MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans ATCC 51888 chromosome

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014313	CGTTAG	2	12	29769	29780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014313	GGCGAA	2	12	66499	66510	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014313	ACGTTG	2	12	85195	85206	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014313	CTCTTT	2	12	160035	160046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014313	GATGGG	2	12	228545	228556	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014313	AAGAAA	2	12	264785	264796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014313	GATGCT	2	12	350683	350694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014313	AAGTGC	2	12	354107	354118	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014313	GGCCAA	2	12	401502	401513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014313	CTTCGC	2	12	446837	446848	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014313	ACGGTC	2	12	603040	603051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014313	TTTCGC	2	12	690179	690190	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014313	AATGCG	2	12	726688	726699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014313	TCGAAA	2	12	736949	736960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014313	GAACGC	2	12	743764	743775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014313	TGGGAT	2	12	782389	782400	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014313	TTTCTT	2	12	782466	782477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014313	AGTATG	2	12	823754	823765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014313	TCGCGC	2	12	826023	826034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014313	CAGAGT	2	12	861179	861190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014313	GGCCGT	2	12	904790	904801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014313	AGCCGG	2	12	941647	941658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014313	CGGTGG	2	12	1041959	1041970	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014313	TCGTGA	2	12	1108343	1108354	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014313	TTTTTG	2	12	1141512	1141523	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014313	CTCAAT	2	12	1248457	1248468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014313	CGTCGC	2	12	1270618	1270629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014313	ATTCGT	2	12	1272417	1272428	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014313	CGTCAG	2	12	1307221	1307232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014313	TGCATT	2	12	1329366	1329377	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014313	ACATGC	2	12	1429734	1429745	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014313	TCGAAA	2	12	1517292	1517303	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014313	GCAGGC	2	12	1605975	1605986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014313	GGATCA	2	12	1606190	1606201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014313	CTCTTT	2	12	1609750	1609761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014313	AAGGGG	2	12	1681765	1681776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014313	GGATGC	2	12	1710011	1710022	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014313	AAGCCG	2	12	1773247	1773258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014313	TCGACG	2	12	1859049	1859060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014313	CTTGGT	2	12	1934111	1934122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014313	CAAGAA	2	12	1934710	1934721	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014313	GTGGAC	2	12	1934761	1934772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014313	GCATGA	2	12	1935131	1935142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014313	CGAATG	2	12	1938623	1938634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014313	CGTGCG	2	12	1958432	1958443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014313	GGAACC	2	12	1984224	1984235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014313	TGCGAA	2	12	1994053	1994064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014313	AGCGCG	2	12	1998787	1998798	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014313	AAACAG	2	12	2009454	2009465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014313	CAAGCG	2	12	2052266	2052277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014313	CCTGAG	2	12	2061715	2061726	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014313	CGTGAG	2	12	2065917	2065928	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014313	CATCGC	2	12	2083256	2083267	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014313	GCTCGG	2	12	2112398	2112409	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014313	TCGCGG	2	12	2118375	2118386	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014313	GTCAAC	2	12	2130333	2130344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014313	GCGTCC	2	12	2150116	2150127	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014313	ACGGAC	2	12	2154036	2154047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014313	CAATCG	2	12	2160593	2160604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014313	GCAACT	2	12	2184051	2184062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014313	GTTTCG	2	12	2219532	2219543	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014313	TAAATT	2	12	2220712	2220723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014313	ACCCTA	2	12	2244833	2244844	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014313	GAGTGC	2	12	2280266	2280277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014313	GCGCTC	2	12	2286405	2286416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014313	ATTTGG	2	12	2339517	2339528	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014313	TTTTGT	2	12	2352720	2352731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014313	CGGGCG	2	12	2458821	2458832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014313	GCCCTG	2	12	2481504	2481515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014313	GCCCCG	2	12	2535011	2535022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014313	CGCAAA	2	12	2584542	2584553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014313	GAGGGG	2	12	2666636	2666647	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014313	CCCGAC	2	12	2715865	2715876	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014313	CGCCGG	2	12	2773401	2773412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014313	TCGAAA	2	12	2810400	2810411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014313	CATGAA	2	12	2841432	2841443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014313	GCACGC	2	12	2875255	2875266	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014313	TCAGCA	2	12	2887388	2887399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014313	TTGGCT	2	12	2923842	2923853	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014313	CGGTGC	2	12	2928394	2928405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014313	TCGATT	2	12	2964912	2964923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014313	ACTTGC	2	12	3015451	3015462	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014313	CTTGCT	2	12	3081911	3081922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014313	TGCGCC	2	12	3114179	3114190	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014313	ATCGAG	2	12	3144774	3144785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014313	GCGAGC	2	12	3174180	3174191	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014313	CGCCAT	2	12	3205209	3205220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014313	CGATTG	2	12	3290228	3290239	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014313	GTAGCA	2	12	3390913	3390924	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014313	AAAATG	2	12	3402607	3402618	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014313	ATTGCG	2	12	3414124	3414135	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014313	CCTCGA	2	12	3424947	3424958	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014313	TTGCGG	2	12	3429791	3429802	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014313	GGCGAC	2	12	3435098	3435109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014313	GGCGCT	2	12	3462345	3462356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014313	CGGTAT	2	12	3492736	3492747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014313	GTAGCC	2	12	3493422	3493433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014313	GTGCGG	2	12	3585617	3585628	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014313	CCGGTT	2	12	3617807	3617818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014313	ATCCGG	2	12	3628994	3629005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.