MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	TGGT	2	8	699	706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014316	CGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014316	GTTG	2	8	879	886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014316	CGGG	2	8	1087	1094	0 %	0 %	75 %	25 %	300115609
5	NC_014316	CTGG	2	8	1701	1708	0 %	25 %	50 %	25 %	300115611
6	NC_014316	GGAA	2	8	1788	1795	50 %	0 %	50 %	0 %	300115611
7	NC_014316	GATT	2	8	2073	2080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014316	TTCT	2	8	2151	2158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014316	TAAT	2	8	2418	2425	50 %	50 %	0 %	0 %	300115612
10	NC_014316	CTTT	2	8	2501	2508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014316	GTAT	2	8	2783	2790	25 %	50 %	25 %	0 %	300115613
12	NC_014316	CCGA	2	8	3318	3325	25 %	0 %	25 %	50 %	300115614
13	NC_014316	AGCA	2	8	3335	3342	50 %	0 %	25 %	25 %	300115614
14	NC_014316	AGCA	2	8	3981	3988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014316	GCAA	2	8	4036	4043	50 %	0 %	25 %	25 %	300115615
16	NC_014316	GACT	2	8	4054	4061	25 %	25 %	25 %	25 %	300115615
17	NC_014316	TGAA	2	8	4783	4790	50 %	25 %	25 %	0 %	300115615
18	NC_014316	AAGG	2	8	4868	4875	50 %	0 %	50 %	0 %	300115615
19	NC_014316	CCGC	2	8	4976	4983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014316	CAAG	2	8	5330	5337	50 %	0 %	25 %	25 %	300115616
21	NC_014316	AAGA	2	8	6156	6163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014316	TGGC	2	8	6785	6792	0 %	25 %	50 %	25 %	300115618
23	NC_014316	CCAC	2	8	6897	6904	25 %	0 %	0 %	75 %	300115618
24	NC_014316	TTTA	2	8	6979	6986	25 %	75 %	0 %	0 %	300115618
25	NC_014316	TGGT	2	8	7126	7133	0 %	50 %	50 %	0 %	300115618
26	NC_014316	GCTT	2	8	7387	7394	0 %	50 %	25 %	25 %	300115618
27	NC_014316	CTTT	2	8	7637	7644	0 %	75 %	0 %	25 %	300115619
28	NC_014316	TCGT	2	8	7711	7718	0 %	50 %	25 %	25 %	300115620
29	NC_014316	TCTA	2	8	7946	7953	25 %	50 %	0 %	25 %	300115620
30	NC_014316	GCAC	2	8	8316	8323	25 %	0 %	25 %	50 %	300115621
31	NC_014316	CGCT	2	8	8424	8431	0 %	25 %	25 %	50 %	300115621
32	NC_014316	GATC	2	8	8557	8564	25 %	25 %	25 %	25 %	300115622
33	NC_014316	AGCC	2	8	9104	9111	25 %	0 %	25 %	50 %	300115623
34	NC_014316	GAAT	2	8	9813	9820	50 %	25 %	25 %	0 %	300115624
35	NC_014316	TATT	2	8	10218	10225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014316	CCCT	2	8	10592	10599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_014316	AGCG	2	8	10634	10641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014316	CGGC	2	8	10818	10825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014316	TTTA	2	8	10909	10916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014316	TAAG	2	8	10929	10936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014316	GTAA	2	8	11222	11229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014316	GCTG	2	8	11701	11708	0 %	25 %	50 %	25 %	300115625
43	NC_014316	ATTA	2	8	11993	12000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014316	AGCG	2	8	12279	12286	25 %	0 %	50 %	25 %	300115626
45	NC_014316	GGCG	2	8	12523	12530	0 %	0 %	75 %	25 %	300115627
46	NC_014316	TTGG	2	8	13409	13416	0 %	50 %	50 %	0 %	300115628
47	NC_014316	CGCC	2	8	14045	14052	0 %	0 %	25 %	75 %	300115629
48	NC_014316	CCCA	2	8	14215	14222	25 %	0 %	0 %	75 %	300115630
49	NC_014316	ATCA	2	8	14275	14282	50 %	25 %	0 %	25 %	300115630
50	NC_014316	GCCG	2	8	14431	14438	0 %	0 %	50 %	50 %	300115630
51	NC_014316	TTCC	2	8	14715	14722	0 %	50 %	0 %	50 %	300115631
52	NC_014316	GATT	2	8	15158	15165	25 %	50 %	25 %	0 %	300115631
53	NC_014316	GGCT	2	8	15304	15311	0 %	25 %	50 %	25 %	300115631
54	NC_014316	CCCT	2	8	16037	16044	0 %	25 %	0 %	75 %	300115632
55	NC_014316	AGGT	2	8	16348	16355	25 %	25 %	50 %	0 %	300115632
56	NC_014316	ACCA	2	8	16361	16368	50 %	0 %	0 %	50 %	300115632
57	NC_014316	CTTA	2	8	16399	16406	25 %	50 %	0 %	25 %	300115632
