MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 chromosome

Total Repeats: 70521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014306	TCT	2	6	593	598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714589
2	NC_014306	CTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714589
3	NC_014306	TCA	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714589
4	NC_014306	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714589
5	NC_014306	TTC	2	6	777	782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714589
6	NC_014306	CTT	2	6	821	826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714589
7	NC_014306	TTG	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714590
8	NC_014306	TAA	2	6	1249	1254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300714590
9	NC_014306	GGT	2	6	1271	1276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714590
10	NC_014306	CCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714590
11	NC_014306	ATG	2	6	1353	1358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714590
12	NC_014306	AGC	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714590
13	NC_014306	ATG	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714590
14	NC_014306	GCG	2	6	1782	1787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714591
15	NC_014306	GGT	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714591
16	NC_014306	GCC	2	6	1867	1872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714591
17	NC_014306	GAG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300714591
18	NC_014306	ATC	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714591
19	NC_014306	CCA	2	6	2136	2141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714591
20	NC_014306	CTT	2	6	2148	2153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714591
21	NC_014306	CCA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714591
22	NC_014306	GAA	2	6	2488	2493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714591
23	NC_014306	CGG	2	6	2498	2503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714591
24	NC_014306	GTC	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714591
25	NC_014306	GTG	2	6	2651	2656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714591
26	NC_014306	CCA	2	6	2731	2736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714591
27	NC_014306	CAG	2	6	2803	2808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714591
28	NC_014306	CGG	2	6	2874	2879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714591
29	NC_014306	CTT	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714591
30	NC_014306	TCA	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714591
31	NC_014306	CGG	2	6	2964	2969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714591
32	NC_014306	CTT	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714591
33	NC_014306	CCG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714591
34	NC_014306	GCG	2	6	3065	3070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714591
35	NC_014306	GAA	2	6	3079	3084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714591
36	NC_014306	GGT	2	6	3133	3138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714591
37	NC_014306	ATC	2	6	3172	3177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714591
38	NC_014306	CAT	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714591
39	NC_014306	TGT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714591
40	NC_014306	CCA	2	6	3576	3581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714591
41	NC_014306	CAT	2	6	3592	3597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714591
42	NC_014306	AAC	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300714591
43	NC_014306	TTG	3	9	3826	3834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714591
44	NC_014306	GCG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714592
45	NC_014306	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
46	NC_014306	ATG	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714592
47	NC_014306	GCT	3	9	4046	4054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
48	NC_014306	GAT	2	6	4122	4127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714592
49	NC_014306	AGC	2	6	4168	4173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
50	NC_014306	GCC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714592
51	NC_014306	CCA	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714592
52	NC_014306	ACG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
53	NC_014306	CAG	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
54	NC_014306	GCC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714592
55	NC_014306	GCT	2	6	4427	4432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
56	NC_014306	ATG	4	12	4437	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714592
57	NC_014306	CAG	2	6	4506	4511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
58	NC_014306	CCA	2	6	4520	4525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714592
59	NC_014306	GGT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714592
60	NC_014306	GTC	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
61	NC_014306	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714592
62	NC_014306	CTC	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300714592
63	NC_014306	GCG	2	6	4676	4681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714592
64	NC_014306	CTT	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714592
65	NC_014306	TGC	2	6	4712	4717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
66	NC_014306	GTT	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714592
67	NC_014306	CGC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714592
68	NC_014306	CAG	2	6	4914	4919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
69	NC_014306	CAG	2	6	4938	4943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
70	NC_014306	CTG	2	6	4944	4949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
71	NC_014306	TGG	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714592
72	NC_014306	ATG	2	6	5079	5084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714592
73	NC_014306	CAG	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
74	NC_014306	CTG	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714592
75	NC_014306	TCC	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300714592
76	NC_014306	GGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714592
77	NC_014306	GCA	2	6	5246	5251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714592
78	NC_014306	TTC	2	6	5257	5262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714592
79	NC_014306	CTG	2	6	5564	5569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
80	NC_014306	GCA	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
81	NC_014306	CGC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714593
82	NC_014306	CAC	2	6	5738	5743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714593
83	NC_014306	GCA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
84	NC_014306	GCA	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
85	NC_014306	GCC	2	6	5852	5857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714593
86	NC_014306	CTG	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
87	NC_014306	TGC	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
88	NC_014306	GCT	3	9	5950	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
89	NC_014306	CAG	2	6	5999	6004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
90	NC_014306	CGT	2	6	6019	6024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
91	NC_014306	CAG	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
92	NC_014306	GCA	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
93	NC_014306	GCG	2	6	6125	6130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714593
94	NC_014306	CTG	2	6	6167	6172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
95	NC_014306	GCA	2	6	6175	6180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
96	NC_014306	CTG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
97	NC_014306	TGC	2	6	6316	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714593
98	NC_014306	CAG	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
99	NC_014306	CAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714593
100	NC_014306	CTT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714593
101	NC_014306	TCA	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714593
102	NC_014306	CGG	2	6	6708	6713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714593
103	NC_014306	CGC	2	6	6763	6768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714593
104	NC_014306	GCC	2	6	7180	7185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714594
105	NC_014306	TGG	2	6	7322	7327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
106	NC_014306	CGG	2	6	7433	7438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714594
107	NC_014306	GGC	2	6	7462	7467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714594
108	NC_014306	CTT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714594
109	NC_014306	GTG	2	6	7486	7491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
