MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014306	GAATAT	2	12	111199	111210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014306	AGCCTG	2	12	111771	111782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014306	TAAATA	2	12	115442	115453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014306	CCGCAT	2	12	115964	115975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014306	GGGGGA	2	12	160164	160175	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014306	GTTCAG	2	12	222723	222734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014306	GCGGAA	2	12	307327	307338	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014306	ATTAAT	2	12	316321	316332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014306	CCGCCT	2	12	364807	364818	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014306	GCTGGT	2	12	434044	434055	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014306	CCCGGT	2	12	435946	435957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014306	ATTTTT	2	12	515828	515839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014306	CGGTGC	2	12	520719	520730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014306	TTTTTA	2	12	532687	532698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014306	GTTTTT	2	12	557231	557242	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014306	CAGAAA	2	12	596203	596214	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014306	AAGCTA	2	12	653176	653187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014306	GTGTTT	2	12	653774	653785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014306	GGATAA	2	12	653874	653885	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014306	ATCATT	2	12	671560	671571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014306	GATTAT	2	12	687620	687631	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014306	ATTTTT	2	12	690397	690408	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014306	CGCCAT	3	18	692186	692203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014306	CATCTG	2	12	719831	719842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014306	TTATAA	2	12	719862	719873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014306	TGTTAT	2	12	736950	736961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014306	CTGACC	2	12	747864	747875	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014306	TCGCTT	2	12	895305	895316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014306	AAAGGT	2	12	913883	913894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014306	TTGATT	2	12	923924	923935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014306	CGTTTA	2	12	951052	951063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014306	TAGAAT	2	12	984621	984632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014306	CCCATT	2	12	1019576	1019587	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014306	GCCAGC	2	12	1111674	1111685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014306	TTCATT	2	12	1130256	1130267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014306	TCAAAC	2	12	1201669	1201680	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014306	GCCAGA	2	12	1203040	1203051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014306	CATCCT	2	12	1283252	1283263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014306	ATATTT	2	12	1285038	1285049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014306	AATGGT	6	36	1296145	1296180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014306	AGATGA	2	12	1317732	1317743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014306	AACAGC	2	12	1402921	1402932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014306	GCAGGA	2	12	1427902	1427913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014306	ATTAAT	2	12	1446204	1446215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014306	TTTTTA	2	12	1459634	1459645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014306	GAAGAT	2	12	1570895	1570906	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014306	AGCGAA	2	12	1587952	1587963	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014306	AGCGAA	2	12	1587988	1587999	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014306	GTCAAG	2	12	1600528	1600539	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014306	AGGGCG	2	12	1668256	1668267	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014306	TTTTCT	2	12	1717233	1717244	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014306	GGGACA	2	12	1757665	1757676	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014306	GGACAG	2	12	1792084	1792095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014306	CATCGG	2	12	1825515	1825526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014306	CAATGG	2	12	1833922	1833933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014306	GCATTC	2	12	1891634	1891645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014306	CATCTC	2	12	1908483	1908494	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014306	ATTTTT	2	12	1953299	1953310	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014306	ATATCA	2	12	1993734	1993745	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014306	ACTTTA	2	12	1993892	1993903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014306	CTCTTT	2	12	2005843	2005854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014306	AAAAAT	2	12	2008689	2008700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014306	GAGATA	2	12	2037850	2037861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014306	GCCCCG	2	12	2051937	2051948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014306	TTTTCG	2	12	2089895	2089906	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014306	AAAAAT	2	12	2105754	2105765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014306	TTTTTA	2	12	2144458	2144469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014306	GATAAA	2	12	2144601	2144612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014306	AGCAAT	2	12	2148929	2148940	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014306	GACACA	2	12	2179677	2179688	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014306	TAGGGA	2	12	2203364	2203375	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014306	CTGTGT	2	12	2284621	2284632	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014306	TAAGGC	2	12	2371173	2371184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014306	TCAGAG	2	12	2412535	2412546	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014306	AATAGC	2	12	2592920	2592931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014306	CAGATA	2	12	2604317	2604328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014306	GATTAA	2	12	2646616	2646627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014306	AAAAAC	2	12	2675062	2675073	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014306	GCTGGC	2	12	2677429	2677440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014306	TTTACC	2	12	2680135	2680146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014306	GCATTT	2	12	2699390	2699401	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014306	TAAAAA	2	12	2699943	2699954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014306	AAAAGG	2	12	2700580	2700591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014306	CTCCTG	2	12	2757792	2757803	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014306	TTACAT	2	12	2774322	2774333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014306	TTAACA	2	12	2812835	2812846	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014306	AATGAT	2	12	2812882	2812893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014306	GCCGAT	2	12	2915049	2915060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014306	ATTGTT	2	12	2923501	2923512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014306	ATTATC	2	12	2954532	2954543	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014306	AATAGC	2	12	2985542	2985553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014306	AACGTT	2	12	2998940	2998951	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014306	CTTTTT	2	12	3000077	3000088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014306	TTTTTG	2	12	3013953	3013964	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014306	CAAAAG	2	12	3024140	3024151	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014306	ACAGAA	2	12	3026813	3026824	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014306	ACCCTT	2	12	3053004	3053015	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014306	ATTTAT	2	12	3088578	3088589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014306	ATACAT	2	12	3112927	3112938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014306	GCCGTT	2	12	3133845	3133856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014306	TCTGAA	2	12	3144641	3144652	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014306	GCGGCA	2	12	3151503	3151514	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014306	GATGCC	2	12	3167199	3167210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014306	GACGCT	2	12	3176090	3176101	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014306	ATCATT	2	12	3203756	3203767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014306	AGTCTG	2	12	3218469	3218480	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014306	TAATCT	2	12	3262632	3262643	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014306	CAGAAC	2	12	3274079	3274090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014306	TAGACT	2	12	3311514	3311525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014306	AGCCAG	2	12	3424170	3424181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014306	AGAAAA	2	12	3485661	3485672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014306	TAAACG	2	12	3516139	3516150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014306	AAAAAG	2	12	3528411	3528422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014306	TATGAT	2	12	3561331	3561342	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014306	TTTAAT	2	12	3561485	3561496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014306	CCAACA	2	12	3564481	3564492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014306	ATGGCT	2	12	3580339	3580350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014306	TGCATA	2	12	3586005	3586016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014306	CATAAC	2	12	3602406	3602417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014306	AATGAT	2	12	3612137	3612148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014306	GCCAGC	2	12	3816720	3816731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014306	GGCTTA	2	12	3829977	3829988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014306	TAAAAC	2	12	3838947	3838958	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014306	ATTTTT	2	12	3847951	3847962	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014306	GCACAC	2	12	3875937	3875948	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014306	GCCCTG	2	12	3892010	3892021	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014306	AACAGA	2	12	3898851	3898862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014306	ATATTC	2	12	3959112	3959123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014306	GAAATA	2	12	4018280	4018291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014306	CGGTGT	2	12	4042820	4042831	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014306	ATAAAA	2	12	4103850	4103861	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014306	ATTTTT	2	12	4205956	4205967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014306	TAAGCA	2	12	4221506	4221517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_014306	TGTTGG	2	12	4996331	4996342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.