MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014311	GTCCTT	2	12	35217	35228	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014311	CGCCAC	2	12	60953	60964	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014311	GCCCCC	2	12	68563	68574	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_014311	GGCGCC	2	12	81310	81321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014311	TCCGTG	2	12	179386	179397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014311	CATCGC	2	12	182510	182521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014311	ATGGGC	2	12	189490	189501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014311	GTTGGA	2	12	203878	203889	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014311	GGGCAA	2	12	206501	206512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014311	TCTTCG	2	12	232246	232257	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014311	TGGTGC	2	12	283883	283894	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014311	AGCTAC	2	12	289851	289862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014311	CTACAG	2	12	290021	290032	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014311	GTTCTT	2	12	297677	297688	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014311	CAGCAC	2	12	301352	301363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014311	CCGATC	5	30	306588	306617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014311	CCGTTC	4	24	306618	306641	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014311	CAGAAA	2	12	321925	321936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014311	GTGGCG	2	12	323945	323956	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014311	ATGAGA	2	12	339482	339493	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014311	GCGTGC	2	12	342367	342378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014311	TGCCGG	2	12	346198	346209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014311	CGGGCG	2	12	346349	346360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014311	GCCGGC	2	12	347452	347463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014311	GTCGCG	2	12	352937	352948	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014311	GGGCCT	2	12	358206	358217	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014311	TTTCTT	2	12	375926	375937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014311	GCACGC	2	12	395087	395098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014311	GGCATC	2	12	399110	399121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014311	AGCCGG	2	12	408433	408444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014311	CGGCAA	2	12	421066	421077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014311	CGTGGC	2	12	427432	427443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014311	AAGCGA	2	12	440124	440135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014311	GTGCAT	2	12	493503	493514	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014311	CCGCGC	2	12	567023	567034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014311	CCCATC	2	12	567115	567126	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014311	CGGCGC	2	12	585388	585399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014311	GCCTTT	2	12	591812	591823	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014311	GCCAGG	2	12	613171	613182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014311	AAGCGA	2	12	620372	620383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014311	CGGCAT	2	12	627612	627623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014311	CGGTGG	2	12	716259	716270	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014311	TGCCGA	2	12	717882	717893	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014311	ATGCGC	2	12	718053	718064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014311	ATGCAG	2	12	725483	725494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014311	CGTCAT	2	12	766714	766725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014311	CTACCG	2	12	779588	779599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014311	GCCGGT	2	12	800518	800529	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014311	TGCCAA	2	12	827838	827849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014311	TTCAGC	2	12	839156	839167	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014311	CGGCTC	2	12	841792	841803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014311	TCCTGA	2	12	842107	842118	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014311	CAACCT	2	12	842273	842284	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014311	CACGCC	2	12	843900	843911	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014311	CCAACA	2	12	844505	844516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014311	CAACGG	2	12	845025	845036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014311	GTGCAA	3	18	858753	858770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014311	AGGGGT	2	12	872768	872779	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014311	GGCACG	2	12	888509	888520	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014311	GTCGGA	2	12	905480	905491	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014311	GATCGC	2	12	907720	907731	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014311	TCCGGT	2	12	914121	914132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014311	ACGTCA	2	12	936646	936657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014311	GGGGCA	2	12	945723	945734	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014311	GCCGGC	2	12	961233	961244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014311	CGGGAA	2	12	963493	963504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014311	CGTTGC	2	12	969480	969491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014311	GACGGT	2	12	990469	990480	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014311	TCGTAC	2	12	992365	992376	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014311	AGGTTG	2	12	1000136	1000147	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014311	TCCGGC	2	12	1152660	1152671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014311	CCGGCA	2	12	1177559	1177570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014311	GGACCC	2	12	1179785	1179796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014311	GCATAT	2	12	1185465	1185476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014311	CGGGCT	2	12	1229785	1229796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014311	GTGCCG	2	12	1242408	1242419	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014311	CTGTTT	2	12	1263258	1263269	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014311	CGCGCT	2	12	1264088	1264099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014311	TTCCAT	2	12	1271647	1271658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014311	AAGTTC	2	12	1320446	1320457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014311	TCGGGT	2	12	1332417	1332428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014311	GCGCGA	