MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 3171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014307	CGACC	2	10	614	623	20 %	0 %	20 %	60 %	300702375
2	NC_014307	ACCAC	2	10	1849	1858	40 %	0 %	0 %	60 %	300702375
3	NC_014307	ATCCG	2	10	2003	2012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014307	AGCGC	2	10	3792	3801	20 %	0 %	40 %	40 %	300702377
5	NC_014307	CAGCG	2	10	5431	5440	20 %	0 %	40 %	40 %	300702377
6	NC_014307	ATTTT	2	10	6080	6089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014307	AGCGA	2	10	7233	7242	40 %	0 %	40 %	20 %	300702380
8	NC_014307	ACACC	2	10	8343	8352	40 %	0 %	0 %	60 %	300702383
9	NC_014307	TGATC	2	10	9335	9344	20 %	40 %	20 %	20 %	300702384
10	NC_014307	TGGCT	2	10	13081	13090	0 %	40 %	40 %	20 %	300702386
11	NC_014307	ACGTG	2	10	13409	13418	20 %	20 %	40 %	20 %	300702386
12	NC_014307	GCGAT	2	10	14456	14465	20 %	20 %	40 %	20 %	300702387
13	NC_014307	GTCGC	2	10	16353	16362	0 %	20 %	40 %	40 %	300702387
14	NC_014307	TCCGT	2	10	17777	17786	0 %	40 %	20 %	40 %	300702387
15	NC_014307	GCCTG	2	10	20168	20177	0 %	20 %	40 %	40 %	300702389
16	NC_014307	CACCG	2	10	21721	21730	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014307	ACAGC	2	10	22273	22282	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014307	ACGCT	2	10	23597	23606	20 %	20 %	20 %	40 %	300702393
19	NC_014307	TGCGC	2	10	24979	24988	0 %	20 %	40 %	40 %	300702393
20	NC_014307	GGCGG	2	10	25650	25659	0 %	0 %	80 %	20 %	300702393
21	NC_014307	AAGAC	2	10	28604	28613	60 %	0 %	20 %	20 %	300702397
22	NC_014307	GCGCC	2	10	29589	29598	0 %	0 %	40 %	60 %	300702398
23	NC_014307	ACCGC	2	10	30472	30481	20 %	0 %	20 %	60 %	300702398
24	NC_014307	GCAAT	2	10	30993	31002	40 %	20 %	20 %	20 %	300702400
25	NC_014307	AGCTG	2	10	32577	32586	20 %	20 %	40 %	20 %	300702403
26	NC_014307	ACGAT	2	10	32750	32759	40 %	20 %	20 %	20 %	300702404
27	NC_014307	ATGCG	2	10	35382	35391	20 %	20 %	40 %	20 %	300702409
28	NC_014307	TTGCA	2	10	35897	35906	20 %	40 %	20 %	20 %	300702410
29	NC_014307	CGTAG	2	10	36253	36262	20 %	20 %	40 %	20 %	300702410
30	NC_014307	TACGC	2	10	37586	37595	20 %	20 %	20 %	40 %	300702411
31	NC_014307	GACCA	2	10	37622	37631	40 %	0 %	20 %	40 %	300702411
32	NC_014307	ACGCA	2	10	39381	39390	40 %	0 %	20 %	40 %	300702412
33	NC_014307	GGGTT	2	10	40443	40452	0 %	40 %	60 %	0 %	300702412
34	NC_014307	GCGCC	2	10	43620	43629	0 %	0 %	40 %	60 %	300702415
35	NC_014307	GCTGC	2	10	43961	43970	0 %	20 %	40 %	40 %	300702415
36	NC_014307	CGGCG	2	10	44590	44599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014307	GAGGG	2	10	44735	44744	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014307	GCGCA	2	10	46113	46122	20 %	0 %	40 %	40 %	300702417
39	NC_014307	GCCAT	2	10	46721	46730	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014307	GCTTC	2	10	46898	46907	0 %	40 %	20 %	40 %	300702418
41	NC_014307	TGCAG	2	10	47184	47193	20 %	20 %	40 %	20 %	300702418
42	NC_014307	CCGCA	2	10	49554	49563	20 %	0 %	20 %	60 %	300702421
43	NC_014307	GCCGC	2	10	50120	50129	0 %	0 %	40 %	60 %	300702422
44	NC_014307	CGGCA	2	10	50414	50423	20 %	0 %	40 %	40 %	300702422
45	NC_014307	GCGCG	2	10	50513	50522	0 %	0 %	60 %	40 %	300702422
