MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170

Total Repeats: 348

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014305	GGCA	2	8	422	429	25 %	0 %	50 %	25 %	300713133
2	NC_014305	CGGC	2	8	1453	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	300713134
3	NC_014305	TCCT	2	8	2617	2624	0 %	50 %	0 %	50 %	300713136
4	NC_014305	CCGG	2	8	2664	2671	0 %	0 %	50 %	50 %	300713136
5	NC_014305	AGGA	2	8	2851	2858	50 %	0 %	50 %	0 %	300713137
6	NC_014305	GGCT	2	8	3674	3681	0 %	25 %	50 %	25 %	300713138
7	NC_014305	ATTA	2	8	5722	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	300713142
8	NC_014305	TGAT	2	8	6894	6901	25 %	50 %	25 %	0 %	300713143
9	NC_014305	CAAA	2	8	7684	7691	75 %	0 %	0 %	25 %	300713145
10	NC_014305	GCAG	2	8	7961	7968	25 %	0 %	50 %	25 %	300713146
11	NC_014305	GGAT	2	8	8285	8292	25 %	25 %	50 %	0 %	300713146
12	NC_014305	GCTG	2	8	8483	8490	0 %	25 %	50 %	25 %	300713146
13	NC_014305	TGCT	2	8	8699	8706	0 %	50 %	25 %	25 %	300713147
14	NC_014305	CCAG	2	8	9011	9018	25 %	0 %	25 %	50 %	300713148
15	NC_014305	ACGA	2	8	9050	9057	50 %	0 %	25 %	25 %	300713148
16	NC_014305	AGAA	2	8	9926	9933	75 %	0 %	25 %	0 %	300713150
17	NC_014305	GACA	2	8	10296	10303	50 %	0 %	25 %	25 %	300713150
18	NC_014305	ATCG	2	8	10570	10577	25 %	25 %	25 %	25 %	300713150
19	NC_014305	CTGA	2	8	10756	10763	25 %	25 %	25 %	25 %	300713150
20	NC_014305	ACGC	2	8	10818	10825	25 %	0 %	25 %	50 %	300713150
21	NC_014305	GGCA	2	8	10892	10899	25 %	0 %	50 %	25 %	300713150
22	NC_014305	CCGA	2	8	11416	11423	25 %	0 %	25 %	50 %	300713150
23	NC_014305	GCTG	2	8	11856	11863	0 %	25 %	50 %	25 %	300713150
24	NC_014305	GTAG	2	8	11950	11957	25 %	25 %	50 %	0 %	300713150
25	NC_014305	CCAC	2	8	12083	12090	25 %	0 %	0 %	75 %	300713150
26	NC_014305	CAGT	2	8	13371	13378	25 %	25 %	25 %	25 %	300713152
27	NC_014305	ACTA	2	8	13844	13851	50 %	25 %	0 %	25 %	300713153
28	NC_014305	CAGG	2	8	14657	14664	25 %	0 %	50 %	25 %	300713154
29	NC_014305	GGCG	2	8	15552	15559	0 %	0 %	75 %	25 %	300713156
30	NC_014305	GCTT	2	8	15762	15769	0 %	50 %	25 %	25 %	300713156
31	NC_014305	ACAT	2	8	15879	15886	50 %	25 %	0 %	25 %	300713156
32	NC_014305	AGCA	2	8	17741	17748	50 %	0 %	25 %	25 %	300713158
33	NC_014305	GTAA	2	8	18520	18527	50 %	25 %	25 %	0 %	300713160
34	NC_014305	GCAT	2	8	18542	18549	25 %	25 %	25 %	25 %	300713160
35	NC_014305	CAGA	2	8	19001	19008	50 %	0 %	25 %	25 %	300713160
36	NC_014305	TCCA	2	8	19205	19212	25 %	25 %	0 %	50 %	300713160
37	NC_014305	TTTC	2	8	20272	20279	0 %	75 %	0 %	25 %	300713162
38	NC_014305	GATA	2	8	20453	20460	50 %	25 %	25 %	0 %	300713162
39	NC_014305	TGAA	2	8	21965	21972	50 %	25 %	25 %	0 %	300713164
40	NC_014305	TCAC	2	8	22075	22082	25 %	25 %	0 %	50 %	300713164
41	NC_014305	GGCC	2	8	22710	22717	0 %	0 %	50 %	50 %	300713165
42	NC_014305	GCTC	2	8	22842	22849	0 %	25 %	25 %	50 %	300713166
43	NC_014305	CAAT	2	8	23879	23886	50 %	25 %	0 %	25 %	300713167
44	NC_014305	TGAC	2	8	24670	24677	25 %	25 %	25 %	25 %	300713168
45	NC_014305	GTAC	2	8	24901	24908	25 %	25 %	25 %	25 %	300713168
46	NC_014305	TTCT	2	8	26956	26963	0 %	75 %	0 %	25 %	300713173
