MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 plasmid RCFBPv3_mp

Total Repeats: 1078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014309	GGGC	2	8	1402	1409	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014309	TCAC	2	8	1981	1988	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014309	TAGA	2	8	4037	4044	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014309	TGGG	2	8	5066	5073	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014309	GCGT	2	8	11011	11018	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014309	CGGG	2	8	11026	11033	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014309	AGGG	2	8	11902	11909	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014309	GCAG	2	8	12050	12057	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014309	CGGC	3	12	12519	12530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014309	GCCG	2	8	12585	12592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014309	GACT	2	8	15532	15539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014309	CGCC	2	8	15639	15646	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014309	CCGG	2	8	23582	23589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014309	GGGC	2	8	23633	23640	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014309	CCGT	2	8	25806	25813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014309	TTTG	2	8	26130	26137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014309	TGTC	2	8	26420	26427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014309	GCGG	2	8	27269	27276	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014309	TGCG	2	8	28250	28257	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014309	GAGG	2	8	28317	28324	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014309	TGTT	2	8	29906	29913	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014309	CCGG	2	8	32259	32266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014309	CGGC	2	8	34135	34142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014309	CGGC	2	8	34189	34196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014309	AGGG	2	8	35458	35465	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014309	AACG	2	8	35499	35506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014309	GGAG	2	8	35723	35730	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014309	GTGG	2	8	36674	36681	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014309	CGGT	2	8	36855	36862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014309	CAGC	2	8	37122	37129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014309	CGGA	2	8	37248	37255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014309	GACA	2	8	37560	37567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014309	GAGC	2	8	40902	40909	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014309	CTCA	2	8	43950	43957	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014309	TCGG	2	8	45776	45783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014309	TCGA	2	8	45927	45934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014309	TATG	2	8	49384	49391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014309	TCGT	2	8	49442	49449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014309	GGGC	2	8	59521	59528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014309	TGGG	2	8	59532	59539	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014309	AGCG	2	8	59594	59601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014309	GCTG	2	8	61708	61715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014309	CGGA	2	8	63269	63276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014309	TTTG	2	8	63329	63336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014309	AGCT	2	8	63377	63384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014309	CCTG	2	8	64851	64858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014309	GGCG	2	8	65869	65876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014309	CGGG	2	8	71991	71998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014309	GGGC	2	8	73572	73579	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014309	GCCG	2	8	75801	75808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014309	GCGT	2	8	85061	85068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014309	CGAT	2	8	85087	85094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014309	ACCG	2	8	85107	85114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014309	GGTA	2	8	85134	85141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014309	CGGT	2	8	85143	85150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014309	GCCG	2	8	90124	90131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014309	ATAC	2	8	90161	90168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014309	GCGG	2	8	91229	91236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014309	CTGC	2	8	93037	93044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014309	GAAA	2	8	94942	94949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014309	GCGG	2	8	102445	102452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014309	CTTT	2	8	105268	105275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014309	GCTT	2	8	105322	105329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014309	CGCC	2	8	106193	106200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014309	CGAC	2	8	113361	113368	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014309	TCGG	2	8	114198	114205	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014309	CGGG	2	8	116514	116521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014309	ACGC	2	8	117847	117854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014309	GCGG	2	8	118604	118611	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014309	TTCA	2	8	119308	119315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014309	TCTG	2	8	119576	119583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014309	TGCA	2	8	120277	120284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014309	CTCG	2	8	123485	123492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014309	TGCG	2	8	123592	123599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014309	CCGG	2	8	127631	127638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014309	CGGC	2	8	127996	128003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014309	AGGC	2	8	131107	131114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014309	ACGG	2	8	131428	131435	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014309	GCGG	2	8	131615	131622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014309	TGGT	2	8	132350	132357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014309	GTCG	2	8	138445	138452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014309	CGTG	2	8	141957	141964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014309	TGAA	2	8	147714	147721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014309	GGTA	2	8	147931	147938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014309	ACCG	2	8	147999	148006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014309	GGGT	2	8	150356	150363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014309	TGTT	2	8	150471	150478	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014309	TTCG	2	8	151291	151298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014309	AAAT	2	8	151922	151929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014309	GATC	2	8	152111	152118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014309	GCCG	2	8	152469	152476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014309	GCCT	2	8	154806	154813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014309	TTGC	2	8	156559	156566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014309	GGCG	2	8	176675	176682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014309	GCCG	2	8	176719	176726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014309	GGGT	2	8	177665	177672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014309	TCCG	2	8	178828	178835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014309	GGCG	2	8	180288	