MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei U32 chromosome

Total Repeats: 204493

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014318	GGT	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781938
2	NC_014318	AGC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
3	NC_014318	GGC	2	6	141	146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
4	NC_014318	CGG	2	6	214	219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
5	NC_014318	GAT	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781938
6	NC_014318	GCC	3	9	375	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781938
7	NC_014318	CCG	2	6	389	394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781938
8	NC_014318	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
9	NC_014318	GCC	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781938
10	NC_014318	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
11	NC_014318	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
12	NC_014318	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
13	NC_014318	CGA	2	6	501	506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
14	NC_014318	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781938
15	NC_014318	CTG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781938
16	NC_014318	TCA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781938
17	NC_014318	CGA	2	6	870	875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
18	NC_014318	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
19	NC_014318	TCG	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781938
20	NC_014318	TTC	2	6	973	978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300781938
21	NC_014318	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781938
22	NC_014318	GGA	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300781938
23	NC_014318	TCA	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781938
24	NC_014318	GCC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781938
25	NC_014318	TCC	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781938
26	NC_014318	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781938
27	NC_014318	GCG	2	6	1153	1158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
28	NC_014318	CAG	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
29	NC_014318	TGC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781938
30	NC_014318	CAT	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781938
31	NC_014318	TTC	2	6	1384	1389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300781938
32	NC_014318	CGA	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
33	NC_014318	CGG	2	6	1515	1520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
34	NC_014318	AAG	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781938
35	NC_014318	CGG	2	6	1582	1587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781938
36	NC_014318	AGC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781938
37	NC_014318	TCC	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781939
38	NC_014318	CGA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781939
39	NC_014318	CGG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781939
40	NC_014318	CCT	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781939
41	NC_014318	GTC	3	9	2950	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781939
42	NC_014318	GAC	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781939
43	NC_014318	CCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781939
44	NC_014318	CGC	2	6	3102	3107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781939
45	NC_014318	GGC	2	6	3138	3143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781939
46	NC_014318	GCG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781939
47	NC_014318	ACG	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781939
48	NC_014318	CCG	2	6	3262	3267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781939
49	NC_014318	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781939
50	NC_014318	TCG	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781939
51	NC_014318	TGG	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781939
52	NC_014318	ACA	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300781939
53	NC_014318	GCG	2	6	3419	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781939
54	NC_014318	ACG	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781939
55	NC_014318	GAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781939
56	NC_014318	TCG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781939
57	NC_014318	CAC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781939
58	NC_014318	TCA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781939
59	NC_014318	CGT	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781939
60	NC_014318	GTC	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781940
61	NC_014318	ACG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781940
62	NC_014318	CGG	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781940
63	NC_014318	CGA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781940
64	NC_014318	CTG	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781940
65	NC_014318	GCG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781940
66	NC_014318	CGG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781940
67	NC_014318	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781940
68	NC_014318	GAT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781940
69	NC_014318	ATG	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781940
70	NC_014318	CTC	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781940
71	NC_014318	GTC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781940
72	NC_014318	GTC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781940
73	NC_014318	GCT	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781940
74	NC_014318	CGA	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781940
75	NC_014318	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781940
76	NC_014318	CAA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300781940
77	NC_014318	CGC	2	6	4527	4532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781940
78	NC_014318	CGG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781940
79	NC_014318	GAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781940
80	NC_014318	CGG	2	6	4572	4577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781940
81	NC_014318	CGC	2	6	4764	4769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781941
82	NC_014318	GGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781941
83	NC_014318	ACG	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
84	NC_014318	CCG	2	6	4854	4859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781941
85	NC_014318	GGA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300781941
86	NC_014318	CGA	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
87	NC_014318	CTC	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781941
88	NC_014318	TGC	2	6	5013	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
89	NC_014318	AGC	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
90	NC_014318	ACG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
91	NC_014318	GAC	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
92	NC_014318	GCT	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
93	NC_014318	TCG	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
94	NC_014318	CGC	2	6	5220	5225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781941
95	NC_014318	GTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
96	NC_014318	GCC	2	6	5300	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781941
97	NC_014318	GCT	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
98	NC_014318	TGC	3	9	5571	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781941
99	NC_014318	CGA	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
100	NC_014318	CCG	2	6	5664	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781941
101	NC_014318	CGA	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781941
102	NC_014318	GTG	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781941
103	NC_014318	CGC	2	6	5990	5995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781942
104	NC_014318	GCC	2	6	6049	6054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781942
105	NC_014318	CGG	2	6	6062	6067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781942
106	NC_014318	CGC	2	6	6087	6092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781942
107	NC_014318	TGA	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300781942
108	NC_014318	TGC	2	6	6322	6327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781942
109	NC_014318	GCT	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781942
110	NC_014318	CGG	2	6	6352	6357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781942
111	NC_014318	CGT	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781942
112	NC_014318	CGT	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781943
113	NC_014318	CAC	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781943
114	NC_014318	AGG	2	6	6795	6800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300781943
115	NC_014318	TCG	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781943
116	NC_014318	CGA	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
117	NC_014318	CCA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781943
118	NC_014318	CTC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781943
119	NC_014318	CGG	2	6	6871	6876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781943
120	NC_014318	CGT	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781943
121	NC_014318	CGA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
122	NC_014318	TCC	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300781943
123	NC_014318	GGC	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781943
124	NC_014318	CGG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781943
125	NC_014318	GGT	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300781943
126	NC_014318	GAA	2	6	7054	7059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300781943
127	NC_014318	GCT	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300781943
128	NC_014318	CGG	2	6	7081	7086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781943
129	NC_014318	CAC	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300781943
130	NC_014318	ACG	2	6	7205	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
131	NC_014318	CAA	2	6	7258	7263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300781943
132	NC_014318	CGA	2	6	7285	7290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
133	NC_014318	CGA	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
134	NC_014318	GCA	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
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159	NC_014318	CGC	2	6	8527	8532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781943
160	NC_014318	CGA	2	6	8539	8544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300781943
161	NC_014318	CGC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300781943
162	NC_014318	TCA	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300781943
163	NC_014318	CTT	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300781943
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250	NC_014318	CGG	2	6	15330	15335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300781946
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