MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum PSI07 plasmid pRSI13

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014308	CCA	2	6	69	74	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698619
2	NC_014308	CTG	2	6	125	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698619
3	NC_014308	GTA	4	12	266	277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698619
4	NC_014308	CGG	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698619
5	NC_014308	CTT	2	6	332	337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698619
6	NC_014308	CGT	2	6	538	543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698619
7	NC_014308	GCT	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698619
8	NC_014308	GTC	2	6	590	595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698619
9	NC_014308	GCT	2	6	711	716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698620
10	NC_014308	TGC	2	6	752	757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698620
11	NC_014308	GTT	2	6	923	928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300698620
12	NC_014308	TGG	2	6	944	949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014308	GCA	2	6	954	959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014308	CCA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014308	CCG	2	6	1037	1042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014308	GCA	2	6	1179	1184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698621
17	NC_014308	TGA	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698621
18	NC_014308	CGG	2	6	1437	1442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698622
19	NC_014308	TGG	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698622
20	NC_014308	GCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698622
21	NC_014308	GTC	2	6	1531	1536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698622
22	NC_014308	CGG	2	6	1653	1658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698622
23	NC_014308	TGC	2	6	1666	1671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698622
24	NC_014308	CGG	2	6	1783	1788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698623
25	NC_014308	CGC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698623
26	NC_014308	TGC	2	6	1902	1907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698623
27	NC_014308	CCG	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698623
28	NC_014308	GCA	2	6	1954	1959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698623
29	NC_014308	ACA	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698623
30	NC_014308	CAG	2	6	2024	2029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698623
31	NC_014308	CAG	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698623
32	NC_014308	AAC	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698623
33	NC_014308	ATG	2	6	2207	2212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698623
34	NC_014308	GCA	2	6	2360	2365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698623
35	NC_014308	CAA	2	6	2413	2418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698623
36	NC_014308	AGC	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698624
37	NC_014308	GAG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300698624
38	NC_014308	AAG	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698624
39	NC_014308	CGC	2	6	2723	2728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
40	NC_014308	ACG	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698625
41	NC_014308	CTT	2	6	2945	2950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698625
42	NC_014308	TTC	2	6	3003	3008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698625
43	NC_014308	TGG	2	6	3157	3162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
44	NC_014308	TGA	2	6	3169	3174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698625
45	NC_014308	CTT	2	6	3185	3190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698625
46	NC_014308	GCC	2	6	3198	3203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
47	NC_014308	TCA	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300698625
48	NC_014308	GTG	2	6	3342	3347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
49	NC_014308	TGA	2	6	3424	3429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698625
50	NC_014308	TGC	2	6	3478	3483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698625
51	NC_014308	CGA	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698625
52	NC_014308	GAT	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698625
53	NC_014308	GGC	2	6	3560	3565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
54	NC_014308	GCC	2	6	3582	3587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
55	NC_014308	TGG	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
56	NC_014308	GCA	3	9	3600	3608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698625
57	NC_014308	GCC	2	6	3609	3614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
58	NC_014308	TGG	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
59	NC_014308	GGC	2	6	3626	3631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
60	NC_014308	GCC	2	6	3636	3641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
61	NC_014308	GGT	2	6	3642	3647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
62	NC_014308	GCC	2	6	3660	3665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
63	NC_014308	CCG	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
64	NC_014308	GCC	2	6	3741	3746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
65	NC_014308	GGC	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
66	NC_014308	GTG	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
67	NC_014308	GGC	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
68	NC_014308	GGC	2	6	3864	3869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
69	NC_014308	CAG	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698625
70	NC_014308	GGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
71	NC_014308	GCA	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698625
72	NC_014308	CCA	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698625
73	NC_014308	CGT	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698625
74	NC_014308	CGG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698625
75	NC_014308	GGT	2	6	4113	4118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698625
76	NC_014308	GCC	2	6	4209	4214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698625
77	NC_014308	CAT	2	6	4391	4396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300698625
78	NC_014308	ACA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698625
79	NC_014308	GAG	2	6	4449	4454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300698626
80	NC_014308	GCG	2	6	4470	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698626
81	NC_014308	TGA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698626
82	NC_014308	CCA	2	6	4603	4608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014308	GAC	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698627
84	NC_014308	CCA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698627
85	NC_014308	TTC	2	6	4698	4703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698627
86	NC_014308	GGC	2	6	4720	4725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698627
87	NC_014308	TTG	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014308	CCG	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014308	GCG	2	6	4996	5001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014308	GGA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300698628
91	NC_014308	AAC	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014308	GAA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014308	GTG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014308	GCC	2	6	5631	5636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014308	AGC	2	6	5707	5712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698629
96	NC_014308	CCA	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698629
