MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalogenimonas lykanthroporepellens BL-DC-9 chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014314	CAGAC	2	10	18944	18953	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014314	GTGCC	2	10	19122	19131	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014314	TGCCA	2	10	20312	20321	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014314	GTAAA	2	10	24012	24021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014314	TGATA	2	10	46018	46027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014314	ACTGA	2	10	59455	59464	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014314	CGGAG	2	10	66052	66061	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014314	CCCGG	2	10	70798	70807	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014314	CTTCC	2	10	74121	74130	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014314	GAAAT	2	10	104951	104960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014314	TTTGA	2	10	109146	109155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014314	TTTTC	2	10	113915	113924	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014314	TACGG	2	10	116650	116659	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014314	GATGA	2	10	120601	120610	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014314	AACCA	2	10	129010	129019	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014314	GCACG	2	10	135613	135622	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014314	CTATA	2	10	165074	165083	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014314	ATACT	2	10	167677	167686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014314	CGCAT	2	10	174534	174543	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014314	AGGAA	2	10	178003	178012	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014314	GCCGG	2	10	188918	188927	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014314	AATTG	2	10	217998	218007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014314	TTTGG	2	10	224738	224747	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014314	TAATT	2	10	224958	224967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014314	AAAGC	2	10	226075	226084	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014314	GTCCA	2	10	226163	226172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014314	CCGCC	2	10	233030	233039	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
28	NC_014314	AGAAA	2	10	243943	243952	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014314	GTGAA	2	10	250983	250992	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014314	CGAAG	2	10	252523	252532	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014314	TTTTA	2	10	265579	265588	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014314	CGACC	2	10	273414	273423	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014314	TGACC	2	10	274925	274934	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014314	CCGTC	2	10	292771	292780	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014314	GCAAT	2	10	293642	293651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014314	TGAAT	2	10	308650	308659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014314	CGTCA	2	10	347625	347634	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014314	ACGAT	2	10	353328	353337	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014314	TAAGG	2	10	371542	371551	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014314	CTTGG	2	10	386147	386156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014314	GGCAG	2	10	392552	392561	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014314	CAAAC	2	10	395291	395300	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014314	AATGT	2	10	438443	438452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014314	CGGGG	2	10	438694	438703	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014314	CTTGG	2	10	448005	448014	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014314	TCAGC	2	10	448247	448256	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014314	CGCTA	2	10	450965	450974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_014314	CAGTT	2	10	494405	494414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014314	TAGTG	2	10	498977	498986	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014314	CCGGG	2	10	521163	521172	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014314	TTCCC	2	10	522634	522643	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014314	TTCCT	2	10	527517	527526	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014314	TAATT	2	10	539096	539105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014314	GATAT	2	10	539194	539203	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014314	ACTTG	2	10	559914	559923	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014314	GTCAG	2	10	574382	574391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014314	ATATA	2	10	578413	578422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014314	CGCTA	2	10	582709	582718	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014314	AAGAA	2	10	595334	595343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014314	TAAAA	2	10	598830	598839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014314	GATGA	2	10	612921	612930	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014314	AAAAG	2	10	649182	649191	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014314	GTTTC	2	10	692894	692903	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014314	GAACT	2	10	733202	733211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014314	TACCC	2	10	761276	761285	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014314	ATTAA	2	10	762002	762011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014314	AATTG	2	10	764112	764121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014314	CAATT	2	10	766718	766727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014314	CTTAT	2	10	776980	776989	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014314	CAACG	2	10	790486	790495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014314	ACTTC	2	10	833845	833854	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014314	AGTAT	2	10	865846	865855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014314	CCGGG	2	10	870025	870034	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014314	ATTTT	2	10	917598	917607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014314	TCAGC	2	10	930107	930116	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014314	GCCTT	2	10	941285	941294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_014314	CCCCG	2	10	945523	945532	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