180295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014309	CGCC	2	8	180935	180942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_014309	CCCG	2	8	184116	184123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_014309	CGCC	2	8	184165	184172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_014309	CTGG	2	8	184225	184232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014309	GGGC	2	8	185227	185234	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014309	GGCG	2	8	185518	185525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014309	CGGG	2	8	185785	185792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014309	CAGC	2	8	186056	186063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014309	CGTG	2	8	186155	186162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014309	CACC	2	8	186299	186306	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_014309	GGCC	2	8	186482	186489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014309	GGCC	2	8	186509	186516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014309	GGCG	2	8	186644	186651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014309	GGGT	2	8	194361	194368	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014309	CCCG	2	8	201602	201609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014309	GCCG	2	8	208655	208662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014309	CCGG	2	8	208717	208724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014309	CTTT	2	8	208825	208832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014309	GCAT	2	8	209737	209744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014309	TGCC	2	8	209754	209761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014309	CGTG	2	8	210912	210919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014309	GCGT	2	8	211406	211413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014309	CCCG	2	8	213355	213362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_014309	GGCC	2	8	213388	213395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014309	GATT	2	8	213420	213427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014309	GGCG	2	8	217043	217050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014309	GCCG	2	8	221159	221166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014309	CCGG	2	8	221342	221349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014309	ACCG	2	8	221394	221401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014309	CAGC	2	8	227590	227597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014309	CCGA	2	8	228824	228831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014309	CGGC	2	8	229991	229998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014309	CATG	2	8	230124	230131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014309	CGGG	2	8	230219	230226	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014309	GACG	2	8	230566	230573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014309	CACG	2	8	230852	230859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014309	TCGC	2	8	231163	231170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014309	GATA	2	8	231340	231347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014309	GTTT	2	8	231568	231575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014309	GGGA	2	8	232223	232230	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014309	GCAC	2	8	233089	233096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014309	TTGC	2	8	233696	233703	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014309	TGCG	2	8	240009	240016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014309	CCGG	2	8	240043	240050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014309	CGTC	2	8	241803	241810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014309	CGAA	2	8	249690	249697	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014309	GCCG	2	8	249993	250000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014309	CGGC	2	8	250120	250127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014309	CTGG	2	8	262179	262186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014309	CTTT	2	8	262246	262253	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014309	AAAG	2	8	262262	262269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014309	AAAG	2	8	262275	262282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014309	AGGG	2	8	262324	262331	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014309	AAGG	2	8	262542	262549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014309	CTTT	2	8	262632	262639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_014309	CTTT	2	8	262645	262652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_014309	AAAG	2	8	262661	262668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014309	CAAA	2	8	262725	262732	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_014309	CCGG	2	8	272315	272322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_014309	TCGG	2	8	274322	274329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_014309	AAGG	2	8	274449	274456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014309	AATA	2	8	274458	274465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_014309	CGTG	2	8	281133	281140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_014309	GCCG	2	8	281271	281278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
168	NC_014309	TGCG	2	8	284025	284032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_014309	GCAA	2	8	284042	284049	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_014309	GGGC	2	8	290700	290707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014309	CCGG	2	8	292741	292748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_014309	TCGG	2	8	301154	301161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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185	NC_014309	TGAG	2	8	312793	312800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014309	CCCG	2	8	312852	312859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
187	NC_014309	CCTG	2	8	313011	313018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
188	NC_014309	TTGA	2	8	313134	313141	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014309	GCGG	2	8	314796	314803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_014309	GCCG	2	8	317197	317204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_014309	GGCC	2	8	317231	317238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
193	NC_014309	GGCG	2	8	317240	317247	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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196	NC_014309	CGGC	2	8	322898	322905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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230	NC_014309	CCGA	2	8	366879	366886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
231	NC_014309	GCCT	2	8	368026	368033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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242	NC_014309	GCCC	2	8	388536	388543	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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282	NC_014309	CCTG	2	8	473033	473040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
283	NC_014309	GCCC	2	8	473567	473574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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450	NC_014309	CCCG	2	8	866498	866505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
451	NC_014309	CGAT	2	8	867179	867186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_014309	TCGA	2	8	921739	921746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014309	ACTG	2	8	931369	931376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_014309	GGCC	2	8	934912	934919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_014309	CGAC	2	8	942845	942852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_014309	GCCA	2	8	943927	943934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_014309	GGGA	2	8	945213	945220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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