MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 36738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014315	ACC	2	6	173	178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112746
2	NC_014315	ACA	2	6	237	242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300112746
3	NC_014315	CTT	2	6	364	369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112746
4	NC_014315	TAA	2	6	483	488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112746
5	NC_014315	GCT	2	6	541	546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112746
6	NC_014315	TCG	2	6	704	709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112746
7	NC_014315	AGG	2	6	827	832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112746
8	NC_014315	AAT	2	6	876	881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112746
9	NC_014315	AAG	2	6	905	910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112746
10	NC_014315	TGA	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112746
11	NC_014315	ATC	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112746
12	NC_014315	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112746
13	NC_014315	ATC	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112746
14	NC_014315	TTC	2	6	1369	1374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112746
15	NC_014315	TAC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112746
16	NC_014315	TCG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112746
17	NC_014315	AGA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112747
18	NC_014315	GCG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112747
19	NC_014315	TAG	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112747
20	NC_014315	CGG	2	6	2112	2117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112747
21	NC_014315	AGA	2	6	2231	2236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112747
22	NC_014315	AAG	2	6	2320	2325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112747
23	NC_014315	CTG	2	6	2377	2382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112747
24	NC_014315	TCA	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112747
25	NC_014315	TTA	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112747
26	NC_014315	TAT	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112747
27	NC_014315	CTT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112747
28	NC_014315	CAA	2	6	2601	2606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300112747
29	NC_014315	CTA	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112747
30	NC_014315	CTG	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112747
31	NC_014315	GAA	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112747
32	NC_014315	TAA	2	6	3005	3010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112747
33	NC_014315	TAT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112747
34	NC_014315	AGA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112747
35	NC_014315	TAG	2	6	3080	3085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112747
36	NC_014315	TGT	2	6	3125	3130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112747
37	NC_014315	TTG	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112748
38	NC_014315	GCC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112748
39	NC_014315	GGC	2	6	3568	3573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112748
40	NC_014315	AAT	2	6	3603	3608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112748
41	NC_014315	GAT	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112748
42	NC_014315	TCA	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112748
43	NC_014315	CCA	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112748
44	NC_014315	TCA	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112748
45	NC_014315	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112748
46	NC_014315	CAA	2	6	3953	3958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300112748
47	NC_014315	TTC	2	6	4831	4836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112749
48	NC_014315	TGA	2	6	4861	4866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112749
49	NC_014315	GGA	2	6	9876	9881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112750
50	NC_014315	TGG	2	6	9948	9953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112750
51	NC_014315	AGC	2	6	9973	9978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112750
52	NC_014315	CCA	2	6	10136	10141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112750
53	NC_014315	GAA	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112750
54	NC_014315	CAA	2	6	10326	10331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300112750
55	NC_014315	TAT	2	6	10372	10377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112750
56	NC_014315	GAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112750
57	NC_014315	ATC	2	6	10441	10446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112750
58	NC_014315	ATT	2	6	10463	10468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112750
59	NC_014315	CCA	2	6	10495	10500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112750
60	NC_014315	GTG	2	6	10516	10521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112750
61	NC_014315	TGA	2	6	10712	10717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
62	NC_014315	CAT	2	6	10731	10736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112751
63	NC_014315	CGA	2	6	10766	10771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
64	NC_014315	TGA	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
65	NC_014315	AAG	3	9	10873	10881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112751
66	NC_014315	TCA	2	6	10900	10905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112751
67	NC_014315	TGC	2	6	10912	10917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112751
68	NC_014315	TGG	2	6	10922	10927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112751
69	NC_014315	TGG	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112751
70	NC_014315	GTT	2	6	10986	10991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112751
71	NC_014315	CTG	2	6	11002	11007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112751
72	NC_014315	CAG	2	6	11046	11051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
73	NC_014315	ACA	2	6	11115	11120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300112751
74	NC_014315	TTA	2	6	11229	11234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112751
75	NC_014315	AGA	2	6	11258	11263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112751
76	NC_014315	AAT	2	6	11430	11435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112751
77	NC_014315	AAG	2	6	11515	11520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112751
78	NC_014315	GAT	2	6	11556	11561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
79	NC_014315	TCT	2	6	11616	11621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112751
80	NC_014315	GGC	2	6	11733	11738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112751
