MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	GTG	2	6	780	785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014316	GCC	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014316	GCC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014316	CGC	2	6	973	978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014316	GCC	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014316	AGG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014316	TTG	2	6	2091	2096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014316	CTA	2	6	2529	2534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014316	GGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014316	CAG	2	6	5512	5517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014316	TCT	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014316	AGC	2	6	5616	5621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014316	CTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014316	TTA	2	6	6045	6050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014316	CAC	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014316	AGT	2	6	7575	7580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014316	TCA	2	6	9004	9009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014316	TTC	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014316	ATT	2	6	10181	10186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014316	ACA	2	6	10425	10430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014316	GGT	2	6	10491	10496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014316	CGC	2	6	10500	10505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014316	TTA	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014316	AGC	2	6	10626	10631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014316	TGG	2	6	10735	10740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014316	CCA	2	6	10972	10977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014316	ATC	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014316	GCA	2	6	11050	11055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014316	CGC	2	6	11085	11090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014316	GAC	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014316	ATT	2	6	11202	11207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014316	ATT	2	6	11262	11267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014316	GTC	2	6	11440	11445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014316	TAG	2	6	11964	11969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014316	AAT	2	6	12031	12036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014316	TAT	2	6	13915	13920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014316	ATG	2	6	15675	15680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014316	GAT	2	6	17091	17096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014316	AAG	2	6	17226	17231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014316	TCT	2	6	18057	18062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014316	TAT	2	6	18138	18143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014316	ATT	2	6	18240	18245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014316	GCG	2	6	18419	18424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014316	CCG	2	6	18511	18516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014316	CCA	2	6	18517	18522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014316	GAA	2	6	18599	18604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014316	ATG	2	6	29511	29516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014316	CAA	2	6	29554	29559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014316	GAA	2	6	29628	29633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014316	CTC	2	6	29655	29660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014316	TAC	2	6	29714	29719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014316	CCG	2	6	31502	31507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014316	TAC	2	6	31623	31628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014316	GAA	2	6	33563	33568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014316	GAT	2	6	33584	33589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014316	TGA	2	6	33615	33620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014316	TGA	2	6	33629	33634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014316	TCC	2	6	34458	34463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014316	TTC	2	6	34638	34643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014316	CAA	2	6	34697	34702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014316	CTG	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014316	CCG	2	6	34771	34776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014316	ACT	2	6	34790	34795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014316	TGT	2	6	34810	34815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014316	GTG	2	6	34887	34892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014316	GCT	2	6	34930	34935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014316	AAG	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014316	CAG	2	6	35038	35043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014316	ATA	2	6	35108	35113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014316	CTT	2	6	35187	35192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014316	CTT	2	6	36494	36499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014316	GAA	2	6	37879	37884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014316	CGT	2	6	38807	38812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014316	TTC	2	6	38913	38918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014316	CGT	2	6	38987	38992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.