MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 2673

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014311	CGACC	2	10	518	527	20 %	0 %	20 %	60 %	300689715
2	NC_014311	ACCAC	2	10	1753	1762	40 %	0 %	0 %	60 %	300689715
3	NC_014311	TGCGC	2	10	5281	5290	0 %	20 %	40 %	40 %	300689717
4	NC_014311	CGCAA	2	10	6801	6810	40 %	0 %	20 %	40 %	300689718
5	NC_014311	CGGGC	2	10	7005	7014	0 %	0 %	60 %	40 %	300689718
6	NC_014311	CGCAA	2	10	10072	10081	40 %	0 %	20 %	40 %	300689719
7	NC_014311	CGGCG	2	10	10519	10528	0 %	0 %	60 %	40 %	300689720
8	NC_014311	GCGCG	2	10	11504	11513	0 %	0 %	60 %	40 %	300689720
9	NC_014311	TGGTT	2	10	13804	13813	0 %	60 %	40 %	0 %	300689721
10	NC_014311	CCTGC	2	10	15784	15793	0 %	20 %	20 %	60 %	300689722
11	NC_014311	CAAAG	2	10	16560	16569	60 %	0 %	20 %	20 %	300689723
12	NC_014311	GCACG	2	10	22607	22616	20 %	0 %	40 %	40 %	300689728
13	NC_014311	AAGAC	2	10	25290	25299	60 %	0 %	20 %	20 %	300689731
14	NC_014311	GGGTG	2	10	27103	27112	0 %	20 %	80 %	0 %	300689732
15	NC_014311	ACGAT	2	10	28108	28117	40 %	20 %	20 %	20 %	300689735
16	NC_014311	TGCAC	2	10	33344	33353	20 %	20 %	20 %	40 %	300689738
17	NC_014311	TGCGC	2	10	34647	34656	0 %	20 %	40 %	40 %	300689739
18	NC_014311	CACCG	2	10	34924	34933	20 %	0 %	20 %	60 %	300689739
19	NC_014311	GCGCA	2	10	36620	36629	20 %	0 %	40 %	40 %	300689740
20	NC_014311	GCACG	2	10	36688	36697	20 %	0 %	40 %	40 %	300689740
21	NC_014311	GCGCG	2	10	39286	39295	0 %	0 %	60 %	40 %	300689743
22	NC_014311	CCGCA	2	10	39835	39844	20 %	0 %	20 %	60 %	300689744
23	NC_014311	GCCGC	2	10	40401	40410	0 %	0 %	40 %	60 %	300689745
24	NC_014311	GCGCG	2	10	40794	40803	0 %	0 %	60 %	40 %	300689745
25	NC_014311	CGCGG	2	10	41495	41504	0 %	0 %	60 %	40 %	300689745
26	NC_014311	GCGCA	2	10	41652	41661	20 %	0 %	40 %	40 %	300689746
27	NC_014311	CATCG	2	10	43283	43292	20 %	20 %	20 %	40 %	300689748
28	NC_014311	GGCAC	2	10	43743	43752	20 %	0 %	40 %	40 %	300689748
29	NC_014311	GGGCT	2	10	43779	43788	0 %	20 %	60 %	20 %	300689748
30	NC_014311	GGCGC	2	10	44033	44042	0 %	0 %	60 %	40 %	300689748
31	NC_014311	CGGCG	2	10	44133	44142	0 %	0 %	60 %	40 %	300689749
32	NC_014311	GGGGC	2	10	44453	44462	0 %	0 %	80 %	20 %	300689749
33	NC_014311	CGGCG	2	10	46028	46037	0 %	0 %	60 %	40 %	300689750
34	NC_014311	CCTGG	2	10	46846	46855	0 %	20 %	40 %	40 %	300689751
35	NC_014311	TGGGC	2	10	47708	47717	0 %	20 %	60 %	20 %	300689752
36	NC_014311	TGGCG	2	10	47958	47967	0 %	20 %	60 %	20 %	300689752
37	NC_014311	CGAAG	2	10	48763	48772	40 %	0 %	40 %	20 %	300689753
38	NC_014311	GCGCG	2	10	48828	48837	0 %	0 %	60 %	40 %	300689753
39	NC_014311	AGGGC	2	10	50465	50474	20 %	0 %	60 %	20 %	300689754
40	NC_014311	CATGC	2	10	52056	52065	20 %	20 %	20 %	40 %	300689755
41	NC_014311	CCGCA	2	10	52716	52725	20 %	0 %	20 %	60 %	300689756
42	NC_014311	GGACA	2	10	54599	54608	40 %	0 %	40 %	20 %	300689757
43	NC_014311	GCGTA	2	10	55108	55117	20 %	20 %	40 %	20 %	300689757
