MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 8604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014318	ACGGC	2	10	125	134	20 %	0 %	40 %	40 %	300781938
2	NC_014318	GCGCG	2	10	186	195	0 %	0 %	60 %	40 %	300781938
3	NC_014318	CCTCC	2	10	2583	2592	0 %	20 %	0 %	80 %	300781939
4	NC_014318	CGAAG	2	10	7441	7450	40 %	0 %	40 %	20 %	300781943
5	NC_014318	CCGCG	2	10	7567	7576	0 %	0 %	40 %	60 %	300781943
6	NC_014318	GAACG	2	10	11313	11322	40 %	0 %	40 %	20 %	300781945
7	NC_014318	GCAGC	2	10	11456	11465	20 %	0 %	40 %	40 %	300781945
8	NC_014318	CGGCG	2	10	17341	17350	0 %	0 %	60 %	40 %	300781948
9	NC_014318	CGGCG	2	10	17852	17861	0 %	0 %	60 %	40 %	300781949
10	NC_014318	TGCGG	2	10	18890	18899	0 %	20 %	60 %	20 %	300781951
11	NC_014318	CGGCG	2	10	19425	19434	0 %	0 %	60 %	40 %	300781952
12	NC_014318	GCAGC	2	10	20914	20923	20 %	0 %	40 %	40 %	300781955
13	NC_014318	CAGCC	2	10	21189	21198	20 %	0 %	20 %	60 %	300781955
14	NC_014318	ATCCC	2	10	22001	22010	20 %	20 %	0 %	60 %	300781956
15	NC_014318	CGACG	2	10	27524	27533	20 %	0 %	40 %	40 %	300781958
16	NC_014318	CGCGG	2	10	29870	29879	0 %	0 %	60 %	40 %	300781961
17	NC_014318	GGCCA	2	10	30802	30811	20 %	0 %	40 %	40 %	300781962
18	NC_014318	CGGCG	2	10	31592	31601	0 %	0 %	60 %	40 %	300781962
19	NC_014318	TCGGC	2	10	32402	32411	0 %	20 %	40 %	40 %	300781962
20	NC_014318	CGGCG	2	10	34224	34233	0 %	0 %	60 %	40 %	300781963
21	NC_014318	CCGGC	2	10	39835	39844	0 %	0 %	40 %	60 %	300781970
22	NC_014318	CGTGG	2	10	41127	41136	0 %	20 %	60 %	20 %	300781972
23	NC_014318	CCAGG	2	10	41539	41548	20 %	0 %	40 %	40 %	300781973
24	NC_014318	CCTCT	2	10	42525	42534	0 %	40 %	0 %	60 %	300781974
25	NC_014318	GTTTC	2	10	44387	44396	0 %	60 %	20 %	20 %	300781977
26	NC_014318	GCGGT	2	10	44919	44928	0 %	20 %	60 %	20 %	300781978
27	NC_014318	CGGTC	2	10	54906	54915	0 %	20 %	40 %	40 %	300781987
28	NC_014318	CCGTG	2	10	55200	55209	0 %	20 %	40 %	40 %	300781988
29	NC_014318	AGGCC	2	10	57773	57782	20 %	0 %	40 %	40 %	300781989
30	NC_014318	GGCTC	2	10	58858	58867	0 %	20 %	40 %	40 %	300781990
31	NC_014318	GCCGC	2	10	61722	61731	0 %	0 %	40 %	60 %	300781993
32	NC_014318	TCGAC	2	10	62486	62495	20 %	20 %	20 %	40 %	300781994
33	NC_014318	CCGCG	2	10	63366	63375	0 %	0 %	40 %	60 %	300781995
34	NC_014318	ACCGC	2	10	64427	64436	20 %	0 %	20 %	60 %	300781996
35	NC_014318	CTCGC	2	10	64624	64633	0 %	20 %	20 %	60 %	300781996
36	NC_014318	CGACC	2	10	65544	65553	20 %	0 %	20 %	60 %	300781996
37	NC_014318	TCGGT	2	10	66791	66800	0 %	40 %	40 %	20 %	300781996
38	NC_014318	CCCGG	2	10	66951	66960	0 %	0 %	40 %	60 %	300781996
