MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum PSI07 megaplasmid mpPSI07

Total Repeats: 1623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014310	GATCG	2	10	3408	3417	20 %	20 %	40 %	20 %	300693046
2	NC_014310	GTCCA	2	10	6219	6228	20 %	20 %	20 %	40 %	300693049
3	NC_014310	CAGCG	2	10	9582	9591	20 %	0 %	40 %	40 %	300693051
4	NC_014310	TGCGC	2	10	9968	9977	0 %	20 %	40 %	40 %	300693051
5	NC_014310	GCCGG	2	10	10242	10251	0 %	0 %	60 %	40 %	300693051
6	NC_014310	TGGCC	2	10	10668	10677	0 %	20 %	40 %	40 %	300693052
7	NC_014310	ATCGA	2	10	11212	11221	40 %	20 %	20 %	20 %	300693052
8	NC_014310	CGGCA	2	10	11773	11782	20 %	0 %	40 %	40 %	300693052
9	NC_014310	GCCAG	2	10	12503	12512	20 %	0 %	40 %	40 %	300693053
10	NC_014310	CCGGC	2	10	13163	13172	0 %	0 %	40 %	60 %	300693054
11	NC_014310	ATGCG	2	10	14168	14177	20 %	20 %	40 %	20 %	300693055
12	NC_014310	GCCGT	2	10	15023	15032	0 %	20 %	40 %	40 %	300693055
13	NC_014310	GCAGC	2	10	15141	15150	20 %	0 %	40 %	40 %	300693055
14	NC_014310	GATGC	2	10	15175	15184	20 %	20 %	40 %	20 %	300693055
15	NC_014310	CGGCG	2	10	21943	21952	0 %	0 %	60 %	40 %	300693061
16	NC_014310	CATGC	2	10	23415	23424	20 %	20 %	20 %	40 %	300693064
17	NC_014310	CCGCA	2	10	24889	24898	20 %	0 %	20 %	60 %	300693065
18	NC_014310	CCTTG	2	10	25215	25224	0 %	40 %	20 %	40 %	300693067
19	NC_014310	GATGA	2	10	26339	26348	40 %	20 %	40 %	0 %	300693068
20	NC_014310	AGCGC	2	10	26963	26972	20 %	0 %	40 %	40 %	300693069
21	NC_014310	TTGCG	2	10	28210	28219	0 %	40 %	40 %	20 %	300693070
22	NC_014310	TCCGG	2	10	28554	28563	0 %	20 %	40 %	40 %	300693070
23	NC_014310	CCAGG	2	10	29379	29388	20 %	0 %	40 %	40 %	300693071
24	NC_014310	GCATC	2	10	30617	30626	20 %	20 %	20 %	40 %	300693072
25	NC_014310	GGCTG	2	10	30804	30813	0 %	20 %	60 %	20 %	300693072
26	NC_014310	GGCAG	2	10	31850	31859	20 %	0 %	60 %	20 %	300693073
27	NC_014310	GGTCC	2	10	37055	37064	0 %	20 %	40 %	40 %	300693077
28	NC_014310	CCAGC	2	10	37536	37545	20 %	0 %	20 %	60 %	300693077
29	NC_014310	CGCGC	2	10	39332	39341	0 %	0 %	40 %	60 %	300693078
30	NC_014310	GCGCG	2	10	39731	39740	0 %	0 %	60 %	40 %	300693078
31	NC_014310	GCGAT	2	10	41002	41011	20 %	20 %	40 %	20 %	300693079
32	NC_014310	GGCTT	2	10	44757	44766	0 %	40 %	40 %	20 %	300693081
33	NC_014310	CCGCA	2	10	45412	45421	20 %	0 %	20 %	60 %	300693083
34	NC_014310	TCCAG	2	10	47712	47721	20 %	20 %	20 %	40 %	300693087
35	NC_014310	CGGTC	2	10	47899	47908	0 %	20 %	40 %	40 %	300693087
36	NC_014310	CGGCG	2	10	52860	52869	0 %	0 %	60 %	40 %	300693091
37	NC_014310	CGTGG	2	10	53502	53511	0 %	20 %	60 %	20 %	300693091
38	NC_014310	CGGCG	2	10	53523	53532	0 %	0 %	60 %	40 %	300693091
