MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	GTGCT	2	10	57	66	0 %	40 %	40 %	20 %	300115608
2	NC_014316	GTTTC	2	10	410	419	0 %	60 %	20 %	20 %	300115608
3	NC_014316	GCGTG	2	10	481	490	0 %	20 %	60 %	20 %	300115608
4	NC_014316	GTCTG	2	10	1329	1338	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014316	TAAGA	2	10	1619	1628	60 %	20 %	20 %	0 %	300115610
6	NC_014316	AAATT	2	10	1649	1658	60 %	40 %	0 %	0 %	300115610
7	NC_014316	AGAGC	2	10	2443	2452	40 %	0 %	40 %	20 %	300115612
8	NC_014316	GGAAT	2	10	4551	4560	40 %	20 %	40 %	0 %	300115615
9	NC_014316	TCATC	2	10	6675	6684	20 %	40 %	0 %	40 %	300115618
10	NC_014316	TTCCA	2	10	6842	6851	20 %	40 %	0 %	40 %	300115618
11	NC_014316	TAGTT	2	10	8978	8987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014316	GAATA	2	10	10371	10380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014316	GAATA	2	10	10408	10417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014316	CGCCC	2	10	12409	12418	0 %	0 %	20 %	80 %	300115627
15	NC_014316	GGGCG	2	10	14547	14556	0 %	0 %	80 %	20 %	300115631
16	NC_014316	AAGGG	2	10	16840	16849	40 %	0 %	60 %	0 %	300115632
17	NC_014316	CCTGA	2	10	19705	19714	20 %	20 %	20 %	40 %	300115635
18	NC_014316	CGGGA	2	10	22376	22385	20 %	0 %	60 %	20 %	300115636
19	NC_014316	CCTAT	2	10	22955	22964	20 %	40 %	0 %	40 %	300115637
20	NC_014316	TAATC	2	10	23003	23012	40 %	40 %	0 %	20 %	300115637
21	NC_014316	GACAA	2	10	26615	26624	60 %	0 %	20 %	20 %	300115638
22	NC_014316	GAGTT	2	10	29453	29462	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014316	AATTA	2	10	29600	29609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014316	CCCTG	2	10	30469	30478	0 %	20 %	20 %	60 %	300115640
25	NC_014316	TCAAA	2	10	31340	31349	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014316	GAAAT	2	10	31818	31827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014316	CGGAT	2	10	32480	32489	20 %	20 %	40 %	20 %	300115641
28	NC_014316	AGAAC	2	10	34214	34223	60 %	0 %	20 %	20 %	300115643
29	NC_014316	CGAAT	2	10	35726	35735	40 %	20 %	20 %	20 %	300115644
30	NC_014316	TCAGC	2	10	36166	36175	20 %	20 %	20 %	40 %	300115645
31	NC_014316	GAGTA	2	10	38134	38143	40 %	20 %	40 %	0 %	300115647
32	NC_014316	GGCGC	2	10	39091	39100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.