44	NC_014311	CGGCC	2	10	55321	55330	0 %	0 %	40 %	60 %	300689757
45	NC_014311	CCGGC	2	10	55936	55945	0 %	0 %	40 %	60 %	300689758
46	NC_014311	GCACG	2	10	57803	57812	20 %	0 %	40 %	40 %	300689759
47	NC_014311	CGGCC	2	10	59066	59075	0 %	0 %	40 %	60 %	300689760
48	NC_014311	AGGCC	2	10	59744	59753	20 %	0 %	40 %	40 %	300689761
49	NC_014311	TGCGG	2	10	61687	61696	0 %	20 %	60 %	20 %	300689762
50	NC_014311	GGCCA	2	10	62796	62805	20 %	0 %	40 %	40 %	300689763
51	NC_014311	TGGGC	2	10	65214	65223	0 %	20 %	60 %	20 %	300689764
52	NC_014311	TGCGC	2	10	66156	66165	0 %	20 %	40 %	40 %	300689765
53	NC_014311	GCCGA	2	10	68995	69004	20 %	0 %	40 %	40 %	300689766
54	NC_014311	TGCGA	2	10	72492	72501	20 %	20 %	40 %	20 %	300689768
55	NC_014311	GCTTG	2	10	74322	74331	0 %	40 %	40 %	20 %	300689771
56	NC_014311	GAATC	2	10	77357	77366	40 %	20 %	20 %	20 %	300689776
57	NC_014311	CGCCC	2	10	79742	79751	0 %	0 %	20 %	80 %	300689778
58	NC_014311	CATCG	2	10	79924	79933	20 %	20 %	20 %	40 %	300689778
59	NC_014311	GCCGC	2	10	80628	80637	0 %	0 %	40 %	60 %	300689778
60	NC_014311	TCGTT	2	10	80751	80760	0 %	60 %	20 %	20 %	300689778
61	NC_014311	CCACG	2	10	82548	82557	20 %	0 %	20 %	60 %	300689780
62	NC_014311	GCGCC	2	10	82713	82722	0 %	0 %	40 %	60 %	300689780
63	NC_014311	TGCCA	2	10	83310	83319	20 %	20 %	20 %	40 %	300689781
64	NC_014311	TGCGG	2	10	84437	84446	0 %	20 %	60 %	20 %	300689782
65	NC_014311	CCGGC	2	10	84495	84504	0 %	0 %	40 %	60 %	300689782
66	NC_014311	GGCGC	2	10	85869	85878	0 %	0 %	60 %	40 %	300689784
67	NC_014311	CGACC	2	10	89022	89031	20 %	0 %	20 %	60 %	300689786
68	NC_014311	TTCGT	2	10	89546	89555	0 %	60 %	20 %	20 %	300689787
69	NC_014311	CTTCG	2	10	90642	90651	0 %	40 %	20 %	40 %	300689788
70	NC_014311	ATCGC	2	10	90781	90790	20 %	20 %	20 %	40 %	300689788
71	NC_014311	TGCCG	2	10	90893	90902	0 %	20 %	40 %	40 %	300689788
72	NC_014311	CAGAT	2	10	91842	91851	40 %	20 %	20 %	20 %	300689789
73	NC_014311	ACCAG	2	10	92482	92491	40 %	0 %	20 %	40 %	300689789
74	NC_014311	CGGCG	2	10	94368	94377	0 %	0 %	60 %	40 %	300689791
75	NC_014311	GGTTG	2	10	94580	94589	0 %	40 %	60 %	0 %	300689791
76	NC_014311	ATCGC	2	10	97110	97119	20 %	20 %	20 %	40 %	300689794
77	NC_014311	AGCGG	2	10	98459	98468	20 %	0 %	60 %	20 %	300689796
78	NC_014311	CGGGC	2	10	99825	99834	0 %	0 %	60 %	40 %	300689798
79	NC_014311	CGAAG	2	10	101542	101551	40 %	0 %	40 %	20 %	300689799
80	NC_014311	CGGTG	2	10	103524	103533	0 %	20 %	60 %	20 %	300689801
81	NC_014311	CGGCG	2	10	104157	104166	0 %	0 %	60 %	40 %	300689801
82	NC_014311	GCCGA	2	10	105595	105604	20 %	0 %	40 %	40 %	300689803
83	NC_014311	GCCTG	2	10	105929	105938	0 %	20 %	40 %	40 %	300689804
84	NC_014311	GTGCC	2	10	114649	114658	0 %	20 %	40 %	40 %	300689813
85	NC_014311	TGTGC	2	10	114799	114808	0 %	40 %	40 %	20 %	300689813
86	NC_014311	GCGCG	2	10	116029	116038	0 %	0 %	60 %	40 %	300689815
87	NC_014311	TGGTG	2	10	117858	117867	0 %	40 %	60 %	0 %	300689818
88	NC_014311	GGGCG	2	10	118664	118673	0 %	0 %	80 %	20 %	300689819
