MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 6

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014303	CGG	2	6	347	352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014303	GAG	2	6	384	389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014303	AAC	2	6	486	491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014303	CGA	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014303	AAC	2	6	507	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014303	TTA	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014303	GTG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014303	GTC	2	6	604	609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014303	TAG	3	9	610	618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014303	GTA	3	9	620	628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014303	GTA	16	48	631	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014303	GGT	2	6	725	730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014303	GGT	2	6	752	757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014303	GCC	2	6	832	837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014303	GGT	2	6	860	865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014303	ACC	2	6	1003	1008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014303	TCC	2	6	1114	1119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014303	AGT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014303	CGT	2	6	1506	1511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014303	TAC	2	6	1526	1531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014303	TCG	2	6	1537	1542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014303	GCG	2	6	1556	1561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014303	CGC	2	6	1735	1740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014303	CAC	2	6	1755	1760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014303	ACC	2	6	2029	2034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014303	CCG	2	6	3458	3463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014303	CCT	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014303	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014303	CGA	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014303	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014303	AGT	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014303	ACG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014303	GAC	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014303	GCC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014303	CGA	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014303	GCC	3	9	4786	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014303	CAG	2	6	4822	4827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014303	CTT	2	6	4859	4864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014303	ACA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014303	TCT	2	6	5037	5042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014303	GAG	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014303	TAC	2	6	5560	5565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014303	TTC	2	6	5899	5904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014303	GTT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014303	TAT	2	6	6270	6275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014303	TTG	2	6	6364	6369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014303	GGT	2	6	6512	6517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014303	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014303	GAC	2	6	6732	6737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014303	TCG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.