MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	TGGT	2	8	699	706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014316	CGCT	2	8	801	808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014316	GTTG	2	8	879	886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014316	GATT	2	8	2073	2080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014316	TTCT	2	8	2151	2158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014316	CTTT	2	8	2501	2508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014316	AGCA	2	8	3981	3988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014316	CCGC	2	8	4976	4983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_014316	AAGA	2	8	6156	6163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014316	TATT	2	8	10218	10225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014316	CCCT	2	8	10592	10599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_014316	AGCG	2	8	10634	10641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014316	CGGC	2	8	10818	10825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014316	TTTA	2	8	10909	10916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014316	TAAG	2	8	10929	10936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014316	GTAA	2	8	11222	11229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014316	ATTA	2	8	11993	12000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014316	GGAA	2	8	17297	17304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014316	GCTG	2	8	18591	18598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014316	TTCC	2	8	33710	33717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014316	CGGC	2	8	34872	34879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014316	AATA	2	8	38710	38717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014316	TAAA	2	8	38843	38850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.