89	NC_014311	AGGCG	2	10	122827	122836	20 %	0 %	60 %	20 %	300689821
90	NC_014311	GGCGT	2	10	124238	124247	0 %	20 %	60 %	20 %	300689823
91	NC_014311	CGAAG	2	10	128457	128466	40 %	0 %	40 %	20 %	300689829
92	NC_014311	CGGCG	2	10	131594	131603	0 %	0 %	60 %	40 %	300689832
93	NC_014311	CTCGA	2	10	132390	132399	20 %	20 %	20 %	40 %	300689832
94	NC_014311	CGGGC	2	10	133907	133916	0 %	0 %	60 %	40 %	300689834
95	NC_014311	CCACG	2	10	134685	134694	20 %	0 %	20 %	60 %	300689834
96	NC_014311	GCCGT	2	10	135214	135223	0 %	20 %	40 %	40 %	300689834
97	NC_014311	TGGCC	2	10	138810	138819	0 %	20 %	40 %	40 %	300689837
98	NC_014311	AGCGG	2	10	138909	138918	20 %	0 %	60 %	20 %	300689837
99	NC_014311	CGGCG	2	10	140338	140347	0 %	0 %	60 %	40 %	300689839
100	NC_014311	GGCGA	2	10	142165	142174	20 %	0 %	60 %	20 %	300689841
101	NC_014311	GCGAT	2	10	142607	142616	20 %	20 %	40 %	20 %	300689841
102	NC_014311	GCGCA	2	10	143155	143164	20 %	0 %	40 %	40 %	300689841
103	NC_014311	CTTCG	2	10	145041	145050	0 %	40 %	20 %	40 %	300689845
104	NC_014311	CGATG	2	10	145310	145319	20 %	20 %	40 %	20 %	300689845
105	NC_014311	GCATC	2	10	145607	145616	20 %	20 %	20 %	40 %	300689845
106	NC_014311	TGGAC	2	10	145879	145888	20 %	20 %	40 %	20 %	300689845
107	NC_014311	GCTGC	2	10	148220	148229	0 %	20 %	40 %	40 %	300689846
108	NC_014311	TGACC	2	10	152254	152263	20 %	20 %	20 %	40 %	300689847
109	NC_014311	CGGCG	2	10	154744	154753	0 %	0 %	60 %	40 %	300689849
110	NC_014311	AGCGC	2	10	157214	157223	20 %	0 %	40 %	40 %	300689852
111	NC_014311	CGGGG	2	10	157910	157919	0 %	0 %	80 %	20 %	300689853
112	NC_014311	GCGCG	2	10	160887	160896	0 %	0 %	60 %	40 %	300689854
113	NC_014311	CGGCG	2	10	161912	161921	0 %	0 %	60 %	40 %	300689855
114	NC_014311	CGAGC	2	10	162461	162470	20 %	0 %	40 %	40 %	300689855
115	NC_014311	GCCGG	2	10	163395	163404	0 %	0 %	60 %	40 %	300689855
116	NC_014311	CCAGG	2	10	164873	164882	20 %	0 %	40 %	40 %	300689857
117	NC_014311	CGGCG	2	10	167757	167766	0 %	0 %	60 %	40 %	300689859
118	NC_014311	GGCGC	2	10	168978	168987	0 %	0 %	60 %	40 %	300689860
119	NC_014311	CCGCG	2	10	169624	169633	0 %	0 %	40 %	60 %	300689860
120	NC_014311	CGCGG	2	10	170887	170896	0 %	0 %	60 %	40 %	300689861
121	NC_014311	CAGCA	2	10	172489	172498	40 %	0 %	20 %	40 %	300689864
122	NC_014311	CTTGC	2	10	174189	174198	0 %	40 %	20 %	40 %	300689866
123	NC_014311	CGCGC	2	10	174796	174805	0 %	0 %	40 %	60 %	300689866
124	NC_014311	CGCCA	2	10	175924	175933	20 %	0 %	20 %	60 %	300689867
125	NC_014311	GATCT	2	10	176104	176113	20 %	40 %	20 %	20 %	300689867
126	NC_014311	ACCCA	2	10	178664	178673	40 %	0 %	0 %	60 %	300689869
127	NC_014311	TGCGC	2	10	179736	179745	0 %	20 %	40 %	40 %	300689870
128	NC_014311	CCAGC	2	10	179920	179929	20 %	0 %	20 %	60 %	300689870
129	NC_014311	GTGGC	2	10	179956	179965	0 %	20 %	60 %	20 %	300689870
130	NC_014311	GCGGT	2	10	180149	180158	0 %	20 %	60 %	20 %	300689870
131	NC_014311	CGGCG	2	10	181068	181077	0 %	0 %	60 %	40 %	300689870