46	NC_014307	GGCAG	2	10	50712	50721	20 %	0 %	60 %	20 %	300702422
47	NC_014307	CGCGG	2	10	51214	51223	0 %	0 %	60 %	40 %	300702422
48	NC_014307	TGAAG	2	10	53761	53770	40 %	20 %	40 %	0 %	300702426
49	NC_014307	GGGCT	2	10	55821	55830	0 %	20 %	60 %	20 %	300702428
50	NC_014307	GGCGC	2	10	56075	56084	0 %	0 %	60 %	40 %	300702428
51	NC_014307	CGGGG	2	10	56494	56503	0 %	0 %	80 %	20 %	300702429
52	NC_014307	CGCGC	2	10	57069	57078	0 %	0 %	40 %	60 %	300702430
53	NC_014307	CGGCG	2	10	58070	58079	0 %	0 %	60 %	40 %	300702430
54	NC_014307	GCGCC	2	10	58185	58194	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_014307	CCGCG	2	10	59096	59105	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014307	TGCGC	2	10	59823	59832	0 %	20 %	40 %	40 %	300702432
57	NC_014307	CCGAC	2	10	61293	61302	20 %	0 %	20 %	60 %	300702432
58	NC_014307	CAGGG	2	10	63253	63262	20 %	0 %	60 %	20 %	300702432
59	NC_014307	CGTGC	2	10	63871	63880	0 %	20 %	40 %	40 %	300702432
60	NC_014307	TCGGT	2	10	64020	64029	0 %	40 %	40 %	20 %	300702432
61	NC_014307	GCCTG	2	10	64191	64200	0 %	20 %	40 %	40 %	300702432
62	NC_014307	GCGAG	2	10	64671	64680	20 %	0 %	60 %	20 %	300702432
63	NC_014307	CGGCG	2	10	67648	67657	0 %	0 %	60 %	40 %	300702433
64	NC_014307	CTGGG	2	10	67743	67752	0 %	20 %	60 %	20 %	300702433
65	NC_014307	CGGCG	2	10	68911	68920	0 %	0 %	60 %	40 %	300702434
66	NC_014307	GACGC	2	10	69324	69333	20 %	0 %	40 %	40 %	300702435
67	NC_014307	TCAGC	2	10	69942	69951	20 %	20 %	20 %	40 %	300702435
68	NC_014307	AGGGC	2	10	71044	71053	20 %	0 %	60 %	20 %	300702436
69	NC_014307	CACGC	2	10	71714	71723	20 %	0 %	20 %	60 %	300702437
70	NC_014307	TGACC	2	10	72605	72614	20 %	20 %	20 %	40 %	300702437
71	NC_014307	CCGCA	2	10	73301	73310	20 %	0 %	20 %	60 %	300702438
72	NC_014307	CAGGA	2	10	75179	75188	40 %	0 %	40 %	20 %	300702439
73	NC_014307	AACGC	2	10	81068	81077	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014307	GCAGC	2	10	82776	82785	20 %	0 %	40 %	40 %	300702444
75	NC_014307	GGCCA	2	10	83566	83575	20 %	0 %	40 %	40 %	300702445
76	NC_014307	CCCGT	2	10	84190	84199	0 %	20 %	20 %	60 %	300702445
77	NC_014307	GGCGC	2	10	85268	85277	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014307	TGGGC	2	10	85983	85992	0 %	20 %	60 %	20 %	300702446
79	NC_014307	GCGCC	2	10	86924	86933	0 %	0 %	40 %	60 %	300702447
80	NC_014307	GGAGT	2	10	89132	89141	20 %	20 %	60 %	0 %	300702447
81	NC_014307	TTGCT	2	10	89343	89352	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014307	GCAAA	2	10	89414	89423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014307	AGCGA	2	10	89557	89566	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014307	CAAAA	2	10	89712	89721	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014307	GCCGA	2	10	90158	90167	20 %	0 %	40 %	40 %	300702448
86	NC_014307	GACCG	2	10	95010	95019	20 %	0 %	40 %	40 %	300702453
87	NC_014307	GCTTG	2	10	95486	95495	0 %	40 %	40 %	20 %	300702453
88	NC_014307	GAACG	2	10	95883	95892	40 %	0 %	40 %	20 %	300702454
89	NC_014307	GCCGC	2	10	96616	96625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_014307	ACCGG	2	10	99913	99922	20 %	0 %	40 %	40 %	300702457
