MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 6

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014303	CGG	2	6	347	352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014303	GAG	2	6	384	389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014303	AAC	2	6	486	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014303	CGA	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014303	AAC	2	6	507	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014303	TTA	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014303	GTG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014303	GTC	2	6	604	609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014303	TAG	3	9	610	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014303	GTA	3	9	620	628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014303	GTA	16	48	631	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014303	GGT	2	6	725	730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014303	GGT	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014303	GCC	2	6	832	837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014303	GGT	2	6	860	865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014303	ACC	2	6	1003	1008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014303	TCC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014303	AGT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014303	CGT	2	6	1506	1511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014303	TAC	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014303	TCG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014303	GCG	2	6	1556	1561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014303	CGC	2	6	1735	1740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014303	CAC	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014303	ACC	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014303	CCA	2	6	2177	2182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
27	NC_014303	ACC	2	6	2336	2341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883500
28	NC_014303	TCG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883500
29	NC_014303	GGT	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883500
30	NC_014303	CGG	2	6	2692	2697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
31	NC_014303	GAC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883500
32	NC_014303	GGC	2	6	2847	2852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883500
33	NC_014303	CCG	2	6	2918	2923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
34	NC_014303	ACT	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883501
35	NC_014303	TCG	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
36	NC_014303	GCT	2	6	3044	3049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
37	NC_014303	GGC	2	6	3206	3211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883501
38	NC_014303	CGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883501
39	NC_014303	CTG	2	6	3318	3323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883501
40	NC_014303	GTG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883501
41	NC_014303	GCC	2	6	3354	3359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883501
42	NC_014303	CCG	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014303	CCT	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014303	ACA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883502
45	NC_014303	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883503
46	NC_014303	GGA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
47	NC_014303	CGG	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
48	NC_014303	GAG	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
49	NC_014303	GTG	2	6	3967	3972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
50	NC_014303	GTC	2	6	4006	4011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883503
51	NC_014303	GGC	2	6	4016	4021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883503
52	NC_014303	GAG	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
53	NC_014303	GTG	2	6	4100	4105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883503
54	NC_014303	GAG	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883503
55	NC_014303	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014303	CGA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014303	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014303	AGT	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014303	ACG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014303	GAC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014303	GCC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014303	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014303	GCC	3	9	4786	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014303	CAG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014303	CTT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014303	ACA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014303	TCT	2	6	5037	5042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014303	GAA	2	6	5265	5270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883504
69	NC_014303	GAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014303	TAC	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014303	ACG	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
72	NC_014303	AGG	2	6	5732	5737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
73	NC_014303	CAG	3	9	5740	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
74	NC_014303	AGG	2	6	5771	5776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883505
75	NC_014303	TTG	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883505
76	NC_014303	CAG	2	6	5821	5826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883505
77	NC_014303	GTG	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883505
78	NC_014303	TTC	2	6	5899	5904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014303	TGC	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883506
80	NC_014303	GAC	2	6	6055	6060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883506
81	NC_014303	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883506
82	NC_014303	GTT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014303	TAT	2	6	6270	6275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014303	TTG	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014303	GGT	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014303	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014303	GAC	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014303	TCG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.