81	NC_014315	GCT	2	6	11751	11756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112751
82	NC_014315	AGC	2	6	11768	11773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
83	NC_014315	TCG	2	6	11795	11800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112751
84	NC_014315	ATT	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112751
85	NC_014315	TAG	2	6	11884	11889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
86	NC_014315	GGA	2	6	11904	11909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112751
87	NC_014315	TTC	2	6	11947	11952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112751
88	NC_014315	TTA	2	6	12028	12033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112751
89	NC_014315	GAA	2	6	12060	12065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112751
90	NC_014315	ATT	2	6	12096	12101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112751
91	NC_014315	TAG	2	6	12181	12186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
92	NC_014315	CCT	2	6	12213	12218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300112751
93	NC_014315	GAT	2	6	12261	12266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
94	NC_014315	ATT	2	6	12376	12381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112751
95	NC_014315	TAA	2	6	12536	12541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112751
96	NC_014315	GCA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
97	NC_014315	AAG	2	6	12784	12789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112751
98	NC_014315	ACG	2	6	12902	12907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
99	NC_014315	GAT	2	6	12927	12932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112751
100	NC_014315	TAC	2	6	12956	12961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112751
101	NC_014315	CGA	2	6	12987	12992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112751
102	NC_014315	GTT	2	6	13117	13122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112752
103	NC_014315	AAG	2	6	13204	13209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112752
104	NC_014315	TGC	2	6	13283	13288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112752
105	NC_014315	GGC	2	6	13343	13348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112752
106	NC_014315	CAG	2	6	13392	13397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112752
107	NC_014315	GAT	2	6	13551	13556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112752
108	NC_014315	AAT	2	6	13593	13598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112752
109	NC_014315	TCA	2	6	13627	13632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112752
110	NC_014315	GCT	2	6	13673	13678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112752
111	NC_014315	TGC	2	6	13724	13729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112752
112	NC_014315	CAG	2	6	14093	14098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112753
113	NC_014315	AGA	2	6	14169	14174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112753
114	NC_014315	ACG	2	6	14203	14208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112753
115	NC_014315	AGC	2	6	14340	14345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112753
116	NC_014315	TGA	2	6	14388	14393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112753
117	NC_014315	GAT	2	6	14394	14399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112753
118	NC_014315	TTG	2	6	14417	14422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112753
119	NC_014315	TTC	2	6	14499	14504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112753
120	NC_014315	TGA	2	6	14738	14743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112754
121	NC_014315	GAT	2	6	14990	14995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112754
122	NC_014315	CCA	2	6	15017	15022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112754
123	NC_014315	CGC	2	6	15026	15031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112754
124	NC_014315	TGC	2	6	15186	15191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112755
125	NC_014315	ATG	2	6	15237	15242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112755
126	NC_014315	CTT	2	6	15370	15375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112755
127	NC_014315	TGA	2	6	15666	15671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112756
128	NC_014315	TGA	2	6	15726	15731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112756
129	NC_014315	ACC	2	6	15782	15787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112756
130	NC_014315	CTT	2	6	15967	15972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112756
131	NC_014315	TGC	2	6	16010	16015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112756
132	NC_014315	CGT	2	6	16142	16147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112756
133	NC_014315	CAT	2	6	16154	16159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112756
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135	NC_014315	TCT	2	6	16221	16226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112756
136	NC_014315	TCG	2	6	16245	16250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112756
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139	NC_014315	CGT	2	6	16441	16446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112756
140	NC_014315	GCC	2	6	16523	16528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112756
141	NC_014315	TAC	2	6	16612	16617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112756
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143	NC_014315	CAC	2	6	16894	16899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112757
144	NC_014315	AGT	2	6	16943	16948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112757
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149	NC_014315	CAT	2	6	17794	17799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112758
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152	NC_014315	TCT	2	6	17930	17935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112758
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162	NC_014315	AGT	2	6	18800	18805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112759
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164	NC_014315	TGA	2	6	18875	18880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112759
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252	NC_014315	GAG	2	6	25932	25937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112763
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255	NC_014315	GCT	3	9	26082	26090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112763
256	NC_014315	GTG	2	6	26233	26238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112763
257	NC_014315	TAA	2	6	26240	26245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112763
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500	NC_014315	CGA	2	6	46038	46043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112782

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