MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 3961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014318	TTGT	2	8	1815	1822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014318	CCGG	2	8	2435	2442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014318	TCGT	2	8	6555	6562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014318	GAGC	2	8	6626	6633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014318	GACT	2	8	11266	11273	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014318	GGTG	2	8	12127	12134	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014318	ACGT	2	8	12719	12726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014318	GGCG	2	8	12783	12790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014318	GGTG	2	8	12889	12896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014318	CGGC	2	8	12965	12972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014318	GCCG	2	8	13175	13182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014318	TCCT	2	8	14055	14062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014318	CTCG	2	8	18225	18232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014318	CGGC	2	8	18492	18499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014318	CCGG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014318	CGTC	2	8	20218	20225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014318	TAGT	2	8	20312	20319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014318	GAGT	2	8	21866	21873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014318	GATC	2	8	25589	25596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014318	AGGC	2	8	26480	26487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014318	GCGG	2	8	26542	26549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014318	CAAC	2	8	28095	28102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014318	AAGC	2	8	28217	28224	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014318	CAGC	2	8	37508	37515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014318	CGCC	2	8	37575	37582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_014318	GCCC	2	8	37638	37645	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_014318	GTGA	2	8	38103	38110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014318	GGTT	2	8	39921	39928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014318	AACC	2	8	39937	39944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014318	GTGG	2	8	43112	43119	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014318	CCGG	2	8	43629	43636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014318	ACCC	2	8	45227	45234	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014318	CTCC	2	8	61364	61371	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_014318	TGCC	2	8	61468	61475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014318	CGTC	2	8	71481	71488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014318	GGAA	2	8	79933	79940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014318	TTCC	2	8	81289	81296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014318	GGTG	2	8	84871	84878	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014318	ACCG	2	8	85067	85074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014318	ACCC	2	8	90203	90210	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_014318	CGGC	2	8	93968	93975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014318	CCGG	2	8	100768	100775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014318	GGGC	2	8	113562	113569	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014318	GACG	2	8	118778	118785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014318	CCGC	2	8	120608	120615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014318	CGGT	2	8	126191	126198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014318	GCCG	2	8	131124	131131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014318	GGTG	2	8	134470	134477	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014318	ACCC	2	8	135782	135789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014318	CAAC	2	8	136912	136919	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014318	ACCC	2	8	137192	137199	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_014318	GGCC	2	8	145255	145262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014318	GAGG	2	8	155228	155235	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014318	GCCG	2	8	156587	156594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014318	TAAG	2	8	157303	157310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014318	ACGC	2	8	159391	159398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014318	CGCT	2	8	161872	161879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014318	GCAA	2	8	162670	162677	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014318	GGCG	2	8	178079	178086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014318	ACCG	2	8	178116	178123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014318	CGGA	2	8	179413	179420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014318	GGAA	2	8	180357	180364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014318	TCGA	2	8	184582	184589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014318	GCCG	2	8	184730	184737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014318	CGGC	2	8	186176	186183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014318	GACT	2	8	191099	191106	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014318	GGCG	2	8	191324	191331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014318	CCCG	2	8	194868	194875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_014318	TGAG	2	8	212738	212745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014318	GGCC	2	8	214886	214893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014318	GGGC	2	8	214897	214904	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014318	CACG	2	8	216814	216821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014318	GGCC	2	8	228306	228313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014318	GCCG	2	8	228373	228380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014318	CCGG	2	8	229258	229265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014318	GCCG	2	8	229462	229469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014318	CCGT	2	8	234391	234398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014318	GGGC	2	8	240301	240308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014318	CACG	2	8	248736	248743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014318	CGGC	2	8	249333	249340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014318	GGGA	2	8	254113	254120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014318	CGTC	2	8	254862	254869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014318	CGGC	2	8	257255	257262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014318	CGAC	2	8	259887	259894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014318	CAGA	2	8	260184	260191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014318	AGCG	2	8	261852	261859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014318	TCCG	2	8	276263	276270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014318	CGTG	2	8	276366	276373	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014318	CCGG	2	8	276503	276510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014318	CCGC	2	8	285592	285599	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_014318	GGCC	2	8	285623	285630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014318	CCGG	2	8	290602	290609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014318	TCCA	2	8	295076	295083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014318	GCCG	2	8	297515	297522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014318	GTGG	2	8	298656	298663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014318	CCGC	2	8	303774	303781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014318	GCAG	2	8	305486	305493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014318	GGCG	2	8	305539	305546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014318	CCGC	2	8	306046	306053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_014318	GAGG	2	8	315664	315671	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014318	CGAC	2	8	315742	315749	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014318	AAGT	2	8	315751	315758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014318	AATC	2	8	318284	318291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014318	CCAC	2	8	326657	326664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_014318	GCCC	2	8	327761	327768	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014318	CGGT	2	8	336819	336826	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014318	CGGG	2	8	340295	340302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014318	ATTC	2	8	340466	340473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014318	GCGT	2	8	340491	340498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014318	CGCA	2	8	340686	340693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014318	CCGC	2	8	340699	340706	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_014318	TCAC	2	8	345067	345074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014318	CCGG	2	8	347569	347576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014318	TATT	2	8	348432	348439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014318	CGGG	2	8	352275	352282	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014318	CGCA	2	8	352304	352311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014318	CTGG	2	8	352413	352420	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014318	CTGC	2	8	352503	352510	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014318	CCGG	2	8	356680	356687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014318	TCCC	2	8	356987	356994	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_014318	GCCG	2	8	360993	361000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014318	CTGA	2	8	361057	361064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014318	CGGG	2	8	362983	362990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014318	GGGT	2	8	366270	366277	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014318	CGGT	3	12	367282	367293	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014318	ACCG	2	8	367302	367309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014318	GGTG	2	8	369406	369413	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014318	TGCT	2	8	371028	371035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014318	TTCC	2	8	373860	373867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014318	GGCC	2	8	376352	376359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014318	GAGC	2	8	376986	376993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014318	GAGG	2	8	377008	377015	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014318	CGTG	2	8	379484	379491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014318	GGTA	2	8	384586	384593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014318	CGGT	2	8	384630	384637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014318	ACTC	2	8	385694	385701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014318	GAGG	2	8	386088	386095	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014318	CCTA	2	8	386366	386373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014318	TAAG	2	8	386495	386502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014318	TGAT	2	8	386717	386724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014318	TCGT	2	8	386926	386933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014318	TGAG	2	8	386943	386950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014318	TGGC	2	8	387862	387869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014318	TTTC	2	8	388723	388730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014318	CCGT	2	8	390345	390352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014318	TCGA	2	8	390463	390470	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014318	CGTC	2	8	395209	395216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014318	TCAC	2	8	396040	396047	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014318	CCGG	2	8	402751	402758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014318	GCTG	2	8	403668	403675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014318	CTCA	2	8	406075	406082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_014318	TGGG	2	8	407164	407171	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_014318	GGCT	2	8	1370872	1370879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014318	AGGG	2	8	1370989	1370996	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_014318	GCGA	2	8	1413816	1413823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_014318	GTTG	2	8	1414220	1414227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_014318	GCCC	2	8	1418556	1418563	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
492	NC_014318	GCCG	2	8	1420038	1420045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_014318	CGGG	2	8	1427953	1427960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
496	NC_014318	CTCC	2	8	1428815	1428822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
497	NC_014318	CCGC	2	8	1428850	1428857	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
498	NC_014318	CGAG	2	8	1432409	1432416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014318	CACC	2	8	1437229	1437236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
500	NC_014318	AGTG	2	8	1443924	1443931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

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