MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 1360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014323	AG	3	6	5861	5866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014323	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014323	TC	3	6	13764	13769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014323	AG	3	6	19187	19192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014323	CG	3	6	20551	20556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014323	TC	3	6	25859	25864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014323	CT	3	6	50283	50288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014323	GC	3	6	54108	54113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014323	GC	3	6	57508	57513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014323	GC	3	6	57672	57677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014323	CG	3	6	57685	57690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014323	TG	3	6	58478	58483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014323	TA	3	6	58813	58818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014323	AT	3	6	62104	62109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014323	CG	3	6	74286	74291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014323	GC	3	6	86602	86607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014323	GC	3	6	91615	91620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014323	CT	4	8	91676	91683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014323	TA	3	6	97531	97536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014323	AG	3	6	97541	97546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014323	CG	3	6	101064	101069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014323	CG	3	6	104550	104555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014323	TC	4	8	108567	108574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014323	CG	3	6	115589	115594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014323	TG	3	6	128345	128350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014323	CG	3	6	128817	128822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014323	TC	3	6	160077	160082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014323	AT	3	6	163251	163256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014323	GC	3	6	166362	166367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014323	GC	3	6	166431	166436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014323	CG	3	6	166526	166531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014323	CG	3	6	175168	175173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014323	CG	3	6	175763	175768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014323	CG	3	6	181854	181859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014323	GA	3	6	183918	183923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014323	GA	3	6	186245	186250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014323	GC	3	6	187123	187128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014323	AG	3	6	187206	187211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014323	GC	3	6	188029	188034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014323	TA	3	6	188118	188123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014323	CA	4	8	196126	196133	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014323	GC	3	6	197835	197840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014323	AG	3	6	200134	200139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014323	GC	3	6	204138	204143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014323	CG	3	6	205695	205700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014323	CT	3	6	213938	213943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014323	GC	3	6	223109	223114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014323	GC	3	6	223150	223155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014323	TC	3	6	231799	231804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014323	CA	3	6	236029	236034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014323	CG	3	6	242522	242527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014323	AT	3	6	244532	244537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014323	AG	3	6	260046	260051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014323	GC	3	6	261089	261094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014323	CT	3	6	266399	266404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014323	GC	4	8	267642	267649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014323	CG	5	10	268555	268564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014323	GA	3	6	268801	268806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014323	GC	3	6	273495	273500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014323	CT	3	6	310637	310642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014323	GC	3	6	310670	310675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014323	GC	3	6	315200	315205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014323	GC	3	6	315221	315226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014323	AC	3	6	315805	315810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014323	GC	3	6	320879	320884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014323	GC	3	6	328235	328240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014323	GC	3	6	328384	328389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014323	TG	3	6	328714	328719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014323	GC	3	6	336595	336600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014323	GA	3	6	349731	349736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014323	GC	3	6	349780	349785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014323	GA	3	6	349896	349901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014323	AG	3	6	351206	351211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014323	GT	3	6	359694	359699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014323	GC	4	8	374547	374554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014323	AT	3	6	376841	376846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014323	GC	3	6	378145	378150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014323	CG	4	8	394035	394042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014323	GC	3	6	400046	400051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014323	GC	3	6	402580	402585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014323	GC	3	6	404982	404987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014323	GC	3	6	407691	407696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014323	AC	3	6	407898	407903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014323	TG	3	6	418555	418560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014323	GC	3	6	418593	418598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014323	CA	3	6	419388	419393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014323	GC	3	6	425856	425861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014323	GC	3	6	427098	427103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014323	TC	4	8	428255	428262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014323	GC	3	6	428294	428299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014323	GC	3	6	428325	428330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014323	GC	3	6	437835	437840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014323	AC	3	6	437846	437851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014323	GT	3	6	440873	440878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014323	CT	3	6	455434	455439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014323	CG	3	6	464824	464829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014323	GC	3	6	464861	464866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014323	GC	3	6	467291	467296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014323	AG	3	6	468028	468033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014323	GC	3	6	472537	472542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014323	GT	3	6	474670	474675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014323	GT	3	6	479523	479528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014323	GA	3	6	486443	486448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014323	CG	3	6	488742	488747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014323	GC	4	8	488895	488902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014323	GC	3	6	495907	495912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014323	CG	3	6	496261	496266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014323	GC	3	6	498028	498033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014323	GC	3	6	498044	498049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014323	CG	3	6	499423	499428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014323	TC	3	6	500615	500620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014323	GC	3	6	507217	507222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014323	AC	3	6	519209	519214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014323	GA	3	6	519594	519599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014323	AT	3	6	519759	519764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014323	GT	3	6	520296	520301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014323	AC	3	6	521029	521034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014323	TC	3	6	522542	522547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014323	GA	3	6	523367	523372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014323	AT	3	6	524643	524648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014323	GC	4	8	531823	531830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014323	GC	3	6	533107	533112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014323	GA	3	6	533161	533166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014323	GC	4	8	535082	535089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014323	CA	3	6	538003	538008	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014323	GC	3	6	539903	539908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014323	AG	4	8	541743	541750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014323	TC	3	6	541792	541797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014323	TC	3	6	545438	545443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014323	CA	3	6	550313	550318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014323	GC	3	6	550791	550796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014323	CA	3	6	557823	557828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014323	TG	3	6	560722	560727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014323	TG	3	6	563751	563756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014323	GC	3	6	568933	568938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014323	GC	3	6	576623	576628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014323	AG	3	6	579418	579423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014323	GC	3	6	579544	579549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014323	TA	3	6	581139	581144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014323	GC	3	6	583154	583159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014323	TC	3	6	590815	590820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014323	AC	3	6	590862	590867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014323	GC	3	6	597459	597464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014323	CT	4	8	600494	600501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014323	GT	3	6	600588	600593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014323	AG	3	6	600727	600732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014323	GC	3	6	611137	611142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014323	CG	3	6	612353	612358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014323	GT	3	6	613395	613400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014323	GC	3	6	614069	614074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_014323	GC	3	6	614204	614209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014323	CA	3	6	615642	615647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_014323	TC	3	6	616730	616735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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