91	NC_014307	GCCCA	2	10	100824	100833	20 %	0 %	20 %	60 %	300702458
92	NC_014307	TCGTT	2	10	101917	101926	0 %	60 %	20 %	20 %	300702458
93	NC_014307	CTGGC	2	10	102598	102607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014307	CGGAT	2	10	102801	102810	20 %	20 %	40 %	20 %	300702460
95	NC_014307	CGTCC	2	10	102927	102936	0 %	20 %	20 %	60 %	300702460
96	NC_014307	GCCAG	2	10	104469	104478	20 %	0 %	40 %	40 %	300702461
97	NC_014307	GACCG	2	10	105652	105661	20 %	0 %	40 %	40 %	300702462
98	NC_014307	GGCGC	2	10	107080	107089	0 %	0 %	60 %	40 %	300702464
99	NC_014307	GGCCC	2	10	108593	108602	0 %	0 %	40 %	60 %	300702466
100	NC_014307	GTCCT	2	10	108848	108857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014307	TGCCG	2	10	109472	109481	0 %	20 %	40 %	40 %	300702467
102	NC_014307	ACCAG	2	10	111062	111071	40 %	0 %	20 %	40 %	300702468
103	NC_014307	GACAG	2	10	112018	112027	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014307	CGGCG	2	10	112967	112976	0 %	0 %	60 %	40 %	300702471
105	NC_014307	GAGAG	2	10	115192	115201	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014307	GGGCC	2	10	115206	115215	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014307	CGATG	2	10	118091	118100	20 %	20 %	40 %	20 %	300702478
108	NC_014307	CGGGC	2	10	118419	118428	0 %	0 %	60 %	40 %	300702479
109	NC_014307	ACCTC	2	10	119397	119406	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_014307	TCGGC	2	10	119808	119817	0 %	20 %	40 %	40 %	300702480
111	NC_014307	CGAAG	2	10	120145	120154	40 %	0 %	40 %	20 %	300702480
112	NC_014307	GCCGC	2	10	120334	120343	0 %	0 %	40 %	60 %	300702481
113	NC_014307	GCGGT	2	10	122131	122140	0 %	20 %	60 %	20 %	300702482
114	NC_014307	CGGCG	2	10	122765	122774	0 %	0 %	60 %	40 %	300702482
115	NC_014307	GCATG	2	10	123537	123546	20 %	20 %	40 %	20 %	300702484
116	NC_014307	CAAAA	2	10	124290	124299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014307	CGAGC	2	10	125936	125945	20 %	0 %	40 %	40 %	300702485
118	NC_014307	GTGCT	2	10	130164	130173	0 %	40 %	40 %	20 %	300702490
119	NC_014307	CCGGG	2	10	131063	131072	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014307	CGCCT	2	10	131078	131087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_014307	GCTGA	2	10	132966	132975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014307	TGCGC	2	10	133429	133438	0 %	20 %	40 %	40 %	300702494
123	NC_014307	GCGCG	2	10	134653	134662	0 %	0 %	60 %	40 %	300702496
124	NC_014307	GGCGC	2	10	135314	135323	0 %	0 %	60 %	40 %	300702496
125	NC_014307	GGGCG	2	10	137479	137488	0 %	0 %	80 %	20 %	300702500
126	NC_014307	CCGGC	2	10	138437	138446	0 %	0 %	40 %	60 %	300702501
127	NC_014307	ACGCC	2	10	140934	140943	20 %	0 %	20 %	60 %	300702502
128	NC_014307	GTCGA	2	10	142271	142280	20 %	20 %	40 %	20 %	300702503
129	NC_014307	GGCGT	2	10	143074	143083	0 %	20 %	60 %	20 %	300702504
130	NC_014307	GAACG	2	10	144332	144341	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014307	GTTCG	2	10	144380	144389	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014307	AAGGC	2	10	146767	146776	40 %	0 %	40 %	20 %	300702509
133	NC_014307	CGAAG	2	10	147307	147316	40 %	0 %	40 %	20 %	300702510
