MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 10099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014307	GAGC	2	8	416	423	25 %	0 %	50 %	25 %	300702375
2	NC_014307	TCGC	2	8	564	571	0 %	25 %	25 %	50 %	300702375
3	NC_014307	CGCC	2	8	901	908	0 %	0 %	25 %	75 %	300702375
4	NC_014307	CGCA	2	8	1284	1291	25 %	0 %	25 %	50 %	300702375
5	NC_014307	CGGC	2	8	1746	1753	0 %	0 %	50 %	50 %	300702375
6	NC_014307	TCCT	2	8	2362	2369	0 %	50 %	0 %	50 %	300702376
7	NC_014307	GCGG	2	8	2806	2813	0 %	0 %	75 %	25 %	300702376
8	NC_014307	ACCT	2	8	3211	3218	25 %	25 %	0 %	50 %	300702376
9	NC_014307	CGTG	2	8	3894	3901	0 %	25 %	50 %	25 %	300702377
10	NC_014307	CACC	2	8	4417	4424	25 %	0 %	0 %	75 %	300702377
11	NC_014307	CCAG	2	8	4968	4975	25 %	0 %	25 %	50 %	300702377
12	NC_014307	GATG	2	8	5860	5867	25 %	25 %	50 %	0 %	300702377
13	NC_014307	TTCC	2	8	6780	6787	0 %	50 %	0 %	50 %	300702379
14	NC_014307	CTTG	2	8	6793	6800	0 %	50 %	25 %	25 %	300702379
15	NC_014307	CCAT	2	8	7046	7053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014307	CAAG	2	8	7178	7185	50 %	0 %	25 %	25 %	300702380
17	NC_014307	GACG	2	8	8228	8235	25 %	0 %	50 %	25 %	300702382
18	NC_014307	GCTG	2	8	8399	8406	0 %	25 %	50 %	25 %	300702383
19	NC_014307	TGAT	2	8	9217	9224	25 %	50 %	25 %	0 %	300702384
20	NC_014307	TGGC	2	8	9565	9572	0 %	25 %	50 %	25 %	300702384
21	NC_014307	ACCG	2	8	10097	10104	25 %	0 %	25 %	50 %	300702384
22	NC_014307	TGAG	2	8	10551	10558	25 %	25 %	50 %	0 %	300702385
23	NC_014307	CGGC	2	8	10648	10655	0 %	0 %	50 %	50 %	300702385
24	NC_014307	CAGT	2	8	11160	11167	25 %	25 %	25 %	25 %	300702385
25	NC_014307	AGCA	2	8	11298	11305	50 %	0 %	25 %	25 %	300702385
26	NC_014307	GCGA	2	8	11349	11356	25 %	0 %	50 %	25 %	300702385
27	NC_014307	CCAA	2	8	11597	11604	50 %	0 %	0 %	50 %	300702385
28	NC_014307	CGGC	2	8	12044	12051	0 %	0 %	50 %	50 %	300702385
29	NC_014307	GCCG	2	8	12089	12096	0 %	0 %	50 %	50 %	300702385
30	NC_014307	GGAT	2	8	12619	12626	25 %	25 %	50 %	0 %	300702385
31	NC_014307	GTTC	2	8	12846	12853	0 %	50 %	25 %	25 %	300702386
32	NC_014307	GCTG	2	8	13175	13182	0 %	25 %	50 %	25 %	300702386
33	NC_014307	GGGC	2	8	13986	13993	0 %	0 %	75 %	25 %	300702386
34	NC_014307	TTCC	2	8	14806	14813	0 %	50 %	0 %	50 %	300702387
35	NC_014307	CATC	2	8	14819	14826	25 %	25 %	0 %	50 %	300702387
36	NC_014307	GGAT	2	8	14939	14946	25 %	25 %	50 %	0 %	300702387
37	NC_014307	TCTA	2	8	15076	15083	25 %	50 %	0 %	25 %	300702387
38	NC_014307	ATCG	2	8	15191	15198	25 %	25 %	25 %	25 %	300702387
39	NC_014307	ATTC	2	8	16184	16191	25 %	50 %	0 %	25 %	300702387
40	NC_014307	TTGA	2	8	16272	16279	25 %	50 %	25 %	0 %	300702387
41	NC_014307	AGCA	3	12	16892	16903	50 %	0 %	25 %	25 %	300702387
42	NC_014307	TGCC	2	8	17200	17207	0 %	25 %	25 %	50 %	300702387
43	NC_014307	CATC	2	8	18184	18191	25 %	25 %	0 %	50 %	300702387
44	NC_014307	CAGC	2	8	18384	18391	25 %	0 %	25 %	50 %	300702387
45	NC_014307	CAAC	2	8	18766	18773	50 %	0 %	0 %	50 %	300702387
46	NC_014307	CGAC	2	8	19504	19511	25 %	0 %	25 %	50 %	300702387
47	NC_014307	TTCA	2	8	19536	19543	25 %	50 %	0 %	25 %	300702387
48	NC_014307	CGGC	2	8	19734	19741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014307	CATG	2	8	20478	20485	25 %	25 %	25 %	25 %	300702389
