MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 plasmid RCFBPv3_mp

Total Repeats: 2137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014309	ATTTT	2	10	1930	1939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014309	AAGAC	2	10	3478	3487	60 %	0 %	20 %	20 %	300696569
3	NC_014309	CGGAG	2	10	4840	4849	20 %	0 %	60 %	20 %	300696570
4	NC_014309	GTCCA	2	10	5397	5406	20 %	20 %	20 %	40 %	300696571
5	NC_014309	CGCTG	2	10	7788	7797	0 %	20 %	40 %	40 %	300696573
6	NC_014309	CGGTG	2	10	8283	8292	0 %	20 %	60 %	20 %	300696573
7	NC_014309	CGGCA	2	10	10946	10955	20 %	0 %	40 %	40 %	300696574
8	NC_014309	AGCGC	2	10	11087	11096	20 %	0 %	40 %	40 %	300696575
9	NC_014309	CCGCA	2	10	11280	11289	20 %	0 %	20 %	60 %	300696575
10	NC_014309	GCCAG	2	10	11771	11780	20 %	0 %	40 %	40 %	300696575
11	NC_014309	CCGGC	2	10	12436	12445	0 %	0 %	40 %	60 %	300696576
12	NC_014309	CGGGG	2	10	13139	13148	0 %	0 %	80 %	20 %	300696577
13	NC_014309	ATGCG	2	10	13441	13450	20 %	20 %	40 %	20 %	300696577
14	NC_014309	GCAGC	2	10	14414	14423	20 %	0 %	40 %	40 %	300696577
15	NC_014309	GATGC	2	10	14448	14457	20 %	20 %	40 %	20 %	300696577
16	NC_014309	TGGCG	2	10	15017	15026	0 %	20 %	60 %	20 %	300696577
17	NC_014309	CGATC	2	10	16145	16154	20 %	20 %	20 %	40 %	300696579
18	NC_014309	GCTCA	2	10	16440	16449	20 %	20 %	20 %	40 %	300696579
19	NC_014309	CCGGT	2	10	18638	18647	0 %	20 %	40 %	40 %	300696581
20	NC_014309	CGGCG	2	10	21228	21237	0 %	0 %	60 %	40 %	300696584
21	NC_014309	GTTGC	2	10	21739	21748	0 %	40 %	40 %	20 %	300696585
22	NC_014309	TGCGG	2	10	22710	22719	0 %	20 %	60 %	20 %	300696587
23	NC_014309	CGATG	2	10	23591	23600	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014309	GATTG	2	10	25350	25359	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014309	TGCGG	2	10	25416	25425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014309	GCGGT	2	10	25746	25755	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014309	GATGA	2	10	26792	26801	40 %	20 %	40 %	0 %	300696591
28	NC_014309	CCAGG	2	10	27663	27672	20 %	0 %	40 %	40 %	300696592
29	NC_014309	GCGCT	2	10	27880	27889	0 %	20 %	40 %	40 %	300696592
30	NC_014309	ATCGA	2	10	29112	29121	40 %	20 %	20 %	20 %	300696593
31	NC_014309	GGCCA	2	10	29277	29286	20 %	0 %	40 %	40 %	300696593
32	NC_014309	GCGCC	2	10	31730	31739	0 %	0 %	40 %	60 %	300696595
33	NC_014309	GCCGG	2	10	32598	32607	0 %	0 %	60 %	40 %	300696596
34	NC_014309	CGCGG	2	10	35637	35646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014309	TCCAG	2	10	37094	37103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014309	TGCGG	2	10	37925	37934	0 %	20 %	60 %	20 %	300696601
37	NC_014309	GCGTT	2	10	38052	38061	0 %	40 %	40 %	20 %	300696602
38	NC_014309	AGCAC	2	10	38556	38565	40 %	0 %	20 %	40 %	300696602
39	NC_014309	CGGCC	2	10	39997	40006	0 %	0 %	40 %	60 %	300696602
40	NC_014309	GGCCG	2	10	40468	40477	0 %	0 %	60 %	40 %	300696603
41	NC_014309	CGGTG	2	10	40806	40815	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014309	CACCG	2	10	41433	41442	20 %	0 %	20 %	60 %	300696604
43	NC_014309	CCTGG	2	10	42935	42944	0 %	20 %	40 %	40 %	300696605
44	NC_014309	GCACG	2	10	43606	43615	20 %	0 %	40 %	40 %	300696606
45	NC_014309	GGCCG	2	10	43862	43871	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014309	GCCGG	2	10	44985	44994	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014309	GATGC	2	10	47746	47755	20 %	20 %	40 %	20 %	300696610