134	NC_014307	GTGCA	2	10	150235	150244	20 %	20 %	40 %	20 %	300702513
135	NC_014307	CTCGA	2	10	151246	151255	20 %	20 %	20 %	40 %	300702513
136	NC_014307	GGCCG	2	10	153243	153252	0 %	0 %	60 %	40 %	300702515
137	NC_014307	CCACG	2	10	153483	153492	20 %	0 %	20 %	60 %	300702515
138	NC_014307	ACCGG	2	10	153592	153601	20 %	0 %	40 %	40 %	300702515
139	NC_014307	CGGCA	2	10	153744	153753	20 %	0 %	40 %	40 %	300702515
140	NC_014307	TGCCG	2	10	155250	155259	0 %	20 %	40 %	40 %	300702516
141	NC_014307	GGCCA	2	10	155740	155749	20 %	0 %	40 %	40 %	300702516
142	NC_014307	GACCT	2	10	156970	156979	20 %	20 %	20 %	40 %	300702518
143	NC_014307	AGCGG	2	10	157704	157713	20 %	0 %	60 %	20 %	300702518
144	NC_014307	CGGCG	2	10	159845	159854	0 %	0 %	60 %	40 %	300702521
145	NC_014307	GGTGT	2	10	160124	160133	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014307	CGATG	2	10	161223	161232	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014307	GGCGA	2	10	161853	161862	20 %	0 %	60 %	20 %	300702523
148	NC_014307	GCGAT	2	10	162295	162304	20 %	20 %	40 %	20 %	300702523
149	NC_014307	GCGCA	2	10	162843	162852	20 %	0 %	40 %	40 %	300702523
150	NC_014307	AGAGG	2	10	164110	164119	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014307	CGGAC	2	10	164629	164638	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014307	GCCGG	2	10	164645	164654	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_014307	TGGAC	2	10	165561	165570	20 %	20 %	40 %	20 %	300702527
154	NC_014307	CGACC	2	10	165631	165640	20 %	0 %	20 %	60 %	300702527
155	NC_014307	GACTT	2	10	166032	166041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014307	TGCAC	2	10	166955	166964	20 %	20 %	20 %	40 %	300702528
157	NC_014307	GCTGC	2	10	167903	167912	0 %	20 %	40 %	40 %	300702528
158	NC_014307	GGCCG	2	10	168279	168288	0 %	0 %	60 %	40 %	300702528
159	NC_014307	AGGCA	2	10	168861	168870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014307	CGGCG	2	10	171433	171442	0 %	0 %	60 %	40 %	300702529
161	NC_014307	GGCAG	2	10	171655	171664	20 %	0 %	60 %	20 %	300702529
162	NC_014307	GATGC	2	10	172283	172292	20 %	20 %	40 %	20 %	300702529
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165	NC_014307	TGCGG	2	10	177360	177369	0 %	20 %	60 %	20 %	300702533
166	NC_014307	CGGGG	2	10	177394	177403	0 %	0 %	80 %	20 %	300702533
167	NC_014307	ACACA	2	10	181419	181428	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_014307	GCGAG	2	10	184773	184782	20 %	0 %	60 %	20 %	300702537
173	NC_014307	TGCGA	2	10	185057	185066	20 %	20 %	40 %	20 %	300702537
174	NC_014307	GGAAA	2	10	189140	189149	60 %	0 %	40 %	0 %	300702539
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178	NC_014307	GCGCG	2	10	191913	191922	0 %	0 %	60 %	40 %	300702542
179	NC_014307	GTGCG	2	10	192315	192324	0 %	20 %	60 %	20 %	300702543
180	NC_014307	TGCCG	2	10	192942	192951	0 %	20 %	40 %	40 %	300702543
181	NC_014307	GCCGG	2	10	194419	194428	0 %	0 %	60 %	40 %	300702543
182	NC_014307	GCGCG	2	10	194912	194921	0 %	0 %	60 %	40 %	300702543
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186	NC_014307	ATGGC	2	10	197262	197271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_014307	TTTTG	2	10	198086	198095	0 %	80 %	20 %	0 %	300702546