110	NC_014306	ATC	2	6	7537	7542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714594
111	NC_014306	GCT	2	6	7593	7598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
112	NC_014306	TGC	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
113	NC_014306	GGC	2	6	7687	7692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714594
114	NC_014306	TGC	2	6	7718	7723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
115	NC_014306	GGT	2	6	7797	7802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
116	NC_014306	TGC	2	6	7931	7936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
117	NC_014306	GAA	2	6	7938	7943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714594
118	NC_014306	CTT	2	6	7965	7970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714594
119	NC_014306	CTG	2	6	7972	7977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
120	NC_014306	TCT	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714594
121	NC_014306	GCC	2	6	8100	8105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714594
122	NC_014306	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714594
123	NC_014306	GCT	2	6	8169	8174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
124	NC_014306	GTG	2	6	8185	8190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
125	NC_014306	TTG	2	6	8198	8203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714594
126	NC_014306	GTT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714594
127	NC_014306	ATC	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714594
128	NC_014306	ACC	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714594
129	NC_014306	CTG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
130	NC_014306	CGT	2	6	8482	8487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
131	NC_014306	GAT	2	6	8517	8522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714594
132	NC_014306	CGC	2	6	8540	8545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714594
133	NC_014306	TGC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
134	NC_014306	GTG	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
135	NC_014306	CTG	2	6	8656	8661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
136	NC_014306	GTG	2	6	8743	8748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714594
137	NC_014306	GAT	2	6	8826	8831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714594
138	NC_014306	TGC	2	6	8918	8923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714594
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141	NC_014306	CAG	2	6	9332	9337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714595
142	NC_014306	CAG	3	9	9356	9364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714595
143	NC_014306	TGA	2	6	9379	9384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714595
144	NC_014306	CGG	2	6	9421	9426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714595
145	NC_014306	GCC	2	6	9651	9656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714595
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149	NC_014306	TCT	2	6	9783	9788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714595
150	NC_014306	AGC	2	6	9876	9881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714595
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152	NC_014306	ACC	3	9	9978	9986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714595
153	NC_014306	CTG	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714595
154	NC_014306	ATC	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714595
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161	NC_014306	CAG	3	9	10361	10369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714595
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250	NC_014306	GGT	2	6	16845	16850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714602
251	NC_014306	GCG	2	6	16859	16864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714602
252	NC_014306	GGC	2	6	17020	17025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714602
253	NC_014306	TTG	2	6	17054	17059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300714602
254	NC_014306	CTG	2	6	17080	17085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714602
255	NC_014306	AGC	2	6	17086	17091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714602
256	NC_014306	CTG	3	9	17176	17184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714602
257	NC_014306	GGC	2	6	17271	17276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714602
258	NC_014306	TGG	2	6	17501	17506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714602
259	NC_014306	CGC	2	6	17514	17519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714602
260	NC_014306	CGC	2	6	17535	17540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300714602
261	NC_014306	CTG	2	6	17614	17619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714602
262	NC_014306	CAT	2	6	17688	17693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714602
263	NC_014306	GTG	2	6	17863	17868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714602
264	NC_014306	CAT	2	6	17949	17954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714602
265	NC_014306	ACA	2	6	17972	17977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300714602
266	NC_014306	TGG	2	6	17978	17983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714602
267	NC_014306	AGA	2	6	17996	18001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714602
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269	NC_014306	GGT	2	6	18532	18537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714603
270	NC_014306	CAT	2	6	18574	18579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714603
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273	NC_014306	TCA	2	6	18688	18693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714603
274	NC_014306	ATC	2	6	18764	18769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714603
275	NC_014306	ATG	2	6	18798	18803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714604
276	NC_014306	CCA	2	6	18931	18936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300714604
277	NC_014306	TGA	2	6	18937	18942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714604
278	NC_014306	TGA	2	6	18946	18951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714604
279	NC_014306	CAT	2	6	19046	19051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714604
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282	NC_014306	TGC	2	6	19171	19176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714604
283	NC_014306	AGC	2	6	19200	19205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714604
284	NC_014306	TGG	2	6	19213	19218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300714604
285	NC_014306	CAG	2	6	19239	19244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714604
286	NC_014306	GAA	2	6	19485	19490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714604
287	NC_014306	ATG	2	6	19506	19511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714604
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291	NC_014306	GCT	2	6	19982	19987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714604
292	NC_014306	TGA	2	6	20029	20034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714604
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294	NC_014306	AGA	2	6	20126	20131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300714604
295	NC_014306	CAT	2	6	20141	20146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714604
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372	NC_014306	GCT	2	6	24404	24409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714609
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374	NC_014306	GCA	2	6	24496	24501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714609
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376	NC_014306	GAT	2	6	24560	24565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714609
377	NC_014306	GCA	2	6	24607	24612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714609
378	NC_014306	CAT	2	6	24662	24667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300714609
379	NC_014306	GCA	2	6	24706	24711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714609
380	NC_014306	GCG	2	6	24753	24758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714609
381	NC_014306	GCG	2	6	24817	24822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300714609
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401	NC_014306	CTT	2	6	31451	31456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714610
402	NC_014306	TTC	2	6	31497	31502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300714610
403	NC_014306	GAT	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300714610
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497	NC_014306	AGC	2	6	40021	40026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300714617
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499	NC_014306	CAA	2	6	40184	40189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300714617
500	NC_014306	TCG	2	6	40234	40239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300714617

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