39	NC_014318	GGTCG	2	10	67345	67354	0 %	20 %	60 %	20 %	300781997
40	NC_014318	CCGTC	2	10	69213	69222	0 %	20 %	20 %	60 %	300781999
41	NC_014318	CGGCC	2	10	70208	70217	0 %	0 %	40 %	60 %	300782000
42	NC_014318	CCGGA	2	10	71856	71865	20 %	0 %	40 %	40 %	300782002
43	NC_014318	CCTGA	2	10	78509	78518	20 %	20 %	20 %	40 %	300782009
44	NC_014318	CTTCG	2	10	80864	80873	0 %	40 %	20 %	40 %	300782010
45	NC_014318	GGTCG	2	10	84159	84168	0 %	20 %	60 %	20 %	300782014
46	NC_014318	GGCCG	2	10	84240	84249	0 %	0 %	60 %	40 %	300782014
47	NC_014318	GCTGG	2	10	85349	85358	0 %	20 %	60 %	20 %	300782015
48	NC_014318	GCCGG	2	10	86120	86129	0 %	0 %	60 %	40 %	300782016
49	NC_014318	GCACC	2	10	86482	86491	20 %	0 %	20 %	60 %	300782016
50	NC_014318	GGCGA	2	10	86522	86531	20 %	0 %	60 %	20 %	300782016
51	NC_014318	GCCCG	2	10	91926	91935	0 %	0 %	40 %	60 %	300782021
52	NC_014318	CGCGC	2	10	92262	92271	0 %	0 %	40 %	60 %	300782021
53	NC_014318	CGGAC	2	10	92604	92613	20 %	0 %	40 %	40 %	300782022
54	NC_014318	CGGCG	2	10	92653	92662	0 %	0 %	60 %	40 %	300782022
55	NC_014318	GCGCG	2	10	94455	94464	0 %	0 %	60 %	40 %	300782024
56	NC_014318	TCGCG	2	10	95171	95180	0 %	20 %	40 %	40 %	300782025
57	NC_014318	GGCCG	2	10	96800	96809	0 %	0 %	60 %	40 %	300782026
58	NC_014318	GACGT	2	10	97202	97211	20 %	20 %	40 %	20 %	300782026
59	NC_014318	AGCGC	2	10	98131	98140	20 %	0 %	40 %	40 %	300782027
60	NC_014318	GCCGC	2	10	100121	100130	0 %	0 %	40 %	60 %	300782030
61	NC_014318	CTGGC	2	10	101289	101298	0 %	20 %	40 %	40 %	300782031
62	NC_014318	TCCGC	2	10	104735	104744	0 %	20 %	20 %	60 %	300782035
63	NC_014318	GCGCC	2	10	106028	106037	0 %	0 %	40 %	60 %	300782036
64	NC_014318	TCCGG	2	10	107237	107246	0 %	20 %	40 %	40 %	300782037
65	NC_014318	CCGGA	2	10	109828	109837	20 %	0 %	40 %	40 %	300782040
66	NC_014318	CGTCC	2	10	110784	110793	0 %	20 %	20 %	60 %	300782041
67	NC_014318	CGGCC	2	10	112278	112287	0 %	0 %	40 %	60 %	300782041
68	NC_014318	GGTGT	2	10	113074	113083	0 %	40 %	60 %	0 %	300782042
69	NC_014318	CGAGT	2	10	113277	113286	20 %	20 %	40 %	20 %	300782042
70	NC_014318	CCCTG	2	10	114360	114369	0 %	20 %	20 %	60 %	300782043
71	NC_014318	CACGC	2	10	114485	114494	20 %	0 %	20 %	60 %	300782043
72	NC_014318	GCACC	2	10	114702	114711	20 %	0 %	20 %	60 %	300782043
73	NC_014318	CCAGC	2	10	115193	115202	20 %	0 %	20 %	60 %	300782044
74	NC_014318	CGCGG	2	10	115857	115866	0 %	0 %	60 %	40 %	300782045
75	NC_014318	GCGCG	2	10	117459	117468	0 %	0 %	60 %	40 %	300782046
76	NC_014318	GCGCG	2	10	122593	122602	0 %	0 %	60 %	40 %	300782051
77	NC_014318	CCGGA	2	10	122753	122762	20 %	0 %	40 %	40 %	300782052