78	NC_014314	TCAAT	2	10	946805	946814	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014314	GCTAC	2	10	949715	949724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014314	ATTTT	2	10	961790	961799	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014314	CTTAT	2	10	1002185	1002194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014314	CCATC	2	10	1010487	1010496	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014314	TTCAG	2	10	1021038	1021047	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014314	TTACG	2	10	1021990	1021999	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014314	ACTGG	2	10	1089519	1089528	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014314	ATCTC	2	10	1100925	1100934	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014314	CTGAG	2	10	1110395	1110404	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014314	CACCC	2	10	1139450	1139459	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_014314	AGATA	2	10	1145605	1145614	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014314	TCGCA	2	10	1153243	1153252	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014314	AGGTG	2	10	1156212	1156221	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014314	GTTCA	2	10	1165183	1165192	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014314	TCAGG	2	10	1167237	1167246	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014314	AAACC	2	10	1167431	1167440	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014314	GTAAA	2	10	1172276	1172285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014314	GGCAA	2	10	1193488	1193497	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014314	AAAAT	2	10	1202628	1202637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014314	GGGCG	2	10	1217527	1217536	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014314	CGCCC	2	10	1217544	1217553	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
100	NC_014314	GCCTG	2	10	1223536	1223545	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014314	GACAG	2	10	1241109	1241118	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014314	GTTCA	2	10	1241208	1241217	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014314	ATTCA	2	10	1241395	1241404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014314	TGATT	2	10	1242082	1242091	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014314	CTAAA	2	10	1242165	1242174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014314	AGACA	2	10	1242613	1242622	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014314	ACCTT	2	10	1248213	1248222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014314	ATATT	2	10	1264939	1264948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014314	TTCAA	2	10	1290750	1290759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014314	GTTTT	2	10	1296730	1296739	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014314	GGCCG	2	10	1307915	1307924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014314	TACGA	2	10	1343981	1343990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014314	CGGCC	2	10	1349674	1349683	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_014314	ATAGC	2	10	1373845	1373854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014314	TCTCG	2	10	1398293	1398302	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014314	CCTCC	2	10	1404977	1404986	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_014314	TTCCT	2	10	1413472	1413481	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014314	TTCCT	2	10	1413616	1413625	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014314	TTCCT	2	10	1414375	1414384	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014314	TTCCT	2	10	1414559	1414568	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014314	TTCCT	2	10	1414663	1414672	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014314	TTCCT	2	10	1414848	1414857	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014314	CCCTC	2	10	1414906	1414915	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_014314	CCAAT	2	10	1422907	1422916	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014314	TCGCA	2	10	1423550	1423559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014314	GTCAG	2	10	1449456	1449465	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014314	GTTCC	2	10	1451515	1451524	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014314	TATAA	2	10	1454017	1454026	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014314	AGCCG	2	10	1454853	1454862	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014314	ACCAA	2	10	1457384	1457393	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014314	ACCTT	2	10	1457676	1457685	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014314	CTGAT	2	10	1487103	1487112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014314	TTGTA	2	10	1490048	1490057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014314	CAGCG	2	10	1498358	1498367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_014314	AAAAT	2	10	1502252	1502261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014314	GATAT	2	10	1502320	1502329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014314	GGGCC	2	10	1508145	1508154	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014314	AACAC	2	10	1518486	1518495	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014314	ACAAT	2	10	1531779	1531788	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014314	TAAGA	2	10	1540089	1540098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014314	TTCTA	2	10	1545951	1545960	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014314	GTGGA	2	10	1548795	1548804	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014314	TTTTA	2	10	1564552	1564561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014314	ATTAT	2	10	1569950	1569959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014314	GTTCA	2	10	1579081	1579090	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014314	CGGTT	2	10	1579468	1579477	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014314	AATCA	2	10	1580826	1580835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014314	CCGTT	2	10	1627815	1627824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_014314	AATGG	2	10	1633005	1633014	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014314	CGGCT	2	10	1654416	1654425	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014314	GCGGG	2	10	1655152	1655161	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014314	AAAAG	2	10	1656690	1656699	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014314	TCGGC	2	10	1666156	1666165	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.