48	NC_014309	GGTAA	2	10	47891	47900	40 %	20 %	40 %	0 %	300696610
49	NC_014309	GCTCG	2	10	47947	47956	0 %	20 %	40 %	40 %	300696610
50	NC_014309	CATGC	2	10	49365	49374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014309	AACTA	2	10	49808	49817	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014309	GATCG	2	10	50709	50718	20 %	20 %	40 %	20 %	300696611
53	NC_014309	GCGCC	2	10	51025	51034	0 %	0 %	40 %	60 %	300696611
54	NC_014309	CGGCG	2	10	52270	52279	0 %	0 %	60 %	40 %	300696612
55	NC_014309	CGTGG	2	10	52912	52921	0 %	20 %	60 %	20 %	300696612
56	NC_014309	CGGCG	2	10	52933	52942	0 %	0 %	60 %	40 %	300696612
57	NC_014309	GGCGC	2	10	53523	53532	0 %	0 %	60 %	40 %	300696613
58	NC_014309	GGGCT	2	10	54742	54751	0 %	20 %	60 %	20 %	300696615
59	NC_014309	TCGTC	2	10	57004	57013	0 %	40 %	20 %	40 %	300696616
60	NC_014309	TCGCC	2	10	57025	57034	0 %	20 %	20 %	60 %	300696616
61	NC_014309	GCCGG	2	10	57156	57165	0 %	0 %	60 %	40 %	300696616
62	NC_014309	CGAAG	2	10	58161	58170	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014309	GTGCG	2	10	61478	61487	0 %	20 %	60 %	20 %	300696622
64	NC_014309	CCATT	2	10	63998	64007	20 %	40 %	0 %	40 %	300696625
65	NC_014309	TGCCG	2	10	64507	64516	0 %	20 %	40 %	40 %	300696626
66	NC_014309	CCTCG	2	10	65758	65767	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014309	ACGTC	2	10	66187	66196	20 %	20 %	20 %	40 %	300696628
68	NC_014309	CGGCC	2	10	66796	66805	0 %	0 %	40 %	60 %	300696628
69	NC_014309	GCACG	2	10	67535	67544	20 %	0 %	40 %	40 %	300696628
70	NC_014309	CGATG	2	10	67766	67775	20 %	20 %	40 %	20 %	300696628
71	NC_014309	CGGCG	2	10	69627	69636	0 %	0 %	60 %	40 %	300696629
72	NC_014309	TGGCC	2	10	70311	70320	0 %	20 %	40 %	40 %	300696629
73	NC_014309	CGGCG	2	10	70351	70360	0 %	0 %	60 %	40 %	300696629
74	NC_014309	CCGGC	2	10	72142	72151	0 %	0 %	40 %	60 %	300696630
75	NC_014309	ACCGC	2	10	72321	72330	20 %	0 %	20 %	60 %	300696630
76	NC_014309	GGCGC	2	10	72722	72731	0 %	0 %	60 %	40 %	300696630
77	NC_014309	TCGGC	2	10	74625	74634	0 %	20 %	40 %	40 %	300696633
78	NC_014309	GCGCT	2	10	75746	75755	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014309	TTCAT	2	10	76107	76116	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014309	CTTTC	2	10	76161	76170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014309	CGGCG	2	10	76600	76609	0 %	0 %	60 %	40 %	300696635
82	NC_014309	GCCAT	2	10	78802	78811	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014309	CCGTG	2	10	81526	81535	0 %	20 %	40 %	40 %	300696638
84	NC_014309	TGGCG	2	10	82351	82360	0 %	20 %	60 %	20 %	300696639
85	NC_014309	CGGCC	2	10	82812	82821	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_014309	CGCTG	2	10	83028	83037	0 %	20 %	40 %	40 %	300696641
87	NC_014309	GCGCG	2	10	83205	83214	0 %	0 %	60 %	40 %	300696641
88	NC_014309	TCCAG	2	10	84033	84042	20 %	20 %	20 %	40 %	300696642
89	NC_014309	CGGCG	2	10	85574	85583	0 %	0 %	60 %	40 %	300696643
90	NC_014309	GCGCG	2	10	87276	87285	0 %	0 %	60 %	40 %	300696645
91	NC_014309	CAGGC	2	10	89646	89655	20 %	0 %	40 %	40 %	300696646
92	NC_014309	CGGCG	2	10	89834	89843	0 %	0 %	60 %	40 %	300696646
93	NC_014309	CTGCA	2	10	90433	90442	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014309	CGCGC	2	10	91031	91040	0 %	0 %	40 %	60 %	300696647
95	NC_014309	CGGGT	2	10	91959	91968	0 %	20 %	60 %	20 %	300696648
