MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Erwinia billingiae Eb661 plasmid pEB102

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014304	TCCCG	2	10	1591	1600	0 %	20 %	20 %	60 %	300781824
2	NC_014304	TGGCT	2	10	3253	3262	0 %	40 %	40 %	20 %	300781827
3	NC_014304	TGGCC	2	10	3774	3783	0 %	20 %	40 %	40 %	300781828
4	NC_014304	TTTCA	2	10	7274	7283	20 %	60 %	0 %	20 %	300781832
5	NC_014304	TACGA	2	10	10281	10290	40 %	20 %	20 %	20 %	300781835
6	NC_014304	GAGAA	2	10	18350	18359	60 %	0 %	40 %	0 %	300781844
7	NC_014304	GGCGG	2	10	18794	18803	0 %	0 %	80 %	20 %	300781845
8	NC_014304	AAATA	2	10	19792	19801	80 %	20 %	0 %	0 %	300781845
9	NC_014304	ACATC	2	10	24686	24695	40 %	20 %	0 %	40 %	300781852
10	NC_014304	TCAGC	2	10	26516	26525	20 %	20 %	20 %	40 %	300781854
11	NC_014304	TTTTC	2	10	27276	27285	0 %	80 %	0 %	20 %	300781854
12	NC_014304	GCCCA	2	10	28891	28900	20 %	0 %	20 %	60 %	300781856
13	NC_014304	CGGTA	2	10	34249	34258	20 %	20 %	40 %	20 %	300781862
14	NC_014304	TGGCG	2	10	34333	34342	0 %	20 %	60 %	20 %	300781862
15	NC_014304	GCTTC	2	10	35530	35539	0 %	40 %	20 %	40 %	300781863
16	NC_014304	AGCAG	2	10	38321	38330	40 %	0 %	40 %	20 %	300781866
17	NC_014304	TTTAA	2	10	39829	39838	40 %	60 %	0 %	0 %	300781867
18	NC_014304	TGCCG	2	10	40025	40034	0 %	20 %	40 %	40 %	300781868
19	NC_014304	TGGCT	2	10	40228	40237	0 %	40 %	40 %	20 %	300781868
20	NC_014304	TGGCG	2	10	40343	40352	0 %	20 %	60 %	20 %	300781868
21	NC_014304	TCAAC	2	10	41585	41594	40 %	20 %	0 %	40 %	300781870
22	NC_014304	CAGTC	2	10	46223	46232	20 %	20 %	20 %	40 %	300781874
23	NC_014304	TGACC	2	10	46764	46773	20 %	20 %	20 %	40 %	300781874
24	NC_014304	ACCGC	2	10	48417	48426	20 %	0 %	20 %	60 %	300781875
25	NC_014304	TGCCA	2	10	48745	48754	20 %	20 %	20 %	40 %	300781876
26	NC_014304	AGTTG	2	10	53186	53195	20 %	40 %	40 %	0 %	300781881
27	NC_014304	CGTTC	2	10	53557	53566	0 %	40 %	20 %	40 %	300781881
28	NC_014304	TCGCT	2	10	53664	53673	0 %	40 %	20 %	40 %	300781881
29	NC_014304	TAACG	2	10	56713	56722	40 %	20 %	20 %	20 %	300781883
30	NC_014304	AAACA	2	10	59312	59321	80 %	0 %	0 %	20 %	300781887
31	NC_014304	TCGCC	2	10	59854	59863	0 %	20 %	20 %	60 %	300781888
32	NC_014304	GCGAA	2	10	59981	59990	40 %	0 %	40 %	20 %	300781888
33	NC_014304	GGCCG	2	10	60433	60442	0 %	0 %	60 %	40 %	300781889
34	NC_014304	GGTTT	2	10	61175	61184	0 %	60 %	40 %	0 %	300781891
35	NC_014304	GATGC	2	10	65078	65087	20 %	20 %	40 %	20 %	300781895
36	NC_014304	AACCG	2	10	66943	66952	40 %	0 %	20 %	40 %	300781897
37	NC_014304	TCAGT	2	10	69778	69787	20 %	40 %	20 %	20 %	300781900
38	NC_014304	TGTAT	2	10	72605	72614	20 %	60 %	20 %	0 %	300781902
39	NC_014304	ATGGA	2	10	73335	73344	40 %	20 %	40 %	0 %	300781904
40	NC_014304	ATAAA	2	10	73726	73735	80 %	20 %	0 %	0 %	300781905
41	NC_014304	CAGTT	2	10	74467	74476	20 %	40 %	20 %	20 %	300781905
42	NC_014304	AGTGC	2	10	74501	74510	20 %	20 %	40 %	20 %	300781905
43	NC_014304	CGTCA	2	10	75620	75629	20 %	20 %	20 %	40 %	300781906
44	NC_014304	GCGCC	2	10	76384	76393	0 %	0 %	40 %	60 %	300781906
45	NC_014304	GTCCC	2	10	78745	78754	0 %	20 %	20 %	60 %	300781909
46	NC_014304	CATTT	2	10	83276	83285	20 %	60 %	0 %	20 %	300781915
47	NC_014304	TGTTT	2	10	83343	83352	0 %	80 %	20 %	0 %	300781915
48	NC_014304	ATTTA	2	10	84790	84799	40 %	60 %	0 %	0 %	300781916
49	NC_014304	CAAAA	2	10	87421	87430	80 %	0 %	0 %	20 %	300781919
50	NC_014304	CTCAG	2	10	87916	87925	20 %	20 %	20 %	40 %	300781920
51	NC_014304	TCCCC	2	10	87961	87970	0 %	20 %	0 %	80 %	300781920
52	NC_014304	AATGC	2	10	88611	88620	40 %	20 %	20 %	20 %	300781921
53	NC_014304	CTGCG	2	10	90412	90421	0 %	20 %	40 %	40 %	300781922
54	NC_014304	GACGC	2	10	92988	92997	20 %	0 %	40 %	40 %	300781925
55	NC_014304	CCCGG	2	10	95373	95382	0 %	0 %	40 %	60 %	300781928

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.