MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 31049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014318	CCCG	2	8	104	111	0 %	0 %	25 %	75 %	300781938
2	NC_014318	GAAG	2	8	162	169	50 %	0 %	50 %	0 %	300781938
3	NC_014318	TCGC	2	8	235	242	0 %	25 %	25 %	50 %	300781938
4	NC_014318	GCCC	2	8	705	712	0 %	0 %	25 %	75 %	300781938
5	NC_014318	AAGG	2	8	952	959	50 %	0 %	50 %	0 %	300781938
6	NC_014318	CCGC	2	8	1032	1039	0 %	0 %	25 %	75 %	300781938
7	NC_014318	CGCA	2	8	1334	1341	25 %	0 %	25 %	50 %	300781938
8	NC_014318	TTGT	2	8	1815	1822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014318	CCGG	2	8	2435	2442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014318	GTGG	2	8	2568	2575	0 %	25 %	75 %	0 %	300781939
11	NC_014318	ACCG	2	8	3040	3047	25 %	0 %	25 %	50 %	300781939
12	NC_014318	CGGC	2	8	3869	3876	0 %	0 %	50 %	50 %	300781940
13	NC_014318	GACG	2	8	4756	4763	25 %	0 %	50 %	25 %	300781941
14	NC_014318	CGGC	2	8	4897	4904	0 %	0 %	50 %	50 %	300781941
15	NC_014318	GGCG	2	8	5170	5177	0 %	0 %	75 %	25 %	300781941
16	NC_014318	GGCG	2	8	5557	5564	0 %	0 %	75 %	25 %	300781941
17	NC_014318	CGGC	2	8	6041	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	300781942
18	NC_014318	CGGC	2	8	6134	6141	0 %	0 %	50 %	50 %	300781942
19	NC_014318	TCGT	2	8	6555	6562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014318	GAGC	2	8	6626	6633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014318	GCGA	2	8	7148	7155	25 %	0 %	50 %	25 %	300781943
22	NC_014318	TGGC	2	8	7778	7785	0 %	25 %	50 %	25 %	300781943
23	NC_014318	CGGC	2	8	7992	7999	0 %	0 %	50 %	50 %	300781943
24	NC_014318	GGCG	2	8	8383	8390	0 %	0 %	75 %	25 %	300781943
25	NC_014318	CCGG	2	8	8876	8883	0 %	0 %	50 %	50 %	300781944
26	NC_014318	CGCA	2	8	9159	9166	25 %	0 %	25 %	50 %	300781944
27	NC_014318	CGAC	2	8	9313	9320	25 %	0 %	25 %	50 %	300781944
28	NC_014318	CGGC	2	8	9936	9943	0 %	0 %	50 %	50 %	300781944
29	NC_014318	GACG	2	8	10739	10746	25 %	0 %	50 %	25 %	300781944
30	NC_014318	CGAC	2	8	10861	10868	25 %	0 %	25 %	50 %	300781944
31	NC_014318	CGCA	2	8	11129	11136	25 %	0 %	25 %	50 %	300781944
32	NC_014318	GACT	2	8	11266	11273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014318	ACCG	2	8	11283	11290	25 %	0 %	25 %	50 %	300781945
34	NC_014318	AAGG	2	8	11353	11360	50 %	0 %	50 %	0 %	300781945
35	NC_014318	GCCC	2	8	11542	11549	0 %	0 %	25 %	75 %	300781945
36	NC_014318	CTGG	2	8	11667	11674	0 %	25 %	50 %	25 %	300781945
37	NC_014318	GGTG	2	8	12127	12134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014318	ACGT	2	8	12719	12726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014318	GGCG	2	8	12783	12790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014318	GGTG	2	8	12889	12896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014318	CGGC	2	8	12965	12972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014318	GCCG	2	8	13175	13182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014318	TCCT	2	8	14055	14062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014318	GCCG	2	8	15046	15053	0 %	0 %	50 %	50 %	300781946
45	NC_014318	GCGA	2	8	15119	15126	25 %	0 %	50 %	25 %	300781946
46	NC_014318	CCCG	2	8	15158	15165	0 %	0 %	25 %	75 %	300781946
47	NC_014318	ACCG	2	8	15167	15174	25 %	0 %	25 %	50 %	300781946
48	NC_014318	CCGT	2	8	15379	15386	0 %	25 %	25 %	50 %	300781946