96	NC_014309	GGCAG	2	10	92422	92431	20 %	0 %	60 %	20 %	300696648
97	NC_014309	TCGGC	2	10	94094	94103	0 %	20 %	40 %	40 %	300696650
98	NC_014309	CCTTG	2	10	94660	94669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014309	CCGGT	2	10	95742	95751	0 %	20 %	40 %	40 %	300696652
100	NC_014309	CGCTG	2	10	98416	98425	0 %	20 %	40 %	40 %	300696654
101	NC_014309	ATCGC	2	10	99894	99903	20 %	20 %	20 %	40 %	300696654
102	NC_014309	GCATC	2	10	100892	100901	20 %	20 %	20 %	40 %	300696655
103	NC_014309	CCGCG	2	10	101698	101707	0 %	0 %	40 %	60 %	300696656
104	NC_014309	GCCGG	2	10	101999	102008	0 %	0 %	60 %	40 %	300696656
105	NC_014309	CCGGC	2	10	104093	104102	0 %	0 %	40 %	60 %	300696657
106	NC_014309	CGCGG	2	10	104418	104427	0 %	0 %	60 %	40 %	300696657
107	NC_014309	CGCGC	2	10	104442	104451	0 %	0 %	40 %	60 %	300696657
108	NC_014309	CAAGG	2	10	104899	104908	40 %	0 %	40 %	20 %	300696658
109	NC_014309	CCGCA	2	10	105908	105917	20 %	0 %	20 %	60 %	300696661
110	NC_014309	TCAGG	2	10	105967	105976	20 %	20 %	40 %	20 %	300696661
111	NC_014309	TTCGA	2	10	105977	105986	20 %	40 %	20 %	20 %	300696661
112	NC_014309	TTGCT	2	10	106217	106226	0 %	60 %	20 %	20 %	300696662
113	NC_014309	AGGTC	2	10	108673	108682	20 %	20 %	40 %	20 %	300696665
114	NC_014309	GCTAT	2	10	109171	109180	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014309	CCCGC	2	10	109942	109951	0 %	0 %	20 %	80 %	300696666
116	NC_014309	GAATC	2	10	111645	111654	40 %	20 %	20 %	20 %	300696667
117	NC_014309	GGCTT	2	10	112358	112367	0 %	40 %	40 %	20 %	300696667
118	NC_014309	GATCA	2	10	113736	113745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014309	CGAGG	2	10	114086	114095	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014309	GCAGC	2	10	114659	114668	20 %	0 %	40 %	40 %	300696670
121	NC_014309	GAACG	2	10	114749	114758	40 %	0 %	40 %	20 %	300696670
122	NC_014309	TCGCC	2	10	115573	115582	0 %	20 %	20 %	60 %	300696670
123	NC_014309	TCGAT	2	10	116766	116775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014309	ACAGC	2	10	117878	117887	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014309	GTCGT	2	10	120176	120185	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014309	GATCA	2	10	123242	123251	40 %	20 %	20 %	20 %	300696676
127	NC_014309	GATGC	2	10	123565	123574	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014309	CGGGC	2	10	124865	124874	0 %	0 %	60 %	40 %	300696678
129	NC_014309	GGACA	2	10	124994	125003	40 %	0 %	40 %	20 %	300696678
130	NC_014309	TCGGA	2	10	126456	126465	20 %	20 %	40 %	20 %	300696679
131	NC_014309	GCGCC	2	10	126513	126522	0 %	0 %	40 %	60 %	300696679
132	NC_014309	CCGGA	2	10	127119	127128	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014309	TCCGA	2	10	127922	127931	20 %	20 %	20 %	40 %	300696681
134	NC_014309	CGGCG	2	10	128344	128353	0 %	0 %	60 %	40 %	300696682
135	NC_014309	GCGCG	2	10	128797	128806	0 %	0 %	60 %	40 %	300696682
136	NC_014309	CGGTC	2	10	129056	129065	0 %	20 %	40 %	40 %	300696682
137	NC_014309	GGGCA	2	10	129233	129242	20 %	0 %	60 %	20 %	300696682
138	NC_014309	GTTTT	2	10	131133	131142	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014309	TCGCT	2	10	262345	262354	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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402	NC_014309	TGCGC	2	10	380858	380867	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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