50	NC_014307	CGCT	2	8	20596	20603	0 %	25 %	25 %	50 %	300702389
51	NC_014307	CGAC	2	8	20837	20844	25 %	0 %	25 %	50 %	300702389
52	NC_014307	TCCC	2	8	21406	21413	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014307	CCTC	2	8	21594	21601	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014307	GGGC	2	8	21615	21622	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014307	CTTA	2	8	21630	21637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014307	GCCG	2	8	21780	21787	0 %	0 %	50 %	50 %	300702391
57	NC_014307	CCTG	2	8	21836	21843	0 %	25 %	25 %	50 %	300702391
58	NC_014307	GCTG	2	8	21980	21987	0 %	25 %	50 %	25 %	300702391
59	NC_014307	AGCC	2	8	22094	22101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014307	CGAC	2	8	22761	22768	25 %	0 %	25 %	50 %	300702392
61	NC_014307	CCTC	2	8	23405	23412	0 %	25 %	0 %	75 %	300702392
62	NC_014307	GCCT	2	8	23510	23517	0 %	25 %	25 %	50 %	300702392
63	NC_014307	CGGC	2	8	23877	23884	0 %	0 %	50 %	50 %	300702393
64	NC_014307	GCTG	3	12	24031	24042	0 %	25 %	50 %	25 %	300702393
65	NC_014307	GCTC	2	8	25804	25811	0 %	25 %	25 %	50 %	300702393
66	NC_014307	AGGC	2	8	25933	25940	25 %	0 %	50 %	25 %	300702393
67	NC_014307	GATG	2	8	26313	26320	25 %	25 %	50 %	0 %	300702393
68	NC_014307	AGAA	2	8	26383	26390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014307	TTGG	2	8	26479	26486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014307	GCTC	2	8	26491	26498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014307	GATC	2	8	26547	26554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014307	GTTT	2	8	26623	26630	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014307	ACCA	2	8	27746	27753	50 %	0 %	0 %	50 %	300702395
74	NC_014307	CCCA	2	8	27910	27917	25 %	0 %	0 %	75 %	300702395
75	NC_014307	GCAA	2	8	28040	28047	50 %	0 %	25 %	25 %	300702396
76	NC_014307	TCCC	2	8	28368	28375	0 %	25 %	0 %	75 %	300702396
77	NC_014307	GGTT	2	8	28718	28725	0 %	50 %	50 %	0 %	300702397
78	NC_014307	AGCG	2	8	29250	29257	25 %	0 %	50 %	25 %	300702397
79	NC_014307	TTGC	2	8	29385	29392	0 %	50 %	25 %	25 %	300702398
80	NC_014307	GGGT	2	8	29871	29878	0 %	25 %	75 %	0 %	300702398
81	NC_014307	GCAC	2	8	30314	30321	25 %	0 %	25 %	50 %	300702398
82	NC_014307	AAAC	2	8	30630	30637	75 %	0 %	0 %	25 %	300702399
83	NC_014307	AGGT	2	8	31704	31711	25 %	25 %	50 %	0 %	300702401
84	NC_014307	TGAC	2	8	31953	31960	25 %	25 %	25 %	25 %	300702402
85	NC_014307	TATC	2	8	32174	32181	25 %	50 %	0 %	25 %	300702402
86	NC_014307	TCTG	2	8	32209	32216	0 %	50 %	25 %	25 %	300702402
87	NC_014307	GGGC	2	8	32727	32734	0 %	0 %	75 %	25 %	300702404
88	NC_014307	CTTG	2	8	32829	32836	0 %	50 %	25 %	25 %	300702404
89	NC_014307	GCTT	2	8	33533	33540	0 %	50 %	25 %	25 %	300702405
90	NC_014307	AAGC	2	8	34002	34009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014307	CTTG	2	8	34181	34188	0 %	50 %	25 %	25 %	300702407
92	NC_014307	CCAT	2	8	34434	34441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014307	CCGT	2	8	35360	35367	0 %	25 %	25 %	50 %	300702409
94	NC_014307	CTGC	2	8	35570	35577	0 %	25 %	25 %	50 %	300702410
95	NC_014307	GGTG	2	8	35689	35696	0 %	25 %	75 %	0 %	300702410
96	NC_014307	TCCG	2	8	35950	35957	0 %	25 %	25 %	50 %	300702410
