MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 56976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014307	GCG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702375
2	NC_014307	CAA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
3	NC_014307	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
4	NC_014307	TGC	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
5	NC_014307	ACT	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
6	NC_014307	GCC	2	6	639	644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
7	NC_014307	GCC	2	6	783	788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
8	NC_014307	GCG	2	6	792	797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702375
9	NC_014307	GCC	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
10	NC_014307	ATG	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702375
11	NC_014307	GAC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
12	NC_014307	GCC	2	6	1008	1013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
13	NC_014307	CAA	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
14	NC_014307	CGA	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
15	NC_014307	CTA	2	6	1223	1228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
16	NC_014307	CTG	3	9	1242	1250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
17	NC_014307	TTC	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
18	NC_014307	GAA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
19	NC_014307	TTC	2	6	1299	1304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
20	NC_014307	TCA	3	9	1342	1350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702375
21	NC_014307	CGA	2	6	1385	1390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
22	NC_014307	GCC	2	6	1436	1441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702375
23	NC_014307	TGA	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702375
24	NC_014307	GGA	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702375
25	NC_014307	CTT	2	6	1517	1522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702375
26	NC_014307	CTG	2	6	1647	1652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702375
27	NC_014307	AGA	2	6	1690	1695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
28	NC_014307	ACA	2	6	1711	1716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702375
29	NC_014307	GAA	2	6	1739	1744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
30	NC_014307	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702375
31	NC_014307	CGA	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
32	NC_014307	GCA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702375
33	NC_014307	ACC	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702375
34	NC_014307	CTG	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
35	NC_014307	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
36	NC_014307	CTG	2	6	2332	2337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
37	NC_014307	CAC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
38	NC_014307	GCG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702376
39	NC_014307	CCA	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
40	NC_014307	GCC	2	6	2566	2571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
41	NC_014307	GAA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
42	NC_014307	AGA	2	6	2630	2635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
43	NC_014307	CTG	2	6	2647	2652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
44	NC_014307	CAG	2	6	2677	2682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
45	NC_014307	CTA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
46	NC_014307	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
47	NC_014307	TGG	3	9	2714	2722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702376
48	NC_014307	GCG	2	6	2774	2779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702376
49	NC_014307	AGC	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
50	NC_014307	CCG	2	6	2798	2803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702376
51	NC_014307	TCA	2	6	2825	2830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
52	NC_014307	CTG	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
53	NC_014307	GCA	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
54	NC_014307	ACC	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
55	NC_014307	CCA	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702376
56	NC_014307	GAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
57	NC_014307	GAA	2	6	3157	3162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702376
58	NC_014307	TCA	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702376
59	NC_014307	GAC	3	9	3304	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702376
60	NC_014307	CGT	2	6	3324	3329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702376
61	NC_014307	CAG	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
62	NC_014307	AGC	3	9	3524	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
63	NC_014307	GCC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
64	NC_014307	CAC	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
65	NC_014307	CGA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
66	NC_014307	CGA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
67	NC_014307	CGG	2	6	3832	3837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
68	NC_014307	GGC	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
69	NC_014307	CAC	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
70	NC_014307	CTG	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
71	NC_014307	CAC	2	6	4057	4062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
72	NC_014307	CGA	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
73	NC_014307	AAC	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
74	NC_014307	GCG	2	6	4239	4244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
75	NC_014307	TCG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
76	NC_014307	CAA	2	6	4267	4272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
77	NC_014307	ACG	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
78	NC_014307	CAA	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702377
79	NC_014307	CGG	2	6	4411	4416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
80	NC_014307	TCA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
81	NC_014307	AAG	2	6	4490	4495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702377
82	NC_014307	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
83	NC_014307	TCC	2	6	4604	4609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702377
84	NC_014307	GAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702377
85	NC_014307	CTG	2	6	4661	4666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
86	NC_014307	ACG	2	6	4677	4682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
87	NC_014307	ATC	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
88	NC_014307	TCG	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
89	NC_014307	GCC	2	6	4712	4717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
