MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 6

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014303	CGGG	2	8	203	210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014303	ACCG	2	8	478	485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014303	GTTC	2	8	914	921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014303	CGGA	2	8	970	977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014303	GTGG	2	8	991	998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014303	CTGT	2	8	1073	1080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014303	GCCA	2	8	1595	1602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014303	CGGT	2	8	1660	1667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014303	GGCC	2	8	1668	1675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014303	GTCG	2	8	2250	2257	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
11	NC_014303	CGTC	2	8	2259	2266	0 %	25 %	25 %	50 %	299883500
12	NC_014303	GCGG	2	8	2376	2383	0 %	0 %	75 %	25 %	299883500
13	NC_014303	GCCC	2	8	2525	2532	0 %	0 %	25 %	75 %	299883500
14	NC_014303	CGAC	2	8	2559	2566	25 %	0 %	25 %	50 %	299883500
15	NC_014303	GGTC	2	8	2814	2821	0 %	25 %	50 %	25 %	299883500
16	NC_014303	ACGG	2	8	2884	2891	25 %	0 %	50 %	25 %	299883500
17	NC_014303	GACG	2	8	3023	3030	25 %	0 %	50 %	25 %	299883501
18	NC_014303	CTCA	2	8	3245	3252	25 %	25 %	0 %	50 %	299883501
19	NC_014303	TCCA	2	8	3433	3440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014303	CGGC	2	8	3848	3855	0 %	0 %	50 %	50 %	299883502
21	NC_014303	GCGG	2	8	3955	3962	0 %	0 %	75 %	25 %	299883503
22	NC_014303	GGTC	2	8	4348	4355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014303	TGGA	2	8	4807	4814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014303	ACCC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014303	GGCG	2	8	5110	5117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014303	CATC	2	8	5208	5215	25 %	25 %	0 %	50 %	299883504
27	NC_014303	CGAG	2	8	5225	5232	25 %	0 %	50 %	25 %	299883504
28	NC_014303	TGAG	2	8	5469	5476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014303	TCAG	2	8	5485	5492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014303	GGCT	2	8	5537	5544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014303	ACTC	2	8	5624	5631	25 %	25 %	0 %	50 %	299883505
32	NC_014303	CTCC	2	8	6548	6555	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014303	AACG	2	8	6710	6717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014303	CGAA	2	8	6748	6755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.