47	NC_014305	GGCC	2	8	27057	27064	0 %	0 %	50 %	50 %	300713173
48	NC_014305	CATC	2	8	27150	27157	25 %	25 %	0 %	50 %	300713173
49	NC_014305	GAGG	2	8	28407	28414	25 %	0 %	75 %	0 %	300713174
50	NC_014305	GCTG	2	8	28660	28667	0 %	25 %	50 %	25 %	300713175
51	NC_014305	CCGG	2	8	28728	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	300713175
52	NC_014305	CCTG	2	8	29492	29499	0 %	25 %	25 %	50 %	300713176
53	NC_014305	GCGG	2	8	30113	30120	0 %	0 %	75 %	25 %	300713176
54	NC_014305	CTTC	2	8	30402	30409	0 %	50 %	0 %	50 %	300713176
55	NC_014305	AATG	2	8	30596	30603	50 %	25 %	25 %	0 %	300713176
56	NC_014305	GGAC	2	8	30946	30953	25 %	0 %	50 %	25 %	300713176
57	NC_014305	GGAG	2	8	31452	31459	25 %	0 %	75 %	0 %	300713178
58	NC_014305	GCCG	2	8	32906	32913	0 %	0 %	50 %	50 %	300713179
59	NC_014305	ACGG	2	8	33215	33222	25 %	0 %	50 %	25 %	300713179
60	NC_014305	CGGG	2	8	34013	34020	0 %	0 %	75 %	25 %	300713181
61	NC_014305	ATGC	2	8	34196	34203	25 %	25 %	25 %	25 %	300713181
62	NC_014305	GCAG	2	8	35131	35138	25 %	0 %	50 %	25 %	300713182
63	NC_014305	CTAC	2	8	35283	35290	25 %	25 %	0 %	50 %	300713182
64	NC_014305	GCGG	2	8	35612	35619	0 %	0 %	75 %	25 %	300713182
65	NC_014305	CAGC	2	8	35812	35819	25 %	0 %	25 %	50 %	300713182
66	NC_014305	TGAG	2	8	35830	35837	25 %	25 %	50 %	0 %	300713182
67	NC_014305	ATTG	2	8	36152	36159	25 %	50 %	25 %	0 %	300713182
68	NC_014305	GATG	2	8	36332	36339	25 %	25 %	50 %	0 %	300713182
69	NC_014305	TCAG	2	8	37208	37215	25 %	25 %	25 %	25 %	300713184
70	NC_014305	AATG	2	8	37253	37260	50 %	25 %	25 %	0 %	300713184
71	NC_014305	CTCA	2	8	37597	37604	25 %	25 %	0 %	50 %	300713184
72	NC_014305	TTCT	2	8	37608	37615	0 %	75 %	0 %	25 %	300713184
73	NC_014305	CAGC	2	8	37833	37840	25 %	0 %	25 %	50 %	300713184
74	NC_014305	GCTG	2	8	37849	37856	0 %	25 %	50 %	25 %	300713184
75	NC_014305	AATG	2	8	38066	38073	50 %	25 %	25 %	0 %	300713185
76	NC_014305	AAAG	2	8	38673	38680	75 %	0 %	25 %	0 %	300713186
77	NC_014305	CAGA	2	8	38742	38749	50 %	0 %	25 %	25 %	300713186
78	NC_014305	CCTG	2	8	39725	39732	0 %	25 %	25 %	50 %	300713189
79	NC_014305	ATTT	2	8	39938	39945	25 %	75 %	0 %	0 %	300713189
80	NC_014305	GTGC	2	8	40930	40937	0 %	25 %	50 %	25 %	300713190
81	NC_014305	GACG	2	8	41113	41120	25 %	0 %	50 %	25 %	300713190
82	NC_014305	CTGC	2	8	41171	41178	0 %	25 %	25 %	50 %	300713191
83	NC_014305	ATCG	2	8	41330	41337	25 %	25 %	25 %	25 %	300713191
84	NC_014305	ATTT	2	8	42669	42676	25 %	75 %	0 %	0 %	300713192
85	NC_014305	CCTG	2	8	42713	42720	0 %	25 %	25 %	50 %	300713192
86	NC_014305	TTTA	2	8	42816	42823	25 %	75 %	0 %	0 %	300713192
87	NC_014305	CTGT	2	8	43685	43692	0 %	50 %	25 %	25 %	300713194
88	NC_014305	ATTT	2	8	44939	44946	25 %	75 %	0 %	0 %	300713197
89	NC_014305	CCCA	2	8	45074	45081	25 %	0 %	0 %	75 %	300713198
90	NC_014305	CTCA	2	8	45493	45500	25 %	25 %	0 %	50 %	300713199
91	NC_014305	GCCC	2	8	45538	45545	0 %	0 %	25 %	75 %	300713199
92	NC_014305	GCCG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	300713199
93	NC_014305	GCTC	2	8	46482	46489	0 %	25 %	25 %	50 %	300713201