90	NC_014307	CGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
91	NC_014307	TCG	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
92	NC_014307	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
93	NC_014307	TCA	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
94	NC_014307	GAC	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
95	NC_014307	ACC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702377
96	NC_014307	CAT	4	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
97	NC_014307	GCT	3	9	5104	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
98	NC_014307	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702377
99	NC_014307	ATC	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
100	NC_014307	GCC	2	6	5173	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702377
101	NC_014307	GAC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
102	NC_014307	CAG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
103	NC_014307	CGG	2	6	5512	5517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
104	NC_014307	ACG	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702377
105	NC_014307	GCG	2	6	5581	5586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
106	NC_014307	TGC	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
107	NC_014307	GCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
108	NC_014307	GCG	2	6	5875	5880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
109	NC_014307	CTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702377
110	NC_014307	GCG	2	6	5912	5917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
111	NC_014307	TAC	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702377
112	NC_014307	TGA	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702377
113	NC_014307	CGG	2	6	5960	5965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702377
114	NC_014307	TGG	2	6	5988	5993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702377
115	NC_014307	AGA	2	6	6254	6259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702378
116	NC_014307	TGG	3	9	6287	6295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702378
117	NC_014307	TGC	2	6	6337	6342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702378
118	NC_014307	CGG	2	6	6362	6367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702378
119	NC_014307	TGC	2	6	6593	6598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702378
120	NC_014307	GAG	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702379
121	NC_014307	TTC	2	6	6828	6833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702379
122	NC_014307	TGT	3	9	6916	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702379
123	NC_014307	CGC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702379
124	NC_014307	CGG	2	6	6942	6947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702379
125	NC_014307	GCC	2	6	6952	6957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702379
126	NC_014307	AAG	2	6	7260	7265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702380
127	NC_014307	TGG	2	6	7339	7344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702380
128	NC_014307	TGC	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702380
129	NC_014307	TCG	2	6	7526	7531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702381
130	NC_014307	TGC	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702381
131	NC_014307	CAA	2	6	7696	7701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702381
132	NC_014307	CAT	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702381
133	NC_014307	GGT	2	6	8062	8067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702382
134	NC_014307	GGC	2	6	8137	8142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702382
135	NC_014307	CCG	2	6	8191	8196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702382
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142	NC_014307	CTG	2	6	9376	9381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702384
143	NC_014307	GGC	2	6	9382	9387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702384
144	NC_014307	CTG	2	6	9394	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702384
145	NC_014307	GAC	2	6	9501	9506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702384
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148	NC_014307	GAC	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702384
149	NC_014307	TTG	2	6	9805	9810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702384
150	NC_014307	CTC	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702384
151	NC_014307	CGT	2	6	9945	9950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702384
152	NC_014307	GTC	2	6	10006	10011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702384
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155	NC_014307	ACT	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702384
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158	NC_014307	AGC	2	6	10231	10236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702384
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160	NC_014307	AAG	2	6	10322	10327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702384
161	NC_014307	CAG	2	6	10559	10564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702385
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163	NC_014307	GGA	2	6	10616	10621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702385
164	NC_014307	CGA	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702385
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252	NC_014307	TCG	2	6	17355	17360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
253	NC_014307	TAC	2	6	17466	17471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702387
254	NC_014307	CTC	2	6	17472	17477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702387
255	NC_014307	GCG	2	6	17510	17515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702387
256	NC_014307	CGA	2	6	17552	17557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702387
257	NC_014307	ACA	2	6	17626	17631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702387
258	NC_014307	GTT	2	6	17654	17659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702387
259	NC_014307	CTG	2	6	17695	17700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
260	NC_014307	CTG	2	6	17715	17720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
261	NC_014307	GGA	2	6	18040	18045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702387
262	NC_014307	CGT	2	6	18110	18115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
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274	NC_014307	TGG	2	6	19147	19152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702387
275	NC_014307	CGA	2	6	19196	19201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702387
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283	NC_014307	GCT	2	6	19563	19568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702387
284	NC_014307	GAA	2	6	19843	19848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702388
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