97	NC_014307	TGCT	2	8	36062	36069	0 %	50 %	25 %	25 %	300702410
98	NC_014307	GCAT	2	8	36529	36536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014307	CGTC	2	8	36573	36580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014307	CGCA	2	8	36787	36794	25 %	0 %	25 %	50 %	300702411
101	NC_014307	GGGC	2	8	36954	36961	0 %	0 %	75 %	25 %	300702411
102	NC_014307	GTGG	2	8	37179	37186	0 %	25 %	75 %	0 %	300702411
103	NC_014307	CAAT	2	8	37187	37194	50 %	25 %	0 %	25 %	300702411
104	NC_014307	CGGG	2	8	37358	37365	0 %	0 %	75 %	25 %	300702411
105	NC_014307	TGCC	2	8	37860	37867	0 %	25 %	25 %	50 %	300702412
106	NC_014307	CCTG	2	8	38059	38066	0 %	25 %	25 %	50 %	300702412
107	NC_014307	CTGG	2	8	38110	38117	0 %	25 %	50 %	25 %	300702412
108	NC_014307	GACA	2	8	38168	38175	50 %	0 %	25 %	25 %	300702412
109	NC_014307	CGGC	2	8	38316	38323	0 %	0 %	50 %	50 %	300702412
110	NC_014307	CGGC	2	8	38553	38560	0 %	0 %	50 %	50 %	300702412
111	NC_014307	AGCG	2	8	39067	39074	25 %	0 %	50 %	25 %	300702412
112	NC_014307	CGGC	2	8	39588	39595	0 %	0 %	50 %	50 %	300702412
113	NC_014307	CAAG	2	8	39789	39796	50 %	0 %	25 %	25 %	300702412
114	NC_014307	ACTC	2	8	40840	40847	25 %	25 %	0 %	50 %	300702412
115	NC_014307	AGTC	2	8	40982	40989	25 %	25 %	25 %	25 %	300702412
116	NC_014307	CGGA	2	8	41297	41304	25 %	0 %	50 %	25 %	300702413
117	NC_014307	TTCG	2	8	41813	41820	0 %	50 %	25 %	25 %	300702413
118	NC_014307	ACCA	2	8	42129	42136	50 %	0 %	0 %	50 %	300702414
119	NC_014307	GACG	2	8	42645	42652	25 %	0 %	50 %	25 %	300702414
120	NC_014307	GCTG	2	8	42771	42778	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014307	CGAC	2	8	43025	43032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014307	CGAT	2	8	43143	43150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014307	CCGT	2	8	43159	43166	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_014307	TTGC	2	8	43783	43790	0 %	50 %	25 %	25 %	300702415
125	NC_014307	GTGC	2	8	43879	43886	0 %	25 %	50 %	25 %	300702415
126	NC_014307	CCGA	2	8	44051	44058	25 %	0 %	25 %	50 %	300702415
127	NC_014307	ATTG	2	8	44888	44895	25 %	50 %	25 %	0 %	300702416
128	NC_014307	GGTG	2	8	45884	45891	0 %	25 %	75 %	0 %	300702417
129	NC_014307	CGGG	2	8	46203	46210	0 %	0 %	75 %	25 %	300702417
130	NC_014307	GCCC	2	8	46492	46499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_014307	GCCG	2	8	46589	46596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014307	CGGC	2	8	46962	46969	0 %	0 %	50 %	50 %	300702418
133	NC_014307	CAGG	2	8	47292	47299	25 %	0 %	50 %	25 %	300702418
134	NC_014307	CGAT	2	8	47734	47741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014307	TCGT	2	8	47832	47839	0 %	50 %	25 %	25 %	300702419
136	NC_014307	TCGC	2	8	47889	47896	0 %	25 %	25 %	50 %	300702419
137	NC_014307	TCCA	2	8	47994	48001	25 %	25 %	0 %	50 %	300702419
138	NC_014307	GGCG	2	8	48038	48045	0 %	0 %	75 %	25 %	300702419
139	NC_014307	CTCG	2	8	48236	48243	0 %	25 %	25 %	50 %	300702419
140	NC_014307	GGCG	2	8	48891	48898	0 %	0 %	75 %	25 %	300702420
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142	NC_014307	GGCC	2	8	49939	49946	0 %	0 %	50 %	50 %	300702421
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