2	12	1332486	1332497	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014311	GTTCAG	2	12	1356922	1356933	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014311	CTCCGA	2	12	1388807	1388818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014311	CGATCG	2	12	1433240	1433251	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014311	GCGGTG	2	12	1561442	1561453	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014311	TCGCGC	2	12	1568624	1568635	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014311	GTGAGG	2	12	1571853	1571864	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014311	CGGCAG	2	12	1587915	1587926	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014311	GATGGG	2	12	1617549	1617560	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014311	CCATGT	2	12	1689953	1689964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014311	CGAAGG	2	12	1784637	1784648	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014311	CCGGCA	2	12	1804717	1804728	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014311	TCAACG	2	12	1847065	1847076	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014311	CGTGTA	2	12	1907822	1907833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014311	GCGGGC	2	12	1980642	1980653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014311	TTCGCT	2	12	2008123	2008134	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014311	AGCGGA	2	12	2051828	2051839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014311	TCGGGA	2	12	2077043	2077054	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014311	GTCTGT	2	12	2158895	2158906	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014311	GCCCGG	2	12	2175774	2175785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014311	CGCAGC	2	12	2199397	2199408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014311	CCCAAT	2	12	2200840	2200851	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014311	TCGGAA	2	12	2248497	2248508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014311	GAAATC	2	12	2264824	2264835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014311	GCCCGC	2	12	2311070	2311081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014311	CCACCG	2	12	2329275	2329286	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014311	CGTAAA	2	12	2347437	2347448	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014311	TCATCG	2	12	2377734	2377745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014311	GACGAA	2	12	2413509	2413520	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014311	CGCTTG	2	12	2415164	2415175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014311	CGGAGC	2	12	2463178	2463189	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014311	TGGCCC	2	12	2525644	2525655	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014311	TCGGCC	2	12	2526403	2526414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014311	CCACCG	2	12	2535831	2535842	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014311	GCCAGC	2	12	2537403	2537414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014311	GATCCT	2	12	2537452	2537463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014311	GCCGCT	2	12	2548012	2548023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014311	CTGGAA	2	12	2596749	2596760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014311	GCAGTC	2	12	2618832	2618843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014311	TTGAAT	2	12	2620358	2620369	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014311	GCCCAT	2	12	2654898	2654909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014311	GCCGGG	2	12	2656889	2656900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014311	GAAGAC	3	18	2665237	2665254	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014311	GGAATG	2	12	2688312	2688323	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014311	GCCTGC	2	12	2695177	2695188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014311	CAGGCG	2	12	2695359	2695370	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014311	AATACA	2	12	2707236	2707247	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014311	CCGTTT	2	12	2739033	2739044	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014311	AGGCAA	2	12	2802369	2802380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014311	CCGCCA	2	12	2823204	2823215	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014311	GATGTC	2	12	2850562	2850573	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014311	GCGCTG	2	12	2875364	2875375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014311	CGCGCA	2	12	2875381	2875392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014311	GTCTGT	2	12	2879505	2879516	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_014311	GCGCCG	2	12	2892224	2892235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014311	TCGCGT	2	12	2930146	2930157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014311	GGGGCC	2	12	2938852	2938863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014311	CTCGCG	2	12	2939236	2939247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014311	ACGCGA	2	12	2939379	2939390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014311	CGCCGG	2	12	2939608	2939619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014311	CTGGGC	2	12	2939756	2939767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014311	GTTCCG	2	12	2959294	2959305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014311	TTGCTT	2	12	2974572	2974583	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014311	CAAAAA	2	12	3007111	3007122	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014311	TCGATC	2	12	3010280	3010291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014311	CGGCCG	2	12	3022567	3022578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014311	ACCGCA	2	12	3063351	3063362	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014311	ATCCGC	2	12	3071606	3071617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014311	CGGAAG	2	12	3120261	3120272	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014311	GGCACG	2	12	3251622	3251633	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014311	TGCTGA	2	12	3360266	3360277	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_014311	GCCGGG	2	12	3371937	3371948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014311	GACGCC	2	12	3386579	3386590	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014311	CGGATG	2	12	3415960	3415971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014311	TGTCGG	2	12	3418713	3418724	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014311	CGCCCG	2	12	3459337	3459348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_014311	CATTCC	2	12	3460360	3460371	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_014311	GTTTCG	2	12	3491313	3491324	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_014311	TCCGGC	2	12	3502629	3502640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
161	NC_014311	CGAAGA	2	12	3513367	3513378	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.