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195	NC_014307	CGGCT	2	10	204717	204726	0 %	20 %	40 %	40 %	300702553
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197	NC_014307	CCGGT	2	10	205120	205129	0 %	20 %	40 %	40 %	300702553
198	NC_014307	CGGCT	2	10	207264	207273	0 %	20 %	40 %	40 %	300702555
199	NC_014307	GATCT	2	10	207291	207300	20 %	40 %	20 %	20 %	300702555
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201	NC_014307	CGTTT	2	10	212071	212080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
202	NC_014307	CGGGC	2	10	212960	212969	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
203	NC_014307	TGCGC	2	10	213295	213304	0 %	20 %	40 %	40 %	300702560
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233	NC_014307	TCAAT	2	10	250712	250721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
234	NC_014307	GCTGC	2	10	251404	251413	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
235	NC_014307	GCAGC	2	10	251949	251958	20 %	0 %	40 %	40 %	300702602
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237	NC_014307	TCGCC	2	10	252866	252875	0 %	20 %	20 %	60 %	300702602
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243	NC_014307	CAACC	2	10	255438	255447	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
244	NC_014307	TCGGA	2	10	256167	256176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
245	NC_014307	CCGGC	2	10	258180	258189	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
246	NC_014307	CGGGC	2	10	258334	258343	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
247	NC_014307	TGCGC	2	10	259148	259157	0 %	20 %	40 %	40 %	300702607
248	NC_014307	CAAGC	2	10	259342	259351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
249	NC_014307	AGCCG	2	10	259462	259471	20 %	0 %	40 %	40 %	300702608
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252	NC_014307	GATTG	2	10	263410	263419	20 %	40 %	40 %	0 %	300702614
253	NC_014307	CTCTG	2	10	263972	263981	0 %	40 %	20 %	40 %	300702615
254	NC_014307	GAAGC	2	10	263997	264006	40 %	0 %	40 %	20 %	300702615
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259	NC_014307	CGATG	2	10	268404	268413	20 %	20 %	40 %	20 %	300702620
260	NC_014307	CCGCG	2	10	269623	269632	0 %	0 %	40 %	60 %	300702621
261	NC_014307	GCGCC	2	10	270332	270341	0 %	0 %	40 %	60 %	300702622
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263	NC_014307	CGGCG	2	10	273358	273367	0 %	0 %	60 %	40 %	300702623
264	NC_014307	CGCAT	2	10	276324	276333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
265	NC_014307	AGCGC	2	10	280640	280649	20 %	0 %	40 %	40 %	300702627
266	NC_014307	CGGCT	2	10	281733	281742	0 %	20 %	40 %	40 %	300702628
267	NC_014307	GGTTT	2	10	282981	282990	0 %	60 %	40 %	0 %	300702629
268	NC_014307	AAGGG	2	10	283212	283221	40 %	0 %	60 %	0 %	300702629
269	NC_014307	CTCAA	2	10	283668	283677	40 %	20 %	0 %	40 %	300702629
270	NC_014307	CGGTA	2	10	283842	283851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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400	NC_014307	CAGCG	2	10	404572	404581	20 %	0 %	40 %	40 %	300702743
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