97	NC_014308	CGA	2	6	5780	5785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698629
98	NC_014308	GAA	2	6	5830	5835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698629
99	NC_014308	AAG	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698629
100	NC_014308	TGC	3	9	5972	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698629
101	NC_014308	TGG	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698629
102	NC_014308	CGC	2	6	6211	6216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698629
103	NC_014308	GCG	3	9	6256	6264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698629
104	NC_014308	GCC	2	6	6265	6270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698629
105	NC_014308	CGT	3	9	6278	6286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698629
106	NC_014308	CGC	2	6	6516	6521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698630
107	NC_014308	GCC	2	6	6564	6569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698630
108	NC_014308	CGA	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698630
109	NC_014308	GCA	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698630
110	NC_014308	CCA	2	6	6731	6736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698630
111	NC_014308	GAA	3	9	6746	6754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698630
112	NC_014308	CAA	2	6	6794	6799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698630
113	NC_014308	TAC	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014308	CTG	2	6	7100	7105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014308	GGC	2	6	7111	7116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014308	TGG	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698631
117	NC_014308	GGC	2	6	7390	7395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698631
118	NC_014308	GAC	2	6	7423	7428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698631
119	NC_014308	CAA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300698631
120	NC_014308	CGC	2	6	7636	7641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698632
121	NC_014308	GCG	2	6	7659	7664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698632
122	NC_014308	CGG	2	6	7720	7725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698632
123	NC_014308	AGC	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698632
124	NC_014308	GAC	2	6	7979	7984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698632
125	NC_014308	AAG	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698632
126	NC_014308	GGT	2	6	8042	8047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698632
127	NC_014308	GTC	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698633
128	NC_014308	ACC	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698633
129	NC_014308	TGC	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698633
130	NC_014308	TGC	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698633
131	NC_014308	CAG	2	6	8308	8313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698633
132	NC_014308	GCT	2	6	8352	8357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698634
133	NC_014308	GCG	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698634
134	NC_014308	GCG	2	6	8487	8492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698634
135	NC_014308	TGA	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698634
136	NC_014308	AGG	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300698634
137	NC_014308	ATG	2	6	8544	8549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698634
138	NC_014308	CCG	2	6	8556	8561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698635
139	NC_014308	CAC	2	6	8574	8579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698635
140	NC_014308	TGG	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698635
141	NC_014308	GTC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014308	CTC	2	6	8892	8897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300698636
143	NC_014308	GCG	2	6	8922	8927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698636
144	NC_014308	CGG	2	6	8951	8956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698636
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146	NC_014308	GTC	2	6	8976	8981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698636
147	NC_014308	GCT	2	6	9047	9052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698636
148	NC_014308	TCG	2	6	9118	9123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698636
149	NC_014308	CTG	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300698636
150	NC_014308	CGC	2	6	9149	9154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698636
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154	NC_014308	GGC	2	6	9448	9453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698636
155	NC_014308	CTT	2	6	9479	9484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300698636
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158	NC_014308	ATG	2	6	9639	9644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698636
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161	NC_014308	ATC	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300698636
162	NC_014308	AGC	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698636
163	NC_014308	GAT	2	6	9815	9820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698636
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165	NC_014308	CCG	2	6	9892	9897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300698636
166	NC_014308	AAG	2	6	9924	9929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300698636
167	NC_014308	GAC	3	9	9951	9959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698636
168	NC_014308	AGG	2	6	10042	10047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300698636
169	NC_014308	GGC	2	6	10070	10075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300698636
170	NC_014308	GTA	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014308	GAC	2	6	10182	10187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014308	CCT	2	6	10313	10318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300698637
173	NC_014308	GGT	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300698637
174	NC_014308	GCA	2	6	10526	10531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014308	CTT	2	6	10560	10565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_014308	GAA	2	6	10783	10788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014308	GTA	2	6	10999	11004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300698638
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180	NC_014308	GCG	2	6	11128	11133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014308	GCG	2	6	11160	11165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_014308	GCG	2	6	11178	11183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_014308	CGC	2	6	11224	11229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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185	NC_014308	CGG	2	6	11352	11357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_014308	GGA	2	6	11376	11381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014308	GCC	2	6	11396	11401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_014308	TTG	2	6	11648	11653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014308	CAG	2	6	11687	11692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_014308	CCT	2	6	11820	11825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300698639
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192	NC_014308	ACG	2	6	11966	11971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300698639
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199	NC_014308	ACC	2	6	12514	12519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_014308	CCT	3	9	12618	12626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300698640
201	NC_014308	CCA	2	6	12708	12713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300698640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.