39	NC_014310	GGCGC	2	10	54107	54116	0 %	0 %	60 %	40 %	300693092
40	NC_014310	GAACC	2	10	54132	54141	40 %	0 %	20 %	40 %	300693092
41	NC_014310	GGGCT	2	10	55335	55344	0 %	20 %	60 %	20 %	300693094
42	NC_014310	CCGCG	2	10	55955	55964	0 %	0 %	40 %	60 %	300693094
43	NC_014310	TCGCC	2	10	57597	57606	0 %	20 %	20 %	60 %	300693095
44	NC_014310	CGAAG	2	10	61210	61219	40 %	0 %	40 %	20 %	300693100
45	NC_014310	CCACG	2	10	62318	62327	20 %	0 %	20 %	60 %	300693102
46	NC_014310	TCCAT	2	10	66167	66176	20 %	40 %	0 %	40 %	300693106
47	NC_014310	TGCCG	2	10	66680	66689	0 %	20 %	40 %	40 %	300693107
48	NC_014310	CGGTG	2	10	68301	68310	0 %	20 %	60 %	20 %	300693109
49	NC_014310	CGGGC	2	10	70286	70295	0 %	0 %	60 %	40 %	300693110
50	NC_014310	CCGGA	2	10	70638	70647	20 %	0 %	40 %	40 %	300693110
51	NC_014310	CGGCG	2	10	71997	72006	0 %	0 %	60 %	40 %	300693111
52	NC_014310	TGGCC	2	10	72681	72690	0 %	20 %	40 %	40 %	300693111
53	NC_014310	CGGCG	2	10	72721	72730	0 %	0 %	60 %	40 %	300693111
54	NC_014310	ACCGC	2	10	74716	74725	20 %	0 %	20 %	60 %	300693112
55	NC_014310	GCGAT	2	10	75760	75769	20 %	20 %	40 %	20 %	300693112
56	NC_014310	TCCAG	2	10	77335	77344	20 %	20 %	20 %	40 %	300693115
57	NC_014310	CTTCA	2	10	77540	77549	20 %	40 %	0 %	40 %	300693115
58	NC_014310	CGGTC	2	10	78152	78161	0 %	20 %	40 %	40 %	300693115
59	NC_014310	GCGCG	2	10	80553	80562	0 %	0 %	60 %	40 %	300693118
60	NC_014310	CGCGG	2	10	83109	83118	0 %	0 %	60 %	40 %	300693119
61	NC_014310	CGCGC	2	10	84304	84313	0 %	0 %	40 %	60 %	300693120
62	NC_014310	TGCGC	2	10	85088	85097	0 %	20 %	40 %	40 %	300693121
63	NC_014310	TCGGG	2	10	85211	85220	0 %	20 %	60 %	20 %	300693121
64	NC_014310	CCGGT	2	10	88909	88918	0 %	20 %	40 %	40 %	300693124
65	NC_014310	CGCTG	2	10	91590	91599	0 %	20 %	40 %	40 %	300693126
66	NC_014310	CCGGC	2	10	92185	92194	0 %	0 %	40 %	60 %	300693126
67	NC_014310	ATCGC	2	10	93068	93077	20 %	20 %	20 %	40 %	300693126
68	NC_014310	GCATC	2	10	94043	94052	20 %	20 %	20 %	40 %	300693127
69	NC_014310	CGAGC	2	10	94179	94188	20 %	0 %	40 %	40 %	300693127
70	NC_014310	GCGCA	2	10	94852	94861	20 %	0 %	40 %	40 %	300693128
71	NC_014310	CGCGC	2	10	97575	97584	0 %	0 %	40 %	60 %	300693129
72	NC_014310	GGCGG	2	10	97856	97865	0 %	0 %	80 %	20 %	300693130
73	NC_014310	ACCGA	2	10	98111	98120	40 %	0 %	20 %	40 %	300693130
74	NC_014310	CAAGA	2	10	104739	104748	60 %	0 %	20 %	20 %	300693135
75	NC_014310	AGCCG	2	10	105255	105264	20 %	0 %	40 %	40 %	300693135
76	NC_014310	CACGG	2	10	106142	106151	20 %	0 %	40 %	40 %	300693135
77	NC_014310	GGGGC	2	10	106785	106794	0 %	0 %	80 %	20 %	300693135
78	NC_014310	ACCCG	2	10	108327	108336	20 %	0 %	20 %	60 %	300693136