58	NC_014316	GTAT	2	8	16990	16997	25 %	50 %	25 %	0 %	300115632
59	NC_014316	GGAA	2	8	17297	17304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014316	GCTG	2	8	18591	18598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014316	ATTT	2	8	18873	18880	25 %	75 %	0 %	0 %	300115635
62	NC_014316	TCAC	2	8	19006	19013	25 %	25 %	0 %	50 %	300115635
63	NC_014316	GTCC	2	8	19017	19024	0 %	25 %	25 %	50 %	300115635
64	NC_014316	GCCT	2	8	19994	20001	0 %	25 %	25 %	50 %	300115636
65	NC_014316	GAGG	2	8	20715	20722	25 %	0 %	75 %	0 %	300115636
66	NC_014316	CCGG	2	8	20736	20743	0 %	0 %	50 %	50 %	300115636
67	NC_014316	GCTG	2	8	20893	20900	0 %	25 %	50 %	25 %	300115636
68	NC_014316	CCGG	2	8	21093	21100	0 %	0 %	50 %	50 %	300115636
69	NC_014316	CAAC	2	8	21448	21455	50 %	0 %	0 %	50 %	300115636
70	NC_014316	CTAG	2	8	22615	22622	25 %	25 %	25 %	25 %	300115636
71	NC_014316	TTGA	2	8	22681	22688	25 %	50 %	25 %	0 %	300115636
72	NC_014316	TTAC	2	8	22813	22820	25 %	50 %	0 %	25 %	300115637
73	NC_014316	TTGG	2	8	22875	22882	0 %	50 %	50 %	0 %	300115637
74	NC_014316	TGAT	2	8	23338	23345	25 %	50 %	25 %	0 %	300115637
75	NC_014316	CCTC	2	8	23561	23568	0 %	25 %	0 %	75 %	300115637
76	NC_014316	TCCT	2	8	24248	24255	0 %	50 %	0 %	50 %	300115638
77	NC_014316	AGAA	2	8	24582	24589	75 %	0 %	25 %	0 %	300115638
78	NC_014316	CTTG	2	8	24781	24788	0 %	50 %	25 %	25 %	300115638
79	NC_014316	TGGC	2	8	24863	24870	0 %	25 %	50 %	25 %	300115638
80	NC_014316	CTTG	2	8	25231	25238	0 %	50 %	25 %	25 %	300115638
81	NC_014316	GCTC	2	8	25296	25303	0 %	25 %	25 %	50 %	300115638
82	NC_014316	GAAG	2	8	25336	25343	50 %	0 %	50 %	0 %	300115638
83	NC_014316	CTTG	2	8	25780	25787	0 %	50 %	25 %	25 %	300115638
84	NC_014316	CAGG	2	8	25891	25898	25 %	0 %	50 %	25 %	300115638
85	NC_014316	CAAA	2	8	26027	26034	75 %	0 %	0 %	25 %	300115638
86	NC_014316	TGAC	2	8	26502	26509	25 %	25 %	25 %	25 %	300115638
87	NC_014316	TCGA	2	8	26697	26704	25 %	25 %	25 %	25 %	300115638
88	NC_014316	GCTT	2	8	26831	26838	0 %	50 %	25 %	25 %	300115638
89	NC_014316	CCGA	2	8	27950	27957	25 %	0 %	25 %	50 %	300115638
90	NC_014316	GACG	2	8	28723	28730	25 %	0 %	50 %	25 %	300115638
91	NC_014316	CGGC	2	8	28817	28824	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
92	NC_014316	CTAC	2	8	28948	28955	25 %	25 %	0 %	50 %	300115638
93	NC_014316	TCGA	2	8	29120	29127	25 %	25 %	25 %	25 %	300115638
94	NC_014316	GCCC	2	8	30371	30378	0 %	0 %	25 %	75 %	300115640
95	NC_014316	CTTC	2	8	30763	30770	0 %	50 %	0 %	50 %	300115640
96	NC_014316	TGCC	2	8	31094	31101	0 %	25 %	25 %	50 %	300115640
97	NC_014316	CGCC	2	8	31851	31858	0 %	0 %	25 %	75 %	300115641
98	NC_014316	ATTA	2	8	31877	31884	50 %	50 %	0 %	0 %	300115641
99	NC_014316	TATC	2	8	31888	31895	25 %	50 %	0 %	25 %	300115641
100	NC_014316	CTTA	2	8	32258	32265	25 %	50 %	0 %	25 %	300115641
101	NC_014316	TCAA	2	8	32355	32362	50 %	25 %	0 %	25 %	300115641
102	NC_014316	GAAG	2	8	33199	33206	50 %	0 %	50 %	0 %	300115642
103	NC_014316	TTCC	2	8	33710	33717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014316	TGGG	2	8	34228	34235	0 %	25 %	75 %	0 %	300115643
105	NC_014316	GAAG	2	8	34248	34255	50 %	0 %	50 %	0 %	300115643
106	NC_014316	CGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014316	TGCC	2	8	35925	35932	0 %	25 %	25 %	50 %	300115644
108	NC_014316	CAGA	2	8	37048	37055	50 %	0 %	25 %	25 %	300115646
109	NC_014316	ACCG	2	8	37340	37347	25 %	0 %	25 %	50 %	300115646
110	NC_014316	GATC	2	8	37374	37381	25 %	25 %	25 %	25 %	300115646
111	NC_014316	AGCT	2	8	37412	37419	25 %	25 %	25 %	25 %	300115646
112	NC_014316	CTCC	2	8	38210	38217	0 %	25 %	0 %	75 %	300115647
113	NC_014316	CAGC	2	8	38219	38226	25 %	0 %	25 %	50 %	300115647
114	NC_014316	ACAG	2	8	38242	38249	50 %	0 %	25 %	25 %	300115647
115	NC_014316	AATA	2	8	38710	38717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014316	TAAA	2	8	38843	38850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.