MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014319	TACTAT	2	12	11820	11831	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014319	GTTTAG	2	12	24356	24367	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014319	GTATGA	2	12	53021	53032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014319	AATATC	2	12	61232	61243	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014319	CTTTAA	2	12	66857	66868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014319	TTTGCT	2	12	86794	86805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014319	GTCATT	2	12	101044	101055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014319	TCAAAT	2	12	118172	118183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014319	AGATTA	2	12	165532	165543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014319	TAAATT	2	12	176718	176729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014319	AATAGA	2	12	238358	238369	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014319	GTTTAT	2	12	253998	254009	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014319	AATAAA	2	12	260800	260811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014319	ATCATT	2	12	281804	281815	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014319	AGTGAA	2	12	288928	288939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014319	ACTAGG	2	12	303882	303893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014319	TTAAAA	2	12	334249	334260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014319	AAAAAT	2	12	383796	383807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014319	TAGGGG	2	12	411175	411186	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014319	GTAAAT	2	12	415379	415390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014319	CTAAAA	2	12	419677	419688	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014319	AAAAGA	2	12	444384	444395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014319	TAAAAA	2	12	459796	459807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014319	TAAAAA	2	12	509715	509726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014319	AATTTC	2	12	565088	565099	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014319	CTATTG	2	12	591209	591220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014319	GTTATT	2	12	651418	651429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014319	GTTTTT	2	12	727215	727226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014319	TAAAAC	2	12	761390	761401	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014319	ATAATG	2	12	829023	829034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014319	TCTCTT	2	12	848025	848036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014319	ATTTCA	2	12	851276	851287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014319	TAAAAA	2	12	864927	864938	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014319	TTTATA	2	12	956129	956140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014319	AAATAT	2	12	987745	987756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014319	GGAAAA	2	12	1011540	1011551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014319	TGTTAT	2	12	1034549	1034560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014319	ATTTCA	2	12	1054911	1054922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014319	TCAAAA	2	12	1061464	1061475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014319	ACTTCA	2	12	1068383	1068394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014319	ATAAAA	2	12	1074712	1074723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014319	CCATTA	2	12	1086416	1086427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014319	TTTAAG	2	12	1107391	1107402	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014319	TTTTAA	2	12	1121454	1121465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014319	TAATTT	2	12	1165010	1165021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014319	CATATT	2	12	1191290	1191301	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014319	AAAAAC	2	12	1286140	1286151	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014319	TTATAA	2	12	1287527	1287538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014319	GAAAAA	2	12	1302269	1302280	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014319	TTTTAT	2	12	1302539	1302550	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014319	ATAATG	2	12	1304573	1304584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014319	ACCTAA	2	12	1322772	1322783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014319	CATAGA	2	12	1326134	1326145	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014319	TATTTT	2	12	1426137	1426148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014319	AATTTA	2	12	1444633	1444644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014319	AAAATG	2	12	1508844	1508855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014319	ATACAT	2	12	1609092	1609103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014319	ATTGAC	2	12	1641559	1641570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014319	CTATTA	2	12	1672522	1672533	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014319	ATATCA	2	12	1680202	1680213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014319	TTAAAT	2	12	1683472	1683483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014319	TAATTG	2	12	1692622	1692633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014319	CTAAAT	2	12	1694882	1694893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014319	TGATTT	2	12	1719530	1719541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014319	TAAATG	2	12	1871160	1871171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014319	AATGTT	3	18	1872420	1872437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014319	ATCTAA	2	12	1873108	1873119	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014319	TTTAGG	2	12	1894721	1894732	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014319	TTTATA	2	12	1905911	1905922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014319	GAGATT	2	12	1925545	1925556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014319	TGTTGG	2	12	1948927	1948938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014319	TTGTTA	2	12	1953807	1953818	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.