49	NC_014318	CGAG	2	8	15597	15604	25 %	0 %	50 %	25 %	300781946
50	NC_014318	GGCG	2	8	16162	16169	0 %	0 %	75 %	25 %	300781948
51	NC_014318	GGTC	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	300781948
52	NC_014318	CGGT	2	8	16568	16575	0 %	25 %	50 %	25 %	300781948
53	NC_014318	GCCG	2	8	16699	16706	0 %	0 %	50 %	50 %	300781948
54	NC_014318	CGGT	2	8	16765	16772	0 %	25 %	50 %	25 %	300781948
55	NC_014318	GCTC	2	8	17487	17494	0 %	25 %	25 %	50 %	300781948
56	NC_014318	GGCT	2	8	17515	17522	0 %	25 %	50 %	25 %	300781948
57	NC_014318	CGGC	2	8	17599	17606	0 %	0 %	50 %	50 %	300781948
58	NC_014318	CGGT	2	8	17708	17715	0 %	25 %	50 %	25 %	300781949
59	NC_014318	CGTC	2	8	17795	17802	0 %	25 %	25 %	50 %	300781949
60	NC_014318	CTCG	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014318	GGCC	2	8	18308	18315	0 %	0 %	50 %	50 %	300781950
62	NC_014318	CGGC	2	8	18492	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014318	CCGG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014318	CGGG	2	8	18709	18716	0 %	0 %	75 %	25 %	300781951
65	NC_014318	GACG	2	8	18736	18743	25 %	0 %	50 %	25 %	300781951
66	NC_014318	GAGC	2	8	18928	18935	25 %	0 %	50 %	25 %	300781951
67	NC_014318	CACG	2	8	19123	19130	25 %	0 %	25 %	50 %	300781951
68	NC_014318	CTCG	2	8	19890	19897	0 %	25 %	25 %	50 %	300781954
69	NC_014318	GATC	2	8	19986	19993	25 %	25 %	25 %	25 %	300781954
70	NC_014318	CGTC	2	8	20218	20225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014318	TAGT	2	8	20312	20319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014318	CCAC	2	8	20834	20841	25 %	0 %	0 %	75 %	300781955
73	NC_014318	CCGA	2	8	21040	21047	25 %	0 %	25 %	50 %	300781955
74	NC_014318	GAGT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014318	GTAG	2	8	22200	22207	25 %	25 %	50 %	0 %	300781956
76	NC_014318	GCTC	2	8	22294	22301	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
77	NC_014318	CAGC	2	8	22315	22322	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
78	NC_014318	GCTC	2	8	22405	22412	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
79	NC_014318	CAGC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
80	NC_014318	GCTC	2	8	22510	22517	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
81	NC_014318	TAGC	2	8	22531	22538	25 %	25 %	25 %	25 %	300781956
82	NC_014318	CAGC	2	8	22624	22631	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
83	NC_014318	CAGC	2	8	22735	22742	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
84	NC_014318	TGCC	2	8	22960	22967	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
85	NC_014318	CGGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	50 %	50 %	300781956
86	NC_014318	CAGC	2	8	23699	23706	25 %	0 %	25 %	50 %	300781956
87	NC_014318	GTCC	2	8	24208	24215	0 %	25 %	25 %	50 %	300781956
88	NC_014318	GCCG	2	8	24384	24391	0 %	0 %	50 %	50 %	300781956
89	NC_014318	ATCA	2	8	24800	24807	50 %	25 %	0 %	25 %	300781956
90	NC_014318	CGAT	2	8	24868	24875	25 %	25 %	25 %	25 %	300781956
91	NC_014318	GATC	2	8	25589	25596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014318	AGGC	2	8	26480	26487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014318	GCGG	2	8	26542	26549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014318	CAGC	2	8	26692	26699	25 %	0 %	25 %	50 %	300781958
