6	46537	46542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014323	ACG	2	6	48839	48844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014323	TCA	2	6	48889	48894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014323	TGC	2	6	50261	50266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014323	CGG	2	6	50318	50323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014323	GTA	2	6	50331	50336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014323	CTT	2	6	52942	52947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014323	TTG	2	6	52954	52959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014323	CCG	2	6	53041	53046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014323	CGG	2	6	54074	54079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014323	CGT	2	6	54091	54096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014323	GCC	2	6	54137	54142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014323	ACA	2	6	56358	56363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014323	CGT	2	6	57724	57729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014323	CAG	2	6	57755	57760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014323	TTG	2	6	57779	57784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014323	TGG	2	6	57814	57819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014323	GGC	2	6	57860	57865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014323	CAG	3	9	57881	57889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014323	CAT	2	6	58547	58552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014323	ATT	2	6	58663	58668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014323	GTC	2	6	58875	58880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014323	GGT	2	6	59853	59858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014323	ACC	3	9	59917	59925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014323	CAA	2	6	60080	60085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014323	AGG	2	6	60111	60116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014323	TGA	2	6	60468	60473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014323	CTG	2	6	60485	60490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014323	CGC	2	6	60515	60520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014323	GAA	2	6	60541	60546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014323	AAC	2	6	60578	60583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014323	GGA	2	6	62001	62006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014323	CGG	2	6	62017	62022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014323	AGC	2	6	62068	62073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014323	GAA	2	6	62081	62086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014323	TCA	2	6	62173	62178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014323	CCG	2	6	63084	63089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014323	GCA	2	6	63135	63140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014323	CCA	2	6	63180	63185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014323	GCA	2	6	63201	63206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014323	GAC	2	6	63735	63740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014323	TGG	2	6	66181	66186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014323	TGC	2	6	66233	66238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014323	GCG	2	6	66297	66302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014323	GCC	2	6	66342	66347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014323	GGC	3	9	66367	66375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014323	GCG	2	6	66389	66394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014323	GCG	2	6	66398	66403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014323	GCC	2	6	66411	66416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014323	AGA	2	6	66425	66430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014323	CCG	3	9	66441	66449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014323	GCG	2	6	66460	66465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014323	CGG	2	6	66466	66471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014323	TCA	2	6	67841	67846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014323	CCA	2	6	67867	67872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014323	TCG	2	6	67908	67913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014323	TCA	2	6	68008	68013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014323	GCG	2	6	68417	68422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014323	GGA	2	6	68437	68442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014323	TTG	2	6	68452	68457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014323	CAA	2	6	68462	68467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014323	CAA	2	6	68490	68495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014323	GCG	2	6	72170	72175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014323	GAA	2	6	72318	72323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014323	CGA	2	6	74243	74248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014323	GCG	2	6	74332	74337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014323	CAG	2	6	74383	74388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014323	GCG	2	6	76442	76447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014323	TCC	2	6	76547	76552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014323	CGC	2	6	77365	77370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014323	TGA	2	6	77390	77395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014323	GCT	2	6	77398	77403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014323	GCT	2	6	77441	77446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014323	CTG	3	9	80616	80624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014323	CGC	2	6	80639	80644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014323	GCG	2	6	80654	80659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014323	GGC	2	6	81124	81129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014323	TGC	2	6	81143	81148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014323	GCA	2	6	81222	81227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014323	GCG	2	6	81263	81268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014323	TGC	2	6	82125	82130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014323	GCT	2	6	82138	82143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014323	GAA	2	6	86482	86487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014323	CGT	2	6	86503	86508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014323	GAT	2	6	86632	86637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014323	GGC	2	6	86681	86686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_014323	TTC	2	6	174265	174270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_014323	TCC	2	6	175724	175729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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