MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum PSI07 megaplasmid mpPSI07

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014310	CTGAAT	2	12	29932	29943	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014310	TTGAGG	2	12	44145	44156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014310	GCGGTC	2	12	64751	64762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014310	TGCCCG	2	12	66399	66410	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014310	GCGCGG	2	12	74367	74378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014310	CCGGGC	2	12	76187	76198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014310	CGATTG	2	12	118534	118545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014310	GGTGGC	2	12	142868	142879	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014310	GCCGGC	2	12	143650	143661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014310	CTCACC	2	12	165808	165819	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014310	GGCGCT	2	12	167837	167848	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014310	GGCGCT	2	12	168077	168088	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014310	CGAAAC	2	12	170970	170981	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014310	GGCCAA	2	12	171513	171524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014310	CGGGGC	2	12	172862	172873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014310	AGCGCC	2	12	174292	174303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014310	CCCCAG	2	12	178384	178395	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014310	CGCAAT	2	12	180764	180775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014310	AATGGC	2	12	202650	202661	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014310	TGGGGC	2	12	220130	220141	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014310	GAAACG	2	12	257705	257716	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014310	ATCCGC	2	12	357412	357423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014310	GATCGG	2	12	365148	365159	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014310	GGGCTG	2	12	403826	403837	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014310	TCTGGG	2	12	406975	406986	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014310	CATTCC	2	12	426005	426016	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014310	CATTCT	2	12	438679	438690	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014310	CAAGTT	2	12	459582	459593	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014310	GCTGCG	2	12	459876	459887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014310	CGTCAA	2	12	545838	545849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014310	CATCGC	2	12	546071	546082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014310	TTCCAT	2	12	553286	553297	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014310	TCTTTT	2	12	596808	596819	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014310	TACCCA	2	12	628692	628703	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014310	CCCGGC	2	12	655552	655563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014310	CGCAAT	2	12	712958	712969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014310	GTGGAG	2	12	718308	718319	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014310	GGTGCT	2	12	719675	719686	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014310	TGGCGG	2	12	720025	720036	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014310	GGTCGG	2	12	749715	749726	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014310	AACCGG	2	12	755719	755730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014310	CGGCAT	2	12	767106	767117	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014310	GACAGC	2	12	773040	773051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014310	GTGCTG	2	12	804154	804165	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014310	TCAGGC	2	12	817674	817685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014310	TCCCGA	2	12	818338	818349	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014310	AGAACG	2	12	848160	848171	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014310	CCGGCC	2	12	850551	850562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014310	GCCGGC	2	12	850913	850924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014310	CCGCGC	2	12	913208	913219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014310	GCCGAC	2	12	1140696	1140707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014310	CGAAAC	2	12	1258795	1258806	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014310	CAGAGC	2	12	1271394	1271405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014310	CGGCAG	2	12	1275526	1275537	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014310	CCGCCC	2	12	1275750	1275761	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
56	NC_014310	CGCGTA	2	12	1276356	1276367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014310	CGTAGA	2	12	1279458	1279469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014310	GCCGTG	2	12	1279958	1279969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014310	GTGGCC	3	18	1290982	1290999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014310	GCCCCG	2	12	1293739	1293750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_014310	TGACGT	2	12	1341516	1341527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014310	ATTGCG	2	12	1346982	1346993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014310	TTGCTG	2	12	1347142	1347153	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014310	AATCAC	2	12	1347268	1347279	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014310	CTTCCC	2	12	1369866	1369877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014310	CGCAAC	2	12	1393424	1393435	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014310	AGTTTC	2	12	1430284	1430295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014310	CTTATC	2	12	1430449	1430460	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014310	AACCAC	2	12	1438565	1438576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014310	TGCGGA	2	12	1439808	1439819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014310	GCCCGC	2	12	1447871	1447882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014310	CCCATG	2	12	1462075	1462086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014310	ACTGTC	2	12	1476407	1476418	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014310	CTTGCG	2	12	1477668	1477679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014310	CACCGC	2	12	1510444	1510455	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014310	GGCATG	2	12	1522716	1522727	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014310	TGCGCC	2	12	1531446	1531457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014310	AGCCCG	2	12	1540156	1540167	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014310	CTCGGG	4	24	1557164	1557187	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014310	CCGGTC	2	12	1560196	1560207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014310	GGCGAT	2	12	1581127	1581138	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014310	TGGATT	2	12	1623629	1623640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014310	GGGGTC	2	12	1634943	1634954	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014310	TACGTT	2	12	1685946	1685957	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014310	CCCCTT	2	12	1700986	1700997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014310	ACGGCA	2	12	1716581	1716592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014310	CTGCGG	2	12	1734697	1734708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014310	ATGGCA	2	12	1738301	1738312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014310	ACCAGC	2	12	1748616	1748627	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014310	GCCGCA	2	12	1763861	1763872	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014310	GGTCCG	2	12	1764529	1764540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014310	TGGCGC	2	12	1779382	1779393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014310	ACCCAC	2	12	1812981	1812992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014310	AAATTT	2	12	1840697	1840708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014310	TTTGGA	2	12	1865156	1865167	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014310	ACCTAA	2	12	1872453	1872464	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014310	CGGGCG	2	12	1894290	1894301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014310	ATGCCT	2	12	1928692	1928703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014310	ATCGCC	2	12	2025034	2025045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014310	CACCGC	2	12	2038488	2038499	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014310	ATCATT	2	12	2042757	2042768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014310	CGATGA	2	12	2059868	2059879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014310	GCGGGT	2	12	2065708	2065719	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.