95	NC_014318	CGGT	2	8	27171	27178	0 %	25 %	50 %	25 %	300781958
96	NC_014318	GACG	2	8	27313	27320	25 %	0 %	50 %	25 %	300781958
97	NC_014318	CAAC	2	8	28095	28102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014318	AAGC	2	8	28217	28224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014318	GCGG	2	8	28886	28893	0 %	0 %	75 %	25 %	300781960
100	NC_014318	GGCC	2	8	29405	29412	0 %	0 %	50 %	50 %	300781960
101	NC_014318	GGCT	2	8	30035	30042	0 %	25 %	50 %	25 %	300781961
102	NC_014318	CCCG	2	8	30367	30374	0 %	0 %	25 %	75 %	300781962
103	NC_014318	CGCT	2	8	30476	30483	0 %	25 %	25 %	50 %	300781962
104	NC_014318	CGAG	2	8	31049	31056	25 %	0 %	50 %	25 %	300781962
105	NC_014318	CGCC	2	8	31511	31518	0 %	0 %	25 %	75 %	300781962
106	NC_014318	CGCC	2	8	31673	31680	0 %	0 %	25 %	75 %	300781962
107	NC_014318	GCCT	2	8	32560	32567	0 %	25 %	25 %	50 %	300781962
108	NC_014318	GGTC	2	8	32903	32910	0 %	25 %	50 %	25 %	300781962
109	NC_014318	GGCT	2	8	33664	33671	0 %	25 %	50 %	25 %	300781963
110	NC_014318	ACCT	2	8	34123	34130	25 %	25 %	0 %	50 %	300781963
111	NC_014318	TCCC	2	8	34758	34765	0 %	25 %	0 %	75 %	300781964
112	NC_014318	GCGG	2	8	35039	35046	0 %	0 %	75 %	25 %	300781964
113	NC_014318	TGCC	2	8	35588	35595	0 %	25 %	25 %	50 %	300781964
114	NC_014318	GGTC	2	8	35623	35630	0 %	25 %	50 %	25 %	300781964
115	NC_014318	GCCG	2	8	35681	35688	0 %	0 %	50 %	50 %	300781964
116	NC_014318	GCCG	2	8	36506	36513	0 %	0 %	50 %	50 %	300781965
117	NC_014318	GTGC	2	8	36846	36853	0 %	25 %	50 %	25 %	300781966
118	NC_014318	CCGG	2	8	36884	36891	0 %	0 %	50 %	50 %	300781966
119	NC_014318	CAGC	2	8	37508	37515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014318	CGCC	2	8	37575	37582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_014318	GCCC	2	8	37638	37645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_014318	CCGT	2	8	37840	37847	0 %	25 %	25 %	50 %	300781967
123	NC_014318	GCGA	2	8	37920	37927	25 %	0 %	50 %	25 %	300781967
124	NC_014318	CGAC	2	8	37957	37964	25 %	0 %	25 %	50 %	300781967
125	NC_014318	GCAC	2	8	38040	38047	25 %	0 %	25 %	50 %	300781967
126	NC_014318	GTGA	2	8	38103	38110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014318	GCCG	2	8	39055	39062	0 %	0 %	50 %	50 %	300781969
128	NC_014318	ACCA	2	8	39405	39412	50 %	0 %	0 %	50 %	300781970
129	NC_014318	CCGC	2	8	39848	39855	0 %	0 %	25 %	75 %	300781970
130	NC_014318	GGTT	2	8	39921	39928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014318	AACC	2	8	39937	39944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014318	CGGT	2	8	40186	40193	0 %	25 %	50 %	25 %	300781971
133	NC_014318	GTGC	2	8	41061	41068	0 %	25 %	50 %	25 %	300781972
134	NC_014318	GCCG	2	8	42014	42021	0 %	0 %	50 %	50 %	300781974
135	NC_014318	CGGC	2	8	42164	42171	0 %	0 %	50 %	50 %	300781974
136	NC_014318	GACC	2	8	42231	42238	25 %	0 %	25 %	50 %	300781974
137	NC_014318	GGCC	2	8	42477	42484	0 %	0 %	50 %	50 %	300781974
138	NC_014318	CCAG	2	8	42728	42735	25 %	0 %	25 %	50 %	300781974
139	NC_014318	GTGG	2	8	43112	43119	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014318	CTCG	2	8	43406	43413	0 %	25 %	25 %	50 %	300781976
141	NC_014318	CCGG	2	8	43629	43636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014318	CCCG	2	8	44274	44281	0 %	0 %	25 %	75 %	300781977
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