94	NC_014305	CACT	2	8	47926	47933	25 %	25 %	0 %	50 %	300713202
95	NC_014305	ATTT	2	8	48390	48397	25 %	75 %	0 %	0 %	300713202
96	NC_014305	CAAA	2	8	48405	48412	75 %	0 %	0 %	25 %	300713202
97	NC_014305	CCCT	2	8	48633	48640	0 %	25 %	0 %	75 %	300713203
98	NC_014305	TTCA	2	8	48909	48916	25 %	50 %	0 %	25 %	300713203
99	NC_014305	CAGC	2	8	49752	49759	25 %	0 %	25 %	50 %	300713205
100	NC_014305	GTAA	2	8	49851	49858	50 %	25 %	25 %	0 %	300713205
101	NC_014305	GCCC	2	8	50687	50694	0 %	0 %	25 %	75 %	300713207
102	NC_014305	GACT	2	8	50784	50791	25 %	25 %	25 %	25 %	300713207
103	NC_014305	CCTT	2	8	52802	52809	0 %	50 %	0 %	50 %	300713211
104	NC_014305	CATG	2	8	52887	52894	25 %	25 %	25 %	25 %	300713211
105	NC_014305	GTGC	2	8	52931	52938	0 %	25 %	50 %	25 %	300713211
106	NC_014305	CGTC	2	8	54869	54876	0 %	25 %	25 %	50 %	300713215
107	NC_014305	GCAC	2	8	55367	55374	25 %	0 %	25 %	50 %	300713215
108	NC_014305	CAGC	2	8	55502	55509	25 %	0 %	25 %	50 %	300713215
109	NC_014305	GACG	2	8	55875	55882	25 %	0 %	50 %	25 %	300713215
110	NC_014305	AGTC	2	8	56094	56101	25 %	25 %	25 %	25 %	300713215
111	NC_014305	GCAG	2	8	56320	56327	25 %	0 %	50 %	25 %	300713215
112	NC_014305	CTGA	2	8	56864	56871	25 %	25 %	25 %	25 %	300713216
113	NC_014305	TTTC	2	8	56914	56921	0 %	75 %	0 %	25 %	300713216
114	NC_014305	TTCA	2	8	56927	56934	25 %	50 %	0 %	25 %	300713216
115	NC_014305	GGCC	2	8	56989	56996	0 %	0 %	50 %	50 %	300713216
116	NC_014305	TTTG	2	8	57162	57169	0 %	75 %	25 %	0 %	300713216
117	NC_014305	CTGG	2	8	57305	57312	0 %	25 %	50 %	25 %	300713216
118	NC_014305	TGAA	2	8	58006	58013	50 %	25 %	25 %	0 %	300713216
119	NC_014305	AGCA	2	8	58274	58281	50 %	0 %	25 %	25 %	300713216
120	NC_014305	GATG	2	8	59002	59009	25 %	25 %	50 %	0 %	300713217
121	NC_014305	TGGC	2	8	59129	59136	0 %	25 %	50 %	25 %	300713217
122	NC_014305	TGAT	2	8	61411	61418	25 %	50 %	25 %	0 %	300713221
123	NC_014305	GCAG	2	8	61437	61444	25 %	0 %	50 %	25 %	300713221
124	NC_014305	TAAT	2	8	61845	61852	50 %	50 %	0 %	0 %	300713223
125	NC_014305	GACA	2	8	62368	62375	50 %	0 %	25 %	25 %	300713224
126	NC_014305	ATGC	2	8	62836	62843	25 %	25 %	25 %	25 %	300713224
127	NC_014305	GAAC	2	8	64290	64297	50 %	0 %	25 %	25 %	300713226
128	NC_014305	TGAT	2	8	64373	64380	25 %	50 %	25 %	0 %	300713226
129	NC_014305	GACC	2	8	65217	65224	25 %	0 %	25 %	50 %	300713226
130	NC_014305	CCTG	2	8	65586	65593	0 %	25 %	25 %	50 %	300713226
131	NC_014305	TCAC	2	8	66145	66152	25 %	25 %	0 %	50 %	300713226
132	NC_014305	TGCC	2	8	66316	66323	0 %	25 %	25 %	50 %	300713226
133	NC_014305	CAGG	2	8	68167	68174	25 %	0 %	50 %	25 %	300713230
134	NC_014305	TAAT	2	8	68339	68346	50 %	50 %	0 %	0 %	300713230
135	NC_014305	CGGC	2	8	68958	68965	0 %	0 %	50 %	50 %	300713231
136	NC_014305	GAGC	2	8	70492	70499	25 %	0 %	50 %	25 %	300713235
137	NC_014305	TTTA	2	8	70537	70544	25 %	75 %	0 %	0 %	300713235
138	NC_014305	AACA	2	8	70545	70552	75 %	0 %	0 %	25 %	300713235
139	NC_014305	TATC	2	8	70817	70824	25 %	50 %	0 %	25 %	300713236
140	NC_014305	GGCC	2	8	72931	72938	0 %	0 %	50 %	50 %	300713240
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.