132	NC_014311	CGCCT	2	10	184553	184562	0 %	20 %	20 %	60 %	300689876
133	NC_014311	GCGCG	2	10	188942	188951	0 %	0 %	60 %	40 %	300689879
134	NC_014311	CGCGC	2	10	189806	189815	0 %	0 %	40 %	60 %	300689881
135	NC_014311	ATCGC	2	10	190509	190518	20 %	20 %	20 %	40 %	300689882
136	NC_014311	CGATG	2	10	193393	193402	20 %	20 %	40 %	20 %	300689886
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138	NC_014311	GCCCG	2	10	196361	196370	0 %	0 %	40 %	60 %	300689890
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152	NC_014311	GGATG	2	10	220826	220835	20 %	20 %	60 %	0 %	300689921
153	NC_014311	CGTGG	2	10	222221	222230	0 %	20 %	60 %	20 %	300689921
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162	NC_014311	GGGGT	2	10	243051	243060	0 %	20 %	80 %	0 %	300689954
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164	NC_014311	TGGAG	2	10	245270	245279	20 %	20 %	60 %	0 %	300689956
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171	NC_014311	CGACA	2	10	254336	254345	40 %	0 %	20 %	40 %	300689962
172	NC_014311	GCTGG	2	10	254381	254390	0 %	20 %	60 %	20 %	300689962
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188	NC_014311	TCGCC	2	10	287996	288005	0 %	20 %	20 %	60 %	300689987
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250	NC_014311	GCCGG	2	10	366229	366238	0 %	0 %	60 %	40 %	300690063
251	NC_014311	CTGCC	2	10	366675	366684	0 %	20 %	20 %	60 %	300690063
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253	NC_014311	GGGCG	2	10	370123	370132	0 %	0 %	80 %	20 %	300690066
254	NC_014311	GCCAG	2	10	370775	370784	20 %	0 %	40 %	40 %	300690067
255	NC_014311	GCGCA	2	10	373758	373767	20 %	0 %	40 %	40 %	300690072
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257	NC_014311	TGACC	2	10	376632	376641	20 %	20 %	20 %	40 %	300690076
258	NC_014311	CGGCG	2	10	377055	377064	0 %	0 %	60 %	40 %	300690076
259	NC_014311	CCGTG	2	10	378780	378789	0 %	20 %	40 %	40 %	300690078
260	NC_014311	CATCG	2	10	378892	378901	20 %	20 %	20 %	40 %	300690078
261	NC_014311	TGGGC	2	10	380789	380798	0 %	20 %	60 %	20 %	300690080
262	NC_014311	CGGGC	2	10	380802	380811	0 %	0 %	60 %	40 %	300690080
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383	NC_014311	GGGTC	2	10	570525	570534	0 %	20 %	60 %	20 %	300690259
384	NC_014311	AGCGC	2	10	571266	571275	20 %	0 %	40 %	40 %	300690259
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387	NC_014311	ATCGC	2	10	579480	579489	20 %	20 %	20 %	40 %	300690266
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389	NC_014311	GCCCA	2	10	581528	581537	20 %	0 %	20 %	60 %	300690270
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392	NC_014311	GGGCC	2	10	583820	583829	0 %	0 %	60 %	40 %	300690271
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499	NC_014311	GCACG	2	10	733642	733651	20 %	0 %	40 %	40 %	300690409
500	NC_014311	AGCGC	2	10	745508	745517	20 %	0 %	40 %	40 %	300690420

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