79	NC_014310	CTGCG	2	10	109724	109733	0 %	20 %	40 %	40 %	300693137
80	NC_014310	ATCCG	2	10	109876	109885	20 %	20 %	20 %	40 %	300693137
81	NC_014310	GCCTC	2	10	110506	110515	0 %	20 %	20 %	60 %	300693138
82	NC_014310	CGGGC	2	10	113056	113065	0 %	0 %	60 %	40 %	300693141
83	NC_014310	CGCGT	2	10	113921	113930	0 %	20 %	40 %	40 %	300693141
84	NC_014310	TCGGA	2	10	114620	114629	20 %	20 %	40 %	20 %	300693142
85	NC_014310	GCAGC	2	10	116514	116523	20 %	0 %	40 %	40 %	300693143
86	NC_014310	CGCGG	2	10	116576	116585	0 %	0 %	60 %	40 %	300693143
87	NC_014310	CCGGC	2	10	120354	120363	0 %	0 %	40 %	60 %	300693147
88	NC_014310	CCGAG	2	10	126100	126109	20 %	0 %	40 %	40 %	300693151
89	NC_014310	CCAGC	2	10	128212	128221	20 %	0 %	20 %	60 %	300693153
90	NC_014310	CCGGT	2	10	129083	129092	0 %	20 %	40 %	40 %	300693153
91	NC_014310	TGCGC	2	10	129519	129528	0 %	20 %	40 %	40 %	300693153
92	NC_014310	CCGGC	2	10	130534	130543	0 %	0 %	40 %	60 %	300693153
93	NC_014310	AGCGC	2	10	130722	130731	20 %	0 %	40 %	40 %	300693153
94	NC_014310	AGGCC	2	10	131394	131403	20 %	0 %	40 %	40 %	300693153
95	NC_014310	GCAGC	2	10	132655	132664	20 %	0 %	40 %	40 %	300693153
96	NC_014310	GCCGG	2	10	134501	134510	0 %	0 %	60 %	40 %	300693153
97	NC_014310	GCGCA	2	10	134716	134725	20 %	0 %	40 %	40 %	300693153
98	NC_014310	CGGGC	2	10	136308	136317	0 %	0 %	60 %	40 %	300693153
99	NC_014310	ACGCC	2	10	138054	138063	20 %	0 %	20 %	60 %	300693155
100	NC_014310	ATGAA	2	10	139659	139668	60 %	20 %	20 %	0 %	300693157
101	NC_014310	CGCAG	2	10	141452	141461	20 %	0 %	40 %	40 %	300693159
102	NC_014310	CTGCG	2	10	145361	145370	0 %	20 %	40 %	40 %	300693160
103	NC_014310	ACTGG	2	10	148252	148261	20 %	20 %	40 %	20 %	300693162
104	NC_014310	CCGCG	2	10	150175	150184	0 %	0 %	40 %	60 %	300693165
105	NC_014310	GCGGG	2	10	153053	153062	0 %	0 %	80 %	20 %	300693168
106	NC_014310	GCTGG	2	10	155345	155354	0 %	20 %	60 %	20 %	300693169
107	NC_014310	ACGGC	2	10	156193	156202	20 %	0 %	40 %	40 %	300693169
108	NC_014310	CGGTA	2	10	156933	156942	20 %	20 %	40 %	20 %	300693169
109	NC_014310	CGGCC	2	10	157129	157138	0 %	0 %	40 %	60 %	300693169
110	NC_014310	CGCGC	2	10	158516	158525	0 %	0 %	40 %	60 %	300693171
111	NC_014310	GCGCC	2	10	159378	159387	0 %	0 %	40 %	60 %	300693172
112	NC_014310	GGCCT	2	10	159571	159580	0 %	20 %	40 %	40 %	300693172
113	NC_014310	TGCCG	2	10	159991	160000	0 %	20 %	40 %	40 %	300693172
114	NC_014310	GCTGC	2	10	160867	160876	0 %	20 %	40 %	40 %	300693173
115	NC_014310	GCCGA	2	10	161180	161189	20 %	0 %	40 %	40 %	300693173
116	NC_014310	CACGG	2	10	162227	162236	20 %	0 %	40 %	40 %	300693174
117	NC_014310	CGCGG	2	10	162977	162986	0 %	0 %	60 %	40 %	300693175