78	NC_014318	GCCGC	2	10	123642	123651	0 %	0 %	40 %	60 %	300782052
79	NC_014318	GCCGT	2	10	123813	123822	0 %	20 %	40 %	40 %	300782052
80	NC_014318	TCGCC	2	10	123998	124007	0 %	20 %	20 %	60 %	300782052
81	NC_014318	GATCG	2	10	124008	124017	20 %	20 %	40 %	20 %	300782052
82	NC_014318	CGAGG	2	10	124164	124173	20 %	0 %	60 %	20 %	300782052
83	NC_014318	GGCCG	2	10	125576	125585	0 %	0 %	60 %	40 %	300782053
84	NC_014318	CGCTG	2	10	126307	126316	0 %	20 %	40 %	40 %	300782054
85	NC_014318	CCGGG	2	10	128235	128244	0 %	0 %	60 %	40 %	300782055
86	NC_014318	GCCGA	2	10	129089	129098	20 %	0 %	40 %	40 %	300782055
87	NC_014318	CCGGT	2	10	129374	129383	0 %	20 %	40 %	40 %	300782055
88	NC_014318	GCCGG	2	10	130386	130395	0 %	0 %	60 %	40 %	300782056
89	NC_014318	TCCGC	2	10	130762	130771	0 %	20 %	20 %	60 %	300782056
90	NC_014318	GGACA	2	10	131000	131009	40 %	0 %	40 %	20 %	300782056
91	NC_014318	CGGGT	2	10	131961	131970	0 %	20 %	60 %	20 %	300782057
92	NC_014318	GGCGG	2	10	132164	132173	0 %	0 %	80 %	20 %	300782057
93	NC_014318	GTCGA	2	10	132365	132374	20 %	20 %	40 %	20 %	300782057
94	NC_014318	CTCGG	2	10	133746	133755	0 %	20 %	40 %	40 %	300782058
95	NC_014318	CGGGG	2	10	137695	137704	0 %	0 %	80 %	20 %	300782063
96	NC_014318	GCGGA	2	10	138005	138014	20 %	0 %	60 %	20 %	300782063
97	NC_014318	GGCCG	2	10	138259	138268	0 %	0 %	60 %	40 %	300782063
98	NC_014318	TCGGG	2	10	138276	138285	0 %	20 %	60 %	20 %	300782063
99	NC_014318	CGGCA	2	10	139738	139747	20 %	0 %	40 %	40 %	300782065
100	NC_014318	CCGGG	2	10	139895	139904	0 %	0 %	60 %	40 %	300782065
101	NC_014318	CGCAC	2	10	142305	142314	20 %	0 %	20 %	60 %	300782067
102	NC_014318	GCCGA	2	10	142673	142682	20 %	0 %	40 %	40 %	300782067
103	NC_014318	CGACG	2	10	143696	143705	20 %	0 %	40 %	40 %	300782068
104	NC_014318	CGGCT	2	10	146158	146167	0 %	20 %	40 %	40 %	300782071
105	NC_014318	GCCGC	2	10	148300	148309	0 %	0 %	40 %	60 %	300782073
106	NC_014318	CCCGC	2	10	148714	148723	0 %	0 %	20 %	80 %	300782073
107	NC_014318	CGACG	2	10	149909	149918	20 %	0 %	40 %	40 %	300782075
108	NC_014318	CTCGG	2	10	150735	150744	0 %	20 %	40 %	40 %	300782075
109	NC_014318	CGGCT	3	15	153938	153952	0 %	20 %	40 %	40 %	300782078
110	NC_014318	GCCAG	2	10	155675	155684	20 %	0 %	40 %	40 %	300782080
111	NC_014318	GCCCG	2	10	156062	156071	0 %	0 %	40 %	60 %	300782081
112	NC_014318	GCCGG	2	10	157633	157642	0 %	0 %	60 %	40 %	300782083
113	NC_014318	ATCGA	2	10	158428	158437	40 %	20 %	20 %	20 %	300782083
114	NC_014318	GCCGG	2	10	158484	158493	0 %	0 %	60 %	40 %	300782083
115	NC_014318	CCGCG	2	10	159446	159455	0 %	0 %	40 %	60 %	300782085
