MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT02

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014317	CAT	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014317	CTC	2	6	109	114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014317	GCC	2	6	122	127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014317	CGG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014317	GGC	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014317	TGG	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014317	CTT	2	6	339	344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014317	CCG	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014317	CCG	2	6	456	461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014317	GCC	2	6	731	736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014317	CCG	2	6	742	747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_014317	CAA	2	6	762	767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014317	CGG	2	6	870	875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014317	GCC	3	9	1022	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014317	CCA	2	6	1085	1090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014317	CGC	2	6	1113	1118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014317	CGG	2	6	1156	1161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014317	GCC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014317	GTC	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014317	GGC	2	6	1191	1196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014317	GCC	2	6	1273	1278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014317	CTA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300067538
23	NC_014317	CCG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067538
24	NC_014317	GAA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067538
25	NC_014317	CTT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067538
26	NC_014317	ACA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067538
27	NC_014317	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300067538
28	NC_014317	TGC	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067539
29	NC_014317	GAA	2	6	2175	2180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067539
30	NC_014317	GCC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067539
31	NC_014317	GCC	2	6	2400	2405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014317	CGC	2	6	2442	2447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014317	ATT	2	6	2469	2474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014317	TGC	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067541
35	NC_014317	CGC	2	6	3230	3235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014317	GAG	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014317	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014317	GAT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014317	ACT	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014317	TCA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014317	GAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014317	CAC	2	6	4245	4250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300067542
43	NC_014317	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
44	NC_014317	ACG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
45	NC_014317	TGC	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
46	NC_014317	AAC	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067542
47	NC_014317	GCT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
48	NC_014317	CTG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
49	NC_014317	CTT	2	6	5015	5020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067542
50	NC_014317	GGC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300067542
51	NC_014317	CTG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014317	TGC	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
53	NC_014317	GCT	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
54	NC_014317	TGC	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
55	NC_014317	GCC	2	6	5260	5265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067543
56	NC_014317	TGT	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
57	NC_014317	GCA	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067543
58	NC_014317	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
59	NC_014317	CTG	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.