MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB170

Total Repeats: 403

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014305	CTT	2	6	50	55	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014305	ATT	2	6	99	104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014305	TCT	2	6	188	193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014305	TTG	2	6	241	246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014305	GCC	3	9	1526	1534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014305	CCT	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014305	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014305	GAG	2	6	2294	2299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014305	AGC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014305	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014305	GGC	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014305	AAT	2	6	5200	5205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014305	TTC	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014305	TCA	2	6	5649	5654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014305	TTC	2	6	6003	6008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014305	GAT	2	6	6267	6272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014305	AAT	2	6	6286	6291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014305	ATA	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014305	AGC	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014305	ATG	2	6	6959	6964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014305	GGC	2	6	7060	7065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014305	AAT	2	6	7168	7173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014305	GAG	2	6	7475	7480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014305	GTT	2	6	8828	8833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014305	CCT	2	6	8868	8873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014305	GTA	2	6	9451	9456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014305	GGT	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014305	TTG	2	6	9506	9511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014305	TTA	2	6	9631	9636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014305	TAA	2	6	9675	9680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014305	TGT	2	6	9813	9818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014305	GAT	2	6	13331	13336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014305	CGT	2	6	14383	14388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014305	TCA	3	9	14760	14768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014305	TTG	2	6	14892	14897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014305	GGA	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014305	TCT	2	6	15938	15943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014305	TAT	2	6	16755	16760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014305	CAT	2	6	16977	16982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014305	CTC	2	6	16997	17002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014305	CAG	3	9	17044	17052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014305	GCC	2	6	17782	17787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014305	GCT	2	6	18093	18098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014305	AAT	2	6	18232	18237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014305	AAT	2	6	18341	18346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014305	ATA	2	6	18397	18402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014305	CAA	2	6	19449	19454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014305	AGT	2	6	19485	19490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014305	ACA	2	6	19514	19519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014305	ATT	2	6	19776	19781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014305	TCA	2	6	21626	21631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014305	GCG	2	6	21775	21780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014305	ACA	2	6	23625	23630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014305	TAA	2	6	25779	25784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014305	CGC	2	6	26094	26099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014305	TCA	2	6	27187	27192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014305	ACA	2	6	27381	27386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014305	ATT	2	6	27549	27554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014305	TAT	2	6	27593	27598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014305	GGA	2	6	31645	31650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014305	GAA	2	6	34393	34398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014305	TCA	2	6	34609	34614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014305	ATT	2	6	34663	34668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014305	ACA	2	6	36800	36805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014305	TTG	2	6	36859	36864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014305	TCA	2	6	36897	36902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014305	GTT	2	6	36993	36998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014305	CCA	2	6	37006	37011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014305	CAG	2	6	37986	37991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014305	GGC	2	6	38586	38591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014305	CCG	2	6	38614	38619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014305	TCA	2	6	39018	39023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014305	GCG	2	6	39352	39357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014305	TGG	2	6	40509	40514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014305	CAG	3	9	40580	40588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014305	GCT	2	6	40589	40594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014305	CTC	2	6	40655	40660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014305	TAT	2	6	40745	40750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014305	TAT	2	6	41500	41505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014305	GGC	2	6	41584	41589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014305	TAA	2	6	41806	41811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014305	AGT	2	6	41850	41855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014305	GAG	2	6	41879	41884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014305	ACT	2	6	41965	41970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014305	TAA	2	6	42065	42070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014305	GGT	2	6	42142	42147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014305	TTA	2	6	42162	42167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014305	GAA	2	6	42222	42227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014305	GCT	2	6	42304	42309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014305	AAC	2	6	43533	43538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014305	ATT	2	6	43560	43565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014305	GAG	2	6	43652	43657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014305	GCC	2	6	43914	43919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_014305	TGG	2	6	43944	43949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014305	CTA	2	6	43950	43955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014305	TAT	2	6	44119	44124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014305	GGT	2	6	44492	44497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014305	GCC	2	6	44517	44522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014305	CCT	2	6	44734	44739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014305	CGC	2	6	45289	45294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014305	ACG	2	6	45314	45319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014305	AGG	2	6	46228	46233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014305	TCG	3	9	46271	46279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014305	GTG	2	6	46308	46313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014305	TCC	2	6	46595	46600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014305	TGA	2	6	46646	46651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014305	AAG	2	6	46676	46681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014305	CCG	2	6	46724	46729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014305	AAC	2	6	46842	46847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014305	GTA	2	6	46954	46959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014305	GGC	2	6	47023	47028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014305	AGT	2	6	47069	47074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014305	TGT	2	6	47260	47265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014305	ATC	2	6	47291	47296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014305	GTG	2	6	47354	47359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014305	CGA	2	6	47418	47423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014305	CGG	2	6	47471	47476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014305	GCG	2	6	47564	47569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014305	ATC	2	6	47577	47582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014305	ATC	2	6	47706	47711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014305	ATT	2	6	47791	47796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014305	TGC	2	6	47801	47806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014305	ATC	2	6	48920	48925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014305	ATA	2	6	48990	48995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014305	ATT	2	6	49015	49020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014305	TGA	2	6	49291	49296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014305	CCT	2	6	49371	49376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014305	CCT	2	6	49451	49456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014305	TCT	2	6	50359	50364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014305	GGA	2	6	51671	51676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014305	CTG	2	6	51865	51870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014305	AAT	2	6	51917	51922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014305	GTC	2	6	52115	52120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014305	GAT	2	6	52334	52339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014305	GCG	2	6	53717	53722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014305	GCA	2	6	53750	53755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014305	TGG	2	6	53922	53927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014305	AGG	2	6	53941	53946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014305	AAT	2	6	54438	54443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014305	GCT	2	6	56416	56421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014305	AAT	2	6	58762	58767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.