116	NC_014318	GCGCC	2	10	161292	161301	0 %	0 %	40 %	60 %	300782087
117	NC_014318	CGGCG	2	10	161640	161649	0 %	0 %	60 %	40 %	300782087
118	NC_014318	TGCCG	2	10	162971	162980	0 %	20 %	40 %	40 %	300782089
119	NC_014318	GTCGG	2	10	165548	165557	0 %	20 %	60 %	20 %	300782091
120	NC_014318	CCAGC	2	10	166057	166066	20 %	0 %	20 %	60 %	300782091
121	NC_014318	CGCGG	2	10	168305	168314	0 %	0 %	60 %	40 %	300782093
122	NC_014318	CCGAG	2	10	169825	169834	20 %	0 %	40 %	40 %	300782095
123	NC_014318	CGGAG	2	10	170361	170370	20 %	0 %	60 %	20 %	300782096
124	NC_014318	ACGCG	2	10	170395	170404	20 %	0 %	40 %	40 %	300782096
125	NC_014318	CGGCG	2	10	171182	171191	0 %	0 %	60 %	40 %	300782097
126	NC_014318	CCGGC	2	10	171491	171500	0 %	0 %	40 %	60 %	300782097
127	NC_014318	GTCGA	2	10	172226	172235	20 %	20 %	40 %	20 %	300782098
128	NC_014318	CCGGC	2	10	175671	175680	0 %	0 %	40 %	60 %	300782100
129	NC_014318	CGGCG	2	10	176106	176115	0 %	0 %	60 %	40 %	300782100
130	NC_014318	GAGCG	2	10	177264	177273	20 %	0 %	60 %	20 %	300782100
131	NC_014318	CGGCG	2	10	177456	177465	0 %	0 %	60 %	40 %	300782100
132	NC_014318	GACGT	2	10	179528	179537	20 %	20 %	40 %	20 %	300782102
133	NC_014318	ACGCC	2	10	180530	180539	20 %	0 %	20 %	60 %	300782103
134	NC_014318	GGGCC	2	10	181729	181738	0 %	0 %	60 %	40 %	300782105
135	NC_014318	TCGGC	2	10	181825	181834	0 %	20 %	40 %	40 %	300782105
136	NC_014318	CCCGG	2	10	185224	185233	0 %	0 %	40 %	60 %	300782107
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143	NC_014318	CCCGG	2	10	193543	193552	0 %	0 %	40 %	60 %	300782115
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148	NC_014318	GATCG	2	10	198205	198214	20 %	20 %	40 %	20 %	300782121
149	NC_014318	CCGCA	2	10	198335	198344	20 %	0 %	20 %	60 %	300782121
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152	NC_014318	TCAGC	2	10	202573	202582	20 %	20 %	20 %	40 %	300782126
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244	NC_014318	CGGCA	2	10	340067	340076	20 %	0 %	40 %	40 %	300782262
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246	NC_014318	GTCCC	2	10	344302	344311	0 %	20 %	20 %	60 %	300782263
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250	NC_014318	CTCCA	2	10	348887	348896	20 %	20 %	0 %	60 %	300782269
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258	NC_014318	GGGAC	2	10	358189	358198	20 %	0 %	60 %	20 %	300782276
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262	NC_014318	TCGGC	2	10	363341	363350	0 %	20 %	40 %	40 %	300782280
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