118	NC_014310	GATCG	2	10	164190	164199	20 %	20 %	40 %	20 %	300693176
119	NC_014310	GGCCG	2	10	164286	164295	0 %	0 %	60 %	40 %	300693176
120	NC_014310	CCTGG	2	10	165116	165125	0 %	20 %	40 %	40 %	300693176
121	NC_014310	CGATG	2	10	165135	165144	20 %	20 %	40 %	20 %	300693176
122	NC_014310	CAGGT	2	10	165433	165442	20 %	20 %	40 %	20 %	300693176
123	NC_014310	TGGGC	2	10	165473	165482	0 %	20 %	60 %	20 %	300693176
124	NC_014310	CCCCG	2	10	171687	171696	0 %	0 %	20 %	80 %	300693178
125	NC_014310	CCAGG	2	10	172197	172206	20 %	0 %	40 %	40 %	300693178
126	NC_014310	CGTGC	2	10	172942	172951	0 %	20 %	40 %	40 %	300693179
127	NC_014310	CGTAC	2	10	173428	173437	20 %	20 %	20 %	40 %	300693180
128	NC_014310	GGGCA	2	10	173439	173448	20 %	0 %	60 %	20 %	300693180
129	NC_014310	CGGTT	2	10	175955	175964	0 %	40 %	40 %	20 %	300693183
130	NC_014310	CGCGC	2	10	177323	177332	0 %	0 %	40 %	60 %	300693185
131	NC_014310	GGCCG	2	10	180498	180507	0 %	0 %	60 %	40 %	300693188
132	NC_014310	GTTCC	2	10	180558	180567	0 %	40 %	20 %	40 %	300693188
133	NC_014310	GGTCT	2	10	183880	183889	0 %	40 %	40 %	20 %	300693191
134	NC_014310	AGCCA	2	10	185191	185200	40 %	0 %	20 %	40 %	300693191
135	NC_014310	GCAGG	2	10	185238	185247	20 %	0 %	60 %	20 %	300693191
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244	NC_014310	GGCAA	2	10	315541	315550	40 %	0 %	40 %	20 %	300693282
245	NC_014310	ACCGC	2	10	315732	315741	20 %	0 %	20 %	60 %	300693283
246	NC_014310	CCGCG	2	10	315750	315759	0 %	0 %	40 %	60 %	300693283
247	NC_014310	GCACG	2	10	318561	318570	20 %	0 %	40 %	40 %	300693285
248	NC_014310	GGCCG	2	10	318641	318650	0 %	0 %	60 %	40 %	300693285
249	NC_014310	CATGG	2	10	318797	318806	20 %	20 %	40 %	20 %	300693285
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251	NC_014310	GCATC	2	10	319201	319210	20 %	20 %	20 %	40 %	300693286
252	NC_014310	CGGGG	2	10	320400	320409	0 %	0 %	80 %	20 %	300693287
253	NC_014310	GGATT	2	10	321466	321475	20 %	40 %	40 %	0 %	300693287
254	NC_014310	AAGGC	2	10	321548	321557	40 %	0 %	40 %	20 %	300693287
255	NC_014310	GCTCG	2	10	322827	322836	0 %	20 %	40 %	40 %	300693289
256	NC_014310	CGGCG	2	10	326351	326360	0 %	0 %	60 %	40 %	300693291
257	NC_014310	GCGCC	2	10	329263	329272	0 %	0 %	40 %	60 %	300693294
258	NC_014310	GTGCT	2	10	331745	331754	0 %	40 %	40 %	20 %	300693295
259	NC_014310	GCAGC	2	10	332302	332311	20 %	0 %	40 %	40 %	300693295
260	NC_014310	CCGGC	2	10	333063	333072	0 %	0 %	40 %	60 %	300693295
261	NC_014310	TGGCA	2	10	334811	334820	20 %	20 %	40 %	20 %	300693296
262	NC_014310	TGCGC	2	10	336269	336278	0 %	20 %	40 %	40 %	300693298
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