MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014316	GT	3	6	566	571	0 %	50 %	50 %	0 %	300115608
2	NC_014316	CG	3	6	1195	1200	0 %	0 %	50 %	50 %	300115609
3	NC_014316	AG	3	6	1637	1642	50 %	0 %	50 %	0 %	300115610
4	NC_014316	GC	3	6	2772	2777	0 %	0 %	50 %	50 %	300115613
5	NC_014316	TA	3	6	5156	5161	50 %	50 %	0 %	0 %	300115616
6	NC_014316	GT	3	6	8814	8819	0 %	50 %	50 %	0 %	300115622
7	NC_014316	GA	4	8	9133	9140	50 %	0 %	50 %	0 %	300115623
8	NC_014316	TG	3	6	9267	9272	0 %	50 %	50 %	0 %	300115623
9	NC_014316	GC	3	6	11671	11676	0 %	0 %	50 %	50 %	300115625
10	NC_014316	TC	3	6	11739	11744	0 %	50 %	0 %	50 %	300115625
11	NC_014316	GC	3	6	12099	12104	0 %	0 %	50 %	50 %	300115626
12	NC_014316	TC	3	6	15808	15813	0 %	50 %	0 %	50 %	300115632
13	NC_014316	TA	3	6	16326	16331	50 %	50 %	0 %	0 %	300115632
14	NC_014316	TA	3	6	16773	16778	50 %	50 %	0 %	0 %	300115632
15	NC_014316	CG	3	6	17340	17345	0 %	0 %	50 %	50 %	300115633
16	NC_014316	AT	3	6	17959	17964	50 %	50 %	0 %	0 %	300115634
17	NC_014316	GC	3	6	19345	19350	0 %	0 %	50 %	50 %	300115635
18	NC_014316	AG	3	6	19886	19891	50 %	0 %	50 %	0 %	300115635
19	NC_014316	CA	3	6	20310	20315	50 %	0 %	0 %	50 %	300115636
20	NC_014316	GC	3	6	20599	20604	0 %	0 %	50 %	50 %	300115636
21	NC_014316	AG	3	6	20614	20619	50 %	0 %	50 %	0 %	300115636
22	NC_014316	GC	3	6	21508	21513	0 %	0 %	50 %	50 %	300115636
23	NC_014316	AG	3	6	21842	21847	50 %	0 %	50 %	0 %	300115636
24	NC_014316	AT	3	6	22867	22872	50 %	50 %	0 %	0 %	300115637
25	NC_014316	GC	4	8	24328	24335	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
26	NC_014316	GC	3	6	25056	25061	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
27	NC_014316	GC	3	6	25275	25280	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
28	NC_014316	GC	3	6	25314	25319	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
29	NC_014316	CA	3	6	25395	25400	50 %	0 %	0 %	50 %	300115638
30	NC_014316	GC	3	6	25702	25707	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
31	NC_014316	AG	4	8	26200	26207	50 %	0 %	50 %	0 %	300115638
32	NC_014316	GC	3	6	27322	27327	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
33	NC_014316	CG	3	6	27350	27355	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
34	NC_014316	CG	3	6	28221	28226	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
35	NC_014316	GC	3	6	28277	28282	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
36	NC_014316	CG	3	6	28371	28376	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
37	NC_014316	GC	3	6	28939	28944	0 %	0 %	50 %	50 %	300115638
38	NC_014316	AC	3	6	29100	29105	50 %	0 %	0 %	50 %	300115638
39	NC_014316	GA	3	6	32998	33003	50 %	0 %	50 %	0 %	300115642
40	NC_014316	GT	3	6	33274	33279	0 %	50 %	50 %	0 %	300115642
41	NC_014316	AG	3	6	33375	33380	50 %	0 %	50 %	0 %	300115642
42	NC_014316	AT	3	6	36011	36016	50 %	50 %	0 %	0 %	300115644
43	NC_014316	CT	3	6	36204	36209	0 %	50 %	0 %	50 %	300115645

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.